FuNGI

Q02939

Protein Details

Accession

Q02939

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
482-501	LWKDDKKKKFFISKEGNSQV	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
506-513	KRKLKKKQ

Subcellular Location(s)

nucl 22.5, cyto_nucl 13, cyto 2.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR040662 Tfb2_C IPR004598 TFIIH_p52/Tfb2
Gene Ontology	GO:0000112 C:nucleotide-excision repair factor 3 complex GO:0000439 C:transcription factor TFIIH core complex GO:0005675 C:transcription factor TFIIH holo complex GO:0001671 F:ATPase activator activity GO:0003690 F:double-stranded DNA binding GO:0006289 P:nucleotide-excision repair GO:0006366 P:transcription by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
KEGG	sce:YPL122C -
Pfam	View protein in Pfam PF03849 Tfb2 PF18307 Tfb2_C

Amino Acid Sequences

MSDYSLKHSVTQYLEEIPQQVQNRLYTSPATCLAIYRILPPLAKFFIMAMVFNENEVPLLDLDKWVNSNGKLQFQNAIKSMKSLHLLIPNKSSGTLMINLNPTFKISLRNALTGGEVQNSFGVVVEENVVSLDLLDEYSANKWETILHFMVGTPLAKIPSEKVLNLLKHSKLMEEVNSTGEFKITNEGFQFLLQEINSQLWTLLLQYLKMIETSKMDLVDVLHFIFMLGALEVGKAYKIDALSETQRIMLQDMRDYGLVFQKHSNDSIFYPTKLALMLTSDTKTIRSASNAMDSVLRQNREEPSVNEDGANGKSTTDITTSDDLNKAGLKNQDIPDGSLIVETNFKIYSYSNSPLQIAVLSLFVHLKARFVNMVLGQITRESIRRALTNGITADQIIAYLETHAHPQMRRLAEEKLEKKLELDPNCKEPLQVLPPTVVDQIRLWQLELDRVITYEGSLYSDFETSQEYNLLSKYAQDIGVLLWKDDKKKKFFISKEGNSQVLDFAKRKLKKKQ

