Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

P53632

Protein Details
Accession P53632    Localization Confidence Medium Confidence Score 13
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
4-45KSVTASSSKKIKNRHNGKVKKSKKIKKVRKPQKSISLNDENEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
12-36KKIKNRHNGKVKKSKKIKKVRKPQK
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 11.333, cyto 3, cyto_mito 2.833, mito 1.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR043519  NT_sf  
IPR002058  PAP_assoc  
IPR002934  Polymerase_NTP_transf_dom  
IPR045862  Trf4-like  
Gene Ontology GO:0005829  C:cytosol  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0031499  C:TRAMP complex  
GO:0051575  F:5'-deoxyribose-5-phosphate lyase activity  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:1990817  F:poly(A) RNA polymerase activity  
GO:0006284  P:base-excision repair  
GO:0051301  P:cell division  
GO:0071044  P:histone mRNA catabolic process  
GO:0051179  P:localization  
GO:0042138  P:meiotic DNA double-strand break formation  
GO:0043629  P:ncRNA polyadenylation  
GO:0045910  P:negative regulation of DNA recombination  
GO:0071031  P:nuclear mRNA surveillance of mRNA 3'-end processing  
GO:0071040  P:nuclear polyadenylation-dependent antisense transcript catabolic process  
GO:0071039  P:nuclear polyadenylation-dependent CUT catabolic process  
GO:0071042  P:nuclear polyadenylation-dependent mRNA catabolic process  
GO:0071035  P:nuclear polyadenylation-dependent rRNA catabolic process  
GO:0071036  P:nuclear polyadenylation-dependent snoRNA catabolic process  
GO:0071037  P:nuclear polyadenylation-dependent snRNA catabolic process  
GO:0071038  P:nuclear polyadenylation-dependent tRNA catabolic process  
GO:0071047  P:polyadenylation-dependent mRNA catabolic process  
GO:0071051  P:polyadenylation-dependent snoRNA 3'-end processing  
GO:0031123  P:RNA 3'-end processing  
GO:0000292  P:RNA fragment catabolic process  
GO:0043631  P:RNA polyadenylation  
GO:0071050  P:sno(s)RNA polyadenylation  
GO:0006400  P:tRNA modification  
GO:0034475  P:U4 snRNA 3'-end processing  
KEGG sce:YOL115W  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01909  NTP_transf_2  
PF03828  PAP_assoc  
CDD cd05402  NT_PAP_TUTase  
Amino Acid Sequences MGAKSVTASSSKKIKNRHNGKVKKSKKIKKVRKPQKSISLNDENEVEILPSRNEQETNKLPKDHVTADGILVLEHKSDDDEGFDVYDGHFDNPTDIPSTTEESKTPSLAVHGDEKDLANNDDFISLSASSEDEQAEQEEEREKQELEIKKEKQKEILNTDYPWILNHDHSKQKEISDWLTFEIKDFVAYISPSREEIEIRNQTISTIREAVKQLWPDADLHVFGSYSTDLYLPGSDIDCVVTSELGGKESRNNLYSLASHLKKKNLATEVEVVAKARVPIIKFVEPHSGIHIDVSFERTNGIEAAKLIREWLDDTPGLRELVLIVKQFLHARRLNNVHTGGLGGFSIICLVFSFLHMHPRIITNEIDPKDNLGVLLIEFFELYGKNFGYDDVALGSSDGYPVYFPKSTWSAIQPIKNPFSLAIQDPGDESNNISRGSFNIRDIKKAFAGAFDLLTNRCFELHSATFKDRLGKSILGNVIKYRGKARDFKDERGLVLNKAIIENENYHKKRSRIIHDEDFAEDTVTSTATATTTDDDYEITNPPAKKAKIEEKPESEPAKRNSGETYITVSSEDDDEDGYNPYTL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.62
2 0.68
3 0.76
4 0.81
5 0.82
6 0.85
7 0.9
8 0.91
9 0.9
10 0.9
11 0.91
12 0.9
13 0.9
14 0.91
15 0.92
16 0.92
17 0.94
18 0.94
19 0.94
20 0.94
21 0.93
22 0.93
23 0.9
24 0.85
25 0.83
26 0.82
27 0.72
28 0.64
29 0.55
30 0.44
31 0.36
32 0.3
33 0.22
34 0.13
35 0.13
36 0.13
37 0.14
38 0.16
39 0.18
40 0.21
41 0.22
42 0.29
43 0.36
44 0.45
45 0.48
46 0.48
47 0.47
48 0.49
49 0.53
50 0.47
51 0.41
52 0.36
53 0.31
54 0.29
55 0.3
56 0.24
57 0.18
58 0.16
59 0.13
60 0.09
61 0.08
62 0.08
63 0.08
64 0.09
65 0.09
66 0.1
67 0.1
68 0.1
69 0.11
70 0.11
71 0.1
72 0.09
73 0.11
74 0.1
75 0.11
76 0.11
77 0.11
78 0.13
79 0.13
80 0.15
81 0.15
82 0.14
83 0.15
84 0.16
85 0.21
86 0.21
87 0.22
88 0.22
89 0.24
90 0.26
91 0.25
92 0.23
93 0.18
94 0.18
95 0.18
96 0.19
97 0.21
98 0.2
99 0.2
100 0.21
101 0.21
102 0.21
103 0.21
104 0.21
105 0.15
106 0.15
107 0.14
108 0.13
109 0.13
110 0.11
111 0.11
112 0.1
113 0.09
114 0.09
115 0.09
116 0.09
117 0.1
118 0.1
119 0.08
120 0.09
121 0.09
122 0.1
123 0.1
124 0.11
125 0.13
126 0.14
127 0.15
128 0.16
129 0.15
130 0.16
131 0.23
132 0.28
133 0.32
134 0.41
135 0.45
136 0.51
137 0.58
138 0.59
139 0.59
140 0.59
141 0.59
142 0.58
143 0.6
144 0.55
145 0.49
146 0.48
147 0.42
148 0.36
149 0.28
150 0.24
151 0.18
152 0.18
153 0.22
154 0.27
155 0.33
156 0.34
157 0.39
158 0.37
159 0.37
160 0.37
161 0.35
162 0.33
163 0.28
164 0.28
165 0.25
166 0.26
167 0.24
168 0.21
169 0.19
170 0.15
171 0.12
172 0.12
173 0.1
174 0.09
175 0.09
176 0.1
177 0.1
178 0.11
179 0.11
180 0.12
181 0.12
182 0.12
183 0.14
184 0.23
185 0.25
186 0.26
187 0.26
188 0.25
189 0.25
190 0.27
191 0.25
192 0.18
193 0.18
194 0.18
195 0.21
196 0.22
197 0.24
198 0.25
199 0.25
200 0.24
201 0.2
202 0.2
203 0.17
204 0.17
205 0.15
206 0.11
207 0.1
208 0.1
209 0.09
210 0.08
211 0.08
212 0.07
213 0.06
214 0.06
215 0.06
216 0.06
217 0.06
218 0.07
219 0.05
220 0.06
221 0.06
222 0.06
223 0.06
224 0.06
225 0.06
226 0.06
227 0.06
228 0.05
229 0.04
230 0.07
231 0.07
232 0.08
233 0.08
234 0.08
235 0.11
236 0.15
237 0.17
238 0.15
239 0.16
240 0.15
241 0.16
242 0.16
243 0.17
244 0.21
245 0.21
246 0.26
247 0.28
248 0.31
249 0.33
250 0.34
251 0.36
252 0.32
253 0.31
254 0.29
255 0.29
256 0.27
257 0.25
258 0.24
259 0.18
260 0.15
261 0.14
262 0.11
263 0.09
264 0.09
265 0.08
266 0.12
267 0.16
268 0.18
269 0.18
270 0.21
