Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

P53769

Protein Details
Accession P53769    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
3-32RKRLVNKSSSDEKNQKKRQKINFSEEKLVAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
99-102AKKR
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 12.5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039971  CWC24-like  
IPR000571  Znf_CCCH  
IPR036855  Znf_CCCH_sf  
IPR001841  Znf_RING  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0005684  C:U2-type spliceosomal complex  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0000349  P:generation of catalytic spliceosome for first transesterification step  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
GO:0034247  P:snoRNA splicing  
KEGG sce:YLR323C  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF13923  zf-C3HC4_2  
PF00642  zf-CCCH  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50103  ZF_C3H1  
PS50089  ZF_RING_2  
CDD cd16539  RING-HC_RNF113A_B  
Amino Acid Sequences MFRKRLVNKSSSDEKNQKKRQKINFSEEKLVASDEEKGSSDLMSLAKSGNSRTLQLSHENEGKLQKKGEDLDKYTLTVNDDSTKEDLLNFERKELAEKAKKRRPSDDNELVLNMSGKNKRLTKQINQPTNIRTTVLMDFQPDVCKDYKQTGYCGYGDSCKFLHSRDDFKTGWKLNQEWNADKEDSKAVTLDLEKIPFKCTLCKEDYKSPVVTNCGHYFCGSCFAKDMKKGTKCFICHKETHGSAKVASDLQKMLNKRKS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.7
2 0.75
3 0.81
4 0.82
5 0.83
6 0.87
7 0.88
8 0.89
9 0.88
10 0.87
11 0.87
12 0.84
13 0.81
14 0.72
15 0.63
16 0.52
17 0.44
18 0.34
19 0.25
20 0.23
21 0.17
22 0.17
23 0.17
24 0.16
25 0.16
26 0.15
27 0.14
28 0.11
29 0.11
30 0.1
31 0.09
32 0.09
33 0.11
34 0.12
35 0.13
36 0.18
37 0.18
38 0.2
39 0.22
40 0.24
41 0.25
42 0.31
43 0.34
44 0.31
45 0.35
46 0.33
47 0.33
48 0.38
49 0.39
50 0.34
51 0.32
52 0.29
53 0.27
54 0.31
55 0.36
56 0.35
57 0.36
58 0.38
59 0.37
60 0.37
61 0.34
62 0.32
63 0.27
64 0.21
65 0.18
66 0.17
67 0.16
68 0.18
69 0.18
70 0.17
71 0.14
72 0.14
73 0.14
74 0.14
75 0.21
76 0.19
77 0.19
78 0.2
79 0.2
80 0.24
81 0.25
82 0.3
83 0.31
84 0.38
85 0.47
86 0.53
87 0.6
88 0.6
89 0.66
90 0.64
91 0.63
92 0.66
93 0.65
94 0.6
95 0.53
96 0.5
97 0.41
98 0.35
99 0.27
100 0.18
101 0.13
102 0.12
103 0.14
104 0.18
105 0.21
106 0.23
107 0.31
108 0.36
109 0.39
110 0.48
111 0.55
112 0.57
113 0.57
114 0.57
115 0.51
116 0.48
117 0.42
118 0.32
119 0.23
120 0.18
121 0.17
122 0.16
123 0.14
124 0.11
125 0.12
126 0.12
127 0.13
128 0.11
129 0.12
130 0.11
131 0.12
132 0.12
133 0.16
134 0.21
135 0.2
136 0.22
137 0.23
138 0.25
139 0.25
140 0.25
141 0.21
142 0.2
143 0.19
144 0.19
145 0.16
146 0.15
147 0.15
148 0.15
149 0.22
150 0.2
151 0.26
152 0.28
153 0.33
154 0.32
155 0.35
156 0.42
157 0.36
158 0.36
159 0.34
160 0.33
161 0.33
162 0.4
163 0.41
164 0.37
165 0.37
166 0.38
167 0.35
168 0.33
169 0.3
170 0.26
171 0.22
172 0.19
173 0.17
174 0.12
175 0.14
176 0.14
177 0.16
178 0.14
179 0.16
180 0.18
181 0.18
182 0.2
183 0.21
184 0.21
185 0.24
186 0.27
187 0.31
188 0.35
189 0.42
190 0.45
191 0.51
192 0.56
193 0.53
194 0.51
195 0.47
196 0.45
197 0.41
198 0.38
199 0.35
200 0.34
201 0.32
202 0.31
203 0.29
204 0.27
205 0.24
206 0.3
207 0.25
208 0.21
209 0.22
210 0.25
211 0.3
212 0.34
213 0.4
214 0.41
215 0.48
216 0.51
217 0.56
218 0.59
219 0.59
220 0.63
221 0.65
222 0.62
223 0.57
224 0.6
225 0.61
226 0.58
227 0.61
228 0.57
229 0.51
230 0.45
231 0.43
232 0.4
233 0.34
234 0.33
235 0.28
236 0.24
237 0.27
238 0.32
239 0.36