Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

P40395

Protein Details
Accession P40395    Localization Confidence Low Confidence Score 6.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
3-28IKQSEKNTPKCLYKKKGKVRVLLTGSHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 14.5, cyto_mito 10.166, nucl 7, cyto_nucl 6.833, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009771  Ribosome_control_1  
IPR040096  Ric1  
Gene Ontology GO:0005801  C:cis-Golgi network  
GO:0005829  C:cytosol  
GO:0005794  C:Golgi apparatus  
GO:0000139  C:Golgi membrane  
GO:0032045  C:guanyl-nucleotide exchange factor complex  
GO:0034066  C:Ric1-Rgp1 guanyl-nucleotide exchange factor complex  
GO:0005085  F:guanyl-nucleotide exchange factor activity  
GO:0006886  P:intracellular protein transport  
GO:0043087  P:regulation of GTPase activity  
GO:0042147  P:retrograde transport, endosome to Golgi  
KEGG sce:YLR039C  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF07064  RIC1  
Amino Acid Sequences MFIKQSEKNTPKCLYKKKGKVRVLLTGSCKKLNTWKMHLWPVSPPQLLRIPPRNAELGEGTKIDDCNILQSMTLPQANVLIMLTPTRVLIYNFKPMALVASHERTMASLKEFGDNRSMKRSAPYNDIIEGLISKKDSQYLLWHQGKLIFYVMTDKNFLLTYQILKNCTNEIIFKEYGIPVIEPLLMSEEEANSAEYDYNNDDDTLTVFDKNSSSRIIQNGFGITKEKGFLHFLSNQENIDELPVKKLELRLKVVLKFDYEIIDMIGIKTFSKVGDGRYEEVLIVLFPHGLQILTISDFKVSKSSLVEVKKGSKTIVCNKQLMVLSHDSVEKQTIVSIIDIEKQAVEAIPLTDTPDELLTCLEVNGYLVVVYKEKIICFDTRIKKVSHSWKPPFVIKLCDKINDKILLLVSEDSVNIHFYTEFGNLLFATYFDEDDYNGDNNNDNSKDKNEKKAAEYKISDFVCLDKSLITVSHSGKYQVWKLWEEIKQTQFDFRNPKCYVLTNTNNDVIIYSPVTSSSINNDNLQVIKLPTKTFNNHIAFVKINSSLRLFATYVSNKNILLIHNLETNMWSSFADQNVLDLHWLGDNYLVCHMKNDDGSTNLKCLQIPLQEANPDVELSDYVMWEYNVPENTIVFSLHVNTLSRYKLLKMKSKNHNASEKQPDALLKTAEIILVTDTQTIVFDVISTVHPCGLNIIKKFYQYLKINIPIDVLPNKIEWIINMKEGLLFFADRKFIKLGKVDGGGWQTLTLLDNIEKIIDVIRDEIFVVQGHNYVVYSLEDLWDDKKPLVSIPIEEDLYPISTTPETATTHTLHCIFNARFSKLVVKHQIYLDQLILAKLEDNTDLEDISHNYRFLKPYKFALEKILSTKILRSDSLDDILKLIKMYDNTDPEHNISPPTHSGMLEIISNCLRKIETKYWNHLFTNLKMTPRDLLALCIEENEAKMLGVLLLVFLNYDEKDLGDDLHFKKSDLGTEESKALNDNSTKKSEKSVTNLLKDEELMLKVLELLVTSAANATDPIKATDSWDMCFQLIRLLKELDRENNTQLVQKALERFK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.76
2 0.79
3 0.84
4 0.87
5 0.91
6 0.89
7 0.88
8 0.83
9 0.83
10 0.79
11 0.75
12 0.73
13 0.71
14 0.67
15 0.62
16 0.56
17 0.49
18 0.52
19 0.54
20 0.54
21 0.53
22 0.58
23 0.61
24 0.7
25 0.7
26 0.62
27 0.6
28 0.59
29 0.59
30 0.53
31 0.46
32 0.42
33 0.45
34 0.48
35 0.49
36 0.51
37 0.49
38 0.5
39 0.53
40 0.52
41 0.46
42 0.45
43 0.41
44 0.35
45 0.32
46 0.28
47 0.27
48 0.25
49 0.25
50 0.22
51 0.2
52 0.16
53 0.17
54 0.18
55 0.16
56 0.14
57 0.15
58 0.17
59 0.2
60 0.21
61 0.17
62 0.15
63 0.17
64 0.17
65 0.16
66 0.13
67 0.09
68 0.08
69 0.09
70 0.09
71 0.08
72 0.08
73 0.09
74 0.1
75 0.12
76 0.19
77 0.22
78 0.31
79 0.31
80 0.31
81 0.3
82 0.29
83 0.29
84 0.22
85 0.22
86 0.18
87 0.23
88 0.23
89 0.23
90 0.23
91 0.21
92 0.23
93 0.22
94 0.19
95 0.18
96 0.19
97 0.26
98 0.27
99 0.28
100 0.35
101 0.36
102 0.36
103 0.4
104 0.4
105 0.34
106 0.39
107 0.45
108 0.4
109 0.44
110 0.46
111 0.41
112 0.41
113 0.41
114 0.35
115 0.28
116 0.24
117 0.18
118 0.15
119 0.13
120 0.13
121 0.13
122 0.16
123 0.17
124 0.17
125 0.24
126 0.3
127 0.39
128 0.43
129 0.43
130 0.41
131 0.45
132 0.44
133 0.37
134 0.31
135 0.2
136 0.15
137 0.22
138 0.23
139 0.2
140 0.22
141 0.2
142 0.2
143 0.2
144 0.2
145 0.15
146 0.15
147 0.17
148 0.22
149 0.26
150 0.28
151 0.29
152 0.31
153 0.29
154 0.3
155 0.27
156 0.22
157 0.22
158 0.25
159 0.24
160 0.23
161 0.23
162 0.21
163 0.22
164 0.2
165 0.17
166 0.11
167 0.12
168 0.12
169 0.09
170 0.09
171 0.11
172 0.09
173 0.1
174 0.1
175 0.09
176 0.1
177 0.11
178 0.11
179 0.08
180 0.09
181 0.09
182 0.09
183 0.11
184 0.12
185 0.13
186 0.13
187 0.12
188 0.12
189 0.11
190 0.12
191 0.13
192 0.12
193 0.12
194 0.11
195 0.12
196 0.14
197 0.15
198 0.16
199 0.16
200 0.17
201 0.19
202 0.24
203 0.26
204 0.25
205 0.26
206 0.27
207 0.25
208 0.24
209 0.23
210 0.19
211 0.17
212 0.18
213 0.17
214 0.15
215 0.18
216 0.19
217 0.21
218 0.24
219 0.25
220 0.29
221 0.3
222 0.27
223 0.24
224 0.24
225 0.19
226 0.17
227 0.19
228 0.14
229 0.16
230 0.16
231 0.16
232 0.18
233 0.24
234 0.28
235 0.3
236 0.34
237 0.38
238 0.42
239 0.46
240 0.47
241 0.43
242 0.38
243 0.33
244 0.28
245 0.23
246 0.19
247 0.15
248 0.12
249 0.11
250 0.1
251 0.09
252 0.09
253 0.08
254 0.07
255 0.08
256 0.08
257 0.07
258 0.11
259 0.12
260 0.13
261 0.2
262 0.23
263 0.24
264 0.25
265 0.26
266 0.22
267 0.2
268 0.18
269 0.1
270 0.08
271 0.06
272 0.05
273 0.04
274 0.05
275 0.05
276 0.05
277 0.05
278 0.05
279 0.06
280 0.08
281 0.08
282 0.08
283 0.1
284 0.1
285 0.11
286 0.13
287 0.12
288 0.12
289 0.13
290 0.16
291 0.2
292 0.23
293 0.26
294 0.27
295 0.33
296 0.34
297 0.33
298 0.32
299 0.29
300 0.32
301 0.39
302 0.46
303 0.43
304 0.43
305 0.42
306 0.46
307 0.45
308 0.4
309 0.35
310 0.27
311 0.24
312 0.23
313 0.24
314 0.18
315 0.16
316 0.16
317 0.12
318 0.09
319 0.09
320 0.09
321 0.09
322 0.08
323 0.09
324 0.08
325 0.11
326 0.11
327 0.1
328 0.09
329 0.09
330 0.09
331 0.08
332 0.07
333 0.05
334 0.05
335 0.06
336 0.06
337 0.07
338 0.07
339 0.07
340 0.07
341 0.08
342 0.07
343 0.07
344 0.07
345 0.06
346 0.06
347 0.06
348 0.05
349 0.04
350 0.04
351 0.04
352 0.04
353 0.04
354 0.04
355 0.05
356 0.06
357 0.06
358 0.08
359 0.09
360 0.09
361 0.11
362 0.13
363 0.13
364 0.16
365 0.26
366 0.3
367 0.35
368 0.38
369 0.37
370 0.38
371 0.45
372 0.52
373 0.52
374 0.55
375 0.56
376 0.59
377 0.61
378 0.61
379 0.58
380 0.5
381 0.48
382 0.41
383 0.42
384 0.37
385 0.4
386 0.39
387 0.36
388 0.39
389 0.33
390 0.3
391 0.25
392 0.23
393 0.18
394 0.16
395 0.14
396 0.1
397 0.08
398 0.08
399 0.07
400 0.07
401 0.07
402 0.06
403 0.06
404 0.06
405 0.06
406 0.08
407 0.08
408 0.08
409 0.07
410 0.08
411 0.07
412 0.07
413 0.07
414 0.05
415 0.07
416 0.07
417 0.07
418 0.07
419 0.07
420 0.07
421 0.08
422 0.1
423 0.08
424 0.08
425 0.09
426 0.1
427 0.1
428 0.14
429 0.14
430 0.13
431 0.14
432 0.18
433 0.27
434 0.29
435 0.37
436 0.4
437 0.41
438 0.45
439 0.52
440 0.51
441 0.48
442 0.47
443 0.4
444 0.41
445 0.39
446 0.35
447 0.26
448 0.23
449 0.18
450 0.17
451 0.15
452 0.08
453 0.08
454 0.08
455 0.08
456 0.08
457 0.1
458 0.12
459 0.13
460 0.14
461 0.15
462 0.17
463 0.19
464 0.2
465 0.19
466 0.21
467 0.2
468 0.21
469 0.27
470 0.28
471 0.3
472 0.32
473 0.32
474 0.32
475 0.31
476 0.35
477 0.29
478 0.31
479 0.36
480 0.32
481 0.38
482 0.36
483 0.38
484 0.34
485 0.35
486 0.34
487 0.33
488 0.38
489 0.33
490 0.35
491 0.34
492 0.32
493 0.3
494 0.26
495 0.18
496 0.13
497 0.09
498 0.07
499 0.06
500 0.06
501 0.07
502 0.08
503 0.07
504 0.09
505 0.14
506 0.15
507 0.15
508 0.16
509 0.15
510 0.15
511 0.15
512 0.13
513 0.09
514 0.1
515 0.11
516 0.12
517 0.14
518 0.17
519 0.19
520 0.22
521 0.3
522 0.29
523 0.3
524 0.3
525 0.29
526 0.26
527 0.25
528 0.23
529 0.15
530 0.14
531 0.12
532 0.12
533 0.12
534 0.11
535 0.13
536 0.11
537 0.1
538 0.15
539 0.16
540 0.18
541 0.19
542 0.19
543 0.17
544 0.18
545 0.19
546 0.14
547 0.14
548 0.13
549 0.12
550 0.13
551 0.14
552 0.13
553 0.12
554 0.12
555 0.1
556 0.09
557 0.08
558 0.08
559 0.09
560 0.09
561 0.1
562 0.09
563 0.09
564 0.09
565 0.09
566 0.07
567 0.06
568 0.06
569 0.05
570 0.05
571 0.05
572 0.06
573 0.06
574 0.07
575 0.1
576 0.11
577 0.1
578 0.11
579 0.12
580 0.12
581 0.12
582 0.13
583 0.11
584 0.12
585 0.15
586 0.15
587 0.17
588 0.17
589 0.17
590 0.15
591 0.15
592 0.16
593 0.16
594 0.18
595 0.18
596 0.18
597 0.18
598 0.19
599 0.18
600 0.15
601 0.12
602 0.1
603 0.08
604 0.06
605 0.06
606 0.06
607 0.05
608 0.05
609 0.06
610 0.06
611 0.06
612 0.07
613 0.09
614 0.09
615 0.1
616 0.09
617 0.09
618 0.1
619 0.1
620 0.09
621 0.07
622 0.06
623 0.07
624 0.08
625 0.09
626 0.09
627 0.09
628 0.12
629 0.12
630 0.14
631 0.13
632 0.15
633 0.19
634 0.25
635 0.32
636 0.38
637 0.47
638 0.55
639 0.65
640 0.7
641 0.71
642 0.75
643 0.7
644 0.69
645 0.69
646 0.6
647 0.5
648 0.44
649 0.38
650 0.31
651 0.3
652 0.22
653 0.13
654 0.12
655 0.12
656 0.11
657 0.1
658 0.08
659 0.06
660 0.07
661 0.07
662 0.07
663 0.06
664 0.06
665 0.06
666 0.06
667 0.06
668 0.04
669 0.04
670 0.04
671 0.05
672 0.06
673 0.07
674 0.07
675 0.09
676 0.09
677 0.09
678 0.11
679 0.15
680 0.19
681 0.19
682 0.24
683 0.24
684 0.25
685 0.27
686 0.27
687 0.31
688 0.3
689 0.33
690 0.34
691 0.4
692 0.4
693 0.38
694 0.37
695 0.28
696 0.28
697 0.25
698 0.2
699 0.14
700 0.13
701 0.13
702 0.13
703 0.12
704 0.09
705 0.14
706 0.14
707 0.14
708 0.14
709 0.14
710 0.14
711 0.14
712 0.14
713 0.09
714 0.09
715 0.08
716 0.1
717 0.13
718 0.12
719 0.15
720 0.16
721 0.17
722 0.2
723 0.23
724 0.23
725 0.24
726 0.25
727 0.24
728 0.25
729 0.25
730 0.21
731 0.18
732 0.15
733 0.12
734 0.1
735 0.11
736 0.07
737 0.07
738 0.07
739 0.07
740 0.07
741 0.07
742 0.07
743 0.06
744 0.08
745 0.07
746 0.07
747 0.09
748 0.09
749 0.09
750 0.09
751 0.09
752 0.09
753 0.08
754 0.09
755 0.07
756 0.08
757 0.08
758 0.08
759 0.07
760 0.07
761 0.07
762 0.07
763 0.08
764 0.07
765 0.07
766 0.08
767 0.09
768 0.11
769 0.12
770 0.13
771 0.13
772 0.14
773 0.14
774 0.14
775 0.18
776 0.17
777 0.16
778 0.19
779 0.21
780 0.2
781 0.19
782 0.19
783 0.16
784 0.16
785 0.14
786 0.1
787 0.09
788 0.08
789 0.09
790 0.1
791 0.12
792 0.13
793 0.15
794 0.18
795 0.18
796 0.19
797 0.21
798 0.23
799 0.2
800 0.19
801 0.25
802 0.22
803 0.28
804 0.32
805 0.31
806 0.29
807 0.3
808 0.38
809 0.34
810 0.42
811 0.43
812 0.41
813 0.43
814 0.44
815 0.47
816 0.4
817 0.38
818 0.3
819 0.23
820 0.2
821 0.17
822 0.16
823 0.11
824 0.11
825 0.09
826 0.1
827 0.08
828 0.08
829 0.1
830 0.1
831 0.1
832 0.09
833 0.11
834 0.12
835 0.16
836 0.17
837 0.16
838 0.18
839 0.21
840 0.25
841 0.28
842 0.33
843 0.32
844 0.37
845 0.45
846 0.47
847 0.45
848 0.49
849 0.48
850 0.43
851 0.44
852 0.42
853 0.35
854 0.33
855 0.34
856 0.31
857 0.3
858 0.27
859 0.27
860 0.27
861 0.27
862 0.31
863 0.29
864 0.24
865 0.22
866 0.23
867 0.2
868 0.15
869 0.13
870 0.13
871 0.13
872 0.16
873 0.21
874 0.24
875 0.26
876 0.29
877 0.3
878 0.31
879 0.32
880 0.3
881 0.27
882 0.24
883 0.25
884 0.25
885 0.26
886 0.25
887 0.22
888 0.22
889 0.2
890 0.2
891 0.19
892 0.17
893 0.15
894 0.17
895 0.18
896 0.17
897 0.17
898 0.16
899 0.17
900 0.25
901 0.31
902 0.38
903 0.45
904 0.54
905 0.6
906 0.65
907 0.62
908 0.61
909 0.56
910 0.5
911 0.52
912 0.46
913 0.43
914 0.39
915 0.4
916 0.36
917 0.32
918 0.33
919 0.24
920 0.23
921 0.21
922 0.22
923 0.2
924 0.18
925 0.18
926 0.14
927 0.15
928 0.13
929 0.11
930 0.09
931 0.09
932 0.08
933 0.07
934 0.06
935 0.06
936 0.05
937 0.05
938 0.05
939 0.05
940 0.05
941 0.07
942 0.07
943 0.08
944 0.08
945 0.08
946 0.1
947 0.11
948 0.12
949 0.12
950 0.19
951 0.2
952 0.29
953 0.29
954 0.27
955 0.32
956 0.32
957 0.36
958 0.33
959 0.36
960 0.31
961 0.33
962 0.36
963 0.32
964 0.31
965 0.27
966 0.24
967 0.24
968 0.26
969 0.3
970 0.32
971 0.39
972 0.42
973 0.41
974 0.48
975 0.5
976 0.5
977 0.51
978 0.56
979 0.58
980 0.61
981 0.63
982 0.57
983 0.51
984 0.45
985 0.41
986 0.33
987 0.25
988 0.19
989 0.16
990 0.14
991 0.13
992 0.13
993 0.1
994 0.07
995 0.07
996 0.07
997 0.07
998 0.07
999 0.07
1000 0.07
1001 0.07
1002 0.08
1003 0.08
1004 0.11
1005 0.12
1006 0.15
1007 0.16
1008 0.17
1009 0.2
1010 0.28
1011 0.28
1012 0.27
1013 0.3
1014 0.29
1015 0.27
1016 0.28
1017 0.24
1018 0.23
1019 0.27
1020 0.27
1021 0.27
1022 0.29
1023 0.3
1024 0.35
1025 0.41
1026 0.42
1027 0.43
1028 0.44
1029 0.44
1030 0.46
1031 0.46
1032 0.44
1033 0.4
1034 0.35
1035 0.31
1036 0.32