Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

P48412

Protein Details
Accession P48412    Localization Confidence High Confidence Score 22.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
7-43ELKNSEGKKKGRGNRYHNKNRGKSKNETVDPKKNENKBasic
47-80ATNATHNNSKGRRNNKKRNREYYNYKRKARLGKSHydrophilic
263-320LVGTGDKVKNKNKKKKNKNAKKKFKEEEASAKIPKKKRNRGKKKRENREKSTISKTKNBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
13-32GKKKGRGNRYHNKNRGKSKN
56-68KGRRNNKKRNREY
71-76YKRKAR
269-313KVKNKNKKKKNKNAKKKFKEEEASAKIPKKKRNRGKKKRENREKS
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 11.5, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR039722  Upf3  
IPR005120  UPF3_dom  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0005844  C:polysome  
GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0071026  P:cytoplasmic RNA surveillance  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0070478  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, 3'-5' exonucleolytic nonsense-mediated decay  
GO:0000184  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay  
GO:0045727  P:positive regulation of translation  
GO:0016567  P:protein ubiquitination  
KEGG sce:YGR072W  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF03467  Smg4_UPF3  
CDD cd12455  RRM_like_Smg4_UPF3  
Amino Acid Sequences MSNVAGELKNSEGKKKGRGNRYHNKNRGKSKNETVDPKKNENKVNNATNATHNNSKGRRNNKKRNREYYNYKRKARLGKSTENEGFKLVIRLLPPNLTADEFFAILRDNNNDDGDKQDIQGKLKYSDWCFFEGHYSSKVFKNSTYSRCNFLFDNLSDLEKCANFIKTCKFIDNKDNITIPDMKLSPYVKKFTQTSKKDAALVGTIEEDEIFKTFMNSMKQLNENDEYSFQDFSVLKSLEKEFSKSIELENKIAERTERVLTELVGTGDKVKNKNKKKKNKNAKKKFKEEEASAKIPKKKRNRGKKKRENREKSTISKTKNSNVVIIEEAGKEVLKQRKKKMLLQEKLKISNSSQPQSSSAQTQPSFQPKENLFVPRVKILHRDDTKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.47
2 0.55
3 0.62
4 0.66
5 0.75
6 0.79
7 0.82
8 0.88
9 0.9
10 0.9
11 0.91
12 0.9
13 0.91
14 0.91
15 0.87
16 0.84
17 0.84
18 0.84
19 0.81
20 0.82
21 0.81
22 0.8
23 0.8
24 0.82
25 0.8
26 0.76
27 0.77
28 0.74
29 0.74
30 0.73
31 0.73
32 0.69
33 0.64
34 0.59
35 0.57
36 0.55
37 0.51
38 0.48
39 0.44
40 0.47
41 0.48
42 0.56
43 0.58
44 0.63
45 0.69
46 0.74
47 0.83
48 0.85
49 0.91
50 0.92
51 0.94
52 0.92
53 0.91
54 0.91
55 0.91
56 0.91
57 0.89
58 0.86
59 0.82
60 0.8
61 0.81
62 0.77
63 0.77
64 0.73
65 0.74
66 0.71
67 0.74
68 0.72
69 0.64
70 0.57
71 0.48
72 0.4
73 0.31
74 0.28
75 0.2
76 0.16
77 0.15
78 0.17
79 0.18
80 0.18
81 0.18
82 0.18
83 0.18
84 0.17
85 0.16
86 0.14
87 0.13
88 0.12
89 0.11
90 0.1
91 0.09
92 0.09
93 0.1
94 0.11
95 0.12
96 0.14
97 0.15
98 0.16
99 0.15
100 0.17
101 0.19
102 0.17
103 0.16
104 0.19
105 0.2
106 0.22
107 0.25
108 0.24
109 0.23
110 0.27
111 0.31
112 0.3
113 0.32
114 0.31
115 0.31
116 0.29
117 0.27
118 0.27
119 0.24
120 0.23
121 0.2
122 0.2
123 0.2
124 0.23
125 0.25
126 0.22
127 0.21
128 0.27
129 0.32
130 0.38
131 0.43
132 0.42
133 0.44
134 0.44
135 0.44
136 0.37
137 0.32
138 0.3
139 0.21
140 0.23
141 0.19
142 0.19
143 0.17
144 0.17
145 0.16
146 0.11
147 0.12
148 0.1
149 0.12
150 0.12
151 0.15
152 0.18
153 0.22
154 0.23
155 0.26
156 0.27
157 0.27
158 0.35
159 0.39
160 0.37
161 0.35
162 0.35
163 0.31
164 0.32
165 0.31
166 0.22
167 0.19
168 0.16
169 0.14
170 0.16
171 0.18
172 0.2
173 0.21
174 0.24
175 0.21
176 0.25
177 0.27
178 0.33
179 0.41
180 0.4
181 0.43
182 0.45
183 0.46
184 0.44
185 0.42
186 0.33
187 0.24
188 0.2
189 0.15
190 0.09
191 0.08
192 0.06
193 0.06
194 0.05
195 0.04
196 0.05
197 0.04
198 0.04
199 0.05
200 0.06
201 0.09
202 0.11
203 0.13
204 0.14
205 0.17
206 0.2
207 0.2
208 0.23
209 0.22
210 0.21
211 0.2
212 0.2
213 0.19
214 0.17
215 0.17
216 0.13
217 0.14
218 0.13
219 0.13
220 0.18
221 0.17
222 0.15
223 0.17
224 0.19
225 0.2
226 0.21
227 0.22
228 0.17
229 0.19
230 0.21
231 0.19
232 0.2
233 0.23
234 0.24
235 0.23
236 0.24
237 0.23
238 0.21
239 0.21
240 0.19
241 0.13
242 0.15
243 0.16
244 0.14
245 0.15
246 0.15
247 0.15
248 0.16
249 0.15
250 0.12
251 0.1
252 0.1
253 0.12
254 0.14
255 0.18
256 0.23
257 0.3
258 0.4
259 0.5
260 0.61
261 0.68
262 0.76
263 0.84
264 0.89
265 0.93
266 0.94
267 0.95
268 0.96
269 0.97
270 0.96
271 0.95
272 0.9
273 0.88
274 0.84
275 0.78
276 0.77
277 0.73
278 0.69
279 0.64
280 0.64
281 0.62
282 0.62
283 0.65
284 0.65
285 0.69
286 0.74
287 0.8
288 0.85
289 0.88
290 0.93
291 0.95
292 0.96
293 0.96
294 0.97
295 0.96
296 0.93
297 0.92
298 0.88
299 0.84
300 0.84
301 0.8
302 0.75
303 0.73
304 0.69
305 0.65
306 0.65
307 0.59
308 0.53
309 0.46
310 0.43
311 0.36
312 0.32
313 0.27
314 0.2
315 0.18
316 0.14
317 0.13
318 0.11
319 0.17
320 0.25
321 0.31
322 0.39
323 0.48
324 0.58
325 0.64
326 0.71
327 0.75
328 0.77
329 0.78
330 0.8
331 0.8
332 0.78
333 0.79
334 0.74
335 0.66
336 0.58
337 0.56
338 0.55
339 0.5
340 0.45
341 0.4
342 0.41
343 0.42
344 0.41
345 0.38
346 0.34
347 0.38
348 0.36
349 0.37
350 0.41
351 0.48
352 0.5
353 0.46
354 0.51
355 0.44
356 0.5
357 0.51
358 0.5
359 0.44
360 0.44
361 0.46
362 0.45
363 0.46
364 0.43
365 0.46
366 0.46
367 0.53