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.31
2	0.29
3	0.29
4	0.25
5	0.28
6	0.28
7	0.29
8	0.29
9	0.3
10	0.31
11	0.3
12	0.31
13	0.29
14	0.28
15	0.28
16	0.27
17	0.26
18	0.24
19	0.24
20	0.24
21	0.25
22	0.24
23	0.22
24	0.25
25	0.24
26	0.26
27	0.25
28	0.28
29	0.26
30	0.25
31	0.23
32	0.18
33	0.22
34	0.21
35	0.2
36	0.16
37	0.18
38	0.18
39	0.17
40	0.18
41	0.12
42	0.11
43	0.11
44	0.11
45	0.07
46	0.09
47	0.09
48	0.11
49	0.12
50	0.13
51	0.14
52	0.15
53	0.19
54	0.18
55	0.25
56	0.26
57	0.33
58	0.33
59	0.34
60	0.38
61	0.37
62	0.41
63	0.38
64	0.38
65	0.31
66	0.31
67	0.32
68	0.29
69	0.28
70	0.25
71	0.25
72	0.31
73	0.35
74	0.36
75	0.38
76	0.36
77	0.34
78	0.32
79	0.28
80	0.2
81	0.19
82	0.2
83	0.17
84	0.19
85	0.24
86	0.24
87	0.25
88	0.23
89	0.22
90	0.2
91	0.19
92	0.22
93	0.19
94	0.27
95	0.28
96	0.3
97	0.29
98	0.28
99	0.28
100	0.24
101	0.23
102	0.17
103	0.14
104	0.13
105	0.13
106	0.12
107	0.11
108	0.09
109	0.09
110	0.05
111	0.06
112	0.07
113	0.06
114	0.06
115	0.06
116	0.06
117	0.05
118	0.05
119	0.05
120	0.04
121	0.04
122	0.04
123	0.04
124	0.05
125	0.06
126	0.09
127	0.09
128	0.09
129	0.09
130	0.11
131	0.13
132	0.17
133	0.17
134	0.15
135	0.15
136	0.15
137	0.16
138	0.14
139	0.13
140	0.08
141	0.08
142	0.09
143	0.09
144	0.1
145	0.1
146	0.16
147	0.18
148	0.17
149	0.2
150	0.26
151	0.27
152	0.31
153	0.34
154	0.28
155	0.3
156	0.3
157	0.26
158	0.23
159	0.23
160	0.21
161	0.19
162	0.19
163	0.18
164	0.18
165	0.19
166	0.16
167	0.14
168	0.12
169	0.09
170	0.14
171	0.12
172	0.13
173	0.13
174	0.14
175	0.14
176	0.14
177	0.14
178	0.09
179	0.1
180	0.08
181	0.09
182	0.08
183	0.08
184	0.08
185	0.07
186	0.07
187	0.05
188	0.06
189	0.05
190	0.07
191	0.07
192	0.07
193	0.07
194	0.08
195	0.08
196	0.08
197	0.09
198	0.07
199	0.09
200	0.1
201	0.11
202	0.11
203	0.11
204	0.1
205	0.1
206	0.1
207	0.09
208	0.07
209	0.06
210	0.06
211	0.06
212	0.05
213	0.04
214	0.04
215	0.03
216	0.03
217	0.03
218	0.03
219	0.03
220	0.03
221	0.03
222	0.03
223	0.03
224	0.05
225	0.05
226	0.05
227	0.06
228	0.09
229	0.11
230	0.12
231	0.12
232	0.11
233	0.12
234	0.11
235	0.12
236	0.11
237	0.1
238	0.1
239	0.11
240	0.11
241	0.11
242	0.11
243	0.1
244	0.13
245	0.12
246	0.12
247	0.13
248	0.15
249	0.16
250	0.17
251	0.16
252	0.13
253	0.14
254	0.19
255	0.19
256	0.17
257	0.16
258	0.16
259	0.15
260	0.14
261	0.13
262	0.07
263	0.07
264	0.08
265	0.08
266	0.09
267	0.09
268	0.09
269	0.1
270	0.11
271	0.11
272	0.1
273	0.11
274	0.13
275	0.13
276	0.17
277	0.17
278	0.16
279	0.16
280	0.15
281	0.2
282	0.22
283	0.21
284	0.18
285	0.2
286	0.22
287	0.25
288	0.27
289	0.21
290	0.23
291	0.25
292	0.25
293	0.22
294	0.2
295	0.18
296	0.17
297	0.18
298	0.11
299	0.09
300	0.09
301	0.1
302	0.1
303	0.09
304	0.09
305	0.11
306	0.13
307	0.14
308	0.15
309	0.16
310	0.15
311	0.14
312	0.15
313	0.12
314	0.15
315	0.16
316	0.17
317	0.22
318	0.23
319	0.27
320	0.26
321	0.27
322	0.24
323	0.22
324	0.19
325	0.14
326	0.12
327	0.08
328	0.09
329	0.08
330	0.09
331	0.08
332	0.08
333	0.08
334	0.09
335	0.12
336	0.16
337	0.19
338	0.21
339	0.22
340	0.22
341	0.21
342	0.21
343	0.17
344	0.12
345	0.09
346	0.07
347	0.06
348	0.07
349	0.07
350	0.07
351	0.1
352	0.1
353	0.11
354	0.11
355	0.12
356	0.12
357	0.13
358	0.16
359	0.13
360	0.15
361	0.15
362	0.14
363	0.13
364	0.12
365	0.13
366	0.11
367	0.12
368	0.11
369	0.13
370	0.16
371	0.17
372	0.18
373	0.22
374	0.22
375	0.25
376	0.24
377	0.22
378	0.2
379	0.18
380	0.17
381	0.12
382	0.1
383	0.06
384	0.06
385	0.05
386	0.05
387	0.06
388	0.07
389	0.09
390	0.11
391	0.15
392	0.15
393	0.19
394	0.27
395	0.28
396	0.3
397	0.31
398	0.33
399	0.36
400	0.46
401	0.45
402	0.45
403	0.45
404	0.43
405	0.42
406	0.45
407	0.46
408	0.44
409	0.48
410	0.44
411	0.47
412	0.51
413	0.49
414	0.41
415	0.34
416	0.34
417	0.33
418	0.32
419	0.27
420	0.26
421	0.27
422	0.29
423	0.31
424	0.24
425	0.19
426	0.17
427	0.2
428	0.23
429	0.22
430	0.21
431	0.2
432	0.21
433	0.24
434	0.24
435	0.22
436	0.18
437	0.18
438	0.18
439	0.15
440	0.15
441	0.11
442	0.1
443	0.11
444	0.11
445	0.11
446	0.12
447	0.13
448	0.12
449	0.11
450	0.16
451	0.14
452	0.15
453	0.16
454	0.15
455	0.16
456	0.16
457	0.17
458	0.13
459	0.13
460	0.15
461	0.16
462	0.15
463	0.14
464	0.14
465	0.14
466	0.21
467	0.19
468	0.17
469	0.21
470	0.25
471	0.34
472	0.42
473	0.49
474	0.5
475	0.58
476	0.67
477	0.71
478	0.73
479	0.75
480	0.77
481	0.77
482	0.8
483	0.77
484	0.7
485	0.61
486	0.55
487	0.49
488	0.42
489	0.4
490	0.31
491	0.32
492	0.4
493	0.47

Q02939

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer