FuNGI

P38882

Protein Details

Accession

P38882

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
465-491	GELNSIKDKHTKKNCKHLKSALRSSEE	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 23.5, cyto_nucl 13

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR015943 WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf
Gene Ontology	GO:0030686 C:90S preribosome GO:0005730 C:nucleolus GO:0005634 C:nucleus GO:0033553 C:rDNA heterochromatin GO:0032040 C:small-subunit processome GO:0034455 C:t-UTP complex GO:0034511 F:U3 snoRNA binding GO:0030490 P:maturation of SSU-rRNA GO:0000462 P:maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) GO:0045943 P:positive regulation of transcription by RNA polymerase I
KEGG	sce:YHR196W -

Amino Acid Sequences

MGSSLDLVASFSHDSTRFAFQASVAQKNNVDIYPLNETKDYVVNSSLVSHIDYETNDMKVSDVIFFGWCSDLIDTQSSNIKRKLDEDEGTGESSEQRCENFFVNGFPDGRIVVYSSNGKDIVNIIKNKKEILGADTDESDIWILDSDKVVKKLQYNNSKPLKTFTLVDGKDDEIVHFQILHQNGTLLVCIITKQMVYIVDPSKRRPSTKYSFEISDAVACEFSSDGKYLLIANNEELIAYDLKEDSKLIQSWPVQVKTLKTLDDLIMALTTDGKINNYKIGEADKVCSIVVNEDLEIIDFTPINSKQQVLISWLNVNEPNFESISLKEIETQGYITINKNEKNNADEADQKKLEEKEEEAQPEVQHEKKETETKINKKVSKSDQVEIANILSSHLEANSTEILDDLMSGSWTEPEIKKFILTKINTVDHLSKIFLTISKSITQNPWNEENLLPLWLKWLLTLKSGELNSIKDKHTKKNCKHLKSALRSSEEILPVLLGIQGRLEMLRRQAKLREDLAQLSMQEGEDDEIEVIEHSNVISNPLQDQASPVEKLEPDSIVYANGESDEFVDASEYKD

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.18
2	0.2
3	0.26
4	0.23
5	0.24
6	0.24
7	0.2
8	0.28
9	0.3
10	0.35
11	0.32
12	0.34
13	0.34
14	0.36
15	0.38
16	0.3
17	0.28
18	0.21
19	0.23
20	0.29
21	0.3
22	0.3
23	0.27
24	0.27
25	0.27
26	0.31
27	0.28
28	0.21
29	0.21
30	0.2
31	0.2
32	0.2
33	0.19
34	0.14
35	0.14
36	0.13
37	0.12
38	0.14
39	0.14
40	0.17
41	0.19
42	0.19
43	0.18
44	0.17
45	0.17
46	0.16
47	0.16
48	0.12
49	0.1
50	0.1
51	0.11
52	0.11
53	0.11
54	0.1
55	0.1
56	0.1
57	0.11
58	0.11
59	0.12
60	0.14
61	0.14
62	0.15
63	0.22
64	0.24
65	0.3
66	0.33
67	0.34
68	0.33
69	0.36
70	0.42
71	0.42
72	0.4
73	0.38
74	0.38
75	0.37
76	0.36
77	0.33
78	0.26
79	0.22
80	0.21
81	0.2
82	0.16
83	0.15
84	0.16
85	0.18
86	0.2
87	0.19
88	0.19
89	0.18
90	0.2
91	0.22
92	0.21
93	0.19
94	0.18
95	0.15
96	0.14
97	0.13
98	0.11
99	0.09
100	0.11
101	0.15
102	0.15
103	0.18
104	0.18
105	0.17
106	0.17
107	0.19
108	0.24
109	0.26
110	0.32
111	0.33
112	0.37
113	0.39
114	0.39
115	0.38
116	0.33
117	0.27
118	0.24
119	0.25
120	0.22
121	0.22
122	0.22
123	0.21
124	0.18
125	0.17
126	0.13
127	0.08
128	0.06
129	0.06
130	0.06
131	0.07
132	0.08
133	0.13
134	0.16
135	0.19
136	0.2
137	0.22
138	0.27
139	0.35
140	0.44
141	0.5
142	0.52
143	0.6
144	0.67
145	0.66
146	0.61
147	0.57
148	0.52
149	0.43
150	0.39
151	0.33
152	0.34
153	0.32
154	0.33
155	0.3
156	0.27
157	0.27
158	0.25
159	0.21
160	0.14
161	0.14
162	0.12
163	0.11
164	0.1
165	0.13
166	0.14
167	0.14
168	0.11
169	0.11
170	0.11
171	0.11
172	0.11
173	0.07
174	0.06
175	0.05
176	0.06
177	0.06
178	0.06
179	0.05
180	0.05
181	0.07
182	0.07
183	0.08
184	0.13
185	0.16
186	0.21
187	0.23
188	0.27
189	0.35
190	0.38
191	0.39
192	0.39
193	0.44
194	0.47
195	0.53
196	0.55
197	0.49
198	0.47
199	0.46
200	0.43
201	0.35
202	0.28
203	0.2
204	0.16
205	0.12
206	0.1
207	0.08
208	0.07
209	0.07
210	0.07
211	0.06
212	0.06
213	0.06
214	0.07
215	0.07
216	0.09
217	0.1
218	0.1
219	0.1
220	0.1
221	0.1
222	0.09
223	0.08
224	0.08
225	0.07
226	0.06
227	0.06
228	0.06
229	0.06
230	0.07
231	0.07
232	0.07
233	0.09
234	0.1
235	0.1
236	0.15
237	0.16
238	0.21
239	0.26
240	0.26
241	0.25
242	0.25
243	0.26
244	0.26
245	0.27
246	0.21
247	0.17
248	0.18
249	0.16
250	0.15
251	0.14
252	0.09
253	0.08
254	0.07
255	0.06
256	0.05
257	0.05
258	0.04
259	0.05
260	0.06
261	0.07
262	0.08
263	0.11
264	0.11
265	0.11
266	0.11
267	0.13
268	0.14
269	0.13
270	0.14
271	0.11
272	0.12
273	0.11
274	0.11
275	0.09
276	0.07
277	0.08
278	0.06
279	0.06
280	0.06
281	0.06
282	0.06
283	0.06
284	0.05
285	0.04
286	0.04
287	0.04
288	0.08
289	0.08
290	0.1
291	0.1
292	0.1
293	0.11
294	0.13
295	0.13
296	0.14
297	0.15
298	0.15
299	0.16
300	0.16
301	0.16
302	0.16
303	0.16
304	0.12
305	0.12
306	0.12
307	0.11
308	0.11
309	0.11
310	0.09
311	0.12
312	0.11
313	0.11
314	0.11
315	0.11
316	0.11
317	0.11
318	0.11
319	0.08
320	0.09
321	0.1
322	0.1
323	0.15
324	0.19
325	0.21
326	0.22
327	0.25
328	0.25
329	0.26
330	0.27
331	0.23
332	0.21
333	0.26
334	0.26
335	0.29
336	0.28
337	0.26
338	0.29
339	0.28
340	0.28
341	0.22
342	0.23
343	0.21
344	0.25
345	0.27
346	0.24
347	0.25
348	0.23
349	0.24
350	0.25
351	0.22
352	0.19
353	0.19
354	0.2
355	0.22
356	0.28
357	0.28
358	0.34
359	0.41
360	0.48
361	0.56
362	0.62
363	0.63
364	0.59
365	0.65
366	0.62
367	0.64
368	0.6
369	0.53
370	0.51
371	0.48
372	0.46
373	0.38
374	0.31
375	0.22
376	0.17
377	0.15
378	0.08
379	0.07
380	0.07
381	0.06
382	0.06
383	0.05
384	0.07
385	0.08
386	0.08
387	0.07
388	0.07
389	0.07
390	0.06
391	0.06
392	0.05
393	0.04
394	0.04
395	0.05
396	0.05
397	0.05
398	0.06
399	0.1
400	0.11
401	0.13
402	0.15
403	0.16
404	0.18
405	0.2
406	0.24
407	0.29
408	0.28
409	0.31
410	0.35
411	0.37
412	0.36
413	0.37
414	0.35
415	0.28
416	0.28
417	0.24
418	0.18
419	0.16
420	0.16
421	0.14
422	0.15
423	0.16
424	0.17
425	0.2
426	0.22
427	0.24
428	0.28
429	0.31
430	0.33
431	0.35
432	0.37
433	0.35
434	0.36
435	0.34
436	0.32
437	0.27
438	0.25
439	0.2
440	0.15
441	0.16
442	0.14
443	0.14
444	0.13
445	0.18
446	0.17
447	0.2
448	0.21
449	0.2
450	0.24
451	0.25
452	0.26
453	0.22
454	0.24
455	0.27
456	0.3
457	0.31
458	0.34
459	0.39
460	0.46
461	0.56
462	0.63
463	0.66
464	0.73
465	0.81
466	0.8
467	0.84
468	0.84
469	0.83
470	0.82
471	0.84
472	0.81
473	0.75
474	0.69
475	0.63
476	0.59
477	0.5
478	0.4
479	0.3
480	0.22
481	0.17
482	0.16
483	0.14
484	0.08
485	0.06
486	0.06
487	0.06
488	0.07
489	0.08
490	0.1
491	0.11
492	0.2
493	0.27
494	0.29
495	0.33
496	0.39
497	0.45
498	0.49
499	0.5
500	0.48
501	0.44
502	0.44
503	0.43
504	0.39
505	0.33
506	0.27
507	0.25
508	0.18
509	0.14
510	0.13
511	0.11
512	0.09
513	0.09
514	0.08
515	0.07
516	0.07
517	0.07
518	0.08
519	0.07
520	0.06
521	0.06
522	0.09
523	0.09
524	0.13
525	0.15
526	0.15
527	0.16
528	0.19
529	0.2
530	0.16
531	0.19
532	0.2
533	0.23
534	0.23
535	0.22
536	0.24
537	0.24
538	0.28
539	0.28
540	0.23
541	0.2
542	0.21
543	0.21
544	0.18
545	0.18
546	0.15
547	0.12
548	0.12
549	0.11
550	0.09
551	0.1
552	0.1
553	0.09
554	0.09
555	0.11

P38882

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer