Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

P53968

Protein Details
Accession P53968    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
394-418IINGRKLKLKKSRRRSSQTSNNSFTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
398-408RKLKLKKSRRR
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 15
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036236  Znf_C2H2_sf  
IPR013087  Znf_C2H2_type  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0000987  F:cis-regulatory region sequence-specific DNA binding  
GO:0001228  F:DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0043565  F:sequence-specific DNA binding  
GO:0006038  P:cell wall chitin biosynthetic process  
GO:0071483  P:cellular response to blue light  
GO:0050801  P:monoatomic ion homeostasis  
GO:2001040  P:positive regulation of cellular response to drug  
GO:0045944  P:positive regulation of transcription by RNA polymerase II  
KEGG sce:YNL027W  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00096  zf-C2H2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00028  ZINC_FINGER_C2H2_1  
PS50157  ZINC_FINGER_C2H2_2  
Amino Acid Sequences MSFSNGNMASYMTSSNGEEQSINNKNDIDDNSAYRRNNFRNSSNSGSHTFQLSDLDLDVDMRMDSANSSEKISKNLSSGIPDSFDSNVNSLLSPSSGSYSADLNYQSLYKPDLPQQQLQQQQLQQQQQQQQQQQQQQQKQTPTLKVEQSDTFQWDDILTPADNQHRPSLTNQFLSPRSNYDGTTRSSGIDSNYSDTESNYHTPYLYPQDLVSSPAMSHLTANNDDFDDLLSVASMNSNYLLPVNSHGYKHISNLDELDDLLSLTYSDNNLLSASNNSDFNNSNNGIINTADTQNSTIAINKSKVGTNQKMLLTIPTSSTPSPSTHAAPVTPIISIQEFNEGHFPVKNEDDGTLQLKVRDNESYSATNNNNLLRPDDNDYNNEALSDIDRSFEDIINGRKLKLKKSRRRSSQTSNNSFTSRRSSRSRSISPDEKAKSISANREKLLEMADLLPSSENDNNRERYDNDSKTSYNTINSSNFNEDNNNNNLLTSKPKIESGIVNIKNELDDTSKDLGILLDIDSLGQFEQKVGFKNDDNHENNDNGTFSVKKNDNLEKLDSVTNNRKNPANFACDVCGKKFTRPYNLKSHLRTHTNERPFICSICGKAFARQHDRKRHEDLHTGKKRYVCGGKLKDGKPWGCGKKFARSDALGRHFKTESGRRCITPLYEEARQEKSGQES
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.13
2 0.17
3 0.18
4 0.18
5 0.17
6 0.19
7 0.27
8 0.33
9 0.33
10 0.31
11 0.31
12 0.3
13 0.35
14 0.36
15 0.33
16 0.28
17 0.32
18 0.37
19 0.43
20 0.43
21 0.44
22 0.5
23 0.51
24 0.57
25 0.58
26 0.58
27 0.59
28 0.65
29 0.67
30 0.63
31 0.6
32 0.55
33 0.51
34 0.46
35 0.41
36 0.34
37 0.28
38 0.25
39 0.22
40 0.18
41 0.15
42 0.15
43 0.12
44 0.12
45 0.11
46 0.09
47 0.08
48 0.07
49 0.07
50 0.06
51 0.06
52 0.08
53 0.14
54 0.14
55 0.18
56 0.23
57 0.24
58 0.29
59 0.32
60 0.31
61 0.28
62 0.32
63 0.3
64 0.29
65 0.3
66 0.27
67 0.25
68 0.24
69 0.23
70 0.2
71 0.21
72 0.18
73 0.17
74 0.17
75 0.16
76 0.16
77 0.14
78 0.13
79 0.11
80 0.11
81 0.1
82 0.11
83 0.11
84 0.12
85 0.12
86 0.13
