Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q12403

Protein Details
Accession Q12403    Localization Confidence Low Confidence Score 9.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
124-145DDIRNERRKARKAQRNLRDSKTBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
130-135RRKARK
Subcellular Location(s) E.R. 7, golg 6, nucl 5.5, plas 4, cyto_nucl 4, mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR015720  Emp24-like  
IPR009038  GOLD_dom  
Gene Ontology GO:0030134  C:COPII-coated ER to Golgi transport vesicle  
GO:0005783  C:endoplasmic reticulum  
GO:0005789  C:endoplasmic reticulum membrane  
GO:0005793  C:endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment  
GO:0005794  C:Golgi apparatus  
GO:0016020  C:membrane  
GO:0006888  P:endoplasmic reticulum to Golgi vesicle-mediated transport  
GO:0007030  P:Golgi organization  
GO:0006886  P:intracellular protein transport  
GO:0006621  P:protein retention in ER lumen  
GO:0016192  P:vesicle-mediated transport  
KEGG sce:YDL018C  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01105  EMP24_GP25L  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50866  GOLD  
Amino Acid Sequences MSNLCVLFFQFFFLAQFFAEASPLTFELNKGRKECLYTLTPEIDCTISYYFAVQQGESNDFDVNYEIFAPDDKNKPIIERSGERQGEWSFIGQHKGEYAICFYGGKAHDKIVDLDFKYNCERQDDIRNERRKARKAQRNLRDSKTDPLQDSVENSIDTIERQLHVLERNIQYYKSRNTRNHHTVCSTEHRIVMFSIYGILLIIGMSCAQIAILEFIFRESRKHNV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.12
2 0.1
3 0.1
4 0.09
5 0.09
6 0.09
7 0.08
8 0.08
9 0.09
10 0.1
11 0.11
12 0.11
13 0.12
14 0.21
15 0.27
16 0.32
17 0.31
18 0.34
19 0.35
20 0.39
21 0.4
22 0.36
23 0.33
24 0.32
25 0.34
26 0.35
27 0.33
28 0.29
29 0.28
30 0.23
31 0.19
32 0.18
33 0.15
34 0.11
35 0.11
36 0.12
37 0.11
38 0.14
39 0.15
40 0.12
41 0.13
42 0.15
43 0.18
44 0.17
45 0.17
46 0.14
47 0.13
48 0.14
49 0.12
50 0.1
51 0.08
52 0.07
53 0.06
54 0.06
55 0.07
56 0.09
57 0.11
58 0.16
59 0.16
60 0.18
61 0.19
62 0.21
63 0.22
64 0.24
65 0.25
66 0.25
67 0.29
68 0.36
69 0.36
70 0.34
71 0.35
72 0.31
73 0.28
74 0.25
75 0.21
76 0.14
77 0.15
78 0.18
79 0.14
80 0.14
81 0.12
82 0.13
83 0.13
84 0.11
85 0.11
86 0.08
87 0.08
88 0.08
89 0.08
90 0.11
91 0.12
92 0.15
93 0.14
94 0.14
95 0.16
96 0.16
97 0.18
98 0.15
99 0.17
100 0.15
101 0.18
102 0.17
103 0.18
104 0.2
105 0.21
106 0.2
107 0.19
108 0.19
109 0.19
110 0.28
111 0.32
112 0.38
113 0.45
114 0.51
115 0.51
116 0.58
117 0.63
118 0.61
119 0.65
120 0.68
121 0.68
122 0.72
123 0.8
124 0.81
125 0.83
126 0.82
127 0.76
128 0.73
129 0.65
130 0.6
131 0.56
132 0.5
133 0.42
134 0.38
135 0.35
136 0.29
137 0.28
138 0.25
139 0.19
140 0.16
141 0.14
142 0.12
143 0.11
144 0.1
145 0.1
146 0.09
147 0.08
148 0.09
149 0.09
150 0.11
151 0.14
152 0.17
153 0.22
154 0.23
155 0.27
156 0.27
157 0.28
158 0.29
159 0.33
160 0.39
161 0.41
162 0.48
163 0.51
164 0.58
165 0.67
166 0.74
167 0.74
168 0.7
169 0.65
170 0.59
171 0.56
172 0.58
173 0.53
174 0.45
175 0.41
176 0.36
177 0.33
178 0.31
179 0.27
180 0.18
181 0.12
182 0.11
183 0.09
184 0.08
185 0.07
186 0.06
187 0.05
188 0.04
189 0.04
190 0.03
191 0.04
192 0.04
193 0.03
194 0.03
195 0.03
196 0.04
197 0.04
198 0.06
199 0.07
200 0.07
201 0.07
202 0.1
203 0.14
204 0.14
205 0.18