Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

P53235

Protein Details
Accession P53235    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
541-568MSANKDANTKNRRRRANKKSSETSPDSTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
501-533KAKAGGAYKPPHARRTGGGRIVPGVPPGAAKKT
547-559ANTKNRRRRANKK
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 12, cyto 7.5, mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011387  TIF2A  
IPR013979  TIF_beta_prop-like  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
Gene Ontology GO:0022626  C:cytosolic ribosome  
GO:0022627  C:cytosolic small ribosomal subunit  
GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0043022  F:ribosome binding  
GO:0003743  F:translation initiation factor activity  
GO:0000049  F:tRNA binding  
GO:0006413  P:translational initiation  
KEGG sce:YGR054W  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08662  eIF2A  
Amino Acid Sequences MSSQFFLKTSQDIELFQSYPTFEQSNTNSKDFPVISSVLSPCGRFLALSTKENVKVFTGPCLDNVLLTMKLSDVYDLHFSPAGNYLSTWERASIQDPNHKNVKVWYLNKPFKKDCVSEDIVPAYEYQAKSQSGWFLQFSKLDNYGLRLFKHDLKIVKLSSANADNFDFQSPFAVLSDDETSQHFTTYLISPAEHPTICTFTPEKGGKPAQLIIWALSEGKITKKIASKTFFKADSCQLKWNPLGNAILCLAITDFDSSNKSYYGENTLYLLSFQGVNGTLGGNSVRVSLTTGPVHDFTWSPTSRQFGVIAGYMPATISFFDLRGNVVHSLPQQAKNTMLFSPSGHYILIAGFGNLQGSVEILDRLDKFKCVSKFDATNTSVCKWSPGGEFIMTATTSPRLRVDNGVKIWHVSGSLVFVKEFKELLKVDWRSPCNYKTLENKDEAFFENHIINNWEPLPDSTTSSLDPKISNKSELQIHSSVQEYISQHPSREASSNGNGSKAKAGGAYKPPHARRTGGGRIVPGVPPGAAKKTIPGLVPGMSANKDANTKNRRRRANKKSSETSPDSTPAPSAPASTNAPTNNKETSPEEKKIRSLLKKLRAIETLKERQAVGDKLEDTQVLKIQTEEKVLKDLEKLGWKDE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.29
2 0.27
3 0.24
4 0.23
5 0.21
6 0.2
7 0.22
8 0.19
9 0.16
10 0.22
11 0.27
12 0.36
13 0.39
14 0.41
15 0.38
16 0.37
17 0.43
18 0.36
19 0.33
20 0.27
21 0.23
22 0.22
23 0.26
24 0.26
25 0.25
26 0.26
27 0.24
28 0.21
29 0.21
30 0.2
31 0.16
32 0.17
33 0.21
34 0.25
35 0.27
36 0.31
37 0.34
38 0.39
39 0.4
40 0.39
41 0.32
42 0.32
43 0.3
44 0.33
45 0.33
46 0.29
47 0.29
48 0.32
49 0.29
50 0.24
51 0.25
52 0.21
53 0.16
54 0.16
55 0.15
56 0.1
57 0.11
58 0.11
59 0.11
60 0.09
61 0.11
62 0.15
63 0.15
64 0.17
65 0.17
66 0.17
67 0.17
68 0.22
69 0.2
70 0.17
71 0.16
72 0.17
73 0.19
74 0.22
75 0.21
76 0.16
77 0.17
78 0.18
79 0.22
80 0.25
81 0.27
82 0.35
83 0.38
84 0.43
85 0.48
86 0.47
87 0.45
88 0.43
89 0.47
90 0.46
91 0.48
92 0.53
93 0.56
94 0.65
95 0.7
96 0.73
97 0.67
98 0.65
99 0.67
100 0.59
101 0.53
102 0.53
103 0.52
104 0.46
105 0.45
106 0.4
107 0.34
108 0.31
109 0.27
110 0.2
111 0.2
112 0.18
113 0.17
114 0.2
115 0.21
116 0.21
117 0.23
118 0.25
119 0.22
120 0.24
121 0.24
122 0.21
123 0.23
124 0.25
125 0.25
126 0.25
127 0.24
128 0.24
129 0.22
130 0.24
131 0.28
132 0.29
133 0.27
134 0.27
135 0.29
136 0.33
137 0.37
138 0.37
139 0.34
140 0.35
141 0.4
142 0.36
143 0.37
144 0.32
145 0.29
146 0.28
147 0.3
148 0.27
149 0.23
150 0.24
151 0.22
152 0.21
153 0.22
154 0.18
155 0.13
156 0.14
157 0.12
158 0.11
159 0.1
160 0.09
161 0.07
162 0.1
163 0.12
164 0.11
165 0.11
166 0.12
167 0.16
168 0.15
169 0.15
170 0.13
171 0.11
172 0.13
173 0.14
174 0.16
175 0.12
176 0.12
177 0.14
178 0.17
179 0.2
180 0.17
181 0.17
182 0.15
183 0.18
184 0.18
185 0.2
186 0.17
187 0.15
188 0.24
189 0.25
190 0.24
191 0.27
192 0.3
193 0.28
194 0.29
195 0.3
196 0.22
197 0.23
198 0.22
199 0.17
200 0.15
201 0.14
202 0.12
203 0.1
204 0.1
205 0.08
206 0.09
207 0.13
208 0.13
209 0.17
210 0.22
211 0.27
212 0.34
213 0.38
214 0.41
215 0.42
216 0.47
217 0.45
218 0.4
219 0.39
220 0.4
221 0.43
222 0.4
223 0.42
224 0.38
225 0.39
226 0.41
227 0.41
228 0.34
229 0.28
230 0.28
231 0.21
232 0.22
233 0.18
234 0.15
235 0.11
236 0.1
237 0.07
238 0.06
239 0.06
240 0.06
241 0.06
242 0.06
243 0.08
244 0.09
245 0.1
246 0.1
247 0.11
248 0.1
249 0.11
250 0.16
251 0.15
252 0.14
253 0.15
254 0.15
255 0.13
256 0.13
257 0.12
258 0.07
259 0.06
260 0.05
261 0.05
262 0.05
263 0.06
264 0.06
265 0.06
266 0.05
267 0.05
268 0.06
269 0.05
270 0.05
271 0.05
272 0.05
273 0.05
274 0.06
275 0.07
276 0.09
277 0.1
278 0.1
279 0.11
280 0.12
281 0.12
282 0.11
283 0.11
284 0.1
285 0.17
286 0.16
287 0.16
288 0.17
289 0.19
290 0.19
291 0.2
292 0.18
293 0.12
294 0.13
295 0.12
296 0.11
297 0.09
298 0.08
299 0.07
300 0.06
301 0.05
302 0.04
303 0.04
304 0.05
305 0.05
306 0.05
307 0.06
308 0.06
309 0.07
310 0.07
311 0.08
312 0.08
313 0.08
314 0.1
315 0.1
316 0.14
317 0.16
318 0.2
319 0.2
320 0.2
321 0.21
322 0.2
323 0.22
324 0.18
325 0.16
326 0.12
327 0.11
328 0.12
329 0.11
330 0.11
331 0.09
332 0.09
333 0.08
334 0.07
335 0.09
336 0.07
337 0.06
338 0.05
339 0.05
340 0.05
341 0.05
342 0.05
343 0.03
344 0.03
345 0.04
346 0.04
347 0.04
348 0.04
349 0.07
350 0.07
351 0.09
352 0.1
353 0.1
354 0.11
355 0.17
356 0.2
357 0.22
