FuNGI

Q12389

Protein Details

Accession

Q12389

Localization Confidence

High

Confidence Score

23.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
68-99	EEGVNNKKKAENKDIKKKKNSKKEIAAFPMLE	Hydrophilic
149-168	LNNIKRKGFRQPTPIQRKTI	Hydrophilic
400-428	SDDENDRQKKRRNFKKEKFRKQKMPAANE	Basic
768-791	EAQENENKKKKKPKSFKDPTFFLS	Hydrophilic
828-855	QVHKQTATVKWDKKRKKYVNTQGIDNKK	Hydrophilic
909-938	ANGRTVRGKFKHKQMKAPKMPDKHRDNYYS	Hydrophilic
970-995	EQIRKDRIIAEKKRAKNARPSKKRKF	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
74-90	KKKAENKDIKKKKNSKK
407-422	QKKRRNFKKEKFRKQK
705-708	RRRK
775-781	KKKKKPK
915-929	RGKFKHKQMKAPKMP
973-995	RKDRIIAEKKRAKNARPSKKRKF

Subcellular Location(s)

nucl 25, cyto_nucl 14.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012541 DBP10_C IPR033517 DDX54/DBP10_DEAD-box_helicase IPR011545 DEAD/DEAH_box_helicase_dom IPR014001 Helicase_ATP-bd IPR001650 Helicase_C IPR027417 P-loop_NTPase IPR000629 RNA-helicase_DEAD-box_CS IPR014014 RNA_helicase_DEAD_Q_motif
Gene Ontology	GO:0005730 C:nucleolus GO:0030687 C:preribosome, large subunit precursor GO:0005524 F:ATP binding GO:0016887 F:ATP hydrolysis activity GO:0042802 F:identical protein binding GO:0003723 F:RNA binding GO:0003724 F:RNA helicase activity GO:1902626 P:assembly of large subunit precursor of preribosome GO:0000466 P:maturation of 5.8S rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) GO:0000463 P:maturation of LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) GO:0006364 P:rRNA processing
KEGG	sce:YDL031W -
Pfam	View protein in Pfam PF08147 DBP10CT PF00270 DEAD PF00271 Helicase_C
PROSITE	View protein in PROSITE PS00039 DEAD_ATP_HELICASE PS51192 HELICASE_ATP_BIND_1 PS51194 HELICASE_CTER PS51195 Q_MOTIF
CDD	cd17959 DEADc_DDX54 cd18787 SF2_C_DEAD

Amino Acid Sequences

MAGVQKRKRDLEDQDDNGSEEDDIAFDIANEIALNDSESDANDSDSEVEADYGPNDVQDVIEYSSDEEEGVNNKKKAENKDIKKKKNSKKEIAAFPMLEMSDDENNASGKTQTGDDEDDVNEYFSTNNLEKTKHKKGSFPSFGLSKIVLNNIKRKGFRQPTPIQRKTIPLILQSRDIVGMARTGSGKTAAFILPMVEKLKSHSGKIGARAVILSPSRELAMQTFNVFKDFARGTELRSVLLTGGDSLEEQFGMMMTNPDVIIATPGRFLHLKVEMNLDLKSVEYVVFDEADRLFEMGFQEQLNELLASLPTTRQTLLFSATLPNSLVDFVKAGLVNPVLVRLDAETKVSENLEMLFLSSKNADREANLLYILQEIIKIPLATSEQLQKLQNSNNEADSDSDDENDRQKKRRNFKKEKFRKQKMPAANELPSEKATILFVPTRHHVEYISQLLRDCGYLISYIYGTLDQHARKRQLYNFRAGLTSILVVTDVAARGVDIPMLANVINYTLPGSSKIFVHRVGRTARAGNKGWAYSIVAENELPYLLDLELFLGKKILLTPMYDSLVDVMKKRWIDEGKPEYQFQPPKLSYTKRLVLGSCPRLDVEGLGDLYKNLMSSNFDLQLAKKTAMKAEKLYYRTRTSASPESLKRSKEIISSGWDAQNAFFGKNEEKEKLDFLAKLQNRRNKETVFEFTRNPDDEMAVFMKRRRKQLAPIQRKATERRELLEKERMAGLSHSIEDEILKGDDGETGYTVSEDALKEFEDADQLLEAQENENKKKKKPKSFKDPTFFLSHYAPAGDIQDKQLQITNGFANDAAQAAYDLNSDDKVQVHKQTATVKWDKKRKKYVNTQGIDNKKYIIGESGQKIAASFRSGRFDDWSKARNLKPLKVGSRETSIPSNLLEDPSQGPAANGRTVRGKFKHKQMKAPKMPDKHRDNYYSQKKKVEKALQSGISVKGYNNAPGLRSELKSTEQIRKDRIIAEKKRAKNARPSKKRKF

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.63
2	0.59
3	0.55
4	0.47
5	0.38
6	0.28
7	0.18
8	0.14
9	0.09
10	0.08
11	0.07
12	0.06
13	0.06
14	0.07
15	0.06
16	0.06
17	0.06
18	0.05
19	0.06
20	0.06
21	0.07
22	0.07
23	0.08
24	0.09
25	0.1
26	0.13
27	0.12
28	0.13
29	0.13
30	0.13
31	0.13
32	0.13
33	0.13
34	0.1
35	0.11
36	0.1
37	0.11
38	0.1
39	0.1
40	0.09
41	0.09
42	0.09
43	0.08
44	0.08
45	0.08
46	0.1
47	0.1
48	0.11
49	0.11
50	0.12
51	0.13
52	0.13
53	0.12
54	0.1
55	0.1
56	0.15
57	0.22
58	0.29
59	0.3
60	0.32
61	0.37
62	0.44
63	0.51
64	0.57
65	0.6
66	0.62
67	0.72
68	0.81
69	0.86
70	0.9
71	0.93
72	0.92
73	0.93
74	0.93
75	0.92
76	0.92
77	0.91
78	0.89
79	0.86
80	0.81
81	0.7
82	0.6
83	0.53
84	0.42
85	0.32
86	0.24
87	0.2
88	0.16
89	0.16
90	0.15
91	0.13
92	0.14
93	0.14
94	0.14
95	0.11
96	0.1
97	0.11
98	0.12
99	0.12
100	0.15
101	0.18
102	0.18
103	0.2
104	0.19
105	0.2
106	0.19
107	0.18
108	0.14
109	0.11
110	0.1
111	0.09
112	0.14
113	0.13
114	0.19
115	0.21
116	0.25
117	0.32
118	0.41
119	0.51
120	0.55
121	0.56
122	0.58
123	0.64
124	0.72
125	0.72
126	0.66
127	0.6
128	0.53
129	0.52
130	0.47
131	0.39
132	0.29
133	0.23
134	0.27
135	0.28
136	0.31
137	0.38
138	0.43
139	0.49
140	0.49
141	0.5
142	0.54
143	0.58
144	0.6
145	0.62
146	0.64
147	0.69
148	0.78
149	0.8
150	0.74
151	0.68
152	0.67
153	0.61
154	0.58
155	0.5
156	0.46
157	0.47
158	0.44
159	0.44
160	0.39
161	0.36
162	0.29
163	0.26
164	0.19
165	0.13
166	0.13
167	0.09
168	0.1
169	0.1
170	0.1
171	0.11
172	0.12
173	0.12
174	0.1
175	0.13
176	0.11
177	0.11
178	0.11
179	0.12
180	0.1
181	0.13
182	0.14
183	0.12
184	0.12
185	0.15
186	0.25
187	0.25
188	0.25
189	0.28
190	0.33
191	0.36
192	0.41
193	0.43
194	0.34
195	0.33
196	0.32
197	0.28
198	0.26
199	0.24
200	0.2
201	0.14
202	0.15
203	0.15
204	0.14
205	0.15
206	0.11
207	0.14
208	0.14
209	0.15
210	0.17
211	0.17
212	0.17
213	0.17
214	0.15
215	0.17
216	0.17
217	0.16
218	0.2
219	0.2
220	0.21
221	0.28
222	0.28
223	0.23
224	0.23
225	0.23
226	0.16
227	0.16
228	0.13
229	0.07
230	0.07
231	0.06
232	0.06
233	0.06
234	0.06
235	0.06
236	0.05
237	0.05
238	0.04
239	0.05
240	0.05
241	0.05
242	0.05
243	0.06
244	0.06
245	0.06
246	0.06
247	0.06
248	0.08
249	0.08
250	0.09
251	0.1
252	0.1
253	0.12
254	0.13
255	0.13
256	0.15
257	0.2
258	0.21
259	0.2
260	0.25
261	0.25
262	0.26
263	0.26
264	0.21
265	0.16
266	0.14
267	0.13
268	0.09
269	0.07
270	0.06
271	0.07
272	0.07
273	0.08
274	0.07
275	0.09
276	0.08
277	0.09
278	0.09
279	0.08
280	0.07
281	0.08
282	0.09
283	0.08
284	0.09
285	0.08
286	0.09
287	0.09
288	0.09
289	0.09
290	0.07
291	0.07
292	0.06
293	0.06
294	0.06
295	0.07
296	0.07
297	0.07
298	0.09
299	0.09
300	0.09
301	0.11
302	0.11
303	0.13
304	0.13
305	0.13
306	0.15
307	0.15
308	0.15
309	0.14
310	0.13
311	0.1
312	0.11
313	0.1
314	0.07
315	0.07
316	0.07
317	0.08
318	0.08
319	0.08
320	0.09
321	0.09
322	0.09
323	0.09
324	0.1
325	0.08
326	0.07
327	0.08
328	0.07
329	0.1
330	0.09
331	0.11
332	0.1
333	0.1
334	0.12
335	0.12
336	0.11
337	0.08
338	0.08
339	0.08
340	0.07
341	0.07
342	0.07
343	0.07
344	0.08
345	0.09
346	0.1
347	0.11
348	0.13
349	0.12
350	0.12
351	0.14
352	0.15
353	0.14
354	0.12
355	0.11
356	0.1
357	0.1
358	0.09
359	0.07
360	0.06
361	0.05
362	0.06
363	0.07
364	0.07
365	0.06
366	0.08
367	0.09
368	0.09
369	0.1
370	0.15
371	0.15
372	0.18
373	0.2
374	0.2
375	0.22
376	0.26
377	0.28
378	0.27
379	0.27
380	0.24
381	0.24
382	0.23
383	0.2
384	0.17
385	0.17
386	0.13
387	0.12
388	0.12
389	0.13
390	0.18
391	0.24
392	0.26
393	0.3
394	0.38
395	0.47
396	0.56
397	0.66
398	0.72
399	0.76
400	0.83
401	0.88
402	0.91
403	0.93
404	0.94
405	0.93
406	0.92
407	0.88
408	0.87
409	0.84
410	0.79
411	0.74
412	0.68
413	0.6
414	0.51
415	0.44
416	0.36
417	0.28
418	0.23
419	0.16
420	0.12
421	0.1
422	0.08
423	0.09
424	0.1
425	0.1
426	0.12
427	0.14
428	0.18
429	0.18
430	0.18
431	0.16
432	0.16
433	0.18
434	0.22
435	0.21
436	0.17
437	0.17
438	0.17
439	0.17
440	0.15
441	0.12
442	0.06
443	0.06
444	0.06
445	0.06
446	0.06
447	0.05
448	0.05
449	0.05
450	0.05
451	0.05
452	0.06
453	0.1
454	0.11
455	0.16
456	0.21
457	0.24
458	0.26
459	0.3
460	0.36
461	0.42
462	0.43
463	0.46
464	0.43
465	0.4
466	0.38
467	0.34
468	0.28
469	0.18
470	0.15
471	0.08
472	0.06
473	0.05
474	0.04
475	0.04
476	0.04
477	0.04
478	0.03
479	0.03
480	0.03
481	0.04
482	0.04
483	0.04
484	0.03
485	0.03
486	0.03
487	0.04
488	0.04
489	0.03
490	0.03
491	0.04
492	0.04
493	0.04
494	0.04
495	0.04
496	0.04
497	0.06
498	0.07
499	0.07
500	0.09
501	0.11
502	0.12
503	0.15
504	0.19
505	0.18
506	0.22
507	0.23
508	0.25
509	0.25
510	0.27
511	0.28
512	0.3
513	0.29
514	0.28
515	0.27
516	0.25
517	0.23
518	0.2
519	0.16
520	0.12
521	0.13
522	0.1
523	0.09
524	0.09
525	0.09
526	0.08
527	0.07
528	0.06
529	0.04
530	0.05
531	0.04
532	0.04
533	0.04
534	0.04
535	0.06
536	0.07
537	0.06
538	0.06
539	0.06
540	0.06
541	0.07
542	0.08
543	0.07
544	0.08
545	0.1
546	0.11
547	0.13
548	0.12
549	0.12
550	0.11
551	0.13
552	0.13
553	0.12
554	0.11
555	0.14
556	0.14
557	0.15
558	0.2
559	0.2
560	0.21
561	0.3
562	0.36
563	0.38
564	0.4
565	0.4
566	0.36
567	0.4
568	0.41
569	0.33
570	0.35
571	0.3
572	0.32
573	0.36
574	0.38
575	0.37
576	0.4
577	0.42
578	0.37
579	0.38
580	0.35
581	0.36
582	0.41
583	0.4
584	0.35
585	0.31
586	0.28
587	0.26
588	0.26
589	0.19
590	0.12
591	0.1
592	0.09
593	0.09
594	0.08
595	0.08
596	0.08
597	0.08
598	0.07
599	0.05
600	0.05
601	0.07
602	0.09
603	0.12
604	0.13
605	0.13
606	0.14
607	0.14
608	0.2
609	0.2
610	0.19
611	0.18
612	0.18
613	0.22
614	0.26
615	0.27
616	0.24
617	0.28
618	0.33
619	0.35
620	0.4
621	0.4
622	0.4
623	0.4
624	0.38
625	0.35
626	0.35
627	0.38
628	0.37
629	0.39
630	0.38
631	0.44
632	0.46
633	0.45
634	0.4
635	0.36
636	0.34
637	0.3
638	0.29
639	0.23
640	0.24
641	0.26
642	0.27
643	0.26
644	0.24
645	0.22
646	0.19
647	0.22
648	0.18
649	0.14
650	0.13
651	0.14
652	0.16
653	0.2
654	0.23
655	0.21
656	0.22
657	0.23
658	0.23
659	0.24
660	0.24
661	0.19
662	0.18
663	0.25
664	0.26
665	0.34
666	0.4
667	0.44
668	0.47
669	0.53
670	0.57
671	0.48
672	0.5
673	0.47
674	0.47
675	0.47
676	0.45
677	0.41
678	0.39
679	0.43
680	0.4
681	0.36
682	0.28
683	0.22
684	0.19
685	0.21
686	0.19
687	0.15
688	0.16
689	0.18
690	0.26
691	0.3
692	0.37
693	0.41
694	0.43
695	0.5
696	0.6
697	0.67
698	0.69
699	0.73
700	0.72
701	0.72
702	0.72
703	0.7
704	0.67
705	0.64
706	0.55
707	0.5
708	0.51
709	0.49
710	0.5
711	0.51
712	0.44
713	0.37
714	0.37
715	0.34
716	0.28
717	0.24
718	0.21
719	0.14
720	0.14
721	0.13
722	0.11
723	0.11
724	0.1
725	0.1
726	0.09
727	0.07
728	0.07
729	0.06
730	0.06
731	0.08
732	0.08
733	0.08
734	0.07
735	0.07
736	0.07
737	0.07
738	0.07
739	0.06
740	0.08
741	0.08
742	0.08
743	0.08
744	0.09
745	0.09
746	0.09
747	0.1
748	0.08
749	0.08
750	0.08
751	0.08
752	0.07
753	0.07
754	0.08
755	0.08
756	0.08
757	0.11
758	0.16
759	0.22
760	0.31
761	0.35
762	0.42
763	0.52
764	0.61
765	0.69
766	0.75
767	0.8
768	0.82
769	0.89
770	0.92
771	0.9
772	0.84
773	0.77
774	0.72
775	0.62
776	0.54
777	0.44
778	0.35
779	0.27
780	0.23
781	0.2
782	0.14
783	0.16
784	0.14
785	0.13
786	0.16
787	0.2
788	0.19
789	0.2
790	0.23
791	0.21
792	0.2
793	0.22
794	0.2
795	0.16
796	0.16
797	0.15
798	0.12
799	0.11
800	0.11
801	0.08
802	0.06
803	0.06
804	0.06
805	0.07
806	0.06
807	0.07
808	0.07
809	0.08
810	0.09
811	0.09
812	0.11
813	0.16
814	0.19
815	0.24
816	0.27
817	0.28
818	0.32
819	0.38
820	0.41
821	0.45
822	0.5
823	0.53
824	0.58
825	0.67
826	0.73
827	0.76
828	0.82
829	0.84
830	0.85
831	0.88
832	0.9
833	0.9
834	0.84
835	0.82
836	0.8
837	0.79
838	0.71
839	0.6
840	0.51
841	0.42
842	0.38
843	0.3
844	0.24
845	0.19
846	0.23
847	0.25
848	0.27
849	0.26
850	0.26
851	0.25
852	0.24
853	0.22
854	0.19
855	0.21
856	0.21
857	0.27
858	0.28
859	0.29
860	0.33
861	0.36
862	0.39
863	0.42
864	0.43
865	0.43
866	0.49
867	0.5
868	0.53
869	0.55
870	0.54
871	0.56
872	0.61
873	0.62
874	0.62
875	0.64
876	0.59
877	0.59
878	0.55
879	0.5
880	0.45
881	0.39
882	0.34
883	0.29
884	0.28
885	0.24
886	0.24
887	0.2
888	0.18
889	0.18
890	0.2
891	0.2
892	0.17
893	0.16
894	0.18
895	0.21
896	0.24
897	0.22
898	0.22
899	0.29
900	0.32
901	0.41
902	0.43
903	0.5
904	0.53
905	0.63
906	0.72
907	0.7
908	0.78
909	0.8
910	0.85
911	0.85
912	0.88
913	0.87
914	0.86
915	0.89
916	0.88
917	0.86
918	0.83
919	0.8
920	0.76
921	0.73
922	0.74
923	0.76
924	0.77
925	0.74
926	0.76
927	0.74
928	0.74
929	0.78
930	0.77
931	0.74
932	0.72
933	0.75
934	0.69
935	0.65
936	0.62
937	0.54
938	0.47
939	0.39
940	0.31
941	0.28
942	0.26
943	0.27
944	0.28
945	0.27
946	0.25
947	0.25
948	0.31
949	0.3
950	0.3
951	0.3
952	0.29
953	0.31
954	0.38
955	0.42
956	0.45
957	0.48
958	0.53
959	0.55
960	0.57
961	0.58
962	0.56
963	0.61
964	0.62
965	0.62
966	0.67
967	0.71
968	0.73
969	0.8
970	0.82
971	0.79
972	0.79
973	0.82
974	0.82
975	0.84

Q12389

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer