FuNGI

P33750

Protein Details

Accession

P33750

Localization Confidence

High

Confidence Score

18.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
407-427	MPEIKRISRHRHVPQVIKKAQ	Hydrophilic
463-489	GTVHKYEDSGRDRKRRKEDDKRDTQEK	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
408-418	PEIKRISRHRH
438-449	KRREANERRTRK
473-480	RDRKRRKE

Subcellular Location(s)

nucl 25, mito_nucl 13.833, cyto_nucl 13.333

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR020472 G-protein_beta_WD-40_rep IPR007287 Sof1 IPR015943 WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf IPR001680 WD40_repeat IPR036322 WD40_repeat_dom_sf
Gene Ontology	GO:0030686 C:90S preribosome GO:0005730 C:nucleolus GO:0005654 C:nucleoplasm GO:0032040 C:small-subunit processome GO:0003729 F:mRNA binding GO:0030490 P:maturation of SSU-rRNA GO:0000462 P:maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)
KEGG	sce:YLL011W -
Pfam	View protein in Pfam PF04158 Sof1 PF00400 WD40
PROSITE	View protein in PROSITE PS50082 WD_REPEATS_2 PS50294 WD_REPEATS_REGION
CDD	cd00200 WD40

Amino Acid Sequences

MKIKTIKRSADDYVPVKSTQESQMPRNLNPELHPFERAREYTKALNATKLERMFAKPFVGQLGYGHRDGVYAIAKNYGSLNKLATGSADGVIKYWNMSTREEFVSFKAHYGLVTGLCVTQPRFHDKKPDLKSQNFMLSCSDDKTVKLWSINVDDYSNKNSSDNDSVTNEEGLIRTFDGESAFQGIDSHRENSTFATGGAKIHLWDVNRLKPVSDLSWGADNITSLKFNQNETDILASTGSDNSIVLYDLRTNSPTQKIVQTMRTNAICWNPMEAFNFVTANEDHNAYYYDMRNLSRSLNVFKDHVSAVMDVDFSPTGDEIVTGSYDKSIRIYKTNHGHSREIYHTKRMQHVFQVKYSMDSKYIISGSDDGNVRLWRSKAWERSNVKTTREKNKLEYDEKLKERFRHMPEIKRISRHRHVPQVIKKAQEIKNIELSSIKRREANERRTRKDMPYISERKKQIVGTVHKYEDSGRDRKRRKEDDKRDTQEK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.48
2	0.43
3	0.39
4	0.35
5	0.32
6	0.29
7	0.35
8	0.35
9	0.36
10	0.45
11	0.48
12	0.48
13	0.5
14	0.47
15	0.42
16	0.4
17	0.45
18	0.43
19	0.4
20	0.44
21	0.39
22	0.41
23	0.46
24	0.44
25	0.41
26	0.38
27	0.4
28	0.41
29	0.46
30	0.49
31	0.43
32	0.46
33	0.44
34	0.44
35	0.47
36	0.42
37	0.38
38	0.34
39	0.37
40	0.35
41	0.35
42	0.35
43	0.28
44	0.28
45	0.29
46	0.26
47	0.21
48	0.2
49	0.25
50	0.25
51	0.24
52	0.24
53	0.2
54	0.2
55	0.19
56	0.21
57	0.16
58	0.15
59	0.15
60	0.18
61	0.18
62	0.18
63	0.21
64	0.2
65	0.18
66	0.18
67	0.19
68	0.18
69	0.19
70	0.18
71	0.16
72	0.15
73	0.14
74	0.15
75	0.15
76	0.12
77	0.11
78	0.12
79	0.12
80	0.1
81	0.11
82	0.15
83	0.16
84	0.19
85	0.22
86	0.25
87	0.28
88	0.29
89	0.29
90	0.25
91	0.28
92	0.25
93	0.24
94	0.21
95	0.18
96	0.16
97	0.16
98	0.16
99	0.11
100	0.11
101	0.1
102	0.09
103	0.09
104	0.11
105	0.11
106	0.14
107	0.16
108	0.25
109	0.29
110	0.31
111	0.41
112	0.45
113	0.54
114	0.56
115	0.64
116	0.63
117	0.62
118	0.64
119	0.58
120	0.61
121	0.51
122	0.46
123	0.37
124	0.33
125	0.3
126	0.28
127	0.25
128	0.18
129	0.18
130	0.18
131	0.18
132	0.17
133	0.17
134	0.16
135	0.18
136	0.21
137	0.22
138	0.22
139	0.2
140	0.2
141	0.21
142	0.24
143	0.22
144	0.19
145	0.18
146	0.18
147	0.2
148	0.23
149	0.22
150	0.21
151	0.21
152	0.22
153	0.22
154	0.21
155	0.18
156	0.13
157	0.12
158	0.1
159	0.09
160	0.07
161	0.07
162	0.07
163	0.07
164	0.08
165	0.08
166	0.07
167	0.09
168	0.09
169	0.08
170	0.09
171	0.08
172	0.11
173	0.12
174	0.14
175	0.12
176	0.13
177	0.13
178	0.14
179	0.15
180	0.12
181	0.1
182	0.11
183	0.11
184	0.1
185	0.11
186	0.1
187	0.08
188	0.09
189	0.11
190	0.1
191	0.16
192	0.19
193	0.23
194	0.26
195	0.26
196	0.25
197	0.24
198	0.25
199	0.2
200	0.18
201	0.15
202	0.12
203	0.15
204	0.14
205	0.14
206	0.12
207	0.11
208	0.1
209	0.1
210	0.09
211	0.07
212	0.12
213	0.12
214	0.13
215	0.14
216	0.14
217	0.14
218	0.14
219	0.15
220	0.11
221	0.1
222	0.09
223	0.08
224	0.07
225	0.06
226	0.05
227	0.04
228	0.04
229	0.04
230	0.04
231	0.04
232	0.04
233	0.04
234	0.06
235	0.07
236	0.08
237	0.09
238	0.09
239	0.12
240	0.15
241	0.16
242	0.16
243	0.17
244	0.2
245	0.22
246	0.29
247	0.29
248	0.28
249	0.31
250	0.3
251	0.28
252	0.26
253	0.25
254	0.2
255	0.17
256	0.17
257	0.14
258	0.15
259	0.16
260	0.15
261	0.13
262	0.12
263	0.12
264	0.1
265	0.11
266	0.1
267	0.1
268	0.1
269	0.11
270	0.1
271	0.1
272	0.12
273	0.1
274	0.13
275	0.12
276	0.13
277	0.15
278	0.15
279	0.16
280	0.16
281	0.16
282	0.17
283	0.18
284	0.19
285	0.2
286	0.21
287	0.2
288	0.19
289	0.2
290	0.17
291	0.16
292	0.14
293	0.12
294	0.1
295	0.1
296	0.1
297	0.07
298	0.09
299	0.08
300	0.06
301	0.07
302	0.06
303	0.06
304	0.05
305	0.05
306	0.04
307	0.05
308	0.05
309	0.05
310	0.06
311	0.07
312	0.08
313	0.08
314	0.1
315	0.14
316	0.16
317	0.21
318	0.24
319	0.31
320	0.39
321	0.49
322	0.53
323	0.54
324	0.55
325	0.51
326	0.53
327	0.53
328	0.52
329	0.46
330	0.46
331	0.46
332	0.47
333	0.54
334	0.52
335	0.47
336	0.48
337	0.53
338	0.49
339	0.46
340	0.47
341	0.39
342	0.39
343	0.39
344	0.31
345	0.24
346	0.22
347	0.2
348	0.18
349	0.18
350	0.15
351	0.15
352	0.15
353	0.14
354	0.17
355	0.18
356	0.15
357	0.18
358	0.18
359	0.18
360	0.2
361	0.2
362	0.17
363	0.24
364	0.32
365	0.38
366	0.44
367	0.53
368	0.55
369	0.62
370	0.69
371	0.67
372	0.65
373	0.64
374	0.65
375	0.66
376	0.69
377	0.66
378	0.64
379	0.68
380	0.71
381	0.66
382	0.66
383	0.64
384	0.64
385	0.64
386	0.65
387	0.61
388	0.57
389	0.6
390	0.62
391	0.6
392	0.62
393	0.64
394	0.67
395	0.71
396	0.76
397	0.74
398	0.74
399	0.76
400	0.74
401	0.76
402	0.76
403	0.74
404	0.74
405	0.77
406	0.78
407	0.8
408	0.81
409	0.77
410	0.71
411	0.67
412	0.66
413	0.64
414	0.62
415	0.58
416	0.51
417	0.56
418	0.52
419	0.48
420	0.44
421	0.42
422	0.43
423	0.43
424	0.41
425	0.36
426	0.39
427	0.5
428	0.55
429	0.63
430	0.64
431	0.69
432	0.73
433	0.77
434	0.8
435	0.75
436	0.75
437	0.7
438	0.67
439	0.67
440	0.7
441	0.7
442	0.73
443	0.7
444	0.65
445	0.63
446	0.57
447	0.53
448	0.53
449	0.54
450	0.54
451	0.59
452	0.56
453	0.52
454	0.51
455	0.47
456	0.46
457	0.45
458	0.46
459	0.48
460	0.56
461	0.65
462	0.74
463	0.82
464	0.84
465	0.88
466	0.89
467	0.91
468	0.91
469	0.94

P33750

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer