Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q12339

Protein Details
Accession Q12339    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
199-249PKAPNPLSVKKKKKVNSPSDEVKDKEDTSKEKKKRRRRKHKSNTNVPVSNGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
192-239TKKRKLGPKAPNPLSVKKKKKVNSPSDEVKDKEDTSKEKKKRRRRKHK
Subcellular Location(s) nucl 18, mito_nucl 13.499, cyto_nucl 11.333, mito 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006984  Fcf1/Utp23  
IPR029060  PIN-like_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005739  C:mitochondrion  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0005654  C:nucleoplasm  
GO:0032040  C:small-subunit processome  
GO:0070181  F:small ribosomal subunit rRNA binding  
GO:0000480  P:endonucleolytic cleavage in 5'-ETS of tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000447  P:endonucleolytic cleavage in ITS1 to separate SSU-rRNA from 5.8S rRNA and LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000472  P:endonucleolytic cleavage to generate mature 5'-end of SSU-rRNA from (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0030490  P:maturation of SSU-rRNA  
GO:0000462  P:maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
KEGG sce:YOR004W  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04900  Fcf1  
CDD cd09865  PIN_ScUtp23p-like  
Amino Acid Sequences MRQKRAKSYRKQLLVYSHTFKFREPYQVLVDNQLVLECNNSNFNLPSGLKRTLQADVKVMITQCCIQALYETRNDGAINLAKQFERRRCNHSFKDPKSPAECIESVVNISGANKHRYVVASQDIDLRRKLRTVPGVPLIHLTRSVMVMEPLSTASAKASKITEEQKLYKGLNDPNIEKLQESGDGSGKESITKKRKLGPKAPNPLSVKKKKKVNSPSDEVKDKEDTSKEKKKRRRRKHKSNTNVPVSNGTTAAQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.72
2 0.69
3 0.63
4 0.57
5 0.55
6 0.52
7 0.47
8 0.43
9 0.4
10 0.42
11 0.38
12 0.39
13 0.39
14 0.45
15 0.44
16 0.43
17 0.4
18 0.3
19 0.29
20 0.24
21 0.18
22 0.12
23 0.13
24 0.1
25 0.11
26 0.13
27 0.13
28 0.15
29 0.15
30 0.16
31 0.18
32 0.18
33 0.22
34 0.25
35 0.28
36 0.27
37 0.28
38 0.29
39 0.3
40 0.34
41 0.31
42 0.29
43 0.27
44 0.27
45 0.27
46 0.25
47 0.2
48 0.17
49 0.16
50 0.14
51 0.13
52 0.12
53 0.1
54 0.13
55 0.16
56 0.18
57 0.19
58 0.2
59 0.19
60 0.2
61 0.2
62 0.16
63 0.16
64 0.15
65 0.14
66 0.14
67 0.15
68 0.14
69 0.19
70 0.26
71 0.31
72 0.36
73 0.39
74 0.45
75 0.52
76 0.6
77 0.63
78 0.67
79 0.7
80 0.66
81 0.73
82 0.69
83 0.66
84 0.61
85 0.56
86 0.46
87 0.41
88 0.36
89 0.27
90 0.24
91 0.19
92 0.15
93 0.14
94 0.12
95 0.07
96 0.07
97 0.1
98 0.13
99 0.15
100 0.15
101 0.15
102 0.16
103 0.17
104 0.17
105 0.15
106 0.17
107 0.15
108 0.15
109 0.21
110 0.21
111 0.22
112 0.23
113 0.21
114 0.18
115 0.18
116 0.19
117 0.18
118 0.23
119 0.24
120 0.26
121 0.32
122 0.32
123 0.31
124 0.33
125 0.29
126 0.22
127 0.2
128 0.16
129 0.09
130 0.09
131 0.09
132 0.07
133 0.06
134 0.06
135 0.06
136 0.06
137 0.06
138 0.06
139 0.06
140 0.05
141 0.06
142 0.08
143 0.08
144 0.09
145 0.1
146 0.11
147 0.15
148 0.19
149 0.23
150 0.25
151 0.28
152 0.29
153 0.32
154 0.31
155 0.29
156 0.31
157 0.29
158 0.31
159 0.33
160 0.31
161 0.32
162 0.34
163 0.32
164 0.27
165 0.24
166 0.19
167 0.17
168 0.17
169 0.13
170 0.15
171 0.15
172 0.16
173 0.18
174 0.16
175 0.18
176 0.21
177 0.29
178 0.34
179 0.39
180 0.42
181 0.47
182 0.55
183 0.61
184 0.67
185 0.69
186 0.71
187 0.76
188 0.76
189 0.77
190 0.75
191 0.75
192 0.75
193 0.75
194 0.75
195 0.72
196 0.76
197 0.74
198 0.79
199 0.81
200 0.81
201 0.79
202 0.78
203 0.8
204 0.78
205 0.78
206 0.69
207 0.62
208 0.56
209 0.49
210 0.47
211 0.43
212 0.43
213 0.47
214 0.56
215 0.61
216 0.67
217 0.76
218 0.81
219 0.86
220 0.9
221 0.93
222 0.93
223 0.95
224 0.96
225 0.97
226 0.97
227 0.97
228 0.96
229 0.94
230 0.87
231 0.78
232 0.73
233 0.65
234 0.55