Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

P36080

Protein Details
Accession P36080    Localization Confidence High Confidence Score 22.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
28-58YYDEKSQEQWKAKKKTKEQSKNDKLKKLDPEHydrophilic
240-260DLENNSKKRFKKGKKDSEINAHydrophilic
342-364DDEKLLRKAIKRKEAQKRKSAIEBasic
374-412DTISERQKRREENLRIRKDNKGKKRNKQEKMKRKYVGSABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
39-48AKKKTKEQSK
170-216RKKNLEALRSKLQAKISDMKSKRKAPGSREAILAQRKRKEELKKRKR
246-254KKRFKKGKK
284-311RKAGRTKGPAKNDVKSHLKLLEAKKNKM
323-325KEK
339-372KIRDDEKLLRKAIKRKEAQKRKSAIEWSERKRVV
376-434ISERQKRREENLRIRKDNKGKKRNKQEKMKRKYVGSAVPKKRAGFEGRLKTGKKKGGPK
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto_nucl 13.5, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR029190  Rrp14/SURF6_C  
IPR029188  Rrp14_N  
IPR007019  SURF6  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0042273  P:ribosomal large subunit biogenesis  
GO:0042274  P:ribosomal small subunit biogenesis  
GO:0006364  P:rRNA processing  
KEGG sce:YKL082C  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF15459  RRP14  
PF04935  SURF6  
Amino Acid Sequences MSNSLEERLRANSSAFDGLLALIPAKYYYDEKSQEQWKAKKKTKEQSKNDKLKKLDPEQRDDETSSTLEVMKKKEKDAKPVVLPGEKFKHMKMQKQKEATSKVEGDSDLNVEVNDPMIIAPDEDEEEEEDIKVIFDDEGNEIPLESKKDTTEPDRSVEKKSITEEEKLQRKKNLEALRSKLQAKISDMKSKRKAPGSREAILAQRKRKEELKKRKRLESEQEQDQDEIASDSDMEDIDSDLENNSKKRFKKGKKDSEINADGVMFQNIIFDDGARATSDLQRLRKAGRTKGPAKNDVKSHLKLLEAKKNKMEAKDELEQIKQKEKEKWQKAMLQAEGIKIRDDEKLLRKAIKRKEAQKRKSAIEWSERKRVVEDTISERQKRREENLRIRKDNKGKKRNKQEKMKRKYVGSAVPKKRAGFEGRLKTGKKKGGPK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.26
2 0.24
3 0.2
4 0.16
5 0.16
6 0.15
7 0.13
8 0.1
9 0.07
10 0.08
11 0.08
12 0.08
13 0.1
14 0.12
15 0.16
16 0.23
17 0.28
18 0.31
19 0.39
20 0.45
21 0.51
22 0.58
23 0.63
24 0.65
25 0.72
26 0.77
27 0.8
28 0.82
29 0.85
30 0.87
31 0.89
32 0.9
33 0.9
34 0.93
35 0.94
36 0.92
37 0.9
38 0.83
39 0.8
40 0.79
41 0.78
42 0.76
43 0.72
44 0.71
45 0.69
46 0.68
47 0.64
48 0.56
49 0.47
50 0.4
51 0.34
52 0.26
53 0.21
54 0.19
55 0.2
56 0.22
57 0.27
58 0.33
59 0.35
60 0.41
61 0.5
62 0.52
63 0.59
64 0.63
65 0.65
66 0.62
67 0.65
68 0.63
69 0.58
70 0.55
71 0.52
72 0.49
73 0.45
74 0.42
75 0.37
76 0.43
77 0.42
78 0.51
79 0.54
80 0.6
81 0.63
82 0.69
83 0.74
84 0.73
85 0.74
86 0.69
87 0.64
88 0.55
89 0.48
90 0.42
91 0.37
92 0.29
93 0.23
94 0.2
95 0.14
96 0.12
97 0.11
98 0.09
99 0.09
100 0.08
101 0.06
102 0.05
103 0.05
104 0.06
105 0.06
106 0.05
107 0.06
108 0.06
109 0.07
110 0.07
111 0.08
112 0.07
113 0.08
114 0.09
115 0.08
116 0.08
117 0.07
118 0.07
119 0.06
120 0.06
121 0.05
122 0.05
123 0.06
124 0.08
125 0.08
126 0.09
127 0.09
128 0.08
129 0.1
130 0.11
131 0.12
132 0.12
133 0.12
134 0.13
135 0.15
136 0.18
137 0.23
138 0.29
139 0.28
140 0.31
141 0.36
142 0.37
143 0.39
144 0.4
145 0.37
146 0.32
147 0.32
148 0.35
149 0.31
150 0.32
151 0.35
152 0.38
153 0.46
154 0.49
155 0.5
156 0.48
157 0.48
158 0.49
159 0.51
160 0.5
161 0.48
162 0.49
163 0.51
164 0.53
165 0.54
166 0.52
167 0.47
168 0.42
169 0.38
170 0.35
171 0.37
172 0.34
173 0.4
174 0.42
175 0.48
176 0.52
177 0.56
178 0.57
179 0.57
180 0.59
181 0.55
182 0.62
183 0.59
184 0.54
185 0.5
186 0.46
187 0.43
188 0.45
189 0.44
190 0.39
191 0.39
192 0.38
193 0.4
194 0.45
195 0.5
196 0.54
197 0.61
198 0.66
199 0.71
200 0.74
201 0.79
202 0.79
203 0.76
204 0.74
205 0.73
206 0.68
207 0.64
208 0.62
209 0.55
210 0.48
211 0.41
212 0.31
213 0.21
214 0.15
215 0.08
216 0.05
217 0.04
218 0.04
219 0.04
220 0.04
221 0.04
222 0.03
223 0.04
224 0.04
225 0.04
226 0.05
227 0.05
228 0.06
229 0.08
230 0.1
231 0.14
232 0.19
233 0.21
234 0.31
235 0.42
236 0.5
237 0.6
238 0.69
239 0.77
240 0.8
241 0.86
242 0.79
243 0.78
244 0.71
245 0.6
246 0.5
247 0.38
248 0.29
249 0.22
250 0.18
251 0.09
252 0.06
253 0.06
254 0.05
255 0.06
256 0.06
257 0.05
258 0.05
259 0.06
260 0.06
261 0.06
262 0.06
263 0.07
264 0.1
265 0.15
266 0.19
267 0.22
268 0.25
269 0.26
270 0.29
271 0.34
272 0.37
273 0.4
274 0.44
275 0.5
276 0.56
277 0.62
278 0.66
279 0.69
280 0.68
281 0.65
282 0.6
283 0.58
284 0.56
285 0.5
286 0.46
287 0.38
288 0.36
289 0.38
290 0.41
291 0.44
292 0.45
293 0.47
294 0.48
295 0.53
296 0.54
297 0.51
298 0.49
299 0.43
300 0.43
301 0.45
302 0.45
303 0.4
304 0.41
305 0.41
306 0.39
307 0.43
308 0.41
309 0.41
310 0.45
311 0.53
312 0.6
313 0.64
314 0.7
315 0.67
316 0.68
317 0.7
318 0.68
319 0.59
320 0.53
321 0.47
322 0.42
323 0.4
324 0.34
325 0.29
326 0.22
327 0.22
328 0.19
329 0.2
330 0.23
331 0.28
332 0.34
333 0.37
334 0.44
335 0.49
336 0.55
337 0.62
338 0.65
339 0.66
340 0.7
341 0.77
342 0.82
343 0.84
344 0.85
345 0.82
346 0.77
347 0.76
348 0.73
349 0.69
350 0.68
351 0.7
352 0.67
353 0.7
354 0.66
355 0.6
356 0.55
357 0.5
358 0.45
359 0.4
360 0.38
361 0.36
362 0.43
363 0.5
364 0.53
365 0.55
366 0.57
367 0.59
368 0.61
369 0.62
370 0.63
371 0.67
372 0.73
373 0.79
374 0.82
375 0.84
376 0.81
377 0.83
378 0.83
379 0.83
380 0.83
381 0.83
382 0.83
383 0.85
384 0.93
385 0.93
386 0.93
387 0.94
388 0.94
389 0.94
390 0.94
391 0.93
392 0.88
393 0.82
394 0.8
395 0.77
396 0.75
397 0.75
398 0.76
399 0.74
400 0.76
401 0.76
402 0.7
403 0.66
404 0.63
405 0.59
406 0.57
407 0.58
408 0.6
409 0.63
410 0.69
411 0.69
412 0.7
413 0.72
414 0.72