Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

P40160

Protein Details
Accession P40160    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
273-294VDCIRRFFKKKLKYEPKPDSSMHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 13.333, cyto 4, cyto_mito 3.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011009  Kinase-like_dom_sf  
IPR030484  Rio2  
IPR015285  RIO2_wHTH_N  
IPR000687  RIO_kinase  
IPR036388  WH-like_DNA-bd_sf  
IPR036390  WH_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0010494  C:cytoplasmic stress granule  
GO:0005829  C:cytosol  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0030688  C:preribosome, small subunit precursor  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0004672  F:protein kinase activity  
GO:0106310  F:protein serine kinase activity  
GO:0004674  F:protein serine/threonine kinase activity  
GO:0030490  P:maturation of SSU-rRNA  
GO:0000462  P:maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0046830  P:positive regulation of RNA import into nucleus  
GO:0006468  P:protein phosphorylation  
KEGG sce:YNL207W  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01163  RIO1  
PF09202  Rio2_N  
CDD cd05144  RIO2_C  
Amino Acid Sequences MKLDTSHMRYLTTDDFRVLQAVEQGSRSHEVVPTPLIHQISGMRSQSGTNRAISDLAKLSLISKMRNVKYDGYRLTYNGIDYLALKTMLNRDTVYSVGNTIGVGKESDIYKVSDKNGNPRVMKIHRLGRTSFHSVRNNRDYLKKSNQGANWMHLSRLAANKEYQFMSMLYSKGFKVPEPFDNSRHIVVMELIEGYPMRRLRKHKNIPKLYSDLMCFIVDLANSGLIHCDFNEFNIMIKDKLEDENDCGFVVIDFPQCISIQHQDADYYFQRDVDCIRRFFKKKLKYEPKPDSSMLDTEGFGDGYKYAYPDFKRDVKRTDNLDELVQASGFSKKHPGDRGLETAVESMRNAVYNSDDDMSNDEAEEENGEGDYSEEDEYYDSELDNESSEDDSEDAQEEENERIIEALSSGVENLKMDKLGNYILE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.29
2 0.3
3 0.29
4 0.3
5 0.25
6 0.18
7 0.18
8 0.2
9 0.2
10 0.2
11 0.2
12 0.22
13 0.24
14 0.24
15 0.21
16 0.2
17 0.2
18 0.21
19 0.23
20 0.22
21 0.2
22 0.24
23 0.23
24 0.21
25 0.21
26 0.22
27 0.23
28 0.27
29 0.27
30 0.23
31 0.23
32 0.25
33 0.3
34 0.32
35 0.31
36 0.27
37 0.27
38 0.27
39 0.29
40 0.27
41 0.26
42 0.21
43 0.2
44 0.18
45 0.16
46 0.16
47 0.19
48 0.21
49 0.19
50 0.23
51 0.31
52 0.34
53 0.38
54 0.41
55 0.43
56 0.48
57 0.54
58 0.52
59 0.47
60 0.46
61 0.42
62 0.42
63 0.35
64 0.29
65 0.22
66 0.18
67 0.14
68 0.13
69 0.14
70 0.12
71 0.11
72 0.11
73 0.11
74 0.16
75 0.17
76 0.18
77 0.17
78 0.17
79 0.18
80 0.19
81 0.18
82 0.13
83 0.13
84 0.11
85 0.11
86 0.09
87 0.09
88 0.08
89 0.08
90 0.08
91 0.07
92 0.09
93 0.1
94 0.11
95 0.12
96 0.13
97 0.15
98 0.18
99 0.21
100 0.25
101 0.26
102 0.34
103 0.41
104 0.45
105 0.44
106 0.43
107 0.48
108 0.45
109 0.5
110 0.46
111 0.47
112 0.46
113 0.48
