FuNGI

P53331

Protein Details

Accession

P53331

Localization Confidence

High

Confidence Score

18.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
33-60	HTNVVSEVNKNKKKKKAKPMTCTLLKSV	Hydrophilic
449-473	GRIKNLERSRNYNKKPRKETPSFDA	Hydrophilic
517-536	EFIQDKKERLDKRREREPEI	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
42-50	KNKKKKKAK

Subcellular Location(s)

nucl 22, cyto_nucl 14.5, cyto 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR013520 Exonuclease_RNaseT/DNA_pol3 IPR034922 REX1-like_exo IPR047021 REXO1/3/4-like IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0008408 F:3'-5' exonuclease activity GO:0000175 F:3'-5'-RNA exonuclease activity GO:0004527 F:exonuclease activity GO:0003723 F:RNA binding GO:0000467 P:exonucleolytic trimming to generate mature 3'-end of 5.8S rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) GO:0002107 P:generation of mature 3'-end of 5S rRNA generated by RNA polymerase III GO:0034415 P:tRNA 3'-trailer cleavage, exonucleolytic GO:0034476 P:U5 snRNA 3'-end processing
KEGG	sce:YGR276C -
Pfam	View protein in Pfam PF00929 RNase_T
CDD	cd06145 REX1_like

Amino Acid Sequences

MQVEGPDTNFVSDLALGSKKRRLSKTSVQEDDHTNVVSEVNKNKKKKKAKPMTCTLLKSVVEKGIGIKDVRDMTQYLLQAENNSPKWIDICNRSSLQKMIVLFIPGLQPDDFENGKNTFNEISDDNFKYIPGEIASTFHTFPVMAPGSKMTLFSPYNSFINVGLSKMEKINKLKELQKKKKITINDLVLSEQQLVANDYPLDSGDTNFDTDWVQTVDFTHGGSHIFALDCEMCLSEQGLVLTRISLVNFDNEVIYEELVKPDVPIVDYLTRYSGITEEKLTVGAKKTLREVQKDLLKIISRSDILIGHSLQNDLKVMKLKHPLVVDTAIIYHHKAGDPFKPSLKYLSETFLNKSIQNGEHDSVEDARACLELTKLKILNGLAFGIGINTENLFTKLHRFEVKTVLLNDMIIKNHTEDDSKGQLIRCVEDDETWTHIHENLNKDVKLIVGRIKNLERSRNYNKKPRKETPSFDASMVLHDIGQHLTQLYENATPGTMILIMSGTGDTRPWNNLSTELEFIQDKKERLDKRREREPEIVEAIKLARGGVASFTVK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.12
2	0.16
3	0.18
4	0.22
5	0.28
6	0.33
7	0.42
8	0.48
9	0.51
10	0.55
11	0.64
12	0.7
13	0.75
14	0.76
15	0.7
16	0.67
17	0.66
18	0.6
19	0.51
20	0.41
21	0.31
22	0.24
23	0.22
24	0.21
25	0.22
26	0.27
27	0.36
28	0.44
29	0.53
30	0.61
31	0.7
32	0.78
33	0.83
34	0.86
35	0.87
36	0.89
37	0.9
38	0.92
39	0.92
40	0.89
41	0.82
42	0.74
43	0.7
44	0.6
45	0.53
46	0.46
47	0.39
48	0.31
49	0.28
50	0.27
51	0.23
52	0.25
53	0.23
54	0.2
55	0.22
56	0.23
57	0.24
58	0.23
59	0.2
60	0.2
61	0.25
62	0.25
63	0.22
64	0.22
65	0.22
66	0.22
67	0.26
68	0.3
69	0.27
70	0.27
71	0.26
72	0.24
73	0.25
74	0.26
75	0.28
76	0.29
77	0.31
78	0.35
79	0.38
80	0.39
81	0.41
82	0.38
83	0.34
84	0.29
85	0.26
86	0.23
87	0.21
88	0.21
89	0.18
90	0.17
91	0.16
92	0.13
93	0.15
94	0.12
95	0.11
96	0.11
97	0.16
98	0.16
99	0.15
100	0.18
101	0.18
102	0.2
103	0.2
104	0.21
105	0.17
106	0.17
107	0.19
108	0.16
109	0.19
110	0.23
111	0.24
112	0.23
113	0.22
114	0.22
115	0.2
116	0.2
117	0.17
118	0.11
119	0.11
120	0.1
121	0.12
122	0.15
123	0.16
124	0.16
125	0.14
126	0.14
127	0.12
128	0.12
129	0.18
130	0.17
131	0.14
132	0.15
133	0.16
134	0.17
135	0.18
136	0.18
137	0.11
138	0.16
139	0.16
140	0.17
141	0.2
142	0.21
143	0.21
144	0.21
145	0.21
146	0.15
147	0.19
148	0.17
149	0.14
150	0.13
151	0.13
152	0.14
153	0.16
154	0.2
155	0.21
156	0.25
157	0.3
158	0.34
159	0.39
160	0.45
161	0.52
162	0.6
163	0.65
164	0.7
165	0.72
166	0.72
167	0.73
168	0.71
169	0.69
170	0.66
171	0.62
172	0.56
173	0.49
174	0.45
175	0.39
176	0.34
177	0.27
178	0.18
179	0.12
180	0.09
181	0.1
182	0.09
183	0.09
184	0.08
185	0.08
186	0.08
187	0.08
188	0.09
189	0.07
190	0.07
191	0.08
192	0.09
193	0.1
194	0.09
195	0.1
196	0.08
197	0.08
198	0.09
199	0.08
200	0.07
201	0.07
202	0.08
203	0.09
204	0.09
205	0.09
206	0.08
207	0.07
208	0.08
209	0.08
210	0.07
211	0.06
212	0.06
213	0.05
214	0.07
215	0.07
216	0.06
217	0.06
218	0.06
219	0.06
220	0.06
221	0.06
222	0.05
223	0.05
224	0.05
225	0.06
226	0.07
227	0.07
228	0.06
229	0.07
230	0.07
231	0.06
232	0.07
233	0.06
234	0.07
235	0.08
236	0.08
237	0.07
238	0.07
239	0.08
240	0.08
241	0.07
242	0.07
243	0.07
244	0.07
245	0.07
246	0.07
247	0.05
248	0.06
249	0.06
250	0.06
251	0.06
252	0.08
253	0.1
254	0.1
255	0.1
256	0.1
257	0.11
258	0.1
259	0.1
260	0.09
261	0.08
262	0.09
263	0.09
264	0.09
265	0.09
266	0.1
267	0.1
268	0.1
269	0.1
270	0.15
271	0.15
272	0.16
273	0.19
274	0.24
275	0.28
276	0.3
277	0.32
278	0.33
279	0.36
280	0.36
281	0.33
282	0.31
283	0.28
284	0.24
285	0.22
286	0.18
287	0.14
288	0.13
289	0.13
290	0.11
291	0.11
292	0.12
293	0.12
294	0.11
295	0.11
296	0.12
297	0.11
298	0.11
299	0.1
300	0.09
301	0.09
302	0.13
303	0.14
304	0.18
305	0.25
306	0.26
307	0.28
308	0.29
309	0.28
310	0.25
311	0.25
312	0.2
313	0.13
314	0.13
315	0.1
316	0.1
317	0.1
318	0.08
319	0.08
320	0.09
321	0.1
322	0.12
323	0.17
324	0.2
325	0.22
326	0.25
327	0.26
328	0.26
329	0.28
330	0.28
331	0.25
332	0.22
333	0.24
334	0.24
335	0.24
336	0.25
337	0.26
338	0.26
339	0.23
340	0.23
341	0.24
342	0.21
343	0.23
344	0.25
345	0.21
346	0.2
347	0.2
348	0.2
349	0.17
350	0.16
351	0.13
352	0.09
353	0.09
354	0.08
355	0.08
356	0.07
357	0.08
358	0.1
359	0.11
360	0.16
361	0.16
362	0.16
363	0.19
364	0.19
365	0.19
366	0.17
367	0.15
368	0.1
369	0.1
370	0.09
371	0.07
372	0.06
373	0.05
374	0.05
375	0.04
376	0.05
377	0.06
378	0.07
379	0.08
380	0.08
381	0.14
382	0.16
383	0.2
384	0.24
385	0.26
386	0.28
387	0.35
388	0.37
389	0.35
390	0.35
391	0.32
392	0.28
393	0.26
394	0.25
395	0.2
396	0.17
397	0.14
398	0.14
399	0.13
400	0.14
401	0.15
402	0.14
403	0.14
404	0.19
405	0.22
406	0.22
407	0.24
408	0.23
409	0.25
410	0.25
411	0.25
412	0.21
413	0.2
414	0.19
415	0.17
416	0.19
417	0.18
418	0.2
419	0.18
420	0.17
421	0.15
422	0.17
423	0.2
424	0.23
425	0.26
426	0.31
427	0.37
428	0.36
429	0.36
430	0.34
431	0.31
432	0.28
433	0.26
434	0.25
435	0.23
436	0.26
437	0.31
438	0.34
439	0.41
440	0.44
441	0.5
442	0.49
443	0.53
444	0.62
445	0.67
446	0.72
447	0.74
448	0.79
449	0.81
450	0.86
451	0.87
452	0.86
453	0.84
454	0.83
455	0.8
456	0.78
457	0.7
458	0.6
459	0.54
460	0.43
461	0.37
462	0.31
463	0.24
464	0.15
465	0.13
466	0.14
467	0.12
468	0.12
469	0.1
470	0.09
471	0.09
472	0.09
473	0.1
474	0.11
475	0.11
476	0.12
477	0.12
478	0.12
479	0.11
480	0.1
481	0.1
482	0.08
483	0.06
484	0.06
485	0.06
486	0.06
487	0.06
488	0.07
489	0.06
490	0.06
491	0.07
492	0.09
493	0.11
494	0.15
495	0.17
496	0.19
497	0.2
498	0.23
499	0.28
500	0.29
501	0.3
502	0.26
503	0.26
504	0.25
505	0.25
506	0.29
507	0.29
508	0.27
509	0.3
510	0.39
511	0.45
512	0.53
513	0.64
514	0.66
515	0.7
516	0.79
517	0.81
518	0.8
519	0.8
520	0.75
521	0.72
522	0.69
523	0.61
524	0.5
525	0.45
526	0.38
527	0.31
528	0.26
529	0.18
530	0.12
531	0.11
532	0.11
533	0.11

P53331

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer