Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

P42838

Protein Details
Accession P42838    Localization Confidence Low Confidence Score 7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
39-63EEDEVKPVRTKNRRPKEDAFTQQRLHydrophilic
263-285GINWESDKKRYKKTKYNYTQIAPHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) plas 18, cyto 2, pero 2, E.R. 2, vacu 2, cyto_pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR005045  CDC50/LEM3_fam  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005783  C:endoplasmic reticulum  
GO:0005794  C:Golgi apparatus  
GO:1990531  C:phospholipid-translocating ATPase complex  
GO:0005886  C:plasma membrane  
GO:0140331  P:aminophospholipid translocation  
GO:0007166  P:cell surface receptor signaling pathway  
GO:0045332  P:phospholipid translocation  
GO:0044088  P:regulation of vacuole organization  
KEGG sce:YNL323W  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF03381  CDC50  
Amino Acid Sequences MVNFDLGQVGEVFRRKDKGAIVSGDNPEEEEDVDASEFEEDEVKPVRTKNRRPKEDAFTQQRLAAINPVLTPRTVLPLYLLIAVVFVIVGGCILAQNSKVDEVTIYYQDCMTNATSSWSDIPSEHWQFVFHKYKTYNTAPQWRFVDDESDDFTKQRGTCQIRFTTPSDMKNNVYLNYVLEKFAANHRRYVLSFSEDQIRGEDASYETVHDATGINCKPLSKNADGKIYYPCGLIANSMFNDTFPLQLTNVGDTSNNYSLTNKGINWESDKKRYKKTKYNYTQIAPPPYWEKMYPDGYNETNIPDIQDWEEFQNWMRPGAFDKITKLIRINKNDTLPAGEYQLDIGLHWPVLEFNGKKGIYLTHGSHLGGRNPFLGIVYLIGGCICAAMALILLTFWLFGGRKIADASSLSWNMK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.28
3 0.32
4 0.36
5 0.39
6 0.42
7 0.43
8 0.44
9 0.47
10 0.49
11 0.46
12 0.41
13 0.34
14 0.28
15 0.24
16 0.19
17 0.14
18 0.11
19 0.1
20 0.11
21 0.1
22 0.09
23 0.09
24 0.08
25 0.07
26 0.1
27 0.08
28 0.12
29 0.15
30 0.17
31 0.19
32 0.24
33 0.34
34 0.42
35 0.53
36 0.61
37 0.68
38 0.76
39 0.82
40 0.85
41 0.84
42 0.84
43 0.84
44 0.82
45 0.76
46 0.69
47 0.62
48 0.55
49 0.48
50 0.38
51 0.32
52 0.24
53 0.2
54 0.19
55 0.2
56 0.19
57 0.17
58 0.18
59 0.14
60 0.19
61 0.17
62 0.16
63 0.15
64 0.16
65 0.17
66 0.17
67 0.16
68 0.1
69 0.1
70 0.09
71 0.07
72 0.05
73 0.04
74 0.03
75 0.02
76 0.02
77 0.02
78 0.02
79 0.02
80 0.03
81 0.04
82 0.05
83 0.06
84 0.07
85 0.09
86 0.09
87 0.09
88 0.09
89 0.11
90 0.13
91 0.14
92 0.14
93 0.14
94 0.14
95 0.14
96 0.14
97 0.14
98 0.12
99 0.1
100 0.1
101 0.12
102 0.12
103 0.13
104 0.14
105 0.13
106 0.12
107 0.12
108 0.17
109 0.22
110 0.24
111 0.24
112 0.23
113 0.24
114 0.25
115 0.33
116 0.38
117 0.3
118 0.34
119 0.34
120 0.38
121 0.43
122 0.47
123 0.46
124 0.43
125 0.53
126 0.48
127 0.52
128 0.51
129 0.45
130 0.41
131 0.33
132 0.31
133 0.22
134 0.22
135 0.2
136 0.2
137 0.19
138 0.18
139 0.18
140 0.18
141 0.17
142 0.18
143 0.24
144 0.28
145 0.32
146 0.38
147 0.41
148 0.4
149 0.43
150 0.43
151 0.43
152 0.4
153 0.41
154 0.39
155 0.38
156 0.36
157 0.37
158 0.36
159 0.28
160 0.26
161 0.21
162 0.18
163 0.18
164 0.18
165 0.13
166 0.12
167 0.11
168 0.11
169 0.18
170 0.26
171 0.23
172 0.25
173 0.26
174 0.28
175 0.28
176 0.31
177 0.25
178 0.2
179 0.2
180 0.19
181 0.24
182 0.22
183 0.22
184 0.19
185 0.18
186 0.15
187 0.14
188 0.13
189 0.07
190 0.08
191 0.08
192 0.08
193 0.07
194 0.07
195 0.07
196 0.06
197 0.06
198 0.05
199 0.11
200 0.11
201 0.12
202 0.12
203 0.13
204 0.13
205 0.17
206 0.22
207 0.2
208 0.26
209 0.28
210 0.35
211 0.35
212 0.36
213 0.35
214 0.32
215 0.28
216 0.22
217 0.19
218 0.13
219 0.13
220 0.12
221 0.09
222 0.09
223 0.09
224 0.1
225 0.1
226 0.08
227 0.11
228 0.1
229 0.1
230 0.09
231 0.1
232 0.08
233 0.11
234 0.11
235 0.1
236 0.1
237 0.1
238 0.09
239 0.09
240 0.14
241 0.14
242 0.14
243 0.13
244 0.14
245 0.14
246 0.17
247 0.18
248 0.13
249 0.14
250 0.15
251 0.16
252 0.22
253 0.3
254 0.32
255 0.4
256 0.49
257 0.52
258 0.6
259 0.68
260 0.72
261 0.73
262 0.79
263 0.8
264 0.8
265 0.85
266 0.82
267 0.75
268 0.73
269 0.68
270 0.65
271 0.53
272 0.46
273 0.41
274 0.36
275 0.35
276 0.28
277 0.26
278 0.26
279 0.31
280 0.29
281 0.28
282 0.3
283 0.28
284 0.3
285 0.26
286 0.22
287 0.18
288 0.17
289 0.16
290 0.12
291 0.13
292 0.13
293 0.13
294 0.13
295 0.14
296 0.15
297 0.14
298 0.15
299 0.2
300 0.18
301 0.19
302 0.19
303 0.17
304 0.19
305 0.24
306 0.27
307 0.22
308 0.24
309 0.3
310 0.31
311 0.32
312 0.34
313 0.38
314 0.43
315 0.5
316 0.54
317 0.52
318 0.54
319 0.54
320 0.5
321 0.44
322 0.38
323 0.31
324 0.27
325 0.21
326 0.18
327 0.16
328 0.17
329 0.12
330 0.1
331 0.1
332 0.09
333 0.08
334 0.08
335 0.08
336 0.06
337 0.08
338 0.15
339 0.15
340 0.16
341 0.25
342 0.24
343 0.25
344 0.26
345 0.26
346 0.23
347 0.28
348 0.28
349 0.25
350 0.27
351 0.27
352 0.31
353 0.32
354 0.34
355 0.32
356 0.3
357 0.27
358 0.25
359 0.25
360 0.2
361 0.18
362 0.12
363 0.1
364 0.1
365 0.09
366 0.08
367 0.08
368 0.07
369 0.06
370 0.05
371 0.04
372 0.03
373 0.03
374 0.03
375 0.03
376 0.03
377 0.03
378 0.03
379 0.04
380 0.04
381 0.04
382 0.04
383 0.08
384 0.08
385 0.09
386 0.15
387 0.16
388 0.17
389 0.19
390 0.2
391 0.18
392 0.2
393 0.22
394 0.24