Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

P39959

Protein Details
Accession P39959    Localization Confidence Low Confidence Score 9.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
390-413GCEFCDRRFKRQEHLKRHVRSLHMBasic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 15, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036236  Znf_C2H2_sf  
IPR013087  Znf_C2H2_type  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0000987  F:cis-regulatory region sequence-specific DNA binding  
GO:0000981  F:DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0042594  P:response to starvation  
KEGG sce:YER130C  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00096  zf-C2H2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00028  ZINC_FINGER_C2H2_1  
PS50157  ZINC_FINGER_C2H2_2  
Amino Acid Sequences MSLYPLQRFESNDTVFSYTLNSKTELFNESRNNDKQHFTLQLIPNANANAKEIDNNNVEIINDLTGNTIVDNCVTTATSSNQLERRLSISDYRTENGNYYEYEFFGRRELNEPLFNNDIVENDDDIDLNNESDVLMVSDDELEVNERFSFLKQQPLDGLNRISSTNNLKNLEIHEFIIDPTENIDDELEDSFTTVPQSKKKVRDYFKLNIFGSSSSSNNNSNSLGCEPIQTENSSSQKMFKNRFFRSRKSTLIKSLPLEQENEVLINSGFDVSSNEESDESDHAIINPLKLVGNNKDISTQSIAKTTNPFKSGSDFKMIEPVSKFSNDSRKDLLAAISEPSSSPSPSAPSPSVQSSSSSHGLVVRKKTGSMQKTRGRKPSLIPDASKQFGCEFCDRRFKRQEHLKRHVRSLHMCEKPFTCHICNKNFSRSDNLNQHVKTHASL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.37
2 0.33
3 0.3
4 0.28
5 0.23
6 0.25
7 0.25
8 0.24
9 0.23
10 0.25
11 0.28
12 0.28
13 0.27
14 0.31
15 0.37
16 0.39
17 0.45
18 0.49
19 0.52
20 0.51
21 0.52
22 0.47
23 0.46
24 0.47
25 0.41
26 0.44
27 0.43
28 0.47
29 0.47
30 0.45
31 0.41
32 0.38
33 0.37
34 0.28
35 0.25
36 0.2
37 0.18
38 0.21
39 0.2
40 0.24
41 0.24
42 0.25
43 0.23
44 0.21
45 0.21
46 0.18
47 0.17
48 0.12
49 0.1
50 0.09
51 0.09
52 0.09
53 0.09
54 0.08
55 0.07
56 0.07
57 0.07
58 0.08
59 0.07
60 0.07
61 0.07
62 0.08
63 0.1
64 0.12
65 0.18
66 0.19
67 0.24
68 0.27
69 0.3
70 0.31
71 0.3
72 0.3
73 0.26
74 0.27
75 0.28
76 0.28
77 0.3
78 0.32
79 0.32
80 0.32
81 0.31
82 0.3
83 0.26
84 0.25
85 0.2
86 0.2
87 0.2
88 0.18
89 0.2
90 0.19
91 0.17
92 0.19
93 0.19
94 0.17
95 0.21
96 0.24
97 0.25
98 0.3
99 0.31
100 0.32
101 0.33
102 0.31
103 0.27
104 0.23
105 0.2
106 0.16
107 0.16
108 0.12
109 0.1
110 0.11
111 0.1
112 0.09
113 0.11
114 0.09
115 0.07
116 0.07
117 0.06
118 0.06
119 0.06
120 0.06
121 0.04
122 0.04
123 0.04
124 0.04
125 0.04
126 0.04
127 0.04
128 0.04
129 0.06
130 0.06
131 0.07
132 0.07
133 0.07
134 0.08
135 0.09
136 0.16
137 0.15
138 0.24
139 0.23
140 0.24
141 0.27
142 0.29
143 0.31
144 0.26
145 0.26
146 0.19
147 0.19
148 0.19
149 0.16
150 0.17
151 0.22
152 0.24
153 0.28
154 0.28
155 0.28
156 0.28
157 0.3
158 0.31
159 0.25
160 0.21
161 0.16
162 0.15
163 0.14
164 0.15
165 0.12
166 0.08
167 0.08
168 0.08
169 0.07
170 0.07
171 0.07
172 0.05
173 0.06
174 0.06
175 0.06
176 0.05
177 0.06
178 0.05
179 0.05
180 0.07
181 0.1
182 0.12
183 0.16
184 0.23
185 0.29
186 0.37
187 0.46
188 0.54
189 0.57
190 0.62
191 0.65
192 0.66
193 0.66
194 0.65
195 0.56
196 0.48
197 0.43
198 0.35
199 0.3
200 0.24
201 0.17
202 0.12
203 0.14
204 0.15
205 0.15
206 0.15
207 0.14
208 0.13
209 0.14
210 0.13
211 0.13
212 0.11
213 0.11
214 0.11
215 0.12
216 0.13
217 0.11
218 0.12
219 0.15
220 0.16
221 0.17
222 0.16
223 0.19
224 0.23
225 0.29
226 0.34
227 0.37
228 0.44
229 0.48
230 0.58
231 0.59
232 0.61
233 0.63
234 0.63
235 0.64
236 0.61
237 0.6
238 0.57
239 0.57
240 0.53
241 0.47
242 0.47
243 0.43
244 0.38
245 0.35
246 0.28
247 0.24
248 0.21
249 0.2
250 0.13
251 0.1
252 0.08
253 0.07
254 0.06
255 0.05
256 0.04
257 0.04
258 0.05
259 0.08
260 0.09
261 0.1
262 0.1
263 0.1
264 0.1
265 0.12
266 0.12
267 0.1
268 0.09
269 0.09
270 0.09
271 0.13
272 0.13
273 0.12
274 0.11
275 0.11
276 0.11
277 0.12
278 0.15
279 0.15
280 0.2
281 0.21
282 0.21
283 0.23
284 0.23
285 0.25
286 0.25
287 0.24
288 0.19
289 0.23
290 0.23
291 0.23
292 0.29
293 0.31
294 0.32
295 0.31
296 0.31
297 0.28
298 0.32
299 0.36
300 0.32
301 0.34
302 0.3
303 0.29
304 0.35
305 0.34
306 0.33
307 0.29
308 0.28
309 0.24
310 0.24
311 0.25
312 0.22
313 0.32
314 0.31
315 0.33
316 0.35
317 0.34
318 0.34
319 0.33
320 0.3
321 0.22
322 0.2
323 0.17
324 0.14
325 0.13
326 0.12
327 0.14
328 0.14
329 0.12
330 0.12
331 0.12
332 0.15
333 0.16
334 0.21
335 0.2
336 0.21
337 0.24
338 0.26
339 0.27
340 0.25
341 0.26
342 0.24
343 0.28
344 0.28
345 0.25
346 0.22
347 0.24
348 0.29
349 0.32
350 0.36
351 0.36
352 0.35
353 0.35
354 0.42
355 0.47
356 0.5
357 0.53
358 0.57
359 0.6
360 0.69
361 0.76
362 0.79
363 0.76
364 0.71
365 0.69
366 0.7
367 0.72
368 0.68
369 0.63
370 0.61
371 0.61
372 0.6
373 0.53
374 0.43
375 0.36
376 0.33
377 0.35
378 0.36
379 0.34
380 0.37
381 0.48
382 0.49
383 0.56
384 0.63
385 0.61
386 0.64
387 0.7
388 0.75
389 0.75
390 0.82
391 0.83
392 0.79
393 0.85
394 0.81
395 0.78
396 0.76
397 0.74
398 0.73
399 0.71
400 0.67
401 0.62
402 0.58
403 0.56
404 0.54
405 0.51
406 0.46
407 0.47
408 0.53
409 0.58
410 0.64
411 0.64
412 0.68
413 0.67
414 0.65
415 0.65
416 0.63
417 0.64
418 0.65
419 0.65
420 0.64
421 0.59
422 0.58
423 0.53