Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

P27476

Protein Details
Accession P27476    Localization Confidence High Confidence Score 15.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-27MAKTTKVKGNKKEVKASKQAKEEKAKAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
8-22KGNKKEVKASKQAKE
353-387RGGSRGFGGRGGGRGGNRGFGGRGGARGGRGGFRP
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 13, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR034276  Gar2_RRM2  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0005739  C:mitochondrion  
GO:0005635  C:nuclear envelope  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0032040  C:small-subunit processome  
GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0008139  F:nuclear localization sequence binding  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0043047  F:single-stranded telomeric DNA binding  
GO:0030490  P:maturation of SSU-rRNA  
GO:0048255  P:mRNA stabilization  
GO:0000381  P:regulation of alternative mRNA splicing, via spliceosome  
GO:0000028  P:ribosomal small subunit assembly  
GO:0006364  P:rRNA processing  
KEGG sce:YGR159C  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12447  RRM1_gar2  
cd12448  RRM2_gar2  
Amino Acid Sequences MAKTTKVKGNKKEVKASKQAKEEKAKAVSSSSSESSSSSSSSSESESESESESESSSSSSSSDSESSSSSSSDSESEAETKKEESKDSSSSSSDSSSDEEEEEEKEETKKEESKESSSSDSSSSSSSDSESEKEESNDKKRKSEDAEEEEDEESSNKKQKNEETEEPATIFVGRLSWSIDDEWLKKEFEHIGGVIGARVIYERGTDRSRGYGYVDFENKSYAEKAIQEMQGKEIDGRPINCDMSTSKPAGNNDRAKKFGDTPSEPSDTLFLGNLSFNADRDAIFELFAKHGEVVSVRIPTHPETEQPKGFGYVQFSNMEDAKKALDALQGEYIDNRPVRLDFSSPRPNNDGGRGGSRGFGGRGGGRGGNRGFGGRGGARGGRGGFRPSGSGANTAPLGRSRNTASFAGSKKTFD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.83
2 0.85
3 0.84
4 0.81
5 0.81
6 0.83
7 0.81
8 0.82
9 0.79
10 0.77
11 0.74
12 0.67
13 0.59
14 0.53
15 0.46
16 0.39
17 0.38
18 0.31
19 0.27
20 0.26
21 0.25
22 0.24
23 0.23
24 0.2
25 0.16
26 0.15
27 0.14
28 0.15
29 0.16
30 0.15
31 0.16
32 0.16
33 0.17
34 0.17
35 0.18
36 0.17
37 0.16
38 0.15
39 0.14
40 0.13
41 0.11
42 0.11
43 0.09
44 0.09
45 0.09
46 0.09
47 0.09
48 0.12
49 0.13
50 0.13
51 0.14
52 0.14
53 0.16
54 0.15
55 0.15
56 0.13
57 0.12
58 0.13
59 0.12
60 0.12
61 0.11
62 0.12
63 0.16
64 0.17
65 0.17
66 0.17
67 0.19
68 0.23
69 0.25
70 0.26
71 0.27
72 0.3
73 0.33
74 0.36
75 0.37
76 0.33
77 0.32
78 0.31
79 0.27
80 0.23
81 0.2
82 0.18
83 0.16
84 0.15
85 0.14
86 0.14
87 0.13
88 0.14
89 0.14
90 0.13
91 0.13
92 0.13
93 0.14
94 0.15
95 0.18
96 0.23
97 0.23
98 0.31
99 0.33
100 0.37
101 0.39
102 0.4
103 0.4
104 0.36
105 0.35
106 0.28
107 0.25
108 0.21
109 0.18
110 0.16
111 0.13
112 0.12
113 0.12
114 0.13
115 0.13
116 0.13
117 0.15
118 0.16
119 0.16
120 0.17
121 0.22
122 0.27
123 0.35
124 0.42
125 0.42
126 0.45
127 0.47
128 0.52
129 0.53
130 0.55
131 0.54
132 0.52
133 0.56
134 0.51
135 0.5
136 0.44
137 0.37
138 0.28
139 0.2
140 0.15
141 0.12
142 0.17
143 0.18
144 0.2
145 0.25
146 0.31
147 0.4
148 0.46
149 0.49
150 0.51
151 0.5
152 0.49
153 0.44
154 0.39
155 0.29
156 0.21
157 0.16
158 0.08
159 0.06
160 0.06
161 0.06
162 0.07
163 0.07
164 0.08
165 0.08
166 0.1
167 0.11
168 0.12
169 0.14
170 0.15
171 0.15
172 0.14
173 0.16
174 0.15
175 0.14
176 0.14
177 0.11
178 0.1
179 0.1
180 0.1
181 0.08
182 0.07
183 0.05
184 0.04
185 0.04
186 0.04
187 0.03
188 0.04
189 0.06
190 0.09
191 0.11
192 0.12
193 0.13
194 0.15
195 0.16
196 0.15
197 0.17
198 0.17
199 0.18
200 0.2
201 0.22
202 0.2
203 0.19
204 0.2
205 0.17
206 0.15
207 0.13
208 0.1
209 0.09
210 0.09
211 0.11
212 0.15
213 0.18
214 0.19
215 0.19
216 0.2
217 0.19
218 0.19
219 0.18
220 0.15
221 0.15
222 0.15
223 0.16
224 0.16
225 0.18
226 0.18
227 0.17
228 0.17
229 0.15
230 0.18
231 0.2
232 0.2
233 0.2
234 0.22
235 0.25
236 0.3
237 0.36
238 0.39
239 0.44
240 0.46
241 0.46
242 0.45
243 0.45
244 0.43
245 0.4
246 0.4
247 0.36
248 0.38
249 0.41
250 0.41
251 0.39
252 0.34
253 0.3
254 0.22
255 0.19
256 0.14
257 0.09
258 0.07
259 0.07
260 0.07
261 0.09
262 0.09
263 0.09
264 0.1
265 0.11
266 0.1
267 0.11
268 0.14
269 0.11
270 0.11
271 0.12
272 0.12
273 0.12
274 0.12
275 0.12
276 0.08
277 0.08
278 0.08
279 0.08
280 0.09
281 0.11
282 0.13
283 0.12
284 0.13
285 0.16
286 0.17
287 0.21
288 0.19
289 0.23
290 0.26
291 0.33
292 0.33
293 0.33
294 0.32
295 0.31
296 0.31
297 0.28
298 0.27
299 0.23
300 0.25
301 0.24
302 0.24
303 0.24
304 0.24
305 0.23
306 0.18
307 0.15
308 0.13
309 0.12
310 0.12
311 0.11
312 0.12
313 0.13
314 0.14
315 0.18
316 0.17
317 0.17
318 0.18
319 0.18
320 0.2
321 0.19
322 0.18
323 0.15
324 0.15
325 0.18
326 0.19
327 0.22
328 0.21
329 0.3
330 0.4
331 0.41
332 0.45
333 0.46
334 0.47
335 0.46
336 0.47
337 0.44
338 0.36
339 0.38
340 0.36
341 0.32
342 0.3
343 0.28
344 0.25
345 0.2
346 0.18
347 0.16
348 0.15
349 0.16
350 0.18
351 0.2
352 0.19
353 0.24
354 0.24
355 0.24
356 0.23
357 0.23
358 0.21
359 0.18
360 0.22
361 0.17
362 0.18
363 0.19
364 0.2
365 0.19
366 0.21
367 0.22
368 0.21
369 0.23
370 0.25
371 0.24
372 0.24
373 0.25
374 0.25
375 0.28
376 0.26
377 0.27
378 0.24
379 0.24
380 0.25
381 0.23
382 0.23
383 0.22
384 0.25
385 0.22
386 0.26
387 0.28
388 0.31
389 0.35
390 0.34
391 0.34
392 0.38
393 0.4
394 0.44