FuNGI

Q04779

Protein Details

Accession

Q04779

Localization Confidence

High

Confidence Score

17.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
22-50	SSSLSSSSSKEKKRPKRLSSQNVNYDLKR	Hydrophilic
552-571	FDKIYKSKMVQKRKLFQFQE	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
33-37	KKRPK

Subcellular Location(s)

nucl 19, cyto 6

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR019786 Zinc_finger_PHD-type_CS IPR011011 Znf_FYVE_PHD IPR001965 Znf_PHD IPR019787 Znf_PHD-finger IPR013083 Znf_RING/FYVE/PHD
Gene Ontology	GO:0000118 C:histone deacetylase complex GO:0005634 C:nucleus GO:0032221 C:Rpd3S/Clr6-CII complex GO:0046872 F:metal ion binding GO:0060195 P:negative regulation of antisense RNA transcription GO:0000122 P:negative regulation of transcription by RNA polymerase II GO:0006334 P:nucleosome assembly GO:0045944 P:positive regulation of transcription by RNA polymerase II GO:0030174 P:regulation of DNA-templated DNA replication initiation GO:0006357 P:regulation of transcription by RNA polymerase II GO:0006368 P:transcription elongation by RNA polymerase II
KEGG	sce:YMR075W -
Pfam	View protein in Pfam PF00628 PHD
PROSITE	View protein in PROSITE PS01359 ZF_PHD_1 PS50016 ZF_PHD_2
CDD	cd15535 PHD1_Rco1 cd15534 PHD2_PHF12_Rco1

