Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

P43607

Protein Details
Accession P43607    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
48-70IPTQTVRRFSKRHNSNPRKPLGIHydrophilic
111-133TPDTDVKKPKEKNKVKKTPETAAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
118-126KPKEKNKVK
Subcellular Location(s) nucl 15, cyto_nucl 13.5, cyto 10
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR034244  Rrt5_RRM1  
IPR034247  Rrt5_RRM2  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0005628  C:prospore membrane  
GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0003729  F:mRNA binding  
KEGG sce:YFR032C  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12409  RRM1_RRT5  
cd12410  RRM2_RRT5  
Amino Acid Sequences MTEQVNNDTTSDTTTTITTVYISNLPFTASERDLHAFLNNYGASSVLIPTQTVRRFSKRHNSNPRKPLGIAFAQFANNTLALKAIQDLNGTVFQNQKLFLKLHVPYEADSTPDTDVKKPKEKNKVKKTPETAADTVYCHDLPDDITDSEIRELFQLYSPQEIWIYRSKVYRRKCIPFAPHQITAALVTLQSETPIGDICDSVAKTATLRGKSIIVKPAYVSKIQEIKQLVKDNLTNARDPPPAALAEPAPAPAPVEPAEQVQEGQDNAETNDVPPPPASSSDRPTVAAT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.14
2 0.14
3 0.13
4 0.13
5 0.11
6 0.1
7 0.11
8 0.14
9 0.14
10 0.15
11 0.15
12 0.15
13 0.15
14 0.17
15 0.19
16 0.17
17 0.18
18 0.2
19 0.23
20 0.23
21 0.23
22 0.23
23 0.2
24 0.19
25 0.23
26 0.19
27 0.17
28 0.16
29 0.16
30 0.13
31 0.12
32 0.12
33 0.08
34 0.08
35 0.08
36 0.1
37 0.17
38 0.2
39 0.26
40 0.3
41 0.37
42 0.42
43 0.5
44 0.59
45 0.62
46 0.69
47 0.75
48 0.8
49 0.83
50 0.87
51 0.84
52 0.77
53 0.68
54 0.6
55 0.54
56 0.48
57 0.39
58 0.31
59 0.28
60 0.25
61 0.24
62 0.22
63 0.18
64 0.13
65 0.12
66 0.1
67 0.09
68 0.08
69 0.08
70 0.08
71 0.08
72 0.08
73 0.08
74 0.09
75 0.1
76 0.13
77 0.13
78 0.13
79 0.14
80 0.15
81 0.15
82 0.16
83 0.15
84 0.15
85 0.15
86 0.15
87 0.19
88 0.2
89 0.21
90 0.23
91 0.22
92 0.2
93 0.23
94 0.22
95 0.18
96 0.16
97 0.15
98 0.14
99 0.15
100 0.16
101 0.16
102 0.23
103 0.27
104 0.35
105 0.4
106 0.47
107 0.56
108 0.65
109 0.72
110 0.77
111 0.82
112 0.8
113 0.83
114 0.8
115 0.75
116 0.7
117 0.66
118 0.55
119 0.47
120 0.4
121 0.32
122 0.27
123 0.22
124 0.17
125 0.1
126 0.09
127 0.08
128 0.07
129 0.08
130 0.09
131 0.07
132 0.08
133 0.08
134 0.09
135 0.09
136 0.09
137 0.08
138 0.06
139 0.07
140 0.07
141 0.08
142 0.1
143 0.1
144 0.11
145 0.12
146 0.12
147 0.12
148 0.12
149 0.13
150 0.17
151 0.18
152 0.19
153 0.24
154 0.3
155 0.37
156 0.43
157 0.5
158 0.51
159 0.56
160 0.59
161 0.61
162 0.62
163 0.63
164 0.67
165 0.63
166 0.57
167 0.5
168 0.45
169 0.38
170 0.31
171 0.23
172 0.13
173 0.07
174 0.06
175 0.06
176 0.06
177 0.06
178 0.06
179 0.05
180 0.05
181 0.06
182 0.06
183 0.05
184 0.05
185 0.06
186 0.09
187 0.09
188 0.09
189 0.09
190 0.09
191 0.09
192 0.15
193 0.2
194 0.18
195 0.19
196 0.2
197 0.23
198 0.26
199 0.3
200 0.33
201 0.28
202 0.27
203 0.28
204 0.33
205 0.32
206 0.3
207 0.27
208 0.26
209 0.32
210 0.32
211 0.37
212 0.33
213 0.36
214 0.41
215 0.46
216 0.41
217 0.37
218 0.38
219 0.37
220 0.42
221 0.4
222 0.35
223 0.3
224 0.35
225 0.33
226 0.32
227 0.29
228 0.23
229 0.21
230 0.2
231 0.2
232 0.15
233 0.15
234 0.15
235 0.14
236 0.12
237 0.11
238 0.11
239 0.09
240 0.12
241 0.12
242 0.14
243 0.14
244 0.15
245 0.18
246 0.17
247 0.17
248 0.15
249 0.16
250 0.14
251 0.14
252 0.14
253 0.13
254 0.13
255 0.15
256 0.14
257 0.12
258 0.18
259 0.17
260 0.17
261 0.17
262 0.19
263 0.19
264 0.24
265 0.3
266 0.3
267 0.35
268 0.41
269 0.42