Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0F7VHU8

Protein Details
Accession A0A0F7VHU8    Localization Confidence High Confidence Score 16.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
104-151DDGEGRSRRKEGRREKKSRRAQEDEAEDGSSRRRERKKKEASPDTDEEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
96-143GRHKRKRTDDGEGRSRRKEGRREKKSRRAQEDEAEDGSSRRRERKKKE
160-161RR
168-181DEAIRKPGKRRSRK
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 14, cyto 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR035441  TFIIS/LEDGF_dom_sf  
IPR017923  TFIIS_N  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF08711  Med26  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51319  TFIIS_N  
Amino Acid Sequences MSASPEHQAGSAAASPEPEQVAAPIDETEPSAEAENNDNALEEQANVDDNEGDISDDESILSEVDEAQFEDFNPENVDVEDRPQLAIDEENLKLIGRHKRKRTDDGEGRSRRKEGRREKKSRRAQEDEAEDGSSRRRERKKKEASPDTDEETLDPETRRRRALDRAMDEAIRKPGKRRSRKQDGIDLEAMADAEIEDMRKRMTHAAQMDAINRQEGKPAMHKLKLLPEVIMLLNRNQYINSLVDPEINLLEAVRFFLEPLDDGSMPAYNIQRDLLTALAKLPIQKDALIASGIGKVVVFYTKSKRTERRIKDMAEKLLAEWTRPILQRSDDYSKRVFQQADFDPTKIIKRTQTPAEVVAAEARAREKLPPRLANRARVDRTNVTYTIVPRQTAVQESKFARPLGSSGEDRFRKMQARNNAAQKGSRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.17
3 0.18
4 0.18
5 0.15
6 0.12
7 0.12
8 0.15
9 0.14
10 0.14
11 0.13
12 0.12
13 0.12
14 0.13
15 0.13
16 0.11
17 0.11
18 0.12
19 0.12
20 0.13
21 0.17
22 0.18
23 0.18
24 0.17
25 0.16
26 0.15
27 0.15
28 0.14
29 0.1
30 0.09
31 0.09
32 0.1
33 0.1
34 0.1
35 0.09
36 0.09
37 0.09
38 0.08
39 0.08
40 0.07
41 0.08
42 0.07
43 0.07
44 0.07
45 0.07
46 0.07
47 0.06
48 0.06
49 0.05
50 0.06
51 0.06
52 0.07
53 0.07
54 0.08
55 0.08
56 0.08
57 0.13
58 0.12
59 0.13
60 0.14
61 0.14
62 0.14
63 0.14
64 0.17
65 0.13
66 0.15
67 0.18
68 0.16
69 0.16
70 0.16
71 0.15
72 0.14
73 0.14
74 0.14
75 0.14
76 0.13
77 0.14
78 0.14
79 0.13
80 0.14
81 0.19
82 0.27
83 0.34
84 0.43
85 0.51
86 0.61
87 0.68
88 0.77
89 0.77
90 0.78
91 0.77
92 0.77
93 0.78
94 0.78
95 0.76
96 0.7
97 0.68
98 0.64
99 0.63
100 0.65
101 0.65
102 0.67
103 0.73
104 0.81
105 0.88
106 0.9
107 0.93
108 0.92
109 0.9
110 0.87
111 0.81
112 0.77
113 0.72
114 0.65
115 0.55
116 0.46
117 0.37
118 0.29
119 0.27
120 0.25
121 0.23
122 0.28
123 0.37
124 0.46
125 0.55
126 0.65
127 0.73
128 0.77
129 0.85
130 0.87
131 0.84
132 0.81
133 0.76
134 0.69
135 0.59
136 0.49
137 0.38
138 0.3
139 0.25
140 0.19
141 0.16
142 0.17
143 0.22
144 0.25
145 0.27
146 0.28
147 0.31
148 0.37
149 0.46
150 0.5
151 0.47
152 0.48
153 0.47
154 0.46
155 0.42
156 0.36
157 0.34
158 0.29
159 0.26
160 0.26
161 0.33
162 0.43
163 0.52
164 0.6
165 0.64
166 0.71
167 0.79
168 0.79
169 0.8
170 0.73
171 0.68
172 0.59
173 0.48
174 0.37
175 0.28
176 0.23
177 0.14
178 0.1
179 0.04
180 0.03
181 0.03
182 0.04
183 0.04
184 0.04
185 0.05
186 0.05
187 0.06
188 0.1
189 0.12
190 0.17
191 0.18
192 0.2
193 0.22
194 0.23
195 0.23
196 0.21
197 0.2
198 0.15
199 0.14
200 0.12
201 0.12
202 0.11
203 0.12
204 0.15
205 0.21
206 0.24
207 0.25
208 0.26
209 0.26
210 0.31
211 0.33
212 0.29
213 0.23
214 0.2
215 0.19
216 0.19
217 0.18
218 0.12
219 0.1
220 0.11
221 0.12
222 0.12
223 0.1
224 0.1
225 0.11
226 0.11
227 0.1
228 0.11
229 0.11
230 0.11
231 0.11
232 0.11
233 0.09
234 0.08
235 0.08
236 0.05
237 0.05
238 0.04
239 0.05
240 0.05
241 0.04
242 0.04
243 0.05
244 0.05
245 0.05
246 0.07
247 0.09
248 0.08
249 0.09
250 0.09
251 0.09
252 0.09
253 0.11
254 0.11
255 0.09
256 0.09
257 0.1
258 0.09
259 0.09
260 0.1
261 0.09
262 0.08
263 0.08
264 0.08
265 0.09
266 0.09
267 0.11
268 0.11
269 0.12
270 0.13
271 0.13
272 0.13
273 0.12
274 0.12
275 0.11
276 0.1
277 0.08
278 0.09
279 0.08
280 0.07
281 0.06
282 0.06
283 0.06
284 0.07
285 0.08
286 0.1
287 0.17
288 0.25
289 0.3
290 0.39
291 0.46
292 0.55
293 0.64
294 0.69
295 0.72
296 0.72
297 0.71
298 0.73
299 0.72
300 0.66
301 0.59
302 0.51
303 0.41
304 0.41
305 0.36
306 0.27
307 0.22
308 0.19
309 0.22
310 0.23
311 0.24
312 0.2
313 0.23
314 0.27
315 0.33
316 0.39
317 0.37
318 0.4
319 0.41
320 0.42
321 0.42
322 0.44
323 0.39
324 0.31
325 0.36
326 0.36
327 0.42
328 0.4
329 0.37
330 0.34
331 0.34
332 0.38
333 0.33
334 0.32
335 0.29
336 0.34
337 0.4
338 0.44
339 0.48
340 0.46
341 0.44
342 0.43
343 0.37
344 0.31
345 0.27
346 0.21
347 0.16
348 0.15
349 0.14
350 0.13
351 0.13
352 0.19
353 0.25
354 0.33
355 0.42
356 0.5
357 0.54
358 0.63
359 0.68
360 0.72
361 0.73
362 0.74
363 0.7
364 0.66
365 0.68
366 0.63
367 0.64
368 0.59
369 0.51
370 0.43
371 0.42
372 0.4
373 0.42
374 0.38
375 0.33
376 0.28
377 0.31
378 0.31
379 0.35
380 0.38
381 0.31
382 0.36
383 0.39
384 0.45
385 0.46
386 0.43
387 0.37
388 0.32
389 0.31
390 0.3
391 0.32
392 0.29
393 0.29
394 0.39
395 0.4
396 0.43
397 0.44
398 0.44
399 0.46
400 0.49
401 0.54
402 0.55
403 0.61
404 0.66
405 0.72
406 0.73
407 0.68