Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q04673

Protein Details
Accession Q04673    Localization Confidence High Confidence Score 15.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
42-72QHSSSHRDRDKHVQRKKKKRLSNRNLQGSNGHydrophilic
100-122ASIVEARKKRTAKKNITPYQRGIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
52-62KHVQRKKKKRL
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 12.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR046349  C1-like_sf  
IPR007198  Ssl1-like  
IPR004595  TFIIH_C1-like_dom  
IPR012170  TFIIH_SSL1/p44  
IPR002035  VWF_A  
IPR036465  vWFA_dom_sf  
IPR013087  Znf_C2H2_type  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0000112  C:nucleotide-excision repair factor 3 complex  
GO:0000439  C:transcription factor TFIIH core complex  
GO:0005675  C:transcription factor TFIIH holo complex  
GO:0061630  F:ubiquitin protein ligase activity  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006289  P:nucleotide-excision repair  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
GO:0006366  P:transcription by RNA polymerase II  
GO:0006367  P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter  
KEGG sce:YLR005W  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF07975  C1_4  
PF04056  Ssl1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50234  VWFA  
CDD cd01453  vWA_transcription_factor_IIH_type  
Amino Acid Sequences MAPVVISESEEDEDRVAITRRTKRQVHFDGEGDDRVDQQQQQHSSSHRDRDKHVQRKKKKRLSNRNLQGSNGGYAWEDEIKRSWDLVKVDDEGDMASLVASIVEARKKRTAKKNITPYQRGIIRSLILTLDCSEAMLEKDLRPNRHAMIIQYAIDFVHEFFDQNPISQMGIIIMRNGLAQLVSQVSGNPQDHIDALKSIRKQEPKGNPSLQNALEMARGLLLPVPAHCTREVLIVFGSLSTTDPGDIHQTIDSLVSEKIRVKVLGLSAQVAICKELCKATNYGDESFYKILLDETHLKELFNEAVTPLPVNKINKGFTLVKMGFPTRIFEDTPTFCSCHSKLVYGGYFCPNCHSKVCSLPTVCPCCDLMLILSTHLARSYHHLMPLKTFAEVPTTEKFRSEDCFSCQSRFPILKNHKNGKLLTSSRYRCEDCKQEFCVDCDVFIHEILHNCPGCESKPVIT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.12
2 0.14
3 0.15
4 0.18
5 0.26
6 0.35
7 0.44
8 0.52
9 0.6
10 0.63
11 0.72
12 0.76
13 0.75
14 0.7
15 0.64
16 0.6
17 0.55
18 0.5
19 0.41
20 0.32
21 0.26
22 0.23
23 0.24
24 0.21
25 0.24
26 0.3
27 0.32
28 0.34
29 0.37
30 0.39
31 0.46
32 0.51
33 0.55
34 0.54
35 0.54
36 0.57
37 0.65
38 0.72
39 0.72
40 0.75
41 0.76
42 0.8
43 0.87
44 0.93
45 0.92
46 0.92
47 0.93
48 0.94
49 0.94
50 0.94
51 0.93
52 0.92
53 0.84
54 0.75
55 0.69
56 0.59
57 0.5
58 0.39
59 0.29
60 0.18
61 0.17
62 0.17
63 0.17
64 0.15
65 0.15
66 0.17
67 0.19
68 0.2
69 0.21
70 0.21
71 0.21
72 0.23
73 0.24
74 0.25
75 0.24
76 0.23
77 0.22
78 0.21
79 0.15
80 0.14
81 0.11
82 0.07
83 0.05
84 0.04
85 0.04
86 0.04
87 0.03
88 0.04
89 0.06
90 0.12
91 0.14
92 0.18
93 0.26
94 0.32
95 0.42
96 0.52
97 0.6
98 0.66
99 0.74
100 0.81
101 0.82
102 0.87
103 0.83
104 0.75
105 0.72
106 0.67
107 0.58
108 0.49
109 0.43
110 0.34
111 0.28
112 0.26
113 0.19
114 0.14
115 0.13
116 0.11
117 0.1
118 0.09
119 0.09
120 0.08
121 0.08
122 0.08
123 0.1
124 0.1
125 0.11
126 0.19
127 0.24
128 0.26
129 0.27
130 0.3
131 0.29
132 0.32
133 0.32
134 0.26
135 0.27
136 0.26
137 0.25
138 0.22
139 0.2
140 0.15
141 0.14
142 0.13
143 0.07
144 0.07
145 0.07
146 0.07
147 0.07
148 0.12
149 0.12
150 0.12
151 0.13
152 0.12
153 0.12
154 0.11
155 0.11
156 0.07
157 0.09
158 0.08
159 0.07
160 0.07
161 0.07
162 0.07
163 0.07
164 0.06
165 0.04
166 0.04
167 0.04
168 0.05
169 0.05
170 0.05
171 0.05
172 0.06
173 0.11
174 0.11
175 0.11
176 0.11
177 0.11
178 0.11
179 0.12
180 0.12
181 0.09
182 0.1
183 0.14
184 0.15
185 0.19
186 0.24
187 0.28
188 0.31
189 0.38
190 0.46
191 0.47
192 0.53
193 0.55
194 0.53
195 0.51
196 0.52
197 0.44
198 0.35
199 0.3
200 0.23
201 0.18
202 0.14
203 0.11
204 0.07
205 0.06
206 0.05
207 0.05
208 0.05
209 0.05
210 0.05
211 0.1
212 0.1
213 0.12
214 0.12
215 0.12
216 0.12
217 0.15
218 0.15
219 0.11
220 0.1
221 0.09
222 0.09
223 0.08
224 0.07
225 0.04
226 0.05
227 0.04
228 0.04
229 0.04
230 0.04
231 0.05
232 0.08
233 0.08
234 0.09
235 0.08
236 0.09
237 0.09
238 0.09
239 0.08
240 0.07
241 0.07
242 0.07
243 0.08
244 0.1
245 0.12
246 0.13
247 0.12
248 0.12
249 0.13
250 0.14
251 0.16
252 0.15
253 0.14
254 0.13
255 0.14
256 0.13
257 0.11
258 0.11
259 0.07
260 0.07
261 0.07
262 0.09
263 0.1
264 0.11
265 0.13
266 0.15
267 0.21
268 0.23
269 0.24
270 0.24
271 0.24
272 0.24
273 0.23
274 0.21
275 0.14
276 0.12
277 0.11
278 0.09
279 0.12
280 0.15
281 0.17
282 0.22
283 0.22
284 0.22
285 0.22
286 0.23
287 0.2
288 0.15
289 0.13
290 0.08
291 0.09
292 0.09
293 0.1
294 0.08
295 0.1
296 0.13
297 0.15
298 0.19
299 0.22
300 0.23
301 0.23
302 0.28
303 0.28
304 0.25
305 0.32
306 0.29
307 0.27
308 0.28
309 0.28
310 0.26
311 0.24
312 0.25
313 0.19
314 0.21
315 0.2
316 0.19
317 0.24
318 0.23
319 0.27
320 0.26
321 0.24
322 0.22
323 0.28
324 0.26
325 0.28
326 0.27
327 0.25
328 0.24
329 0.29
330 0.32
331 0.28
332 0.3
333 0.29
334 0.29
335 0.27
336 0.31
337 0.27
338 0.27
339 0.28
340 0.27
341 0.24
342 0.31
343 0.35
344 0.37
345 0.37
346 0.41
347 0.47
348 0.5
349 0.47
350 0.4
351 0.37
352 0.31
353 0.29
354 0.23
355 0.16
356 0.13
357 0.13
358 0.12
359 0.13
360 0.12
361 0.12
362 0.13
363 0.12
364 0.1
365 0.16
366 0.22
367 0.23
368 0.29
369 0.34
370 0.33
371 0.37
372 0.42
373 0.36
374 0.3
375 0.28
376 0.23
377 0.23
378 0.23
379 0.23
380 0.24
381 0.28
382 0.27
383 0.29
384 0.3
385 0.27
386 0.32
387 0.34
388 0.31
389 0.32
390 0.4
391 0.41
392 0.43
393 0.44
394 0.42
395 0.44
396 0.45
397 0.41
398 0.44
399 0.52
400 0.58
401 0.65
402 0.71
403 0.7
404 0.71
405 0.71
406 0.65
407 0.64
408 0.58
409 0.55
410 0.56
411 0.53
412 0.53
413 0.59
414 0.57
415 0.52
416 0.57
417 0.6
418 0.57
419 0.61
420 0.6
421 0.61
422 0.6
423 0.58
424 0.58
425 0.48
426 0.4
427 0.33
428 0.32
429 0.25
430 0.23
431 0.22
432 0.16
433 0.19
434 0.21
435 0.27
436 0.24
437 0.23
438 0.24
439 0.25
440 0.25
441 0.27