271 0.26
272 0.25
273 0.25
274 0.23
275 0.2
276 0.17
277 0.17
278 0.15
279 0.09
280 0.09
281 0.12
282 0.1
283 0.09
284 0.1
285 0.09
286 0.1
287 0.09
288 0.09
289 0.06
290 0.06
291 0.07
292 0.07
293 0.07
294 0.07
295 0.07
296 0.07
297 0.08
298 0.08
299 0.09
300 0.09
301 0.1
302 0.11
303 0.12
304 0.12
305 0.1
306 0.09
307 0.07
308 0.09
309 0.11
310 0.09
311 0.09
312 0.09
313 0.1
314 0.13
315 0.14
316 0.18
317 0.2
318 0.22
319 0.27
320 0.31
321 0.32
322 0.34
323 0.33
324 0.27
325 0.23
326 0.22
327 0.16
328 0.12
329 0.1
330 0.05
331 0.04
332 0.04
333 0.04
334 0.03
335 0.03
336 0.03
337 0.04
338 0.04
339 0.06
340 0.09
341 0.09
342 0.17
343 0.17
344 0.18
345 0.18
346 0.2
347 0.21
348 0.2
349 0.2
350 0.15
351 0.22
352 0.23
353 0.24
354 0.21
355 0.21
356 0.19
357 0.19
358 0.16
359 0.09
360 0.08
361 0.06
362 0.07
363 0.05
364 0.04
365 0.04
366 0.04
367 0.05
368 0.05
369 0.06
370 0.07
371 0.07
372 0.07
373 0.08
374 0.08
375 0.09
376 0.09
377 0.08
378 0.08
379 0.08
380 0.07
381 0.07
382 0.07
383 0.05
384 0.06
385 0.05
386 0.04
387 0.04
388 0.05
389 0.09
390 0.1
391 0.1
392 0.14
393 0.17
394 0.18
395 0.2
396 0.22
397 0.26
398 0.3
399 0.35
400 0.36
401 0.4
402 0.41
403 0.39
404 0.37
405 0.3
406 0.28
407 0.26
408 0.22
409 0.2
410 0.17
411 0.17
412 0.17
413 0.18
414 0.17
415 0.14
416 0.14
417 0.14
418 0.16
419 0.16
420 0.16
421 0.14
422 0.15
423 0.22
424 0.23
425 0.23
426 0.3
427 0.3
428 0.36
429 0.37
430 0.39
431 0.33
432 0.34
433 0.29
434 0.22
435 0.24
436 0.18
437 0.17
438 0.15
439 0.15
440 0.13
441 0.14
442 0.13
443 0.11
444 0.1
445 0.1
446 0.1
447 0.16
448 0.19
449 0.24
450 0.27
451 0.29
452 0.32
453 0.33
454 0.4
455 0.33
456 0.32
457 0.31
458 0.29
459 0.28
460 0.32
461 0.36
462 0.31
463 0.31
464 0.3
465 0.33
466 0.32
467 0.33
468 0.31
469 0.33
470 0.37
471 0.44
472 0.47
473 0.51
474 0.54
475 0.58
476 0.62
477 0.57
478 0.53
479 0.52
480 0.5
481 0.4
482 0.37
483 0.33
484 0.24
485 0.23
486 0.22
487 0.16
488 0.17
489 0.2
490 0.25
491 0.34
492 0.35
493 0.4
494 0.46
495 0.46
496 0.52
497 0.56
498 0.59
499 0.58
500 0.65
501 0.68
502 0.66
503 0.66
504 0.59
505 0.52
506 0.42
507 0.34
508 0.25
509 0.17
510 0.13
511 0.12
512 0.09
513 0.07
514 0.08
515 0.07
516 0.08
517 0.08
518 0.1
519 0.11
520 0.11
521 0.11
522 0.11
523 0.13
524 0.14
525 0.15
526 0.16
527 0.21
528 0.21
529 0.25
530 0.33
531 0.33
532 0.36
533 0.42
534 0.5
535 0.54
536 0.62
537 0.67
538 0.66
539 0.71
540 0.75
541 0.72
542 0.68
543 0.67
544 0.62
545 0.62
546 0.56
547 0.52
548 0.47
549 0.45
550 0.43
551 0.36
552 0.37
553 0.29
554 0.29
555 0.27
556 0.24
557 0.21
558 0.18
559 0.17
560 0.11
561 0.11
562 0.11
563 0.12
564 0.14