FuNGI

Q6CNC0

Protein Details

Accession

Q6CNC0

Localization Confidence

High

Confidence Score

26.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
113-135	VFIPAKSKKPIEKKKLKDPESLF	Hydrophilic
338-357	KTSSKTGGKARKARHKKGAM	Basic
450-479	ADEVSKGKLSMRRKREKEKKSVKGITNGLN	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
118-128	KSKKPIEKKKL
343-355	TGGKARKARHKKG
455-472	KGKLSMRRKREKEKKSVK

Subcellular Location(s)

nucl 24, cyto 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007307 Ltv1
Gene Ontology	GO:0042274 P:ribosomal small subunit biogenesis
KEGG	kla:KLLA0_E13729g -
Pfam	View protein in Pfam PF04180 LTV

Amino Acid Sequences

MSGRTRFNKNNATKFAVVHRPHDDPNYHDPEAGEHVLVPVQNRHKKKDVSQSSEDGPIPKLVSTPTAPSTSASKNAVNEHVGEAALYGITFDDSKYDYTQHLKPIGLDPSHSVFIPAKSKKPIEKKKLKDPESLFVEPSYQDLENKAAEPLFVRGVAKQEYLDQMQEIPGELVGFKPDMNPALREVLVALEDDAYVINEDVAVEIKPKSNNAAEGLDEDDDDIFAELLGSGKADGADEFEDEFDEWDMQDLDNFEEEHYKQEMAQFDDIGKLQDLQGIDVSADVRRFKLQQKKVRNDWDSENDFSDDDNGSINHSEDEEELKEEVEDGDVLGSLPSFKTSSKTGGKARKARHKKGAMSDVSGFSMSSSALARTEVMTVLDDKYDQIIGGYENYEEELAEDEEKHESFDMLKERPDLESMLDDFLDNYELGSGNRKLVKKDEEIARLKEAADEVSKGKLSMRRKREKEKKSVKGITNGLNSLKF

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.63
2	0.62
3	0.62
4	0.55
5	0.51
6	0.5
7	0.48
8	0.5
9	0.54
10	0.49
11	0.45
12	0.51
13	0.53
14	0.49
15	0.45
16	0.42
17	0.38
18	0.41
19	0.36
20	0.26
21	0.18
22	0.18
23	0.18
24	0.19
25	0.18
26	0.2
27	0.28
28	0.37
29	0.42
30	0.49
31	0.56
32	0.62
33	0.68
34	0.72
35	0.72
36	0.72
37	0.73
38	0.7
39	0.64
40	0.64
41	0.56
42	0.47
43	0.38
44	0.32
45	0.27
46	0.22
47	0.2
48	0.16
49	0.18
50	0.18
51	0.21
52	0.22
53	0.23
54	0.23
55	0.24
56	0.28
57	0.27
58	0.3
59	0.29
60	0.29
61	0.3
62	0.33
63	0.35
64	0.31
65	0.29
66	0.25
67	0.23
68	0.19
69	0.16
70	0.12
71	0.09
72	0.08
73	0.06
74	0.04
75	0.04
76	0.05
77	0.05
78	0.05
79	0.06
80	0.08
81	0.1
82	0.11
83	0.13
84	0.16
85	0.21
86	0.24
87	0.28
88	0.3
89	0.29
90	0.29
91	0.32
92	0.35
93	0.31
94	0.28
95	0.26
96	0.26
97	0.26
98	0.25
99	0.22
100	0.18
101	0.21
102	0.29
103	0.3
104	0.31
105	0.36
106	0.42
107	0.48
108	0.57
109	0.64
110	0.66
111	0.73
112	0.76
113	0.81
114	0.86
115	0.82
116	0.8
117	0.74
118	0.71
119	0.68
120	0.62
121	0.52
122	0.42
123	0.39
124	0.29
125	0.26
126	0.2
127	0.13
128	0.12
129	0.12
130	0.14
131	0.14
132	0.14
133	0.14
134	0.11
135	0.11
136	0.11
137	0.11
138	0.1
139	0.1
140	0.1
141	0.1
142	0.14
143	0.15
144	0.15
145	0.13
146	0.15
147	0.17
148	0.17
149	0.17
150	0.13
151	0.12
152	0.12
153	0.12
154	0.1
155	0.07
156	0.06
157	0.06
158	0.05
159	0.05
160	0.05
161	0.06
162	0.05
163	0.06
164	0.07
165	0.09
166	0.11
167	0.11
168	0.12
169	0.14
170	0.14
171	0.13
172	0.13
173	0.1
174	0.09
175	0.08
176	0.07
177	0.05
178	0.04
179	0.05
180	0.04
181	0.04
182	0.04
183	0.04
184	0.03
185	0.03
186	0.03
187	0.03
188	0.04
189	0.04
190	0.05
191	0.06
192	0.09
193	0.09
194	0.1
195	0.13
196	0.13
197	0.14
198	0.16
199	0.16
200	0.13
201	0.14
202	0.15
203	0.12
204	0.11
205	0.09
206	0.07
207	0.06
208	0.05
209	0.05
210	0.03
211	0.03
212	0.03
213	0.03
214	0.03
215	0.03
216	0.03
217	0.03
218	0.03
219	0.03
220	0.03
221	0.03
222	0.04
223	0.05
224	0.05
225	0.05
226	0.05
227	0.06
228	0.05
229	0.06
230	0.05
231	0.05
232	0.04
233	0.05
234	0.05
235	0.05
236	0.05
237	0.05
238	0.06
239	0.06
240	0.07
241	0.06
242	0.09
243	0.09
244	0.11
245	0.12
246	0.11
247	0.11
248	0.14
249	0.16
250	0.16
251	0.16
252	0.14
253	0.13
254	0.14
255	0.14
256	0.12
257	0.1
258	0.07
259	0.07
260	0.09
261	0.08
262	0.08
263	0.08
264	0.07
265	0.07
266	0.07
267	0.07
268	0.06
269	0.08
270	0.08
271	0.09
272	0.1
273	0.13
274	0.21
275	0.3
276	0.39
277	0.47
278	0.57
279	0.65
280	0.71
281	0.78
282	0.74
283	0.67
284	0.63
285	0.62
286	0.55
287	0.48
288	0.42
289	0.33
290	0.3
291	0.26
292	0.22
293	0.14
294	0.1
295	0.1
296	0.08
297	0.08
298	0.09
299	0.09
300	0.08
301	0.08
302	0.08
303	0.08
304	0.1
305	0.1
306	0.11
307	0.1
308	0.1
309	0.1
310	0.09
311	0.09
312	0.07
313	0.06
314	0.04
315	0.04
316	0.04
317	0.04
318	0.04
319	0.04
320	0.04
321	0.04
322	0.05
323	0.06
324	0.07
325	0.09
326	0.12
327	0.19
328	0.24
329	0.3
330	0.37
331	0.46
332	0.54
333	0.6
334	0.67
335	0.71
336	0.76
337	0.79
338	0.81
339	0.8
340	0.78
341	0.79
342	0.79
343	0.71
344	0.64
345	0.58
346	0.49
347	0.42
348	0.35
349	0.26
350	0.16
351	0.14
352	0.1
353	0.08
354	0.07
355	0.07
356	0.07
357	0.08
358	0.08
359	0.08
360	0.09
361	0.09
362	0.09
363	0.09
364	0.1
365	0.1
366	0.1
367	0.1
368	0.09
369	0.1
370	0.1
371	0.08
372	0.07
373	0.07
374	0.08
375	0.09
376	0.09
377	0.08
378	0.08
379	0.09
380	0.09
381	0.07
382	0.07
383	0.08
384	0.09
385	0.1
386	0.1
387	0.1
388	0.13
389	0.13
390	0.14
391	0.11
392	0.11
393	0.11
394	0.16
395	0.21
396	0.2
397	0.22
398	0.24
399	0.25
400	0.26
401	0.26
402	0.22
403	0.18
404	0.2
405	0.19
406	0.18
407	0.17
408	0.16
409	0.14
410	0.14
411	0.13
412	0.09
413	0.08
414	0.08
415	0.08
416	0.09
417	0.15
418	0.15
419	0.19
420	0.26
421	0.28
422	0.31
423	0.38
424	0.44
425	0.43
426	0.5
427	0.53
428	0.56
429	0.6
430	0.61
431	0.57
432	0.51
433	0.46
434	0.4
435	0.33
436	0.26
437	0.22
438	0.21
439	0.19
440	0.22
441	0.22
442	0.2
443	0.24
444	0.28
445	0.36
446	0.43
447	0.53
448	0.6
449	0.69
450	0.8
451	0.86
452	0.9
453	0.91
454	0.92
455	0.91
456	0.91
457	0.91
458	0.87
459	0.85
460	0.81
461	0.78
462	0.73
463	0.67

Q6CNC0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer