Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

P43596

Protein Details
Accession P43596    Localization Confidence High Confidence Score 20.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
47-103QSSDNLRRSRRVPKPRTSIYDEYEEELKERANKPKRKRPAPPKKKAPSTQNSKSNDKHydrophilic
454-475RYEIRSKKKHFVKQLKEGKKPDBasic
725-751VQFADMKPGKRQLRRIQRQTVNYNTEYHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
75-132ERANKPKRKRPAPPKKKAPSTQNSKSNDKVEKKKTTSIAKDGKPTLKTNDKKVAPKPK
459-478SKKKHFVKQLKEGKKPDLSR
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 13.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR028942  WHIM1_dom  
Gene Ontology GO:0016587  C:Isw1 complex  
GO:0036436  C:Isw1a complex  
GO:0006338  P:chromatin remodeling  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
GO:0007062  P:sister chromatid cohesion  
KEGG sce:YFR013W  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF15612  WHIM1  
Amino Acid Sequences MDSPSNSIQNLQQEAQGSSSAQLADHDHDRVSMAMPLQTDQSVSVSQSSDNLRRSRRVPKPRTSIYDEYEEELKERANKPKRKRPAPPKKKAPSTQNSKSNDKVEKKKTTSIAKDGKPTLKTNDKKVAPKPKPAHEQVEPALIPSNWTSVIPLLTSDFKNQYSVISRLKNPNMKPVPYAGDIIKLMAFINKFSSFFHSDLQNLSFQDFEVGLDLYPGDPNGSAAGIVKGPEDTSLLLYPDFMAIKDIVYCQDKMNLLFLSLLDLTFTENFDGKSAKKKGPLTTWENLKSSSKKVFSNPLYRLRLVAREWGYPREWRQQLPSDQDISKPKTALFEQDEQTPVVDPSHPEILTPNIYTWNANEPLPLESNPLYNREMDKNGILALKPMDRVVLLRALTDWCASHSSAIHDEIYKLTHGKKDPVFGIQTQQVPRYTIEGVDNTINQFKKLCSLIQSRYEIRSKKKHFVKQLKEGKKPDLSRKLEILKEIKAELKNAVKSEKDELLFSLYDKWVPLFEGELPDQPLANPFSERLYKLRLQEFFLGRVPHIGDFYMPRLHSYGDSLEMSTFTDLRNLQALLSKFKNNEYNAFTLFENDGQSMSAQFKLFYHDTPSLAHDVARGRNTSGKVYWYELCHDSATLLEFLEFLDYKIVKPQDEKKEGNEKEKEALNNEAHILEQKSTTDNNPSINTNPLPKDAKYNTARKKLQILKEFLSDYYFILRQFEQMKVQFADMKPGKRQLRRIQRQTVNYNTEYDSEEYVDDEEDDEADIYDDNDNDSSFDDGRVKRQRT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.3
3 0.27
4 0.2
5 0.16
6 0.17
7 0.15
8 0.12
9 0.13
10 0.15
11 0.18
12 0.2
13 0.21
14 0.19
15 0.19
16 0.2
17 0.19
18 0.18
19 0.16
20 0.15
21 0.15
22 0.16
23 0.16
24 0.17
25 0.17
26 0.16
27 0.14
28 0.15
29 0.14
30 0.14
31 0.15
32 0.14
33 0.14
34 0.19
35 0.24
36 0.28
37 0.34
38 0.4
39 0.43
40 0.49
41 0.55
42 0.61
43 0.65
44 0.7
45 0.73
46 0.76
47 0.81
48 0.84
49 0.85
50 0.83
51 0.8
52 0.73
53 0.7
54 0.61
55 0.54
56 0.48
57 0.41
58 0.33
59 0.27
60 0.25
61 0.25
62 0.29
63 0.36
64 0.44
65 0.53
66 0.63
67 0.73
68 0.81
69 0.84
70 0.9
71 0.91
72 0.92
73 0.94
74 0.94
75 0.95
76 0.94
77 0.94
78 0.92
79 0.91
80 0.9
81 0.89
82 0.88
83 0.86
84 0.81
85 0.77
86 0.74
87 0.72
88 0.71
89 0.7
90 0.7
91 0.71
92 0.75
93 0.74
94 0.76
95 0.76
96 0.76
97 0.74
98 0.73
99 0.73
100 0.67
101 0.7
102 0.69
103 0.68
104 0.62
105 0.59
106 0.57
107 0.58
108 0.58
109 0.59
110 0.62
111 0.62
112 0.66
113 0.71
114 0.75
115 0.7
116 0.76
117 0.75
118 0.75
119 0.77
120 0.76
121 0.74
122 0.66
123 0.67
124 0.58
125 0.57
126 0.47
127 0.39
128 0.36
129 0.28
130 0.25
131 0.19
132 0.19
133 0.13
134 0.13
135 0.13
136 0.11
137 0.12
138 0.1
139 0.1
140 0.11
141 0.14
142 0.15
143 0.18
144 0.2
145 0.2
146 0.22
147 0.21
148 0.22
149 0.24
150 0.27
151 0.3
152 0.32
153 0.37
154 0.44
155 0.52
156 0.56
157 0.53
158 0.58
159 0.58
160 0.55
161 0.51
162 0.47
163 0.44
164 0.38
165 0.39
166 0.28
167 0.26
168 0.24
169 0.22
170 0.18
171 0.14
172 0.12
173 0.13
174 0.12
175 0.09
176 0.14
177 0.14
178 0.15
179 0.15
180 0.21
181 0.22
182 0.23
183 0.25
184 0.23
185 0.23
186 0.25
187 0.25
188 0.22
189 0.18
190 0.18
191 0.15
192 0.13
193 0.13
194 0.11
195 0.09
196 0.08
197 0.08
198 0.07
199 0.07
200 0.07
201 0.06
202 0.06
203 0.06
204 0.05
205 0.05
206 0.05
207 0.06
208 0.06
209 0.05
210 0.06
211 0.07
212 0.07
213 0.07
214 0.07
215 0.07
216 0.07
217 0.07
218 0.07
219 0.07
220 0.09
221 0.09
222 0.1
223 0.09
224 0.09
225 0.09
226 0.1
227 0.09
228 0.07
229 0.08
230 0.07
231 0.08
232 0.08
233 0.09
234 0.1
235 0.12
236 0.13
237 0.12
238 0.16
239 0.17
240 0.17
241 0.2
242 0.17
243 0.15
244 0.14
245 0.13
246 0.12
247 0.11
248 0.1
249 0.07
250 0.07
251 0.08
252 0.08
253 0.09
254 0.07
255 0.08
256 0.08
257 0.09
258 0.11
259 0.11
260 0.2
261 0.24
262 0.27
263 0.33
264 0.37
265 0.42
266 0.47
267 0.53
268 0.51
269 0.51
270 0.56
271 0.53
272 0.49
273 0.46
274 0.44
275 0.39
276 0.37
277 0.38
278 0.33
279 0.32
280 0.34
281 0.41
282 0.43
283 0.48
284 0.5
285 0.53
286 0.54
287 0.51
288 0.5
289 0.42
290 0.4
291 0.32
292 0.34
293 0.27
294 0.27
295 0.29
296 0.3
297 0.3
298 0.3
299 0.34
300 0.36
301 0.36
302 0.33
303 0.36
304 0.4
305 0.43
306 0.45
307 0.43
308 0.38
309 0.36
310 0.39
311 0.4
312 0.37
313 0.34
314 0.29
315 0.26
316 0.25
317 0.25
318 0.27
319 0.25
320 0.25
321 0.25
322 0.26
323 0.27
324 0.24
325 0.24
326 0.19
327 0.15
328 0.1
329 0.1
330 0.08
331 0.1
332 0.13
333 0.13
334 0.12
335 0.13
336 0.14
337 0.15
338 0.15
339 0.13
340 0.11
341 0.12
342 0.12
343 0.12
344 0.15
345 0.15
346 0.14
347 0.14
348 0.13
349 0.14
350 0.15
351 0.15
352 0.12
353 0.11
354 0.14
355 0.15
356 0.16
357 0.16
358 0.15
359 0.17
360 0.18
361 0.19
362 0.17
363 0.17
364 0.14
365 0.15
366 0.14
367 0.11
368 0.1
369 0.1
370 0.1
371 0.1
372 0.09
373 0.08
374 0.07
375 0.08
376 0.08
377 0.1
378 0.09
379 0.09
380 0.09
381 0.1
382 0.1
383 0.1
384 0.09
385 0.07
386 0.08
387 0.08
388 0.08
389 0.09
390 0.1
391 0.11
392 0.12
393 0.12
394 0.1
395 0.11
396 0.11
397 0.11
398 0.09
399 0.09
400 0.1
401 0.14
402 0.15
403 0.2
404 0.21
405 0.23
406 0.23
407 0.25
408 0.25
409 0.21
410 0.23
411 0.21
412 0.24
413 0.22
414 0.24
415 0.21
416 0.21
417 0.21
418 0.2
419 0.17
420 0.14
421 0.14
422 0.12
423 0.13
424 0.12
425 0.12
426 0.11
427 0.15
428 0.14
429 0.13
430 0.13
431 0.12
432 0.14
433 0.15
434 0.15
435 0.17
436 0.22
437 0.26
438 0.31
439 0.35
440 0.34
441 0.37
442 0.42
443 0.41
444 0.43
445 0.49
446 0.49
447 0.54
448 0.61
449 0.65
450 0.69
451 0.75
452 0.76
453 0.76
454 0.81
455 0.81
456 0.8
457 0.76
458 0.71
459 0.68
460 0.65
461 0.64
462 0.64
463 0.59
464 0.54
465 0.56
466 0.55
467 0.49
468 0.49
469 0.42
470 0.33
471 0.3
472 0.28
473 0.28
474 0.24
475 0.24
476 0.23
477 0.25
478 0.25
479 0.25
480 0.27
481 0.23
482 0.24
483 0.27
484 0.27
485 0.22
486 0.2
487 0.19
488 0.2
489 0.19
490 0.17
491 0.17
492 0.13
493 0.13
494 0.12
495 0.12
496 0.09
497 0.1
498 0.1
499 0.08
500 0.08
501 0.11
502 0.12
503 0.14
504 0.15
505 0.15
506 0.14
507 0.13
508 0.15
509 0.13
510 0.13
511 0.12
512 0.11
513 0.14
514 0.17
515 0.18
516 0.18
517 0.22
518 0.25
519 0.29
520 0.35
521 0.34
522 0.34
523 0.39
524 0.39
525 0.36
526 0.35
527 0.31
528 0.25
529 0.26
530 0.23
531 0.17
532 0.16
533 0.13
534 0.11
535 0.12
536 0.14
537 0.17
538 0.15
539 0.16
540 0.16
541 0.17
542 0.16
543 0.17
544 0.15
545 0.14
546 0.14
547 0.14
548 0.13
549 0.12
550 0.13
551 0.11
552 0.1
553 0.07
554 0.11
555 0.11
556 0.12
557 0.14
558 0.13
559 0.13
560 0.17
561 0.19
562 0.2
563 0.23
564 0.26
565 0.25
566 0.29
567 0.35
568 0.32
569 0.37
570 0.35
571 0.35
572 0.33
573 0.34
574 0.29
575 0.25
576 0.24
577 0.2
578 0.17
579 0.14
580 0.12
581 0.11
582 0.11
583 0.1
584 0.11
585 0.12
586 0.11
587 0.11
588 0.11
589 0.17
590 0.18
591 0.18
592 0.22
593 0.22
594 0.23
595 0.24
596 0.26
597 0.22
598 0.21
599 0.2
600 0.18
601 0.2
602 0.24
603 0.25
604 0.24
605 0.23
606 0.28
607 0.3
608 0.3
609 0.28
610 0.27
611 0.26
612 0.29
613 0.3
614 0.27
615 0.3
616 0.28
617 0.28
618 0.25
619 0.22
620 0.19
621 0.16
622 0.16
623 0.12
624 0.1
625 0.08
626 0.07
627 0.07
628 0.1
629 0.1
630 0.08
631 0.13
632 0.13
633 0.14
634 0.21
635 0.23
636 0.21
637 0.27
638 0.37
639 0.42
640 0.5
641 0.52
642 0.52
643 0.61
644 0.64
645 0.67
646 0.64
647 0.55
648 0.52
649 0.55
650 0.5
651 0.43
652 0.45
653 0.38
654 0.33
655 0.32
656 0.27
657 0.22
658 0.23
659 0.22
660 0.16
661 0.16
662 0.15
663 0.17
664 0.19
665 0.21
666 0.25
667 0.25
668 0.28
669 0.29
670 0.31
671 0.31
672 0.34
673 0.34
674 0.34
675 0.34
676 0.36
677 0.38
678 0.36
679 0.43
680 0.4
681 0.47
682 0.48
683 0.56
684 0.6
685 0.66
686 0.7
687 0.64
688 0.72
689 0.71
690 0.73
691 0.72
692 0.68
693 0.61
694 0.62
695 0.6
696 0.5
697 0.43
698 0.35
699 0.26
700 0.25
701 0.23
702 0.18
703 0.2
704 0.19
705 0.22
706 0.24
707 0.26
708 0.29
709 0.29
710 0.34
711 0.32
712 0.34
713 0.36
714 0.33
715 0.41
716 0.39
717 0.42
718 0.43
719 0.51
720 0.58
721 0.59
722 0.69
723 0.69
724 0.75
725 0.81
726 0.84
727 0.86
728 0.86
729 0.87
730 0.86
731 0.85
732 0.8
733 0.71
734 0.64
735 0.55
736 0.48
737 0.43
738 0.36
739 0.28
740 0.22
741 0.2
742 0.18
743 0.17
744 0.16
745 0.13
746 0.11
747 0.1
748 0.09
749 0.09
750 0.09
751 0.08
752 0.08
753 0.08
754 0.08
755 0.1
756 0.1
757 0.11
758 0.11
759 0.11
760 0.11
761 0.12
762 0.15
763 0.13
764 0.16
765 0.22
766 0.23
767 0.33