Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

P40487

Protein Details
Accession P40487    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-28MSGSTESKKQPRRRFIGRKSGNSNNDKLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
12-13RR
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 13.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR016435  DPH1/DPH2  
IPR042263  DPH1/DPH2_1  
IPR042264  DPH1/DPH2_2  
IPR042265  DPH1/DPH2_3  
IPR035435  DPH1/DPH2_euk_archaea  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0032991  C:protein-containing complex  
GO:0090560  F:2-(3-amino-3-carboxypropyl)histidine synthase activity  
GO:0051539  F:4 iron, 4 sulfur cluster binding  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0017183  P:peptidyl-diphthamide biosynthetic process from peptidyl-histidine  
KEGG sce:YIL103W  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01866  Diphthamide_syn  
Amino Acid Sequences MSGSTESKKQPRRRFIGRKSGNSNNDKLTTVAENGNEIIHKQKSRIALGRSVNHVPEDILNDKELNEAIKLLPSNYNFEIHKTVWNIRKYNAKRIALQMPEGLLIYSLIISDILEQFCGVETLVMGDVSYGACCIDDFTARALDCDFIVHYAHSCLVPIDVTKIKVLYVFVTINIQEDHIIKTLQKNFPKGSRIATFGTIQFNPAVHSVRDKLLNDEEHMLYIIPPQIKPLSRGEVLGCTSERLDKEQYDAMVFIGDGRFHLESAMIHNPEIPAFKYDPYNRKFTREGYDQKQLVEVRAEAIEVARKGKVFGLILGALGRQGNLNTVKNLEKNLIAAGKTVVKIILSEVFPQKLAMFDQIDVFVQVACPRLSIDWGYAFNKPLLTPYEASVLLKKDVMFSEKYYPMDYYEAKGYGRGETPKHAIE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.89
2 0.89
3 0.91
4 0.9
5 0.89
6 0.87
7 0.87
8 0.86
9 0.81
10 0.76
11 0.71
12 0.63
13 0.55
14 0.47
15 0.4
16 0.33
17 0.3
18 0.28
19 0.23
20 0.21
21 0.21
22 0.21
23 0.18
24 0.16
25 0.19
26 0.22
27 0.24
28 0.24
29 0.28
30 0.33
31 0.4
32 0.46
33 0.45
34 0.47
35 0.52
36 0.56
37 0.57
38 0.55
39 0.48
40 0.42
41 0.38
42 0.31
43 0.25
44 0.25
45 0.22
46 0.2
47 0.2
48 0.19
49 0.19
50 0.19
51 0.17
52 0.13
53 0.11
54 0.11
55 0.1
56 0.13
57 0.14
58 0.14
59 0.19
60 0.19
61 0.24
62 0.25
63 0.28
64 0.25
65 0.28
66 0.31
67 0.26
68 0.3
69 0.29
70 0.35
71 0.39
72 0.46
73 0.45
74 0.44
75 0.53
76 0.53
77 0.59
78 0.61
79 0.57
80 0.54
81 0.57
82 0.62
83 0.53
84 0.51
85 0.41
86 0.32
87 0.29
88 0.25
89 0.19
90 0.11
91 0.09
92 0.07
93 0.05
94 0.04
95 0.04
96 0.04
97 0.04
98 0.05
99 0.08
100 0.08
101 0.08
102 0.08
103 0.08
104 0.08
105 0.08
106 0.06
107 0.04
108 0.04
109 0.05
110 0.05
111 0.05
112 0.05
113 0.04
114 0.05
115 0.05
116 0.05
117 0.04
118 0.03
119 0.04
120 0.04
121 0.05
122 0.05
123 0.06
124 0.07
125 0.08
126 0.12
127 0.11
128 0.12
129 0.11
130 0.11
131 0.1
132 0.1
133 0.09
134 0.07
135 0.07
136 0.07
137 0.07
138 0.07
139 0.08
140 0.07
141 0.07
142 0.07
143 0.06
144 0.07
145 0.06
146 0.09
147 0.11
148 0.12
149 0.12
150 0.12
151 0.12
152 0.12
153 0.13
154 0.1
155 0.11
156 0.1
157 0.1
158 0.11
159 0.11
160 0.11
161 0.11
162 0.1
163 0.08
164 0.09
165 0.1
166 0.1
167 0.1
168 0.1
169 0.15
170 0.23
171 0.28
172 0.3
173 0.33
174 0.35
175 0.39
176 0.42
177 0.37
178 0.35
179 0.3
180 0.3
181 0.28
182 0.27
183 0.24
184 0.22
185 0.23
186 0.19
187 0.17
188 0.15
189 0.13
190 0.12
191 0.12
192 0.12
193 0.09
194 0.11
195 0.12
196 0.13
197 0.17
198 0.16
199 0.17
200 0.19
201 0.2
202 0.19
203 0.2
204 0.18
205 0.15
206 0.15
207 0.12
208 0.09
209 0.09
210 0.11
211 0.09
212 0.09
213 0.1
214 0.13
215 0.14
216 0.17
217 0.19
218 0.2
219 0.2
220 0.21
221 0.2
222 0.19
223 0.2
224 0.18
225 0.15
226 0.12
227 0.12
228 0.13
229 0.13
230 0.14
231 0.15
232 0.14
233 0.17
234 0.18
235 0.18
236 0.15
237 0.15
238 0.12
239 0.09
240 0.09
241 0.07
242 0.06
243 0.05
244 0.05
245 0.07
246 0.07
247 0.07
248 0.07
249 0.07
250 0.07
251 0.11
252 0.16
253 0.14
254 0.14
255 0.15
256 0.15
257 0.15
258 0.17
259 0.13
260 0.11
261 0.12
262 0.13
263 0.19
264 0.26
265 0.34
266 0.36
267 0.44
268 0.42
269 0.46
270 0.48
271 0.45
272 0.46
273 0.46
274 0.51
275 0.48
276 0.56
277 0.51
278 0.49
279 0.5
280 0.43
281 0.36
282 0.3
283 0.24
284 0.16
285 0.15
286 0.15
287 0.1
288 0.1
289 0.12
290 0.11
291 0.12
292 0.12
293 0.12
294 0.13
295 0.14
296 0.17
297 0.13
298 0.13
299 0.15
300 0.14
301 0.14
302 0.13
303 0.12
304 0.09
305 0.09
306 0.08
307 0.06
308 0.06
309 0.1
310 0.14
311 0.16
312 0.17
313 0.2
314 0.23
315 0.24
316 0.26
317 0.23
318 0.2
319 0.19
320 0.21
321 0.2
322 0.17
323 0.16
324 0.16
325 0.18
326 0.17
327 0.17
328 0.14
329 0.12
330 0.12
331 0.13
332 0.15
333 0.13
334 0.17
335 0.2
336 0.21
337 0.21
338 0.21
339 0.2
340 0.17
341 0.17
342 0.17
343 0.15
344 0.15
345 0.16
346 0.16
347 0.17
348 0.15
349 0.14
350 0.09
351 0.09
352 0.1
353 0.11
354 0.1
355 0.1
356 0.11
357 0.11
358 0.14
359 0.15
360 0.16
361 0.17
362 0.21
363 0.23
364 0.25
365 0.26
366 0.25
367 0.25
368 0.22
369 0.22
370 0.22
371 0.24
372 0.23
373 0.23
374 0.26
375 0.25
376 0.27
377 0.27
378 0.26
379 0.23
380 0.24
381 0.22
382 0.21
383 0.23
384 0.26
385 0.25
386 0.26
387 0.32
388 0.34
389 0.36
390 0.34
391 0.33
392 0.31
393 0.34
394 0.32
395 0.27
396 0.28
397 0.28
398 0.26
399 0.29
400 0.27
401 0.26
402 0.29
403 0.32
404 0.3
405 0.35