Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

P53863

Protein Details
Accession P53863    Localization Confidence High Confidence Score 22.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
17-39DLELKKAYRKKALQYHPDKNPDNHydrophilic
215-237YSKNYDRRTKREVNRRNEKARQQHydrophilic
447-477SDENVHVNTKNKKKRKKKKKAKVDTETEESEBasic
506-536DDEDWSTKAKKKKGKQPKKNSKSTKSTPSLSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
254-275KKLDKRMKEGAKIAEEQRKLKE
456-468KNKKKRKKKKKAK
513-528KAKKKKGKQPKKNSKS
580-590VKRKKVKTKRI
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 13.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001623  DnaJ_domain  
IPR018253  DnaJ_domain_CS  
IPR036869  J_dom_sf  
IPR022755  Znf_C2H2_jaz  
IPR036236  Znf_C2H2_sf  
IPR013087  Znf_C2H2_type  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005829  C:cytosol  
GO:0005739  C:mitochondrion  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0001671  F:ATPase activator activity  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0006897  P:endocytosis  
GO:0008361  P:regulation of cell size  
GO:0042273  P:ribosomal large subunit biogenesis  
GO:0000055  P:ribosomal large subunit export from nucleus  
GO:0006364  P:rRNA processing  
KEGG sce:YNL227C  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00226  DnaJ  
PF12171  zf-C2H2_jaz  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00636  DNAJ_1  
PS50076  DNAJ_2  
PS00028  ZINC_FINGER_C2H2_1  
PS50157  ZINC_FINGER_C2H2_2  
CDD cd06257  DnaJ  
Amino Acid Sequences MKTCYYELLGVETHASDLELKKAYRKKALQYHPDKNPDNVEEATQKFAVIRAAYEVLSDPQERAWYDSHKEQILNDTPPSTDDYYDYEVDATVTGVTTDELLLFFNSALYTKIDNSAAGIYQIAGKIFAKLAKDEILSGKRLGKFSEYQDDVFEQDINSIGYLKACDNFINKTDKLLYPLFGYSPTDYEYLKHFYKTWSAFNTLKSFSWKDEYMYSKNYDRRTKREVNRRNEKARQQARNEYNKTVKRFVVFIKKLDKRMKEGAKIAEEQRKLKEQQRKNELNNRRKFGNDNNDEEKFHLQSWQTVKEENWDELEKVYDNFGEFENSKNDKEGEVLIYECFICNKTFKSEKQLKNHINTKLHKKNMEEIRKEMEEENITLGLDNLSDLEKFDSADESVKEKEDIDLQALQAELAEIERKLAESSSEDESEDDNLNIEMDIEVEDVSSDENVHVNTKNKKKRKKKKKAKVDTETEESESFDDTKDKRSNELDDLLASLGDKGLQTDDDEDWSTKAKKKKGKQPKKNSKSTKSTPSLSTLPSSMSPTSAIEVCTTCGESFDSRNKLFNHVKIAGHAAVKNVVKRKKVKTKRI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.12
2 0.12
3 0.12
4 0.13
5 0.17
6 0.21
7 0.22
8 0.3
9 0.37
10 0.44
11 0.5
12 0.56
13 0.61
14 0.66
15 0.76
16 0.78
17 0.81
18 0.84
19 0.84
20 0.87
21 0.8
22 0.74
23 0.7
24 0.62
25 0.56
26 0.47
27 0.42
28 0.39
29 0.37
30 0.37
31 0.3
32 0.27
33 0.23
34 0.23
35 0.23
36 0.17
37 0.16
38 0.16
39 0.17
40 0.17
41 0.17
42 0.17
43 0.15
44 0.18
45 0.18
46 0.15
47 0.15
48 0.18
49 0.18
50 0.2
51 0.22
52 0.24
53 0.29
54 0.35
55 0.38
56 0.38
57 0.39
58 0.37
59 0.41
60 0.41
61 0.4
62 0.35
63 0.31
64 0.28
65 0.28
66 0.31
67 0.25
68 0.2
69 0.18
70 0.2
71 0.24
72 0.24
73 0.23
74 0.18
75 0.17
76 0.16
77 0.15
78 0.1
79 0.06
80 0.06
81 0.05
82 0.05
83 0.05
84 0.05
85 0.05
86 0.05
87 0.05
88 0.06
89 0.06
90 0.06
91 0.06
92 0.06
93 0.06
94 0.07
95 0.08
96 0.09
97 0.11
98 0.11
99 0.14
100 0.14
101 0.14
102 0.15
103 0.15
104 0.13
105 0.12
106 0.11
107 0.08
108 0.09
109 0.1
110 0.09
111 0.09
112 0.09
113 0.1
114 0.11
115 0.13
116 0.13
117 0.13
118 0.15
119 0.16
120 0.16
121 0.17
122 0.22
123 0.22
124 0.23
125 0.24
126 0.28
127 0.29
128 0.3
129 0.29
130 0.27
131 0.29
132 0.31
133 0.38
134 0.35
135 0.32
136 0.33
137 0.32
138 0.29
139 0.26
140 0.21
141 0.12
142 0.1
143 0.1
144 0.09
145 0.08
146 0.07
147 0.07
148 0.07
149 0.08
150 0.09
151 0.09
152 0.1
153 0.12
154 0.13
155 0.15
156 0.18
157 0.24
158 0.23
159 0.24
160 0.27
161 0.26
162 0.29
163 0.27
164 0.25
165 0.2
166 0.21
167 0.18
168 0.16
169 0.17
170 0.13
171 0.13
172 0.14
173 0.14
174 0.13
175 0.14
176 0.16
177 0.19
178 0.19
179 0.2
180 0.19
181 0.19
182 0.27
183 0.29
184 0.3
185 0.28
186 0.32
187 0.33
188 0.36
189 0.38
190 0.33
191 0.31
192 0.31
193 0.29
194 0.26
195 0.28
196 0.25
197 0.23
198 0.26
199 0.3
200 0.29
201 0.31
202 0.32
203 0.34
204 0.38
205 0.43
206 0.48
207 0.48
208 0.51
209 0.57
210 0.64
211 0.66
212 0.72
213 0.75
214 0.76
215 0.82
216 0.83
217 0.83
218 0.81
219 0.79
220 0.79
221 0.78
222 0.76
223 0.71
224 0.73
225 0.73
226 0.75
227 0.71
228 0.66
229 0.65
230 0.62
231 0.61
232 0.55
233 0.47
234 0.39
235 0.37
236 0.37
237 0.39
238 0.36
239 0.35
240 0.41
241 0.44
242 0.5
243 0.55
244 0.52
245 0.47
246 0.54
247 0.55
248 0.49
249 0.5
250 0.46
251 0.42
252 0.43
253 0.42
254 0.39
255 0.36
256 0.34
257 0.32
258 0.34
259 0.34
260 0.38
261 0.44
262 0.44
263 0.51
264 0.59
265 0.64
266 0.65
267 0.72
268 0.75
269 0.75
270 0.75
271 0.69
272 0.6
273 0.54
274 0.51
275 0.49
276 0.5
277 0.44
278 0.43
279 0.45
280 0.45
281 0.44
282 0.42
283 0.35
284 0.25
285 0.2
286 0.18
287 0.14
288 0.17
289 0.2
290 0.23
291 0.22
292 0.22
293 0.22
294 0.24
295 0.26
296 0.21
297 0.21
298 0.17
299 0.17
300 0.16
301 0.17
302 0.11
303 0.1
304 0.1
305 0.08
306 0.07
307 0.08
308 0.08
309 0.09
310 0.09
311 0.1
312 0.16
313 0.18
314 0.18
315 0.18
316 0.19
317 0.16
318 0.17
319 0.16
320 0.11
321 0.1
322 0.1
323 0.09
324 0.09
325 0.08
326 0.07
327 0.07
328 0.07
329 0.07
330 0.08
331 0.1
332 0.15
333 0.21
334 0.22
335 0.31
336 0.41
337 0.47
338 0.54
339 0.63
340 0.63
341 0.66
342 0.71
343 0.69
344 0.67
345 0.65
346 0.68
347 0.66
348 0.66
349 0.62
350 0.57
351 0.58
352 0.6
353 0.64
354 0.56
355 0.51
356 0.51
357 0.47
358 0.47
359 0.39
360 0.32
361 0.24
362 0.21
363 0.19
364 0.14
365 0.13
366 0.11
367 0.11
368 0.07
369 0.05
370 0.05
371 0.04
372 0.05
373 0.05
374 0.05
375 0.06
376 0.06
377 0.07
378 0.07
379 0.08
380 0.08
381 0.11
382 0.11
383 0.13
384 0.13
385 0.14
386 0.14
387 0.13
388 0.14
389 0.14
390 0.14
391 0.14
392 0.14
393 0.13
394 0.14
395 0.13
396 0.12
397 0.09
398 0.08
399 0.05
400 0.05
401 0.06
402 0.05
403 0.06
404 0.06
405 0.07
406 0.07
407 0.07
408 0.08
409 0.09
410 0.12
411 0.15
412 0.15
413 0.15
414 0.16
415 0.16
416 0.17
417 0.16
418 0.13
419 0.1
420 0.09
421 0.09
422 0.08
423 0.08
424 0.05
425 0.05
426 0.05
427 0.05
428 0.05
429 0.05
430 0.05
431 0.04
432 0.05
433 0.05
434 0.05
435 0.05
436 0.06
437 0.07
438 0.09
439 0.13
440 0.19
441 0.28
442 0.38
443 0.48
444 0.57
445 0.68
446 0.77
447 0.85
448 0.9
449 0.92
450 0.94
451 0.94
452 0.96
453 0.97
454 0.96
455 0.95
456 0.93
457 0.89
458 0.83
459 0.75
460 0.66
461 0.55
462 0.45
463 0.35
464 0.27
465 0.2
466 0.15
467 0.18
468 0.16
469 0.24
470 0.29
471 0.3
472 0.33
473 0.37
474 0.41
475 0.4
476 0.42
477 0.34
478 0.29
479 0.28
480 0.24
481 0.2
482 0.15
483 0.1
484 0.07
485 0.07
486 0.06
487 0.06
488 0.07
489 0.08
490 0.09
491 0.11
492 0.12
493 0.14
494 0.17
495 0.17
496 0.17
497 0.21
498 0.25
499 0.28
500 0.35
501 0.4
502 0.48
503 0.57
504 0.68
505 0.74
506 0.81
507 0.86
508 0.91
509 0.94
510 0.94
511 0.95
512 0.95
513 0.93
514 0.92
515 0.89
516 0.88
517 0.84
518 0.79
519 0.71
520 0.66
521 0.6
522 0.52
523 0.46
524 0.37
525 0.32
526 0.29
527 0.3
528 0.24
529 0.21
530 0.2
531 0.18
532 0.2
533 0.19
534 0.18
535 0.16
536 0.16
537 0.17
538 0.17
539 0.18
540 0.16
541 0.15
542 0.17
543 0.18
544 0.23
545 0.3
546 0.36
547 0.35
548 0.42
549 0.42
550 0.49
551 0.53
552 0.52
553 0.52
554 0.5
555 0.49
556 0.46
557 0.49
558 0.44
559 0.4
560 0.37
561 0.3
562 0.31
563 0.34
564 0.38
565 0.42
566 0.45
567 0.5
568 0.58
569 0.66
570 0.71