Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q12102

Protein Details
Accession Q12102    Localization Confidence High Confidence Score 19.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
218-237GSSQPFKKRSKIFKDTLKKGHydrophilic
426-445KVQLKEKKRDRNKKILLVKRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
430-449KEKKRDRNKKILLVKRESKK
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR022712  Beta_Casp  
IPR027075  CPSF2  
IPR025069  Cpsf2_C  
IPR035639  CPSF2_MBL  
IPR001279  Metallo-B-lactamas  
IPR036866  RibonucZ/Hydroxyglut_hydro  
Gene Ontology GO:0005847  C:mRNA cleavage and polyadenylation specificity factor complex  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006379  P:mRNA cleavage  
GO:0006378  P:mRNA polyadenylation  
GO:0098789  P:pre-mRNA cleavage required for polyadenylation  
GO:0030846  P:termination of RNA polymerase II transcription, poly(A)-coupled  
KEGG sce:YLR115W  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF13299  CPSF100_C  
PF16661  Lactamase_B_6  
CDD cd16293  CPSF2-like_MBL-fold  
Amino Acid Sequences MTYKYNCCDDGSGTTVGSVVRFDNVTLLIDPGWNPSKVSYEQCIKYWEKVIPEIDVIILSQPTIECLGAHSLLYYNFTSHFISRIQVYATLPVINLGRVSTIDSYASAGVIGPYDTNKLDLEDIEISFDHIVPLKYSQLVDLRSRYDGLTLLAYNAGVCPGGSIWCISTYSEKLVYAKRWNHTRDNILNAASILDATGKPLSTLMRPSAIITTLDRFGSSQPFKKRSKIFKDTLKKGLSSDGSVIIPVDMSGKFLDLFTQVHELLFESTKINAHTQVPVLILSYARGRTLTYAKSMLEWLSPSLLKTWENRNNTSPFEIGSRIKIIAPNELSKYPGSKICFVSEVGALINEVIIKVGNSEKTTLILTKPSFECASSLDKILEIVEQDERNWKTFPEDGKSFLCDNYISIDTIKEEPLSKEETEAFKVQLKEKKRDRNKKILLVKRESKKLANGNAIIDDTNGERAMRNQDILVENVNGVPPIDHIMGGDEDDDEEEENDNLLNLLKDNSEKSAAKKNTEVPVDIIIQPSAASKHKMFPFNPAKIKKDDYGTVVDFTMFLPDDSDNVNQNSRKRPLKDGAKTTSPVNEEDNKNEEEDGYNMSDPISKRSKHRASRYSGFSGTGEAENFDNLDYLKIDKTLSKRTISTVNVQLKCSVVILNLQSLVDQRSASIIWPSLKSRKIVLSAPKQIQNEEITAKLIKKNIEVVNMPLNKIVEFSTTIKTLDISIDSNLDNLLKWQRISDSYTVATVVGRLVKESLPQVNNHQKTASRSKLVLKPLHGSSRSHKTGALSIGDVRLAQLKKLLTEKNYIAEFKGEGTLVINEKVAVRKINDAETIIDGTPSELFDTVKKLVTDMLAKI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.23
2 0.21
3 0.19
4 0.17
5 0.13
6 0.1
7 0.11
8 0.11
9 0.11
10 0.12
11 0.13
12 0.15
13 0.14
14 0.14
15 0.12
16 0.14
17 0.14
18 0.18
19 0.21
20 0.19
21 0.2
22 0.2
23 0.25
24 0.28
25 0.33
26 0.34
27 0.39
28 0.41
29 0.43
30 0.49
31 0.46
32 0.47
33 0.47
34 0.43
35 0.38
36 0.41
37 0.4
38 0.36
39 0.33
40 0.29
41 0.24
42 0.2
43 0.17
44 0.13
45 0.11
46 0.08
47 0.08
48 0.07
49 0.08
50 0.1
51 0.1
52 0.08
53 0.1
54 0.14
55 0.14
56 0.14
57 0.13
58 0.13
59 0.13
60 0.17
61 0.15
62 0.13
63 0.14
64 0.16
65 0.18
66 0.17
67 0.19
68 0.17
69 0.18
70 0.19
71 0.19
72 0.18
73 0.19
74 0.19
75 0.2
76 0.2
77 0.19
78 0.17
79 0.18
80 0.17
81 0.14
82 0.14
83 0.1
84 0.1
85 0.09
86 0.13
87 0.12
88 0.12
89 0.12
90 0.12
91 0.13
92 0.13
93 0.12
94 0.09
95 0.08
96 0.07
97 0.07
98 0.07
99 0.06
100 0.07
101 0.1
102 0.1
103 0.11
104 0.12
105 0.13
106 0.13
107 0.13
108 0.15
109 0.15
110 0.15
111 0.15
112 0.15
113 0.14
114 0.14
115 0.14
116 0.11
117 0.11
118 0.12
119 0.12
120 0.13
121 0.14
122 0.15
123 0.16
124 0.18
125 0.2
126 0.23
127 0.27
128 0.29
129 0.29
130 0.29
131 0.3
132 0.27
133 0.23
134 0.2
135 0.17
136 0.16
137 0.14
138 0.13
139 0.12
140 0.11
141 0.1
142 0.09
143 0.08
144 0.06
145 0.05
146 0.05
147 0.05
148 0.06
149 0.06
150 0.07
151 0.07
152 0.09
153 0.1
154 0.1
155 0.14
156 0.15
157 0.18
158 0.19
159 0.19
160 0.21
161 0.25
162 0.3
163 0.35
164 0.4
165 0.44
166 0.51
167 0.56
168 0.61
169 0.62
170 0.65
171 0.61
172 0.61
173 0.57
174 0.49
175 0.44
176 0.35
177 0.3
178 0.2
179 0.15
180 0.08
181 0.07
182 0.06
183 0.08
184 0.09
185 0.08
186 0.08
187 0.1
188 0.11
189 0.12
190 0.16
191 0.15
192 0.17
193 0.17
194 0.18
195 0.18
196 0.18
197 0.17
198 0.16
199 0.16
200 0.16
201 0.16
202 0.15
203 0.14
204 0.14
205 0.22
206 0.25
207 0.29
208 0.37
209 0.45
210 0.48
211 0.56
212 0.63
213 0.65
214 0.7
215 0.72
216 0.7
217 0.73
218 0.8
219 0.79
220 0.78
221 0.71
222 0.61
223 0.53
224 0.51
225 0.42
226 0.33
227 0.28
228 0.22
229 0.19
230 0.18
231 0.17
232 0.11
233 0.09
234 0.08
235 0.08
236 0.06
237 0.07
238 0.07
239 0.07
240 0.08
241 0.08
242 0.08
243 0.08
244 0.09
245 0.09
246 0.12
247 0.12
248 0.11
249 0.12
250 0.12
251 0.12
252 0.12
253 0.11
254 0.09
255 0.09
256 0.11
257 0.12
258 0.13
259 0.14
260 0.15
261 0.16
262 0.16
263 0.16
264 0.15
265 0.13
266 0.13
267 0.1
268 0.09
269 0.08
270 0.1
271 0.1
272 0.09
273 0.1
274 0.09
275 0.12
276 0.16
277 0.17
278 0.17
279 0.18
280 0.18
281 0.19
282 0.2
283 0.17
284 0.14
285 0.13
286 0.11
287 0.11
288 0.11
289 0.11
290 0.11
291 0.12
292 0.13
293 0.16
294 0.25
295 0.31
296 0.36
297 0.38
298 0.42
299 0.44
300 0.44
301 0.43
302 0.33
303 0.26
304 0.23
305 0.23
306 0.19
307 0.18
308 0.17
309 0.15
310 0.16
311 0.18
312 0.17
313 0.19
314 0.2
315 0.21
316 0.22
317 0.22
318 0.23
319 0.21
320 0.22
321 0.18
322 0.2
323 0.2
324 0.22
325 0.23
326 0.22
327 0.23
328 0.22
329 0.21
330 0.17
331 0.15
332 0.11
333 0.09
334 0.07
335 0.06
336 0.06
337 0.04
338 0.03
339 0.03
340 0.03
341 0.03
342 0.04
343 0.06
344 0.07
345 0.08
346 0.1
347 0.1
348 0.11
349 0.12
350 0.12
351 0.11
352 0.14
353 0.14
354 0.17
355 0.17
356 0.18
357 0.18
358 0.17
359 0.17
360 0.14
361 0.19
362 0.15
363 0.16
364 0.14
365 0.13
366 0.13
367 0.13
368 0.11
369 0.06
370 0.06
371 0.08
372 0.08
373 0.09
374 0.16
375 0.16
376 0.18
377 0.18
378 0.17
379 0.17
380 0.21
381 0.23
382 0.22
383 0.22
384 0.24
385 0.25
386 0.27
387 0.25
388 0.21
389 0.19
390 0.13
391 0.12
392 0.12
393 0.12
394 0.1
395 0.09
396 0.09
397 0.1
398 0.11
399 0.11
400 0.09
401 0.09
402 0.09
403 0.11
404 0.14
405 0.12
406 0.13
407 0.15
408 0.16
409 0.18
410 0.18
411 0.17
412 0.18
413 0.2
414 0.23
415 0.26
416 0.29
417 0.36
418 0.43
419 0.52
420 0.59
421 0.68
422 0.71
423 0.77
424 0.79
425 0.79
426 0.81
427 0.78
428 0.75
429 0.71
430 0.72
431 0.66
432 0.65
433 0.59
434 0.51
435 0.49
436 0.47
437 0.44
438 0.41
439 0.36
440 0.31
441 0.29
442 0.28
443 0.22
444 0.16
445 0.12
446 0.07
447 0.07
448 0.07
449 0.06
450 0.06
451 0.07
452 0.12
453 0.12
454 0.12
455 0.11
456 0.14
457 0.15
458 0.15
459 0.15
460 0.11
461 0.1
462 0.1
463 0.1
464 0.07
465 0.06
466 0.05
467 0.04
468 0.06
469 0.07
470 0.06
471 0.06
472 0.07
473 0.08
474 0.08
475 0.08
476 0.05
477 0.05
478 0.05
479 0.05
480 0.04
481 0.04
482 0.05
483 0.05
484 0.05
485 0.05
486 0.04
487 0.05
488 0.05
489 0.04
490 0.04
491 0.05
492 0.06
493 0.07
494 0.08
495 0.09
496 0.13
497 0.14
498 0.17
499 0.26
500 0.28
501 0.29
502 0.32
503 0.36
504 0.37
505 0.38
506 0.36
507 0.27
508 0.27
509 0.27
510 0.24
511 0.2
512 0.14
513 0.12
514 0.11
515 0.1
516 0.1
517 0.1
518 0.12
519 0.12
520 0.19
521 0.24
522 0.3
523 0.3
524 0.38
525 0.45
526 0.49
527 0.57
528 0.55
529 0.54
530 0.52
531 0.55
532 0.48
533 0.43
534 0.37
535 0.31
536 0.31
537 0.29
538 0.26
539 0.22
540 0.19
541 0.16
542 0.14
543 0.13
544 0.08
545 0.07
546 0.07
547 0.07
548 0.08
549 0.1
550 0.11
551 0.12
552 0.13
553 0.18
554 0.2
555 0.24
556 0.31
557 0.36
558 0.42
559 0.43
560 0.48
561 0.53
562 0.61
563 0.64
564 0.65
565 0.64
566 0.61
567 0.59
568 0.53
569 0.49
570 0.4
571 0.33
572 0.3
573 0.31
574 0.29
575 0.31
576 0.33
577 0.29
578 0.28
579 0.26
580 0.23
581 0.16
582 0.15
583 0.14
584 0.12
585 0.12
586 0.11
587 0.11
588 0.14
589 0.14
590 0.19
591 0.23
592 0.23
593 0.29
594 0.4
595 0.49
596 0.55
597 0.65
598 0.67
599 0.69
600 0.75
601 0.76
602 0.7
603 0.62
604 0.54
605 0.44
606 0.37
607 0.3
608 0.23
609 0.17
610 0.13
611 0.12
612 0.1
613 0.1
614 0.09
615 0.07
616 0.06
617 0.07
618 0.07
619 0.08
620 0.09
621 0.09
622 0.1
623 0.14
624 0.18
625 0.27
626 0.3
627 0.32
628 0.33
629 0.35
630 0.41
631 0.39
632 0.41
633 0.41
634 0.46
635 0.45
636 0.45
637 0.43
638 0.37
639 0.35
640 0.29
641 0.2
642 0.11
643 0.12
644 0.13
645 0.13
646 0.13
647 0.12
648 0.12
649 0.13
650 0.14
651 0.12
652 0.11
653 0.09
654 0.1
655 0.11
656 0.11
657 0.12
658 0.13
659 0.14
660 0.17
661 0.22
662 0.27
663 0.3
664 0.31
665 0.32
666 0.33
667 0.35
668 0.38
669 0.43
670 0.46
671 0.52
672 0.56
673 0.59
674 0.55
675 0.52
676 0.5
677 0.42
678 0.36
679 0.29
680 0.24
681 0.2
682 0.22
683 0.23
684 0.23
685 0.24
686 0.23
687 0.23
688 0.3
689 0.3
690 0.33
691 0.32
692 0.32
693 0.38
694 0.38
695 0.36
696 0.31
697 0.28
698 0.23
699 0.23
700 0.2
701 0.13
702 0.15
703 0.17
704 0.19
705 0.19
706 0.2
707 0.19
708 0.19
709 0.17
710 0.15
711 0.14
712 0.12
713 0.12
714 0.14
715 0.14
716 0.13
717 0.13
718 0.12
719 0.1
720 0.12
721 0.17
722 0.18
723 0.18
724 0.19
725 0.22
726 0.25
727 0.3
728 0.29
729 0.27
730 0.25
731 0.26
732 0.24
733 0.21
734 0.18
735 0.14
736 0.13
737 0.12
738 0.11
739 0.12
740 0.13
741 0.14
742 0.16
743 0.2
744 0.26
745 0.25
746 0.28
747 0.36
748 0.45
749 0.48
750 0.47
751 0.45
752 0.41
753 0.47
754 0.55
755 0.53
756 0.47
757 0.47
758 0.53
759 0.57
760 0.62
761 0.6
762 0.54
763 0.52
764 0.54
765 0.59
766 0.53
767 0.51
768 0.5
769 0.54
770 0.54
771 0.49
772 0.45
773 0.39
774 0.42
775 0.42
776 0.37
777 0.29
778 0.27
779 0.27
780 0.25
781 0.22
782 0.17
783 0.21
784 0.19
785 0.17
786 0.2
787 0.2
788 0.24
789 0.31
790 0.36
791 0.32
792 0.38
793 0.4
794 0.42
795 0.45
796 0.42
797 0.36
798 0.33
799 0.3
800 0.24
801 0.24
802 0.18
803 0.14
804 0.15
805 0.18
806 0.18
807 0.18
808 0.16
809 0.15
810 0.18
811 0.21
812 0.23
813 0.23
814 0.23
815 0.3
816 0.33
817 0.36
818 0.36
819 0.34
820 0.32
821 0.31
822 0.31
823 0.24
824 0.21
825 0.17
826 0.15
827 0.14
828 0.13
829 0.12
830 0.1
831 0.11
832 0.12
833 0.17
834 0.19
835 0.22
836 0.22
837 0.21
838 0.22
839 0.25