Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

P19736

Protein Details
Accession P19736    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
54-81IAENKIYKFKKVKRKRKQIILQQHEINIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
61-70KFKKVKRKRK
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000690  Matrin/U1-C_Znf_C2H2  
IPR003604  Matrin/U1-like-C_Znf_C2H2  
IPR031590  PRP9_N  
IPR031774  SF3A3_dom  
IPR024598  SF3a60/Prp9_C  
IPR022755  Znf_C2H2_jaz  
IPR036236  Znf_C2H2_sf  
IPR013087  Znf_C2H2_type  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0005686  C:U2 snRNP  
GO:0071004  C:U2-type prespliceosome  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0000395  P:mRNA 5'-splice site recognition  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
GO:1903241  P:U2-type prespliceosome assembly  
KEGG sce:YDL030W  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF16958  PRP9_N  
PF16837  SF3A3  
PF11931  SF3a60_Prp9_C  
PF12171  zf-C2H2_jaz  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50171  ZF_MATRIN  
Amino Acid Sequences MNLLETRRSLLEEMEIIENAIAERIQRNPELYYHYIQESSKVFPDTKLPRSSLIAENKIYKFKKVKRKRKQIILQQHEINIFLRDYQEKQQTFNKINRPEETQEDDKDLPNFERKLQQLEKELKNEDENFELDINSKKDKYALFSSSSDPSRRTNILSDRARDLDLNEIFTRDEQYGEYMELEQFHSLWLNVIKRGDCSLLQFLDILELFLDDEKYLLTPPMDRKNDRYMAFLLKLSKYVETFFFKSYALLDAAAVENLIKSDFEHSYCRGSLRSEAKGIYCPFCSRWFKTSSVFESHLVGKIHKKNESKRRNFVYSEYKLHRYLKYLNDEFSRTRSFVERKLAFTANERMAEMDILTQKYEAPAYDSTEKEGAEQVDGEQRDGQLQEEHLSGKSFDMPLGPDGLPMPYWLYKLHGLDREYRCEICSNKVYNGRRTFERHFNEERHIYHLRCLGIEPSSVFKGITKIKEAQELWKNMQGQSQLTSIAAVPPKPNPSQLKVPTELELEEEDEEGNVMSKKVYDELKKQGLV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.19
3 0.17
4 0.16
5 0.15
6 0.11
7 0.11
8 0.08
9 0.08
10 0.1
11 0.14
12 0.19
13 0.21
14 0.23
15 0.24
16 0.28
17 0.33
18 0.36
19 0.35
20 0.34
21 0.34
22 0.34
23 0.32
24 0.34
25 0.29
26 0.28
27 0.29
28 0.28
29 0.27
30 0.25
31 0.35
32 0.38
33 0.43
34 0.45
35 0.43
36 0.43
37 0.46
38 0.5
39 0.48
40 0.49
41 0.47
42 0.45
43 0.51
44 0.51
45 0.56
46 0.53
47 0.52
48 0.53
49 0.57
50 0.65
51 0.69
52 0.77
53 0.79
54 0.9
55 0.92
56 0.93
57 0.94
58 0.94
59 0.94
60 0.91
61 0.88
62 0.8
63 0.73
64 0.63
65 0.54
66 0.44
67 0.34
68 0.26
69 0.19
70 0.18
71 0.17
72 0.2
73 0.26
74 0.34
75 0.33
76 0.37
77 0.43
78 0.48
79 0.51
80 0.55
81 0.56
82 0.56
83 0.6
84 0.59
85 0.59
86 0.55
87 0.55
88 0.55
89 0.5
90 0.44
91 0.44
92 0.42
93 0.38
94 0.35
95 0.32
96 0.27
97 0.3
98 0.29
99 0.27
100 0.32
101 0.32
102 0.39
103 0.41
104 0.43
105 0.45
106 0.52
107 0.55
108 0.53
109 0.54
110 0.47
111 0.47
112 0.44
113 0.37
114 0.31
115 0.26
116 0.22
117 0.2
118 0.18
119 0.15
120 0.18
121 0.19
122 0.2
123 0.2
124 0.19
125 0.22
126 0.23
127 0.26
128 0.28
129 0.28
130 0.29
131 0.3
132 0.33
133 0.35
134 0.37
135 0.34
136 0.3
137 0.29
138 0.3
139 0.3
140 0.29
141 0.3
142 0.34
143 0.41
144 0.44
145 0.44
146 0.43
147 0.43
148 0.41
149 0.35
150 0.29
151 0.28
152 0.23
153 0.24
154 0.2
155 0.19
156 0.19
157 0.19
158 0.2
159 0.12
160 0.12
161 0.09
162 0.1
163 0.1
164 0.1
165 0.11
166 0.09
167 0.1
168 0.1
169 0.1
170 0.09
171 0.08
172 0.08
173 0.07
174 0.07
175 0.08
176 0.1
177 0.11
178 0.13
179 0.15
180 0.15
181 0.16
182 0.17
183 0.17
184 0.14
185 0.16
186 0.17
187 0.15
188 0.15
189 0.14
190 0.13
191 0.13
192 0.12
193 0.09
194 0.05
195 0.05
196 0.05
197 0.05
198 0.05
199 0.04
200 0.04
201 0.04
202 0.04
203 0.05
204 0.05
205 0.05
206 0.09
207 0.14
208 0.24
209 0.29
210 0.3
211 0.34
212 0.41
213 0.47
214 0.44
215 0.42
216 0.35
217 0.33
218 0.33
219 0.31
220 0.26
221 0.2
222 0.21
223 0.19
224 0.17
225 0.14
226 0.14
227 0.15
228 0.17
229 0.18
230 0.18
231 0.18
232 0.17
233 0.17
234 0.16
235 0.14
236 0.1
237 0.08
238 0.07
239 0.07
240 0.07
241 0.07
242 0.06
243 0.04
244 0.04
245 0.04
246 0.04
247 0.03
248 0.03
249 0.06
250 0.07
251 0.09
252 0.11
253 0.12
254 0.15
255 0.15
256 0.16
257 0.14
258 0.14
259 0.19
260 0.21
261 0.22
262 0.21
263 0.22
264 0.21
265 0.26
266 0.26
267 0.22
268 0.18
269 0.18
270 0.18
271 0.25
272 0.29
273 0.27
274 0.3
275 0.32
276 0.33
277 0.35
278 0.38
279 0.35
280 0.34
281 0.33
282 0.29
283 0.28
284 0.27
285 0.27
286 0.23
287 0.2
288 0.23
289 0.27
290 0.31
291 0.35
292 0.41
293 0.46
294 0.57
295 0.66
296 0.67
297 0.7
298 0.73
299 0.71
300 0.66
301 0.62
302 0.61
303 0.55
304 0.55
305 0.5
306 0.47
307 0.46
308 0.48
309 0.44
310 0.38
311 0.39
312 0.38
313 0.43
314 0.41
315 0.39
316 0.38
317 0.4
318 0.37
319 0.35
320 0.31
321 0.23
322 0.23
323 0.26
324 0.27
325 0.29
326 0.38
327 0.36
328 0.36
329 0.39
330 0.4
331 0.34
332 0.35
333 0.36
334 0.29
335 0.28
336 0.25
337 0.21
338 0.2
339 0.19
340 0.15
341 0.12
342 0.12
343 0.12
344 0.12
345 0.11
346 0.11
347 0.12
348 0.12
349 0.09
350 0.1
351 0.11
352 0.15
353 0.2
354 0.2
355 0.22
356 0.23
357 0.23
358 0.2
359 0.21
360 0.17
361 0.13
362 0.13
363 0.12
364 0.16
365 0.16
366 0.16
367 0.14
368 0.14
369 0.15
370 0.15
371 0.15
372 0.11
373 0.12
374 0.13
375 0.13
376 0.14
377 0.12
378 0.13
379 0.12
380 0.11
381 0.13
382 0.12
383 0.11
384 0.11
385 0.12
386 0.12
387 0.15
388 0.14
389 0.12
390 0.13
391 0.13
392 0.12
393 0.11
394 0.13
395 0.11
396 0.12
397 0.12
398 0.15
399 0.18
400 0.21
401 0.26
402 0.29
403 0.3
404 0.38
405 0.42
406 0.45
407 0.44
408 0.42
409 0.38
410 0.37
411 0.37
412 0.35
413 0.39
414 0.35
415 0.39
416 0.47
417 0.52
418 0.56
419 0.62
420 0.59
421 0.57
422 0.6
423 0.61
424 0.62
425 0.62
426 0.6
427 0.59
428 0.59
429 0.61
430 0.59
431 0.54
432 0.5
433 0.5
434 0.44
435 0.42
436 0.42
437 0.36
438 0.3
439 0.3
440 0.26
441 0.22
442 0.23
443 0.19
444 0.19
445 0.19
446 0.19
447 0.18
448 0.16
449 0.21
450 0.26
451 0.28
452 0.3
453 0.34
454 0.36
455 0.44
456 0.45
457 0.47
458 0.5
459 0.51
460 0.51
461 0.5
462 0.5
463 0.43
464 0.46
465 0.4
466 0.33
467 0.3
468 0.27
469 0.22
470 0.19
471 0.19
472 0.15
473 0.18
474 0.19
475 0.19
476 0.2
477 0.24
478 0.3
479 0.31
480 0.39
481 0.4
482 0.44
483 0.52
484 0.57
485 0.6
486 0.59
487 0.59
488 0.54
489 0.49
490 0.43
491 0.35
492 0.29
493 0.23
494 0.19
495 0.17
496 0.14
497 0.12
498 0.12
499 0.09
500 0.1
501 0.09
502 0.09
503 0.09
504 0.1
505 0.12
506 0.17
507 0.24
508 0.29
509 0.36
510 0.45