87 0.13
88 0.15
89 0.15
90 0.13
91 0.13
92 0.13
93 0.13
94 0.13
95 0.16
96 0.17
97 0.19
98 0.26
99 0.35
100 0.38
101 0.43
102 0.48
103 0.52
104 0.55
105 0.56
106 0.54
107 0.49
108 0.52
109 0.54
110 0.54
111 0.51
112 0.51
113 0.56
114 0.57
115 0.62
116 0.61
117 0.62
118 0.64
119 0.67
120 0.68
121 0.7
122 0.7
123 0.71
124 0.71
125 0.68
126 0.68
127 0.67
128 0.63
129 0.59
130 0.59
131 0.54
132 0.49
133 0.48
134 0.42
135 0.38
136 0.36
137 0.33
138 0.28
139 0.24
140 0.22
141 0.18
142 0.16
143 0.14
144 0.13
145 0.1
146 0.1
147 0.13
148 0.2
149 0.22
150 0.23
151 0.27
152 0.26
153 0.27
154 0.31
155 0.36
156 0.34
157 0.34
158 0.33
159 0.34
160 0.36
161 0.37
162 0.35
163 0.29
164 0.3
165 0.29
166 0.29
167 0.28
168 0.29
169 0.28
170 0.31
171 0.27
172 0.23
173 0.23
174 0.23
175 0.2
176 0.21
177 0.19
178 0.18
179 0.18
180 0.18
181 0.18
182 0.17
183 0.17
184 0.16
185 0.18
186 0.16
187 0.16
188 0.15
189 0.15
190 0.18
191 0.23
192 0.2
193 0.18
194 0.17
195 0.19
196 0.19
197 0.21
198 0.19
199 0.13
200 0.11
201 0.13
202 0.14
203 0.11
204 0.11
205 0.11
206 0.14
207 0.15
208 0.16
209 0.15
210 0.14
211 0.14
212 0.13
213 0.11
214 0.08
215 0.07
216 0.06
217 0.05
218 0.05
219 0.05
220 0.05
221 0.05
222 0.04
223 0.05
224 0.05
225 0.05
226 0.06
227 0.06
228 0.06
229 0.09
230 0.13
231 0.14
232 0.15
233 0.16
234 0.19
235 0.19
236 0.21
237 0.24
238 0.2
239 0.19
240 0.19
241 0.19
242 0.16
243 0.15
244 0.13
245 0.08
246 0.07
247 0.06
248 0.05
249 0.04
250 0.04
251 0.05
252 0.05
253 0.05
254 0.05
255 0.06
256 0.06
257 0.06
258 0.07
259 0.07
260 0.09
261 0.1
262 0.11
263 0.11
264 0.13
265 0.14
266 0.14
267 0.18
268 0.17
269 0.16
270 0.17
271 0.16
272 0.15
273 0.14
274 0.14
275 0.1
276 0.11
277 0.1
278 0.09
279 0.09
280 0.09
281 0.09
282 0.08
283 0.1
284 0.1
285 0.13
286 0.14
287 0.14
288 0.15
289 0.16
290 0.21
291 0.26
292 0.27
293 0.27
294 0.31
295 0.3
296 0.3
297 0.29
298 0.25
299 0.19
300 0.16
301 0.14
302 0.1
303 0.12
304 0.11
305 0.12
306 0.13
307 0.13
308 0.15
309 0.16
310 0.16
311 0.16
312 0.16
313 0.15
314 0.14
315 0.13
316 0.12
317 0.09
318 0.08
319 0.07
320 0.07
321 0.07
322 0.07
323 0.12
324 0.11
325 0.12
326 0.14
327 0.14
328 0.14
329 0.15
330 0.15
331 0.11
332 0.12
333 0.12
334 0.1
335 0.1
336 0.11
337 0.11
338 0.12
339 0.12
340 0.12
341 0.13
342 0.16
343 0.16
344 0.16
345 0.16
346 0.16
347 0.16
348 0.19
349 0.18
350 0.16
351 0.21
352 0.19
353 0.2
354 0.21
355 0.2
356 0.19
357 0.18
358 0.19
359 0.15
360 0.17
361 0.2
362 0.22
363 0.22
364 0.22
365 0.23
366 0.22
367 0.21
368 0.19
369 0.14
370 0.1
371 0.09
372 0.09
373 0.07
374 0.07
375 0.07
376 0.08
377 0.09
378 0.1
379 0.1
380 0.11
381 0.14
382 0.19
383 0.2
384 0.19
385 0.24
386 0.26
387 0.34
388 0.41
389 0.5
390 0.54
391 0.65
392 0.74
393 0.79
394 0.86
395 0.85
396 0.85
397 0.85
398 0.85
399 0.82
400 0.76
401 0.68
402 0.62
403 0.55
404 0.46
405 0.44
406 0.37
407 0.34
408 0.36
409 0.4
410 0.46
411 0.53
412 0.56
413 0.55
414 0.59
415 0.61
416 0.57
417 0.59
418 0.53
419 0.46
420 0.42
421 0.36
422 0.33
423 0.3
424 0.37
425 0.37
426 0.39
427 0.38
428 0.38
429 0.38
430 0.34
431 0.32
432 0.22
433 0.15
434 0.11
435 0.11
436 0.09
437 0.09
438 0.09
439 0.07
440 0.1
441 0.12
442 0.13
443 0.17
444 0.22
445 0.25
446 0.26
447 0.29
448 0.27
449 0.32
450 0.4
451 0.39
452 0.37
453 0.38
454 0.37
455 0.37
456 0.39
457 0.32
458 0.26
459 0.24
460 0.25
461 0.25
462 0.27
463 0.27
464 0.28
465 0.27
466 0.26
467 0.28
468 0.26
469 0.28
470 0.29
471 0.27
472 0.22
473 0.22
474 0.21
475 0.18
476 0.22
477 0.19
478 0.2
479 0.19
480 0.2
481 0.21
482 0.23
483 0.24
484 0.25
485 0.33
486 0.32
487 0.32
488 0.31
489 0.3
490 0.28
491 0.26
492 0.21
493 0.13
494 0.11
495 0.15
496 0.17
497 0.17
498 0.17
499 0.17
500 0.15
501 0.13
502 0.12
503 0.08
504 0.06
505 0.06
506 0.06
507 0.05
508 0.06
509 0.05
510 0.06
511 0.05
512 0.05
513 0.1
514 0.12
515 0.16
516 0.19
517 0.22
518 0.24
519 0.31
520 0.36
521 0.42
522 0.43
523 0.44
524 0.44
525 0.41
526 0.39
527 0.33
528 0.29
529 0.19
530 0.18
531 0.15
532 0.14
533 0.22
534 0.24
535 0.26
536 0.32
537 0.39
538 0.43
539 0.45
540 0.48
541 0.41
542 0.41
543 0.42
544 0.37
545 0.37
546 0.42
547 0.45
548 0.46
549 0.47
550 0.49
551 0.47
552 0.53
553 0.51
554 0.47
555 0.42
556 0.4
557 0.4
558 0.41
559 0.43
560 0.37
561 0.39
562 0.34
563 0.39
564 0.45
565 0.47
566 0.52
567 0.57
568 0.61
569 0.65
570 0.72
571 0.74
572 0.71
573 0.73
574 0.7
575 0.69
576 0.67
577 0.66
578 0.67
579 0.66
580 0.67
581 0.6
582 0.57
583 0.53
584 0.5
585 0.44
586 0.37
587 0.32
588 0.29
589 0.34
590 0.29
591 0.34
592 0.39
593 0.44
594 0.52
595 0.58
596 0.65
597 0.7
598 0.75
599 0.75
600 0.79
601 0.78
602 0.73
603 0.74
604 0.72
605 0.73
606 0.76
607 0.73
608 0.68
609 0.64
610 0.6
611 0.59
612 0.58
613 0.54
614 0.54
615 0.58
616 0.64
617 0.69
618 0.68
619 0.67
620 0.68
621 0.63
622 0.59
623 0.61
624 0.61
625 0.56
626 0.63
627 0.6
628 0.62
629 0.66
630 0.64
631 0.62
632 0.56
633 0.58
634 0.6
635 0.64
636 0.62
637 0.57
638 0.57
639 0.5
640 0.49
641 0.51
642 0.51
643 0.51
644 0.51
645 0.55
646 0.51
647 0.54
648 0.55
649 0.5
650 0.45
651 0.43
652 0.41
653 0.42
654 0.45
655 0.47
656 0.48
657 0.46
658 0.42