FuNGI

P50875

Protein Details

Accession

P50875

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

14.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
555-601	NNNNNLDKPKVKRPRKNAKKSESGTPAPKKKRMTKKKQSASSTPSST	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
562-591	KPKVKRPRKNAKKSESGTPAPKKKRMTKKK

Subcellular Location(s)

nucl 23.5, cyto_nucl 13.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR021950 Spt20 IPR046468 Spt20-like_SEP
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0000124 C:SAGA complex GO:0046695 C:SLIK (SAGA-like) complex GO:0003712 F:transcription coregulator activity GO:0006325 P:chromatin organization GO:0016573 P:histone acetylation GO:0016578 P:histone deubiquitination GO:0036498 P:IRE1-mediated unfolded protein response GO:0006357 P:regulation of transcription by RNA polymerase II
KEGG	sce:YOL148C -
Pfam	View protein in Pfam PF12090 Spt20

Amino Acid Sequences

MSANSPTGNDPHVFGIPVNATPSNMGSPGSPVNVPPPMNPAVANVNHPVMRTNSNSNANEGTRTLTREQIQQLQQRQRLLLQQRLLEQQRKQQALQNYEAQFYQMLMTLNKRPKRLYNFVEDADSILKKYEQYLHSFEFHIYENNYKICAPANSRLQQQQKQPELTSDGLILTKNNETLKEFLEYVARGRIPDAIMEVLRDCNIQFYEGNLILQVYDHTNTVDVTPKENKPNLNSSSSPSNNNSTQDNSKIQQPSEPNSGVANTGANTANKKASFKRPRVYRTLLKPNDLTTYYDMMSYADNARFSDSIYQQFESEILTLTKRNLSLSVPLNPYEHRDMLEETAFSEPHWDSEKKSFIHEHRAESTREGTKGVVGHIEERDEFPQHSSNYEQLMLIMNERTTTITNSTFAVSLTKNAMEIASSSSNGVRGASSSTSNSASNTRNNSLANGNQVALAAAAAAAAVGSTMGNDNNQFSRLKFIEQWRINKEKRKQQALSANINPTPFNARISMTAPLTPQQQLLQRQQQALEQQQNGGAMKNANKRSGNNATSNNNNNNNNLDKPKVKRPRKNAKKSESGTPAPKKKRMTKKKQSASSTPSSTTMS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.19
2	0.21
3	0.2
4	0.2
5	0.22
6	0.19
7	0.19
8	0.19
9	0.21
10	0.18
11	0.17
12	0.16
13	0.13
14	0.16
15	0.18
16	0.19
17	0.18
18	0.17
19	0.21
20	0.26
21	0.27
22	0.24
23	0.28
24	0.28
25	0.28
26	0.28
27	0.26
28	0.27
29	0.27
30	0.3
31	0.27
32	0.28
33	0.28
34	0.28
35	0.28
36	0.24
37	0.27
38	0.29
39	0.32
40	0.36
41	0.44
42	0.45
43	0.45
44	0.46
45	0.43
46	0.4
47	0.34
48	0.31
49	0.25
50	0.28
51	0.27
52	0.28
53	0.3
54	0.34
55	0.38
56	0.43
57	0.48
58	0.52
59	0.59
60	0.63
61	0.64
62	0.61
63	0.58
64	0.52
65	0.53
66	0.52
67	0.51
68	0.46
69	0.44
70	0.45
71	0.52
72	0.56
73	0.54
74	0.51
75	0.52
76	0.56
77	0.57
78	0.54
79	0.52
80	0.54
81	0.52
82	0.53
83	0.53
84	0.45
85	0.43
86	0.41
87	0.36
88	0.27
89	0.22
90	0.18
91	0.12
92	0.12
93	0.12
94	0.16
95	0.24
96	0.32
97	0.37
98	0.39
99	0.41
100	0.48
101	0.56
102	0.61
103	0.58
104	0.59
105	0.59
106	0.57
107	0.56
108	0.47
109	0.39
110	0.33
111	0.28
112	0.19
113	0.15
114	0.15
115	0.12
116	0.15
117	0.21
118	0.21
119	0.26
120	0.31
121	0.32
122	0.34
123	0.34
124	0.32
125	0.26
126	0.24
127	0.23
128	0.19
129	0.2
130	0.21
131	0.21
132	0.21
133	0.19
134	0.19
135	0.18
136	0.2
137	0.22
138	0.26
139	0.34
140	0.36
141	0.4
142	0.48
143	0.53
144	0.55
145	0.58
146	0.61
147	0.59
148	0.59
149	0.56
150	0.51
151	0.47
152	0.42
153	0.34
154	0.25
155	0.19
156	0.16
157	0.16
158	0.13
159	0.11
160	0.11
161	0.13
162	0.13
163	0.14
164	0.15
165	0.17
166	0.18
167	0.18
168	0.17
169	0.15
170	0.17
171	0.16
172	0.16
173	0.18
174	0.17
175	0.14
176	0.15
177	0.16
178	0.14
179	0.14
180	0.14
181	0.11
182	0.11
183	0.11
184	0.11
185	0.1
186	0.1
187	0.1
188	0.08
189	0.09
190	0.09
191	0.1
192	0.09
193	0.1
194	0.14
195	0.13
196	0.14
197	0.11
198	0.11
199	0.09
200	0.09
201	0.09
202	0.06
203	0.07
204	0.07
205	0.07
206	0.07
207	0.08
208	0.09
209	0.14
210	0.13
211	0.17
212	0.22
