Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

P39875

Protein Details
Accession P39875    Localization Confidence High Confidence Score 15.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
80-107DAIPVKKSTESKRRDKRKENKAIAERLWHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
89-100ESKRRDKRKENK
Subcellular Location(s) nucl 18, mito 5, cyto 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036279  5-3_exonuclease_C_sf  
IPR037315  EXO1_H3TH  
IPR008918  HhH2  
IPR029060  PIN-like_dom_sf  
IPR044752  PIN-like_EXO1  
IPR006086  XPG-I_dom  
IPR006084  XPG/Rad2  
IPR019974  XPG_CS  
IPR006085  XPG_DNA_repair_N  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0035312  F:5'-3' DNA exonuclease activity  
GO:0008409  F:5'-3' exonuclease activity  
GO:0017108  F:5'-flap endonuclease activity  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0000729  P:DNA double-strand break processing  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0007534  P:gene conversion at mating-type locus  
GO:0000706  P:meiotic DNA double-strand break processing  
GO:0006298  P:mismatch repair  
GO:0044818  P:mitotic G2/M transition checkpoint  
GO:0000723  P:telomere maintenance  
GO:0031860  P:telomeric 3' overhang formation  
KEGG sce:YOR033C  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00867  XPG_I  
PF00752  XPG_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00841  XPG_1  
PS00842  XPG_2  
CDD cd09908  H3TH_EXO1  
cd09857  PIN_EXO1  
Amino Acid Sequences MGIQGLLPQLKPIQNPVSLRRYEGEVLAIDGYAWLHRAACSCAYELAMGKPTDKYLQFFIKRFSLLKTFKVEPYLVFDGDAIPVKKSTESKRRDKRKENKAIAERLWACGEKKNAMDYFQKCVDITPEMAKCIICYCKLNGIRYIVAPFEADSQMVYLEQKNIVQGIISEDSDLLVFGCRRLITKLNDYGECLEICRDNFIKLPKKFPLGSLTNEEIITMVCLSGCDYTNGIPKVGLITAMKLVRRFNTIERIILSIQREGKLMIPDTYINEYEAAVLAFQFQRVFCPIRKKIVSLNEIPLYLKDTESKRKRLYACIGFVIHRETQKKQIVHFDDDIDHHLHLKIAQGDLNPYDFHQPLANREHKLQLASKSNIEFGKTNTTNSEAKVKPIESFFQKMTKLDHNPKVANNIHSLRQAEDKLTMAIKRRKLSNANVVQETLKDTRSKFFNKPSMTVVENFKEKGDSIQDFKEDTNSQSLEEPVSESQLSTQIPSSFITTNLEDDDNLSEEVSEVVSDIEEDRKNSEGKTIGNEIYNTDDDGDGDTSEDYSETAESRVPTSSTTSFPGSSQRSISGCTKVLQKFRYSSSFSGVNANRQPLFPRHVNQKSRGMVYVNQNRDDDCDDNDGKNQITQRPSLRKSLIGARSQRIVIDMKSVDERKSFNSSPILHEESKKRDIETTKSSQARPAVRSISLLSQFVYKGK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.36
2 0.42
3 0.47
4 0.51
5 0.48
6 0.5
7 0.45
8 0.45
9 0.41
10 0.36
11 0.31
12 0.23
13 0.24
14 0.21
15 0.18
16 0.13
17 0.11
18 0.11
19 0.08
20 0.08
21 0.07
22 0.08
23 0.09
24 0.12
25 0.15
26 0.18
27 0.19
28 0.2
29 0.2
30 0.2
31 0.21
32 0.2
33 0.2
34 0.23
35 0.21
36 0.21
37 0.21
38 0.23
39 0.28
40 0.28
41 0.28
42 0.28
43 0.38
44 0.43
45 0.44
46 0.47
47 0.45
48 0.46
49 0.45
50 0.43
51 0.43
52 0.4
53 0.43
54 0.45
55 0.44
56 0.44
57 0.47
58 0.43
59 0.34
60 0.38
61 0.36
62 0.3
63 0.26
64 0.24
65 0.2
66 0.21
67 0.25
68 0.18
69 0.15
70 0.16
71 0.17
72 0.21
73 0.27
74 0.34
75 0.39
76 0.48
77 0.57
78 0.67
79 0.78
80 0.85
81 0.89
82 0.9
83 0.91
84 0.93
85 0.92
86 0.92
87 0.89
88 0.86
89 0.77
90 0.76
91 0.66
92 0.58
93 0.51
94 0.43
95 0.36
96 0.34
97 0.36
98 0.3
99 0.31
100 0.34
101 0.32
102 0.33
103 0.4
104 0.37
105 0.4
106 0.38
107 0.38
108 0.32
109 0.31
110 0.3
111 0.24
112 0.24
113 0.24
114 0.23
115 0.22
116 0.23
117 0.22
118 0.2
119 0.21
120 0.22
121 0.18
122 0.2
123 0.21
124 0.29
125 0.34
126 0.37
127 0.37
128 0.37
129 0.36
130 0.35
131 0.35
132 0.26
133 0.21
134 0.19
135 0.15
136 0.14
137 0.13
138 0.11
139 0.1
140 0.1
141 0.09
142 0.09
143 0.1
144 0.08
145 0.1
146 0.11
147 0.12
148 0.12
149 0.12
150 0.12
151 0.1
152 0.09
153 0.12
154 0.12
155 0.12
156 0.12
157 0.11
158 0.11
159 0.11
160 0.11
161 0.06
162 0.07
163 0.07
164 0.07
165 0.09
166 0.09
167 0.11
168 0.14
169 0.2
170 0.23
171 0.3
172 0.37
173 0.39
174 0.39
175 0.39
176 0.38
177 0.34
178 0.29
179 0.22
180 0.17
181 0.15
182 0.14
183 0.17
184 0.16
185 0.15
186 0.18
187 0.26
188 0.34
189 0.35
190 0.41
191 0.41
192 0.45
193 0.45
194 0.44
195 0.43
196 0.37
197 0.38
198 0.38
199 0.36
200 0.32
201 0.31
202 0.29
203 0.21
204 0.17
205 0.14
206 0.08
207 0.06
208 0.04
209 0.04
210 0.05
211 0.06
212 0.07
213 0.07
214 0.08
215 0.1
216 0.16
217 0.17
218 0.16
219 0.15
220 0.14
221 0.15
222 0.14
223 0.14
224 0.08
225 0.08
226 0.12
227 0.14
228 0.16
229 0.16
230 0.18
231 0.18
232 0.21
233 0.22
234 0.22
235 0.28
236 0.28
237 0.28
238 0.27
239 0.28
240 0.26
241 0.27
242 0.25
243 0.2
244 0.21
245 0.2
246 0.19
247 0.17
248 0.19
249 0.18
250 0.18
251 0.15
252 0.14
253 0.14
254 0.16
255 0.18
256 0.15
257 0.13
258 0.12
259 0.11
260 0.1
261 0.1
262 0.08
263 0.05
264 0.04
265 0.06
266 0.05
267 0.06
268 0.07
269 0.06
270 0.08
271 0.11
272 0.14
273 0.16
274 0.26
275 0.28
276 0.35
277 0.37
278 0.37
279 0.4
280 0.45
281 0.46
282 0.4
283 0.41
284 0.34
285 0.34
286 0.32
287 0.26
288 0.21
289 0.17
290 0.14
291 0.14
292 0.17
293 0.27
294 0.33
295 0.4
296 0.4
297 0.46
298 0.48
299 0.5
300 0.54
301 0.5
302 0.46
303 0.42
304 0.4
305 0.34
306 0.32
307 0.29
308 0.23
309 0.21
310 0.21
311 0.2
312 0.28
313 0.33
314 0.34
315 0.32
316 0.39
317 0.39
318 0.4
319 0.4
320 0.33
321 0.28
322 0.27
323 0.27
324 0.2
325 0.16
326 0.12
327 0.11
328 0.1
329 0.09
330 0.11
331 0.09
332 0.09
333 0.1
334 0.09
335 0.1
336 0.11
337 0.11
338 0.09
339 0.09
340 0.11
341 0.1
342 0.1
343 0.12
344 0.12
345 0.15
346 0.22
347 0.26
348 0.24
349 0.26
350 0.28
351 0.26
352 0.28
353 0.27
354 0.25
355 0.28
356 0.28
357 0.29
358 0.27
359 0.29
360 0.27
361 0.25
362 0.2
363 0.15
364 0.23
365 0.22
366 0.22
367 0.2
368 0.23
369 0.23
370 0.23
371 0.3
372 0.2
373 0.22
374 0.24
375 0.24
376 0.22
377 0.22
378 0.24
379 0.19
380 0.22
381 0.21
382 0.22
383 0.23
384 0.22
385 0.24
386 0.28
387 0.32
388 0.37
389 0.42
390 0.43
391 0.44
392 0.44
393 0.48
394 0.44
395 0.39
396 0.36
397 0.32
398 0.29
399 0.3
400 0.3
401 0.24
402 0.25
403 0.23
404 0.19
405 0.18
406 0.16
407 0.15
408 0.15
409 0.16
410 0.21
411 0.26
412 0.31
413 0.33
414 0.35
415 0.4
416 0.44
417 0.48
418 0.5
419 0.52
420 0.5
421 0.48
422 0.46
423 0.4
424 0.35
425 0.33
426 0.24
427 0.18
428 0.17
429 0.17
430 0.2
431 0.26
432 0.31
433 0.32
434 0.39
435 0.46
436 0.46
437 0.47
438 0.46
439 0.43
440 0.4
441 0.37
442 0.33
443 0.28
444 0.27
445 0.25
446 0.23
447 0.2
448 0.18
449 0.18
450 0.18
451 0.17
452 0.18
453 0.2
454 0.21
455 0.21
456 0.21
457 0.24
458 0.2
459 0.19
460 0.2
461 0.19
462 0.18
463 0.18
464 0.19
465 0.15
466 0.14
467 0.14
468 0.1
469 0.12
470 0.11
471 0.1
472 0.1
473 0.13
474 0.13
475 0.12
476 0.14
477 0.12
478 0.13
479 0.14
480 0.16
481 0.14
482 0.14
483 0.16
484 0.15
485 0.15
486 0.16
487 0.15
488 0.12
489 0.13
490 0.13
491 0.12
492 0.11
493 0.1
494 0.08
495 0.08
496 0.08
497 0.07
498 0.05
499 0.04
500 0.04
501 0.04
502 0.04
503 0.05
504 0.1
505 0.11
506 0.12
507 0.14
508 0.16
509 0.17
510 0.17
511 0.21
512 0.19
513 0.19
514 0.23
515 0.25
516 0.25
517 0.26
518 0.26
519 0.23
520 0.24
521 0.23
522 0.18
523 0.15
524 0.13
525 0.12
526 0.13
527 0.13
528 0.08
529 0.09
530 0.08
531 0.08
532 0.08
533 0.07
534 0.06
535 0.06
536 0.06
537 0.06
538 0.07
539 0.09
540 0.1
541 0.11
542 0.13
543 0.12
544 0.13
545 0.17
546 0.19
547 0.19
548 0.21
549 0.23
550 0.22
551 0.22
552 0.29
553 0.28
554 0.29
555 0.28
556 0.29
557 0.27
558 0.31
559 0.33
560 0.3
561 0.28
562 0.28
563 0.35
564 0.37
565 0.43
566 0.43
567 0.44
568 0.44
569 0.47
570 0.51
571 0.48
572 0.44
573 0.41
574 0.4
575 0.36
576 0.41
577 0.38
578 0.39
579 0.38
580 0.41
581 0.37
582 0.35
583 0.39
584 0.35
585 0.4
586 0.37
587 0.4
588 0.46
589 0.55
590 0.61
591 0.63
592 0.67
593 0.65
594 0.62
595 0.59
596 0.51
597 0.47
598 0.51
599 0.54
600 0.51
601 0.49
602 0.47
603 0.45
604 0.45
605 0.43
606 0.35
607 0.28
608 0.3
609 0.28
610 0.29
611 0.32
612 0.31
613 0.27
614 0.28
615 0.3
616 0.29
617 0.31
618 0.35
619 0.41
620 0.49
621 0.52
622 0.57
623 0.55
624 0.52
625 0.52
626 0.56
627 0.54
628 0.53
629 0.56
630 0.51
631 0.53
632 0.5
633 0.46
634 0.39
635 0.35
636 0.27
637 0.28
638 0.25
639 0.23
640 0.31
641 0.33
642 0.32
643 0.33
644 0.34
645 0.32
646 0.4
647 0.38
648 0.35
649 0.41
650 0.4
651 0.43
652 0.47
653 0.49
654 0.44
655 0.5
656 0.53
657 0.53
658 0.58
659 0.54
660 0.49
661 0.5
662 0.52
663 0.53
664 0.54
665 0.54
666 0.56
667 0.6
668 0.6
669 0.58
670 0.6
671 0.6
672 0.54
673 0.54
674 0.48
675 0.43
676 0.45
677 0.42
678 0.42
679 0.38
680 0.35
681 0.29
682 0.28