Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

P29478

Protein Details
Accession P29478    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
253-273KITAAEKSFKPPKNKYKVVRRHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
265-267KNK
Subcellular Location(s) nucl 13.5, cyto_nucl 13, cyto 11.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002778  Signal_recog_particle_SRP19  
IPR036521  SRP19-like_sf  
IPR022938  SRP19_arc-type  
Gene Ontology GO:0005786  C:signal recognition particle, endoplasmic reticulum targeting  
GO:0008312  F:7S RNA binding  
GO:0006614  P:SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane  
GO:0006617  P:SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane, signal sequence recognition  
KEGG sce:YML105C  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01922  SRP19  
Amino Acid Sequences MPRLEEIDDFNDIDDLDMELAELDPSLRTPIAPKITPKVVRSQDQENPAFLPGTNNNSNSNNNSSNEKEQLSFINPKTGKVERSEAISKKDLEEVKRFQVLYPCYFDINRSHKEGRRVPKELAVENPLAKTMADAVRELGILCIFEGEKCHPQDFGNPGRIRVLFKENGQLIGAATKFKGGKRQLMKAVGEYMKRHPTTIESLREIPYGPDFDNIEFKKIPRVKGFKMNEIVPLHSPFLMGHPMTKSVYETPKITAAEKSFKPPKNKYKVVRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.12
2 0.09
3 0.07
4 0.07
5 0.06
6 0.06
7 0.06
8 0.06
9 0.05
10 0.05
11 0.05
12 0.06
13 0.08
14 0.08
15 0.08
16 0.11
17 0.19
18 0.25
19 0.28
20 0.32
21 0.36
22 0.45
23 0.5
24 0.5
25 0.52
26 0.52
27 0.55
28 0.56
29 0.57
30 0.54
31 0.57
32 0.56
33 0.48
34 0.43
35 0.37
36 0.33
37 0.25
38 0.24
39 0.19
40 0.24
41 0.27
42 0.27
43 0.3
44 0.33
45 0.36
46 0.35
47 0.38
48 0.34
49 0.32
50 0.35
51 0.35
52 0.37
53 0.37
54 0.34
55 0.29
56 0.26
57 0.27
58 0.27
59 0.3
60 0.26
61 0.33
62 0.31
63 0.32
64 0.36
65 0.36
66 0.34
67 0.31
68 0.35
69 0.26
70 0.32
71 0.38
72 0.35
73 0.37
74 0.38
75 0.35
76 0.31
77 0.36
78 0.34
79 0.31
80 0.35
81 0.34
82 0.34
83 0.37
84 0.36
85 0.31
86 0.34
87 0.33
88 0.29
89 0.3
90 0.27
91 0.25
92 0.25
93 0.25
94 0.27
95 0.3
96 0.29
97 0.31
98 0.35
99 0.37
100 0.45
101 0.51
102 0.53
103 0.54
104 0.55
105 0.51
106 0.51
107 0.51
108 0.44
109 0.39
110 0.32
111 0.26
112 0.23
113 0.22
114 0.16
115 0.14
116 0.12
117 0.09
118 0.09
119 0.09
120 0.09
121 0.09
122 0.1
123 0.1
124 0.1
125 0.1
126 0.07
127 0.05
128 0.04
129 0.04
130 0.04
131 0.04
132 0.04
133 0.06
134 0.08
135 0.13
136 0.14
137 0.15
138 0.15
139 0.16
140 0.21
141 0.24
142 0.26
143 0.3
144 0.29
145 0.3
146 0.31
147 0.32
148 0.29
149 0.26
150 0.28
151 0.21
152 0.21
153 0.27
154 0.25
155 0.25
156 0.23
157 0.2
158 0.15
159 0.15
160 0.14
161 0.09
162 0.08
163 0.1
164 0.12
165 0.13
166 0.21
167 0.22
168 0.3
169 0.35
170 0.41
171 0.45
172 0.48
173 0.48
174 0.42
175 0.45
176 0.4
177 0.38
178 0.34
179 0.33
180 0.36
181 0.36
182 0.35
183 0.29
184 0.29
185 0.33
186 0.38
187 0.38
188 0.33
189 0.35
190 0.37
191 0.36
192 0.33
193 0.27
194 0.22
195 0.2
196 0.16
197 0.17
198 0.17
199 0.17
200 0.26
201 0.25
202 0.27
203 0.25
204 0.25
205 0.33
206 0.36
207 0.41
208 0.41
209 0.48
210 0.49
211 0.58
212 0.63
213 0.6
214 0.61
215 0.56
216 0.54
217 0.49
218 0.46
219 0.39
220 0.37
221 0.31
222 0.26
223 0.25
224 0.18
225 0.18
226 0.21
227 0.17
228 0.18
229 0.18
230 0.21
231 0.22
232 0.22
233 0.23
234 0.24
235 0.31
236 0.32
237 0.31
238 0.31
239 0.36
240 0.37
241 0.35
242 0.35
243 0.33
244 0.38
245 0.39
246 0.45
247 0.49
248 0.55
249 0.63
250 0.67
251 0.73
252 0.75
253 0.83