213	0.25
214	0.31
215	0.34
216	0.36
217	0.33
218	0.41
219	0.4
220	0.39
221	0.37
222	0.34
223	0.39
224	0.38
225	0.38
226	0.33
227	0.34
228	0.31
229	0.32
230	0.31
231	0.26
232	0.27
233	0.27
234	0.28
235	0.24
236	0.28
237	0.29
238	0.28
239	0.28
240	0.29
241	0.29
242	0.32
243	0.31
244	0.25
245	0.23
246	0.23
247	0.19
248	0.17
249	0.12
250	0.07
251	0.09
252	0.09
253	0.1
254	0.1
255	0.12
256	0.15
257	0.15
258	0.17
259	0.2
260	0.29
261	0.38
262	0.44
263	0.5
264	0.55
265	0.6
266	0.64
267	0.66
268	0.63
269	0.62
270	0.66
271	0.6
272	0.55
273	0.51
274	0.45
275	0.42
276	0.36
277	0.29
278	0.2
279	0.2
280	0.17
281	0.16
282	0.15
283	0.12
284	0.11
285	0.1
286	0.1
287	0.09
288	0.09
289	0.09
290	0.1
291	0.1
292	0.1
293	0.13
294	0.13
295	0.16
296	0.18
297	0.18
298	0.17
299	0.17
300	0.17
301	0.13
302	0.11
303	0.08
304	0.06
305	0.07
306	0.07
307	0.08
308	0.1
309	0.1
310	0.1
311	0.1
312	0.1
313	0.15
314	0.17
315	0.22
316	0.22
317	0.22
318	0.23
319	0.22
320	0.25
321	0.23
322	0.21
323	0.16
324	0.16
325	0.16
326	0.17
327	0.17
328	0.13
329	0.11
330	0.12
331	0.11
332	0.09
333	0.11
334	0.09
335	0.1
336	0.15
337	0.15
338	0.16
339	0.22
340	0.28
341	0.25
342	0.28
343	0.32
344	0.3
345	0.41
346	0.41
347	0.39
348	0.4
349	0.42
350	0.4
351	0.36
352	0.38
353	0.3
354	0.28
355	0.25
356	0.19
357	0.18
358	0.18
359	0.16
360	0.14
361	0.11
362	0.13
363	0.13
364	0.14
365	0.12
366	0.13
367	0.14
368	0.14
369	0.14
370	0.13
371	0.18
372	0.17
373	0.18
374	0.18
375	0.19
376	0.19
377	0.19
378	0.17
379	0.13
380	0.15
381	0.13
382	0.12
383	0.11
384	0.09
385	0.09
386	0.09
387	0.1
388	0.09
389	0.1
390	0.12
391	0.12
392	0.13
393	0.13
394	0.14
395	0.13
396	0.12
397	0.13
398	0.11
399	0.11
400	0.12
401	0.12
402	0.11
403	0.11
404	0.11
405	0.08
406	0.09
407	0.11
408	0.1
409	0.11
410	0.11
411	0.11
412	0.12
413	0.12
414	0.12
415	0.08
416	0.07
417	0.09
418	0.1
419	0.12
420	0.12
421	0.14
422	0.16
423	0.16
424	0.17
425	0.19
426	0.21
427	0.25
428	0.29
429	0.29
430	0.3
431	0.3
432	0.31
433	0.3
434	0.28
435	0.27
436	0.23
437	0.21
438	0.19
439	0.18
440	0.16
441	0.12
442	0.1
443	0.05
444	0.03
445	0.03
446	0.02
447	0.02
448	0.02
449	0.02
450	0.02
451	0.02
452	0.02
453	0.02
454	0.04
455	0.04
456	0.06
457	0.07
458	0.09
459	0.1
460	0.13
461	0.13
462	0.13
463	0.2
464	0.2
465	0.23
466	0.27
467	0.33
468	0.42
469	0.48
470	0.55
471	0.55
472	0.63
473	0.66
474	0.7
475	0.72
476	0.71
477	0.74
478	0.76
479	0.71
480	0.71
481	0.74
482	0.72
483	0.72
484	0.68
485	0.63
486	0.55
487	0.53
488	0.44
489	0.36
490	0.35
491	0.27
492	0.23
493	0.2
494	0.19
495	0.21
496	0.23
497	0.25
498	0.21
499	0.22
500	0.21
501	0.22
502	0.24
503	0.23
504	0.22
505	0.22
506	0.27
507	0.32
508	0.4
509	0.46
510	0.48
511	0.49
512	0.49
513	0.49
514	0.49
515	0.5
516	0.49
517	0.41
518	0.37
519	0.36
520	0.38
521	0.34
522	0.28
523	0.22
524	0.18
525	0.25
526	0.33
527	0.36
528	0.4
529	0.43
530	0.44
531	0.51
532	0.57
533	0.55
534	0.53
535	0.55
536	0.54
537	0.59
538	0.65
539	0.64
540	0.63
541	0.6
542	0.55
543	0.54
544	0.52
545	0.5
546	0.47
547	0.45
548	0.45
549	0.48
550	0.57
551	0.63
552	0.69
553	0.73
554	0.8
555	0.85
556	0.89
557	0.94
558	0.94
559	0.92
560	0.92
561	0.86
562	0.85
563	0.82
564	0.78
565	0.77
566	0.77
567	0.78
568	0.76
569	0.8
570	0.79
571	0.81
572	0.85
573	0.86
574	0.87
575	0.88
576	0.9
577	0.93
578	0.93
579	0.92
580	0.9
581	0.87
582	0.84
583	0.78
584	0.7

P50875

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer