Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q12099

Protein Details
Accession Q12099    Localization Confidence Low Confidence Score 8.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
7-27EDQKLKFKTSKKLKVSSTFESHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 12, cyto_nucl 11, cyto 8, mito 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011545  DEAD/DEAH_box_helicase_dom  
IPR014001  Helicase_ATP-bd  
IPR001650  Helicase_C  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR000629  RNA-helicase_DEAD-box_CS  
IPR014014  RNA_helicase_DEAD_Q_motif  
Gene Ontology GO:0071013  C:catalytic step 2 spliceosome  
GO:0097078  C:FAL1-SGD1 complex  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0030688  C:preribosome, small subunit precursor  
GO:0032040  C:small-subunit processome  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0016887  F:ATP hydrolysis activity  
GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0003724  F:RNA helicase activity  
GO:0030490  P:maturation of SSU-rRNA  
GO:0000462  P:maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
KEGG sce:YDR021W  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00270  DEAD  
PF00271  Helicase_C  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00039  DEAD_ATP_HELICASE  
PS51192  HELICASE_ATP_BIND_1  
PS51194  HELICASE_CTER  
PS51195  Q_MOTIF  
CDD cd18787  SF2_C_DEAD  
Amino Acid Sequences MSFDREEDQKLKFKTSKKLKVSSTFESMNLKDDLLRGIYSYGFEAPSSIQSRAITQIISGKDVIAQAQSGTGKTATFTIGLLQAIDLRKKDLQALILSPTRELASQIGQVVKNLGDYMNVNAFAITGGKTLKDDLKKMQKHGCQAVSGTPGRVLDMIKKQMLQTRNVQMLVLDEADELLSETLGFKQQIYDIFAKLPKNCQVVVVSATMNKDILEVTRKFMNDPVKILVKRDEISLEGIKQYVVNVDKEEWKFDTLCDIYDSLTITQCVIFCNTKKKVDWLSQRLIQSNFAVVSMHGDMKQEERDKVMNDFRTGHSRVLISTDVWARGIDVQQVSLVINYDLPEIIENYIHRIGRSGRFGRKGVAINFITKADLAKLREIEKFYSIKINPMPANFAELS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.59
2 0.66
3 0.71
4 0.72
5 0.78
6 0.78
7 0.81
8 0.81
9 0.77
10 0.72
11 0.64
12 0.57
13 0.55
14 0.47
15 0.41
16 0.35
17 0.29
18 0.23
19 0.22
20 0.22
21 0.17
22 0.17
23 0.13
24 0.14
25 0.14
26 0.14
27 0.14
28 0.13
29 0.12
30 0.12
31 0.12
32 0.12
33 0.18
34 0.21
35 0.2
36 0.21
37 0.21
38 0.23
39 0.26
40 0.26
41 0.19
42 0.17
43 0.22
44 0.2
45 0.22
46 0.2
47 0.16
48 0.17
49 0.17
50 0.17
51 0.12
52 0.11
53 0.09
54 0.12
55 0.13
56 0.11
57 0.12
58 0.12
59 0.11
60 0.11
61 0.12
62 0.1
63 0.09
64 0.09
65 0.09
66 0.11
67 0.11
68 0.1
69 0.09
70 0.12
71 0.14
72 0.17
73 0.16
74 0.18
75 0.19
76 0.2
77 0.23
78 0.22
79 0.22
80 0.22
81 0.23
82 0.25
83 0.26
84 0.26
85 0.22
86 0.21
87 0.18
88 0.16
89 0.15
90 0.12
91 0.11
92 0.13
93 0.15
94 0.18
95 0.17
96 0.17
97 0.18
98 0.16
99 0.14
100 0.13
101 0.1
102 0.08
103 0.08
104 0.11
105 0.11
106 0.11
107 0.11
108 0.1
109 0.1
110 0.09
111 0.09
112 0.07
113 0.06
114 0.06
115 0.07
116 0.07
117 0.09
118 0.15
119 0.17
120 0.19
121 0.26
122 0.37
123 0.4
124 0.45
125 0.52
126 0.5
127 0.53
128 0.57
129 0.51
130 0.41
131 0.39
132 0.36
133 0.33
134 0.3
135 0.24
136 0.18
137 0.17
138 0.16
139 0.16
140 0.14
141 0.14
142 0.18
143 0.21
144 0.21
145 0.22
146 0.23
147 0.28
148 0.3
149 0.28
150 0.29
151 0.31
152 0.33
153 0.32
154 0.31
155 0.25
156 0.23
157 0.2
158 0.14
159 0.09
160 0.06
161 0.06
162 0.05
163 0.05
164 0.04
165 0.03
166 0.03
167 0.03
168 0.03
169 0.04
170 0.06
171 0.06
172 0.05
173 0.06
174 0.08
175 0.09
176 0.13
177 0.14
178 0.13
179 0.14
180 0.18
181 0.19
182 0.19
183 0.21
184 0.22
185 0.23
186 0.22
187 0.22
188 0.19
189 0.18
190 0.19
191 0.17
192 0.12
193 0.12
194 0.12
195 0.11
196 0.1
197 0.09
198 0.07
199 0.06
200 0.07
201 0.11
202 0.12
203 0.13
204 0.16
205 0.17
206 0.17
207 0.21
208 0.27
209 0.23
210 0.24
211 0.25
212 0.29
213 0.29
214 0.3
215 0.3
216 0.26
217 0.25
218 0.24
219 0.22
220 0.16
221 0.19
222 0.19
223 0.15
224 0.13
225 0.12
226 0.12
227 0.11
228 0.1
229 0.1
230 0.11
231 0.11
232 0.12
233 0.13
234 0.2
235 0.2
236 0.23
237 0.2
238 0.2
239 0.19
240 0.18
241 0.23
242 0.16
243 0.17
244 0.16
245 0.15
246 0.13
247 0.14
248 0.15
249 0.1
250 0.1
251 0.1
252 0.09
253 0.09
254 0.09
255 0.09
256 0.11
257 0.14
258 0.15
259 0.25
260 0.29
261 0.33
262 0.34
263 0.39
264 0.42
265 0.48
266 0.56
267 0.54
268 0.56
269 0.56
270 0.58
271 0.57
272 0.52
273 0.44
274 0.35
275 0.29
276 0.23
277 0.18
278 0.15
279 0.11
280 0.12
281 0.12
282 0.12
283 0.11
284 0.12
285 0.12
286 0.15
287 0.21
288 0.22
289 0.21
290 0.23
291 0.26
292 0.27
293 0.32
294 0.37
295 0.34
296 0.33
297 0.35
298 0.34
299 0.39
300 0.39
301 0.35
302 0.3
303 0.27
304 0.24
305 0.25
306 0.23
307 0.17
308 0.18
309 0.2
310 0.18
311 0.18
312 0.17
313 0.15
314 0.16
315 0.17
316 0.18
317 0.15
318 0.15
319 0.14
320 0.15
321 0.14
322 0.12
323 0.12
324 0.07
325 0.08
326 0.08
327 0.09
328 0.08
329 0.08
330 0.09
331 0.09
332 0.1
333 0.11
334 0.11
335 0.15
336 0.2
337 0.21
338 0.2
339 0.22
340 0.27
341 0.31
342 0.4
343 0.43
344 0.46
345 0.52
346 0.53
347 0.53
348 0.54
349 0.55
350 0.48
351 0.49
352 0.42
353 0.39
354 0.39
355 0.36
356 0.31
357 0.24
358 0.23
359 0.19
360 0.23
361 0.22
362 0.27
363 0.3
364 0.33
365 0.37
366 0.4
367 0.38
368 0.38
369 0.38
370 0.34
371 0.39
372 0.37
373 0.39
374 0.4
375 0.44
376 0.42
377 0.42
378 0.45
379 0.35