358 0.25
359 0.27
360 0.3
361 0.32
362 0.38
363 0.34
364 0.33
365 0.32
366 0.3
367 0.27
368 0.23
369 0.23
370 0.15
371 0.17
372 0.15
373 0.15
374 0.15
375 0.14
376 0.14
377 0.13
378 0.14
379 0.11
380 0.09
381 0.08
382 0.09
383 0.09
384 0.1
385 0.12
386 0.12
387 0.14
388 0.21
389 0.25
390 0.29
391 0.31
392 0.32
393 0.3
394 0.29
395 0.28
396 0.21
397 0.17
398 0.1
399 0.08
400 0.09
401 0.11
402 0.1
403 0.1
404 0.1
405 0.11
406 0.12
407 0.12
408 0.09
409 0.13
410 0.13
411 0.15
412 0.24
413 0.25
414 0.29
415 0.35
416 0.37
417 0.37
418 0.41
419 0.4
420 0.37
421 0.36
422 0.37
423 0.4
424 0.46
425 0.46
426 0.45
427 0.45
428 0.41
429 0.41
430 0.38
431 0.3
432 0.22
433 0.2
434 0.19
435 0.17
436 0.17
437 0.17
438 0.15
439 0.15
440 0.15
441 0.13
442 0.12
443 0.13
444 0.15
445 0.13
446 0.15
447 0.15
448 0.16
449 0.17
450 0.18
451 0.19
452 0.18
453 0.19
454 0.19
455 0.25
456 0.26
457 0.28
458 0.27
459 0.3
460 0.34
461 0.34
462 0.36
463 0.3
464 0.29
465 0.27
466 0.27
467 0.23
468 0.18
469 0.2
470 0.16
471 0.19
472 0.26
473 0.26
474 0.25
475 0.27
476 0.28
477 0.26
478 0.27
479 0.26
480 0.23
481 0.26
482 0.32
483 0.3
484 0.33
485 0.32
486 0.3
487 0.3
488 0.26
489 0.21
490 0.19
491 0.2
492 0.22
493 0.3
494 0.33
495 0.37
496 0.45
497 0.49
498 0.51
499 0.52
500 0.48
501 0.45
502 0.5
503 0.52
504 0.49
505 0.47
506 0.43
507 0.42
508 0.42
509 0.37
510 0.29
511 0.21
512 0.15
513 0.15
514 0.16
515 0.17
516 0.17
517 0.16
518 0.19
519 0.22
520 0.25
521 0.24
522 0.23
523 0.22
524 0.21
525 0.22
526 0.2
527 0.19
528 0.17
529 0.18
530 0.16
531 0.16
532 0.2
533 0.22
534 0.31
535 0.38
536 0.47
537 0.56
538 0.65
539 0.73
540 0.79
541 0.87
542 0.89
543 0.9
544 0.9
545 0.9
546 0.89
547 0.86
548 0.85
549 0.81
550 0.73
551 0.66
552 0.58
553 0.49
554 0.42
555 0.35
556 0.27
557 0.23
558 0.2
559 0.18
560 0.17
561 0.19
562 0.22
563 0.23
564 0.27
565 0.29
566 0.34
567 0.34
568 0.36
569 0.36
570 0.33
571 0.36
572 0.36
573 0.41
574 0.44
575 0.49
576 0.53
577 0.52
578 0.55
579 0.59
580 0.64
581 0.63
582 0.65
583 0.67
584 0.7
585 0.74
586 0.74
587 0.72
588 0.69
589 0.64
590 0.62
591 0.62
592 0.62
593 0.58
594 0.56
595 0.5
596 0.47
597 0.49
598 0.44
599 0.37
600 0.34
601 0.31
602 0.3
603 0.32
604 0.3
605 0.24
606 0.24
607 0.25
608 0.21
609 0.2
610 0.2
611 0.23
612 0.24
613 0.3
614 0.3
615 0.27
616 0.31
617 0.32
618 0.32
619 0.31
620 0.33
621 0.32
622 0.38