114 0.47
115 0.44
116 0.46
117 0.48
118 0.47
119 0.47
120 0.5
121 0.51
122 0.58
123 0.6
124 0.57
125 0.52
126 0.54
127 0.51
128 0.51
129 0.56
130 0.54
131 0.51
132 0.54
133 0.53
134 0.54
135 0.51
136 0.46
137 0.42
138 0.36
139 0.32
140 0.27
141 0.26
142 0.2
143 0.24
144 0.22
145 0.18
146 0.2
147 0.21
148 0.22
149 0.22
150 0.19
151 0.15
152 0.13
153 0.14
154 0.14
155 0.14
156 0.12
157 0.13
158 0.12
159 0.14
160 0.15
161 0.13
162 0.16
163 0.19
164 0.24
165 0.31
166 0.33
167 0.33
168 0.37
169 0.38
170 0.33
171 0.3
172 0.25
173 0.17
174 0.15
175 0.12
176 0.08
177 0.06
178 0.06
179 0.05
180 0.05
181 0.05
182 0.08
183 0.11
184 0.13
185 0.18
186 0.25
187 0.34
188 0.46
189 0.56
190 0.61
191 0.69
192 0.76
193 0.75
194 0.73
195 0.67
196 0.58
197 0.49
198 0.41
199 0.32
200 0.24
201 0.2
202 0.15
203 0.11
204 0.1
205 0.08
206 0.08
207 0.06
208 0.05
209 0.05
210 0.05
211 0.06
212 0.05
213 0.06
214 0.05
215 0.07
216 0.06
217 0.07
218 0.09
219 0.08
220 0.09
221 0.1
222 0.11
223 0.1
224 0.1
225 0.1
226 0.1
227 0.12
228 0.13
229 0.11
230 0.15
231 0.16
232 0.17
233 0.16
234 0.14
235 0.12
236 0.11
237 0.11
238 0.08
239 0.07
240 0.06
241 0.07
242 0.08
243 0.08
244 0.08
245 0.1
246 0.12
247 0.13
248 0.14
249 0.14
250 0.13
251 0.14
252 0.18
253 0.17
254 0.16
255 0.15
256 0.15
257 0.15
258 0.15
259 0.18
260 0.22
261 0.25
262 0.25
263 0.28
264 0.36
265 0.4
266 0.47
267 0.54
268 0.55
269 0.59
270 0.68
271 0.76
272 0.77
273 0.84
274 0.86
275 0.83
276 0.78
277 0.7
278 0.62
279 0.53
280 0.45
281 0.37
282 0.28
283 0.22
284 0.17
285 0.17
286 0.14
287 0.11
288 0.1
289 0.07
290 0.07
291 0.07
292 0.07
293 0.08
294 0.13
295 0.15
296 0.2
297 0.25
298 0.32
299 0.4
300 0.44
301 0.51
302 0.52
303 0.57
304 0.58
305 0.57
306 0.53
307 0.47
308 0.42
309 0.36
310 0.3
311 0.24
312 0.18
313 0.13
314 0.1
315 0.13
316 0.13
317 0.13
318 0.19
319 0.21
320 0.28
321 0.34
322 0.37
323 0.38
324 0.43
325 0.47
326 0.41
327 0.39
328 0.34
329 0.3
330 0.26
331 0.21
332 0.16
333 0.13
334 0.11
335 0.12
336 0.11
337 0.1
338 0.12
339 0.13
340 0.15
341 0.15
342 0.14
343 0.14
344 0.17
345 0.18
346 0.16
347 0.14
348 0.13
349 0.11
350 0.12
351 0.12
352 0.09
353 0.07
354 0.07
355 0.07
356 0.06
357 0.06
358 0.07
359 0.07
360 0.07
361 0.07
362 0.07
363 0.08
364 0.09
365 0.11
366 0.1
367 0.09
368 0.09
369 0.1
370 0.1
371 0.11
372 0.1
373 0.1
374 0.1
375 0.1
376 0.1
377 0.1
378 0.1
379 0.1
380 0.11
381 0.11
382 0.1
383 0.12
384 0.13
385 0.13
386 0.15
387 0.14
388 0.13
389 0.12
390 0.12
391 0.11
392 0.09
393 0.09
394 0.07
395 0.07
396 0.08
397 0.09
398 0.09
399 0.1
400 0.12
401 0.13
402 0.13
403 0.14
404 0.15
405 0.17