Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

P38772

Protein Details
Accession P38772    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
23-45QTCSLECSKKHKTRDNCSGQTHDHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 13, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007529  Znf_HIT  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0070761  C:pre-snoRNP complex  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0030515  F:snoRNA binding  
GO:0000492  P:box C/D snoRNP assembly  
GO:0000463  P:maturation of LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0042254  P:ribosome biogenesis  
GO:0016074  P:sno(s)RNA metabolic process  
GO:0048254  P:snoRNA localization  
KEGG sce:YHR040W  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04438  zf-HIT  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51083  ZF_HIT  
Amino Acid Sequences MAVLCGVCGIKEFKYKCPRCLVQTCSLECSKKHKTRDNCSGQTHDPKEYISSEALKQADDDKHERNAYVQRDYNYLTQLKRMVHVQKMDARMKNKRVLGPVGGHNSNFKKRRYDIDEDDRDSTECQRIIRRGVNCLMLPKGMQRSSQNRSKWDKTMDLFVWSVEWILCPMQEKGEKKELFKHVSHRIKETDFLVQGMGKNVFQKCCEFYRLAGTSSCIEGEDGSETKEERTQILQKSGLKFYTKTFPYNTTHIMDSKKLVELAIHEKCIGELLKNTTVIEFPTIFVAMTEADLPEGYEVLHQEPRPLEHTSTLNKFIDNAREEEDAEEDSQPTEEPVQKETQDASDSDSDSDDDYNPGLSMDFLTA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.46
2 0.52
3 0.56
4 0.64
5 0.66
6 0.66
7 0.73
8 0.7
9 0.68
10 0.71
11 0.67
12 0.63
13 0.62
14 0.57
15 0.51
16 0.53
17 0.54
18 0.53
19 0.6
20 0.64
21 0.69
22 0.76
23 0.84
24 0.86
25 0.83
26 0.81
27 0.78
28 0.75
29 0.76
30 0.69
31 0.62
32 0.52
33 0.45
34 0.42
35 0.37
36 0.32
37 0.25
38 0.25
39 0.22
40 0.27
41 0.26
42 0.23
43 0.22
44 0.26
45 0.26
46 0.29
47 0.32
48 0.3
49 0.36
50 0.38
51 0.37
52 0.35
53 0.39
54 0.39
55 0.41
56 0.41
57 0.36
58 0.38
59 0.41
60 0.39
61 0.37
62 0.36
63 0.3
64 0.29
65 0.32
66 0.3
67 0.29
68 0.33
69 0.34
70 0.35
71 0.38
72 0.39
73 0.4
74 0.47
75 0.52
76 0.51
77 0.52
78 0.55
79 0.58
80 0.6
81 0.59
82 0.55
83 0.52
84 0.51
85 0.47
86 0.43
87 0.43
88 0.42
89 0.38
90 0.34
91 0.36
92 0.37
93 0.43
94 0.44
95 0.41
96 0.42
97 0.43
98 0.52
99 0.54
100 0.57
101 0.57
102 0.62
103 0.66
104 0.62
105 0.61
106 0.53
107 0.45
108 0.38
109 0.32
110 0.26
111 0.2
112 0.19
113 0.22
114 0.24
115 0.28
116 0.33
117 0.32
118 0.33
119 0.34
120 0.35
121 0.31
122 0.3
123 0.26
124 0.21
125 0.19
126 0.18
127 0.21
128 0.19
129 0.21
130 0.25
131 0.32
132 0.37
133 0.45
134 0.45
135 0.47
136 0.53
137 0.55
138 0.54
139 0.51
140 0.5
141 0.43
142 0.45
143 0.38
144 0.33
145 0.29
146 0.23
147 0.2
148 0.14
149 0.14
150 0.07
151 0.07
152 0.05
153 0.05
154 0.05
155 0.07
156 0.07
157 0.1
158 0.15
159 0.17
160 0.2
161 0.3
162 0.31
163 0.3
164 0.38
165 0.41
166 0.41
167 0.41
168 0.43
169 0.44
170 0.51
171 0.51
172 0.46
173 0.43
174 0.39
175 0.39
176 0.34
177 0.27
178 0.2
179 0.19
180 0.16
181 0.13
182 0.13
183 0.13
184 0.13
185 0.09
186 0.13
187 0.14
188 0.15
189 0.15
190 0.17
191 0.18
192 0.2
193 0.22
194 0.19
195 0.18
196 0.24
197 0.24
198 0.24
199 0.21
200 0.2
201 0.18
202 0.18
203 0.17
204 0.1
205 0.08
206 0.07
207 0.07
208 0.08
209 0.07
210 0.08
211 0.08
212 0.08
213 0.09
214 0.12
215 0.12
216 0.11
217 0.15
218 0.2
219 0.23
220 0.27
221 0.3
222 0.32
223 0.35
224 0.36
225 0.35
226 0.31
227 0.29
228 0.28
229 0.32
230 0.3
231 0.3
232 0.29
233 0.32
234 0.34
235 0.36
236 0.37
237 0.31
238 0.3
239 0.31
240 0.31
241 0.27
242 0.26
243 0.23
244 0.21
245 0.19
246 0.17
247 0.14
248 0.16
249 0.22
250 0.22
251 0.22
252 0.2
253 0.2
254 0.2
255 0.22
256 0.19
257 0.12
258 0.13
259 0.18
260 0.2
261 0.21
262 0.21
263 0.19
264 0.19
265 0.19
266 0.18
267 0.13
268 0.1
269 0.11
270 0.11
271 0.1
272 0.1
273 0.1
274 0.07
275 0.07
276 0.07
277 0.06
278 0.06
279 0.06
280 0.06
281 0.06
282 0.05
283 0.05
284 0.06
285 0.07
286 0.1
287 0.15
288 0.15
289 0.19
290 0.2
291 0.23
292 0.25
293 0.27
294 0.26
295 0.25
296 0.31
297 0.34
298 0.37
299 0.4
300 0.38
301 0.34
302 0.35
303 0.35
304 0.38
305 0.33
306 0.31
307 0.29
308 0.29
309 0.3
310 0.29
311 0.27
312 0.21
313 0.19
314 0.18
315 0.14
316 0.13
317 0.13
318 0.12
319 0.12
320 0.15
321 0.19
322 0.19
323 0.23
324 0.27
325 0.27
326 0.3
327 0.3
328 0.29
329 0.26
330 0.24
331 0.26
332 0.25
333 0.25
334 0.24
335 0.23
336 0.2
337 0.19
338 0.2
339 0.16
340 0.13
341 0.13
342 0.13
343 0.12
344 0.11
345 0.1
346 0.09