Amino Acid Sequences

MDTSKKDTTRSPSHSNSSSPSSSSLSSSSSKEKKRPKRLSSQNVNYDLKRRKIITSEGIERSFKNEHSNLAVEDNIPEEEPKELLEKDSKGNIIKLNEPSTISEDSKVSVTGLPLNKGPSEKIKRESLWNYRKNLGGQSNNSEMTLVPSKRFTQVPKNFQDLNRNDLKTFLTENMTEESNIRSTIGWNGDIINRTRDREPESDRDNKKLSNIRTKIILSTNATYDSKSKLFGQNSIKSTSNASEKIFRDKNNSTIDFENEDFCSACNQSGSFLCCDTCPKSFHFLCLDPPIDPNNLPKGDWHCNECKFKIFINNSMATLKKIESNFIKQNNNVKIFAKLLFNIDSHNPKQFQLPNYIKETFPAVKTGSRGQYSDENDKIPLTDRQLFNTSYGQSITKLDSYNPDTHIDSNSGKFLICYKCNQTRLGSWSHPENSRLIMTCDYCQTPWHLDCVPRASFKNLGSKWKCPLHSPTKVYKKIHHCQEDNSVNYKVWKKQRLINKKNQLYYEPLQKIGYQNNGNIQIIPTTSHTDYDFNQDFKITQIDENSIKYDFFDKIYKSKMVQKRKLFQFQESLIDKLVSNGSQNGNSEDNMVKDIASLIYFQVSNNDKSSNNKSASKSNNLRKLWDLKELTNVVVPNELDSIQFNDFSSDEIKHLLYLKKIIESKPKEELLKFLNIENPENQSE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.67
2	0.64
3	0.6
4	0.57
5	0.51
6	0.44
7	0.4
8	0.35
9	0.33
10	0.31
11	0.28
12	0.25
13	0.25
14	0.28
15	0.34
16	0.4
17	0.47
18	0.54
19	0.63
20	0.7
21	0.79
22	0.86
23	0.85
24	0.87
25	0.91
26	0.93
27	0.93
28	0.92
29	0.9
30	0.88
31	0.84
32	0.75
33	0.74
34	0.71
35	0.66
36	0.62
37	0.56
38	0.52
39	0.52
40	0.57
41	0.56
42	0.56
43	0.58
44	0.57
45	0.58
46	0.55
47	0.5
48	0.48
49	0.43
50	0.36
51	0.36
52	0.32
53	0.31
54	0.34
55	0.36
56	0.32
57	0.3
58	0.29
59	0.21
60	0.2
61	0.19
62	0.15
63	0.13
64	0.12
65	0.1
66	0.11
67	0.1
68	0.11
69	0.13
70	0.13
71	0.16
72	0.21
73	0.23
74	0.26
75	0.3
76	0.32
77	0.31
78	0.35
79	0.36
80	0.34
81	0.37
82	0.39
83	0.38
84	0.36
85	0.35
86	0.34
87	0.33
88	0.34
89	0.29
90	0.26
91	0.23
92	0.22
93	0.22
94	0.19
95	0.16
96	0.13
97	0.13
98	0.18
99	0.2
100	0.21
101	0.22
102	0.24
103	0.24
104	0.24
105	0.26
106	0.3
107	0.36
108	0.4
109	0.43
110	0.49
111	0.49
112	0.57
113	0.63
114	0.63
115	0.65
116	0.66
117	0.66
118	0.62
119	0.63
120	0.57
121	0.55
122	0.52
123	0.49
124	0.46
125	0.47
126	0.48
127	0.45
128	0.42
129	0.35
130	0.27
131	0.25
132	0.28
133	0.24
134	0.21
135	0.24
136	0.26
137	0.29
138	0.32
139	0.33
140	0.36
141	0.44
142	0.52
143	0.54
144	0.59
145	0.6
146	0.59
147	0.64
148	0.56
149	0.52
150	0.51
151	0.47
152	0.41
153	0.38
154	0.36
155	0.28
156	0.28
157	0.24
158	0.19
159	0.18
160	0.19
161	0.2
162	0.19
163	0.17
164	0.16
165	0.16
166	0.14
167	0.13
168	0.12
169	0.1
170	0.11
171	0.15
172	0.16
173	0.15
174	0.14
175	0.15
176	0.17
177	0.2
178	0.21
179	0.22
180	0.22
181	0.25
182	0.27
183	0.29
184	0.32
185	0.35
186	0.4
187	0.41
188	0.45
189	0.52
190	0.53
191	0.55
192	0.52
193	0.47
194	0.48
195	0.47
196	0.48
197	0.49
198	0.49
199	0.45
200	0.47
201	0.46
202	0.43
203	0.38
204	0.36
205	0.28
206	0.27
207	0.27
208	0.26
209	0.25
210	0.23
211	0.21
212	0.21
213	0.18
214	0.18
215	0.2
216	0.24
217	0.25
218	0.31
219	0.38
220	0.41
221	0.43
222	0.45
223	0.43
224	0.36
225	0.37
226	0.33
227	0.3
228	0.25
229	0.24
230	0.27
231	0.27
232	0.36
233	0.38
234	0.36
235	0.39
236	0.39
237	0.44
238	0.44
239	0.45
240	0.39
241	0.36
242	0.37
243	0.32
244	0.3
245	0.25
246	0.18
247	0.17
248	0.14
249	0.13
250	0.12
251	0.1
252	0.1
253	0.08
254	0.08
255	0.09
256	0.11
257	0.13
258	0.11
259	0.11
260	0.11
261	0.11
262	0.14
263	0.16
264	0.17
265	0.17
266	0.18
267	0.25
268	0.25
269	0.28
270	0.28
271	0.26
272	0.27
273	0.29
274	0.28
275	0.21
276	0.22
277	0.21
278	0.19
279	0.18
280	0.18
281	0.19
282	0.19
283	0.19
284	0.2
285	0.24
286	0.3
287	0.31
288	0.32
289	0.32
290	0.38
291	0.42
292	0.4
293	0.38
294	0.32
295	0.32
296	0.36
297	0.33
298	0.33
299	0.33
300	0.33
301	0.3
302	0.3
303	0.29
304	0.21
305	0.2
306	0.15
307	0.14
308	0.13
309	0.16
310	0.18
311	0.23
312	0.28
313	0.33
314	0.35
315	0.34
316	0.42
317	0.45
318	0.44
319	0.4
320	0.35
321	0.31
322	0.29
323	0.28
324	0.21
325	0.15
326	0.14
327	0.14
328	0.13
329	0.13
330	0.15
331	0.18
332	0.18
333	0.21
334	0.2
335	0.19
336	0.24
337	0.27
338	0.26
339	0.31
340	0.34
341	0.33
342	0.37
343	0.38
344	0.33
345	0.3
346	0.32
347	0.24
348	0.2
349	0.19
350	0.16
351	0.16
352	0.17
353	0.21
354	0.21
355	0.21
356	0.2
357	0.2
358	0.25
359	0.28
360	0.32
361	0.29
362	0.26
363	0.25
364	0.25
365	0.23
366	0.19
367	0.17
368	0.16
369	0.21
370	0.21
371	0.23
372	0.26
373	0.26
374	0.26
375	0.27
376	0.22
377	0.17
378	0.17
379	0.15
380	0.13
381	0.14
382	0.13
383	0.12
384	0.12
385	0.12
386	0.16
387	0.2
388	0.21
389	0.22
390	0.23
391	0.22
392	0.22
393	0.23
394	0.21
395	0.19
396	0.17
397	0.16
398	0.14
399	0.13
400	0.12
401	0.16
402	0.18
403	0.18
404	0.21
405	0.27
406	0.34
407	0.37
408	0.39
409	0.36
410	0.35
411	0.36
412	0.39
413	0.34
414	0.29
415	0.31
416	0.33
417	0.33
418	0.3
419	0.28
420	0.24
421	0.24
422	0.22
423	0.19
424	0.18
425	0.17
426	0.17
427	0.19
428	0.18
429	0.16
430	0.16
431	0.17
432	0.19
433	0.18
434	0.2
435	0.2
436	0.22
437	0.24
438	0.29
439	0.28
440	0.26
441	0.28
442	0.27
443	0.29
444	0.3
445	0.37
446	0.34
447	0.43
448	0.43
449	0.46
450	0.49
451	0.51
452	0.5
453	0.44
454	0.51
455	0.5
456	0.55
457	0.57
458	0.6
459	0.64
460	0.71
461	0.7
462	0.69
463	0.7
464	0.69
465	0.73
466	0.72
467	0.63
468	0.59
469	0.66
470	0.64
471	0.58
472	0.53
473	0.45
474	0.37
475	0.4
476	0.41
477	0.39
478	0.41
479	0.46
480	0.45
481	0.5
482	0.6
483	0.66
484	0.71
485	0.74
486	0.76
487	0.76
488	0.77
489	0.74
490	0.66
491	0.62
492	0.56
493	0.56
494	0.47
495	0.41
496	0.37
497	0.36
498	0.37
499	0.34
500	0.37
501	0.29
502	0.29
503	0.33
504	0.35
505	0.34
506	0.3
507	0.26
508	0.2
509	0.18
510	0.18
511	0.14
512	0.16
513	0.16
514	0.17
515	0.18
516	0.19
517	0.19
518	0.27
519	0.28
520	0.24
521	0.24
522	0.23
523	0.22
524	0.21
525	0.23
526	0.16
527	0.14
528	0.15
529	0.19
530	0.21
531	0.22
532	0.22
533	0.2
534	0.18
535	0.18
536	0.19
537	0.16
538	0.16
539	0.2
540	0.21
541	0.25
542	0.3
543	0.32
544	0.32
545	0.41
546	0.48
547	0.54
548	0.61
549	0.65
550	0.71
551	0.77
552	0.84
553	0.78
554	0.73
555	0.7
556	0.63
557	0.62
558	0.54
559	0.46
560	0.37
561	0.34
562	0.29
563	0.24
564	0.23
565	0.15
566	0.14
567	0.17
568	0.19
569	0.2
570	0.22
571	0.23
572	0.22
573	0.22
574	0.24
575	0.21
576	0.19
577	0.18
578	0.17
579	0.14
580	0.12
581	0.13
582	0.1
583	0.09
584	0.09
585	0.08
586	0.1
587	0.1
588	0.1
589	0.17
590	0.2
591	0.22
592	0.24
593	0.26
594	0.25
595	0.32
596	0.4
597	0.41
598	0.43
599	0.46
600	0.48
601	0.54
602	0.59
603	0.63
604	0.66
605	0.67
606	0.72
607	0.67
608	0.67
609	0.65
610	0.67
611	0.6
612	0.6
613	0.54
614	0.46
615	0.52
616	0.49
617	0.44
618	0.39
619	0.36
620	0.27
621	0.26
622	0.25
623	0.18
624	0.18
625	0.17
626	0.14
627	0.15
628	0.18
629	0.16
630	0.17
631	0.15
632	0.16
633	0.16
634	0.17
635	0.18
636	0.15
637	0.15
638	0.16
639	0.16
640	0.16
641	0.22
642	0.24
643	0.25
644	0.29
645	0.3
646	0.35
647	0.4
648	0.44
649	0.49
650	0.52
651	0.55
652	0.57
653	0.61
654	0.59
655	0.55
656	0.56
657	0.49
658	0.51
659	0.47
660	0.41
661	0.41
662	0.39
663	0.41
664	0.38

Q04779

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer