Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0F7TFB5

Protein Details
Accession A0A0F7TFB5    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
257-283STDYARPARKGPKRRRATKSIKAPPPPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
262-281RPARKGPKRRRATKSIKAPP
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 15
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR014144  LigD_PE_domain  
Pfam View protein in Pfam  
PF13298  LigD_N  
Amino Acid Sequences MKRSWGTDSQEEELDFNAHPARRRTPPLISSLKTSVSPPPKRKSVSNQKSHELASIEAGEVEVTDHLGIFSTKLSQHTRPLNISKVTPRLAMNDYVNLYRRNNHPTGRHFVIHQHDHPIAGTHYDLRLQFSETSSVSWSIMYGLPGDPNSVKLNRNATETRVHCLWNHLIETASAKTGSLIIWDTGEYEVLPYTRATSCPQTDESQADSSDGEGSHRESISDSTKLKEAFKNRKIRLRLHGNRLPAGYTLLLRMDKSTDYARPARKGPKRRRATKSIKAPPPPASTSTSESPSPPPPDKTQKQDVTDDKLSVQEPKSEADHANHSDDNVDYQIRKNNAYPGSSNTIGSIHQRRWYLSMDRESSGFEPRKITGGEGASNRMWVRSGDGSSSGLKGFEPFYVRGPEVERSVVTGRRGQDVLEDEGVEGFIARKGWRAVVR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.21
3 0.18
4 0.2
5 0.2
6 0.26
7 0.31
8 0.36
9 0.42
10 0.49
11 0.53
12 0.56
13 0.57
14 0.61
15 0.64
16 0.59
17 0.57
18 0.53
19 0.49
20 0.42
21 0.39
22 0.4
23 0.42
24 0.5
25 0.53
26 0.58
27 0.64
28 0.67
29 0.73
30 0.75
31 0.76
32 0.76
33 0.78
34 0.76
35 0.72
36 0.72
37 0.65
38 0.58
39 0.48
40 0.38
41 0.31
42 0.26
43 0.21
44 0.17
45 0.15
46 0.11
47 0.09
48 0.09
49 0.06
50 0.05
51 0.05
52 0.05
53 0.05
54 0.06
55 0.06
56 0.06
57 0.06
58 0.09
59 0.11
60 0.16
61 0.22
62 0.25
63 0.32
64 0.39
65 0.44
66 0.48
67 0.51
68 0.52
69 0.49
70 0.5
71 0.49
72 0.48
73 0.45
74 0.41
75 0.37
76 0.35
77 0.35
78 0.35
79 0.3
80 0.28
81 0.28
82 0.28
83 0.3
84 0.29
85 0.28
86 0.29
87 0.32
88 0.36
89 0.39
90 0.42
91 0.46
92 0.49
93 0.55
94 0.55
95 0.51
96 0.44
97 0.46
98 0.48
99 0.47
100 0.43
101 0.4
102 0.36
103 0.35
104 0.34
105 0.29
106 0.21
107 0.16
108 0.15
109 0.11
110 0.11
111 0.14
112 0.15
113 0.15
114 0.16
115 0.17
116 0.17
117 0.17
118 0.19
119 0.16
120 0.17
121 0.16
122 0.16
123 0.14
124 0.12
125 0.11
126 0.1
127 0.1
128 0.09
129 0.09
130 0.08
131 0.09
132 0.1
133 0.11
134 0.1
135 0.11
136 0.14
137 0.16
138 0.17
139 0.2
140 0.27
141 0.26
142 0.31
143 0.3
144 0.3
145 0.35
146 0.34
147 0.35
148 0.3
149 0.3
150 0.25
151 0.28
152 0.28
153 0.22
154 0.22
155 0.18
156 0.17
157 0.16
158 0.18
159 0.14
160 0.12
161 0.09
162 0.08
163 0.08
164 0.08
165 0.08
166 0.06
167 0.07
168 0.06
169 0.06
170 0.06
171 0.07
172 0.06
173 0.07
174 0.05
175 0.05
176 0.05
177 0.05
178 0.06
179 0.05
180 0.07
181 0.08
182 0.1
183 0.12
184 0.16
185 0.17
186 0.19
187 0.21
188 0.2
189 0.22
190 0.22
191 0.22
192 0.19
193 0.18
194 0.16
195 0.13
196 0.12
197 0.11
198 0.09
199 0.07
200 0.07
201 0.08
202 0.09
203 0.09
204 0.09
205 0.08
206 0.11
207 0.13
208 0.16
209 0.15
210 0.15
211 0.18
212 0.19
213 0.21
214 0.23
215 0.3
216 0.36
217 0.44
218 0.53
219 0.55
220 0.61
221 0.63
222 0.64
223 0.64
224 0.65
225 0.64
226 0.63
227 0.63
228 0.58
229 0.55
230 0.5
231 0.42
232 0.31
233 0.25
234 0.16
235 0.12
236 0.1
237 0.1
238 0.1
239 0.09
240 0.1
241 0.1
242 0.09
243 0.11
244 0.13
245 0.13
246 0.17
247 0.24
248 0.28
249 0.29
250 0.35
251 0.43
252 0.49
253 0.58
254 0.64
255 0.68
256 0.74
257 0.81
258 0.84
259 0.85
260 0.86
261 0.85
262 0.85
263 0.84
264 0.82
265 0.78
266 0.75
267 0.7
268 0.66
269 0.59
270 0.51
271 0.45
272 0.4
273 0.39
274 0.37
275 0.33
276 0.28
277 0.27
278 0.28
279 0.29
280 0.32
281 0.31
282 0.32
283 0.37
284 0.46
285 0.5
286 0.54
287 0.58
288 0.58
289 0.59
290 0.62
291 0.6
292 0.57
293 0.54
294 0.48
295 0.38
296 0.34
297 0.31
298 0.29
299 0.25
300 0.22
301 0.21
302 0.22
303 0.23
304 0.23
305 0.25
306 0.22
307 0.28
308 0.26
309 0.29
310 0.27
311 0.25
312 0.23
313 0.21
314 0.2
315 0.16
316 0.15
317 0.12
318 0.15
319 0.21
320 0.22
321 0.24
322 0.25
323 0.31
324 0.33
325 0.34
326 0.33
327 0.32
328 0.37
329 0.35
330 0.34
331 0.27
332 0.24
333 0.22
334 0.28
335 0.28
336 0.25
337 0.29
338 0.31
339 0.32
340 0.34
341 0.38
342 0.37
343 0.39
344 0.44
345 0.42
346 0.41
347 0.4
348 0.4
349 0.36
350 0.39
351 0.35
352 0.29
353 0.28
354 0.28
355 0.32
356 0.3
357 0.29
358 0.25
359 0.25
360 0.28
361 0.27
362 0.3
363 0.26
364 0.29
365 0.28
366 0.23
367 0.21
368 0.16
369 0.19
370 0.2
371 0.21
372 0.19
373 0.21
374 0.23
375 0.23
376 0.24
377 0.2
378 0.15
379 0.14
380 0.14
381 0.14
382 0.15
383 0.18
384 0.18
385 0.21
386 0.26
387 0.26
388 0.27
389 0.29
390 0.3
391 0.28
392 0.29
393 0.25
394 0.24
395 0.28
396 0.3
397 0.3
398 0.32
399 0.31
400 0.34
401 0.34
402 0.3
403 0.31
404 0.31
405 0.32
406 0.29
407 0.27
408 0.22
409 0.22
410 0.22
411 0.16
412 0.12
413 0.08
414 0.08
415 0.1
416 0.1
417 0.15
418 0.17