Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

P47076

Protein Details
Accession P47076    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
32-55KSLAALKKSRSKGKQNRPYNHPELHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010997  HRDC-like_sf  
IPR005574  Rpb4/RPC9  
IPR038324  Rpb4/RPC9_sf  
IPR038846  RPC9  
Gene Ontology GO:0005829  C:cytosol  
GO:0005654  C:nucleoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0005666  C:RNA polymerase III complex  
GO:0000166  F:nucleotide binding  
GO:0006386  P:termination of RNA polymerase III transcription  
GO:0006383  P:transcription by RNA polymerase III  
GO:0006384  P:transcription initiation at RNA polymerase III promoter  
GO:0042797  P:tRNA transcription by RNA polymerase III  
KEGG sce:YJL011C  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF03874  RNA_pol_Rpb4  
Amino Acid Sequences MKVLEERNAFLSDYEVLKFLTDLEKKHLWDQKSLAALKKSRSKGKQNRPYNHPELQGITRNVVNYLSINKNFINQEDEGEERESSGAKDAEKSGISKMSDESFAELMTKLNSFKLFKAEKLQIVNQLPANMVHLYSIVEECDARFDEKTIEEMLEIISGYA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.14
3 0.13
4 0.13
5 0.12
6 0.12
7 0.17
8 0.18
9 0.19
10 0.25
11 0.29
12 0.31
13 0.39
14 0.44
15 0.38
16 0.4
17 0.41
18 0.4
19 0.42
20 0.43
21 0.41
22 0.41
23 0.42
24 0.43
25 0.5
26 0.51
27 0.53
28 0.58
29 0.65
30 0.69
31 0.77
32 0.81
33 0.83
34 0.85
35 0.83
36 0.84
37 0.79
38 0.73
39 0.64
40 0.55
41 0.48
42 0.43
43 0.42
44 0.33
45 0.29
46 0.24
47 0.22
48 0.21
49 0.18
50 0.15
51 0.09
52 0.13
53 0.15
54 0.15
55 0.17
56 0.16
57 0.19
58 0.19
59 0.19
60 0.18
61 0.14
62 0.15
63 0.14
64 0.15
65 0.13
66 0.14
67 0.13
68 0.1
69 0.1
70 0.09
71 0.07
72 0.09
73 0.09
74 0.08
75 0.09
76 0.1
77 0.11
78 0.12
79 0.12
80 0.11
81 0.14
82 0.14
83 0.14
84 0.14
85 0.14
86 0.14
87 0.13
88 0.14
89 0.11
90 0.1
91 0.11
92 0.09
93 0.09
94 0.08
95 0.09
96 0.08
97 0.09
98 0.13
99 0.13
100 0.14
101 0.22
102 0.23
103 0.24
104 0.31
105 0.33
106 0.34
107 0.37
108 0.38
109 0.38
110 0.38
111 0.39
112 0.33
113 0.3
114 0.26
115 0.22
116 0.23
117 0.15
118 0.13
119 0.1
120 0.09
121 0.09
122 0.1
123 0.1
124 0.07
125 0.08
126 0.08
127 0.08
128 0.11
129 0.12
130 0.13
131 0.13
132 0.14
133 0.16
134 0.17
135 0.19
136 0.17
137 0.16
138 0.14
139 0.14
140 0.13
141 0.11