Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

P31115

Protein Details
Accession P31115    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
71-93EVTRSKAKKAPKKFDFSKHNTRFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
65-65R
73-83TRSKAKKAPKK
436-438KKN
440-440K
Subcellular Location(s) mito 19, nucl 5.5, cyto_nucl 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR020103  PsdUridine_synth_cat_dom_sf  
IPR001406  PsdUridine_synth_TruA  
IPR020097  PsdUridine_synth_TruA_a/b_dom  
IPR020095  PsdUridine_synth_TruA_C  
IPR041707  Pus3-like  
IPR020094  TruA/RsuA/RluB/E/F_N  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0009982  F:pseudouridine synthase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0106029  F:tRNA pseudouridine synthase activity  
GO:1990481  P:mRNA pseudouridine synthesis  
GO:0031119  P:tRNA pseudouridine synthesis  
KEGG sce:YFL001W  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01416  PseudoU_synth_1  
CDD cd02569  PseudoU_synth_ScPus3  
Amino Acid Sequences MSNFIRRLVGKMKAISTGTNAIVSKKDSIYANWSKEQLIRRITELENANKPHSEKFQHIEDNKKRKISQEEVTRSKAKKAPKKFDFSKHNTRFIALRFAYLGWNYNGLAVQKEYTPLPTVEGTILEAMNKCKLVPSMVLQDYKFSRCGRTDKGVSAMNQVISLEVRSNLTDEEQRDPTNDSREIPYVHVLNQLLPDDIRISAVCLRPPPNFDARFSCVHRHYKYIFNGKNLNIEKMSKAASYFVGERDFRNFCKLDGSKQITNFKRTIISSKILPLSETFYCFDLVGSAFLWHQVRCMMAILFLVGQSLEVPEIVLRLTDIEKTPQRPVYEMANDIPLLLYDCKFPEMDWQEPTVDDYKAIKFTTATEALTLHYELKAAVCNIFKDVLPTANTNNFSKTIINLGDGRGKVVGTYVKLEDRSVMEPVEVVNAKYSKKKNNKNK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.43
2 0.39
3 0.37
4 0.34
5 0.29
6 0.29
7 0.28
8 0.25
9 0.26
10 0.27
11 0.27
12 0.23
13 0.26
14 0.23
15 0.25
16 0.33
17 0.39
18 0.42
19 0.42
20 0.43
21 0.41
22 0.45
23 0.49
24 0.47
25 0.44
26 0.41
27 0.4
28 0.44
29 0.42
30 0.44
31 0.43
32 0.43
33 0.45
34 0.46
35 0.46
36 0.43
37 0.44
38 0.42
39 0.43
40 0.41
41 0.39
42 0.4
43 0.46
44 0.52
45 0.55
46 0.61
47 0.64
48 0.69
49 0.7
50 0.72
51 0.66
52 0.64
53 0.68
54 0.64
55 0.63
56 0.63
57 0.67
58 0.66
59 0.71
60 0.71
61 0.64
62 0.64
63 0.59
64 0.59
65 0.59
66 0.63
67 0.68
68 0.69
69 0.78
70 0.78
71 0.84
72 0.84
73 0.83
74 0.84
75 0.8
76 0.79
77 0.7
78 0.64
79 0.57
80 0.49
81 0.5
82 0.39
83 0.33
84 0.26
85 0.26
86 0.26
87 0.23
88 0.23
89 0.14
90 0.16
91 0.14
92 0.14
93 0.15
94 0.13
95 0.14
96 0.12
97 0.12
98 0.11
99 0.12
100 0.12
101 0.12
102 0.14
103 0.13
104 0.14
105 0.14
106 0.14
107 0.13
108 0.13
109 0.12
110 0.11
111 0.11
112 0.09
113 0.1
114 0.11
115 0.12
116 0.12
117 0.11
118 0.12
119 0.12
120 0.13
121 0.14
122 0.16
123 0.22
124 0.25
125 0.29
126 0.27
127 0.3
128 0.3
129 0.3
130 0.31
131 0.24
132 0.24
133 0.26
134 0.31
135 0.33
136 0.38
137 0.39
138 0.37
139 0.4
140 0.39
141 0.36
142 0.35
143 0.31
144 0.23
145 0.2
146 0.18
147 0.15
148 0.11
149 0.11
150 0.08
151 0.07
152 0.07
153 0.07
154 0.08
155 0.08
156 0.09
157 0.12
158 0.13
159 0.17
160 0.19
161 0.19
162 0.19
163 0.22
164 0.23
165 0.24
166 0.24
167 0.21
168 0.21
169 0.23
170 0.23
171 0.21
172 0.21
173 0.17
174 0.17
175 0.19
176 0.16
177 0.15
178 0.15
179 0.14
180 0.12
181 0.11
182 0.1
183 0.08
184 0.07
185 0.07
186 0.06
187 0.07
188 0.11
189 0.12
190 0.13
191 0.15
192 0.18
193 0.19
194 0.21
195 0.23
196 0.27
197 0.27
198 0.28
199 0.29
200 0.3
201 0.33
202 0.33
203 0.34
204 0.32
205 0.38
206 0.38
207 0.38
208 0.37
209 0.4
210 0.43
211 0.48
212 0.46
213 0.42
214 0.45
215 0.42
216 0.47
217 0.41
218 0.37
219 0.28
220 0.27
221 0.23
222 0.2
223 0.2
224 0.12
225 0.11
226 0.11
227 0.1
228 0.11
229 0.11
230 0.11
231 0.14
232 0.14
233 0.15
234 0.18
235 0.2
236 0.19
237 0.23
238 0.22
239 0.18
240 0.26
241 0.26
242 0.26
243 0.33
244 0.38
245 0.36
246 0.41
247 0.49
248 0.44
249 0.48
250 0.44
251 0.36
252 0.34
253 0.32
254 0.32
255 0.27
256 0.26
257 0.23
258 0.26
259 0.27
260 0.24
261 0.23
262 0.19
263 0.19
264 0.18
265 0.19
266 0.16
267 0.14
268 0.15
269 0.14
270 0.13
271 0.1
272 0.1
273 0.08
274 0.07
275 0.07
276 0.06
277 0.09
278 0.11
279 0.09
280 0.1
281 0.1
282 0.1
283 0.1
284 0.11
285 0.08
286 0.07
287 0.08
288 0.07
289 0.07
290 0.06
291 0.06
292 0.04
293 0.04
294 0.04
295 0.04
296 0.04
297 0.04
298 0.04
299 0.04
300 0.04
301 0.04
302 0.04
303 0.04
304 0.05
305 0.06
306 0.08
307 0.09
308 0.15
309 0.2
310 0.24
311 0.29
312 0.32
313 0.32
314 0.32
315 0.33
316 0.34
317 0.33
318 0.32
319 0.28
320 0.26
321 0.25
322 0.23
323 0.2
324 0.13
325 0.13
326 0.12
327 0.11
328 0.1
329 0.11
330 0.13
331 0.13
332 0.13
333 0.2
334 0.24
335 0.27
336 0.28
337 0.29
338 0.28
339 0.28
340 0.31
341 0.24
342 0.19
343 0.17
344 0.18
345 0.18
346 0.21
347 0.21
348 0.19
349 0.16
350 0.19
351 0.24
352 0.23
353 0.21
354 0.18
355 0.19
356 0.19
357 0.2
358 0.19
359 0.13
360 0.11
361 0.11
362 0.1
363 0.11
364 0.13
365 0.12
366 0.14
367 0.15
368 0.16
369 0.18
370 0.19
371 0.18
372 0.18
373 0.19
374 0.2
375 0.2
376 0.22
377 0.24
378 0.3
379 0.33
380 0.31
381 0.33
382 0.3
383 0.29
384 0.28
385 0.24
386 0.24
387 0.21
388 0.23
389 0.21
390 0.23
391 0.28
392 0.27
393 0.27
394 0.22
395 0.21
396 0.18
397 0.19
398 0.2
399 0.16
400 0.2
401 0.21
402 0.25
403 0.27
404 0.27
405 0.27
406 0.27
407 0.27
408 0.25
409 0.23
410 0.18
411 0.17
412 0.17
413 0.21
414 0.19
415 0.17
416 0.21
417 0.24
418 0.27
419 0.35
420 0.42
421 0.46
422 0.56