Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

P53201

Protein Details
Accession P53201    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
349-373VKENLSPKKTKRQRQEMQTALKRKSHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 12, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR032563  DAMP1_SANT-like  
IPR009057  Homeobox-like_sf  
IPR001005  SANT/Myb  
IPR027109  Swc4/Dmap1  
Gene Ontology GO:0000785  C:chromatin  
GO:0035267  C:NuA4 histone acetyltransferase complex  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0000812  C:Swr1 complex  
GO:0003714  F:transcription corepressor activity  
GO:0006338  P:chromatin remodeling  
GO:0051276  P:chromosome organization  
GO:0006281  P:DNA repair  
GO:0006351  P:DNA-templated transcription  
GO:0016573  P:histone acetylation  
GO:0043968  P:histone H2A acetylation  
GO:0043967  P:histone H4 acetylation  
GO:0000122  P:negative regulation of transcription by RNA polymerase II  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
KEGG sce:YGR002C  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF16282  SANT_DAMP1_like  
CDD cd11658  SANT_DMAP1_like  
Amino Acid Sequences MSSSDIFDVLNIKQKSRSPTNGQVSVPSSSAANRPKPQVTGMQRELFNLLGENQPPVVIKSGNNFKEKMLSTSKPSPWSFVEFKANNSVTLRHWVKGSKELIGDTPKESPYSKFNQHLSIPSFTKEEYEAFMNENEGTQKSVESEKNHNENFTNEKKDESKNSWSFEEIEYLFNLCKKYDLRWFLIFDRYSYNNSRTLEDLKEKFYYTCRNYFKASDPSNPLLSSLNFSAEKEIERKKYLQRLLSRSAAEIAEEEALVVESKKFEMAAKRTLAERESLLRLLDSPHSDQTITQYLTSQGMSQLYNALLADKTRKRKHDLNIPENPWMKQQQQFAQHRQLQQLNVKKSEVKENLSPKKTKRQRQEMQTALKRKSESAYAEQLLKDFNSDERKALGVITHGEKLSPGVYLRSTKLSTFKPALQNKILAILQELSLPSRPVMPSFDVMERQEELLKKINTLIDLKKHVDKYEAGMSITK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.34
2 0.42
3 0.48
4 0.54
5 0.54
6 0.63
7 0.7
8 0.71
9 0.67
10 0.63
11 0.58
12 0.51
13 0.43
14 0.33
15 0.25
16 0.21
17 0.28
18 0.3
19 0.36
20 0.39
21 0.45
22 0.48
23 0.49
24 0.5
25 0.53
26 0.53
27 0.54
28 0.56
29 0.56
30 0.53
31 0.52
32 0.5
33 0.41
34 0.33
35 0.24
36 0.19
37 0.17
38 0.17
39 0.17
40 0.15
41 0.15
42 0.16
43 0.15
44 0.17
45 0.14
46 0.15
47 0.22
48 0.32
49 0.37
50 0.4
51 0.4
52 0.37
53 0.43
54 0.43
55 0.41
56 0.39
57 0.36
58 0.4
59 0.48
60 0.52
61 0.52
62 0.51
63 0.5
64 0.45
65 0.49
66 0.44
67 0.4
68 0.45
69 0.39
70 0.4
71 0.45
72 0.43
73 0.38
74 0.37
75 0.35
76 0.26
77 0.35
78 0.35
79 0.27
80 0.29
81 0.31
82 0.32
83 0.38
84 0.38
85 0.32
86 0.31
87 0.31
88 0.33
89 0.33
90 0.32
91 0.26
92 0.28
93 0.24
94 0.25
95 0.25
96 0.24
97 0.25
98 0.3
99 0.35
100 0.38
101 0.39
102 0.43
103 0.44
104 0.47
105 0.45
106 0.43
107 0.38
108 0.34
109 0.32
110 0.27
111 0.26
112 0.21
113 0.18
114 0.15
115 0.16
116 0.15
117 0.15
118 0.15
119 0.15
120 0.13
121 0.13
122 0.12
123 0.11
124 0.11
125 0.1
126 0.1
127 0.1
128 0.16
129 0.19
130 0.22
131 0.29
132 0.36
133 0.43
134 0.43
135 0.43
136 0.39
137 0.38
138 0.41
139 0.39
140 0.38
141 0.31
142 0.33
143 0.36
144 0.39
145 0.42
146 0.41
147 0.44
148 0.43
149 0.45
150 0.43
151 0.4
152 0.38
153 0.32
154 0.31
155 0.22
156 0.18
157 0.15
158 0.15
159 0.14
160 0.14
161 0.14
162 0.1
163 0.12
164 0.13
165 0.16
166 0.23
167 0.28
168 0.3
169 0.33
170 0.36
171 0.35
172 0.4
173 0.37
174 0.3
175 0.29
176 0.27
177 0.27
178 0.28
179 0.28
180 0.27
181 0.27
182 0.28
183 0.25
184 0.26
185 0.26
186 0.29
187 0.29
188 0.27
189 0.27
190 0.27
191 0.25
192 0.25
193 0.3
194 0.27
195 0.35
196 0.35
197 0.36
198 0.38
199 0.4
200 0.42
201 0.42
202 0.41
203 0.37
204 0.39
205 0.39
206 0.38
207 0.35
208 0.31
209 0.23
210 0.2
211 0.17
212 0.13
213 0.13
214 0.12
215 0.12
216 0.12
217 0.11
218 0.12
219 0.15
220 0.19
221 0.19
222 0.21
223 0.25
224 0.28
225 0.36
226 0.39
227 0.41
228 0.44
229 0.46
230 0.49
231 0.5
232 0.45
233 0.37
234 0.34
235 0.28
236 0.21
237 0.15
238 0.11
239 0.07
240 0.07
241 0.06
242 0.04
243 0.04
244 0.04
245 0.04
246 0.04
247 0.04
248 0.04
249 0.04
250 0.05
251 0.07
252 0.13
253 0.16
254 0.21
255 0.22
256 0.23
257 0.25
258 0.26
259 0.25
260 0.2
261 0.17
262 0.15
263 0.16
264 0.15
265 0.14
266 0.13
267 0.12
268 0.13
269 0.14
270 0.14
271 0.14
272 0.15
273 0.15
274 0.15
275 0.15
276 0.17
277 0.2
278 0.18
279 0.16
280 0.16
281 0.16
282 0.17
283 0.17
284 0.14
285 0.1
286 0.1
287 0.1
288 0.1
289 0.1
290 0.09
291 0.09
292 0.09
293 0.08
294 0.07
295 0.08
296 0.15
297 0.2
298 0.3
299 0.36
300 0.41
301 0.46
302 0.54
303 0.61
304 0.63
305 0.68
306 0.68
307 0.71
308 0.69
309 0.7
310 0.64
311 0.57
312 0.51
313 0.45
314 0.39
315 0.35
316 0.37
317 0.36
318 0.44
319 0.51
320 0.53
321 0.59
322 0.6
323 0.59
324 0.59
325 0.57
326 0.52
327 0.52
328 0.54
329 0.5
330 0.47
331 0.45
332 0.43
333 0.41
334 0.46
335 0.43
336 0.39
337 0.41
338 0.49
339 0.57
340 0.6
341 0.64
342 0.59
343 0.66
344 0.71
345 0.73
346 0.73
347 0.75
348 0.77
349 0.81
350 0.86
351 0.83
352 0.84
353 0.84
354 0.81
355 0.73
356 0.69
357 0.6
358 0.51
359 0.45
360 0.4
361 0.37
362 0.35
363 0.39
364 0.36
365 0.38
366 0.36
367 0.34
368 0.3
369 0.24
370 0.19
371 0.13
372 0.17
373 0.22
374 0.23
375 0.23
376 0.23
377 0.24
378 0.23
379 0.23
380 0.19
381 0.13
382 0.16
383 0.18
384 0.19
385 0.18
386 0.18
387 0.18
388 0.18
389 0.16
390 0.14
391 0.12
392 0.11
393 0.15
394 0.18
395 0.21
396 0.25
397 0.26
398 0.27
399 0.32
400 0.33
401 0.37
402 0.38
403 0.43
404 0.48
405 0.53
406 0.58
407 0.55
408 0.54
409 0.47
410 0.48
411 0.42
412 0.32
413 0.28
414 0.22
415 0.18
416 0.18
417 0.18
418 0.14
419 0.16
420 0.16
421 0.14
422 0.17
423 0.18
424 0.18
425 0.22
426 0.23
427 0.24
428 0.27
429 0.3
430 0.3
431 0.31
432 0.32
433 0.29
434 0.27
435 0.3
436 0.28
437 0.28
438 0.33
439 0.32
440 0.3
441 0.32
442 0.33
443 0.31
444 0.35
445 0.38
446 0.37
447 0.43
448 0.46
449 0.51
450 0.52
451 0.5
452 0.48
453 0.43
454 0.41
455 0.43
456 0.41