Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0A1SYD2

Protein Details
Accession A0A0A1SYD2    Localization Confidence High Confidence Score 15.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
284-325ATPRGRTTRSPKRQPQHPISASPVRRVPPAPLERKRRRPSTDHydrophilic
401-425RFADIMKKMRQARRNKRQMIQEFENHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
294-321PKRQPQHPISASPVRRVPPAPLERKRRR
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 12, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR029178  Ecm11_C  
Pfam View protein in Pfam  
PF15463  ECM11  
Amino Acid Sequences MPLANLRDRGNRLKAFAENKKPLGPIRMQEDVQESDYDGIGSTSTTPTKRNMADAAKLPVPQPARRPVDPIFDDNDTMRVNFDDTGRSMQPPPPAMFSKSLPVDRLEQLLSGSELGDSFMHSGISTPLNEPEDGYEQPQYEERSKTPRGHQTRARQYPEKLARSVGPSFQLGEDLFMSVVTQPTQRYPHDMKDGFSGSAVKNRGLESPQRHHRHHKQASLQQSLPMREVKVHKQYRQESEDRDVRQRRFSSWEPQRAVKPIEVEATVEVESVVSSNYDEEDLQATPRGRTTRSPKRQPQHPISASPVRRVPPAPLERKRRRPSTDYDDRILSSMSFGELQNEPFDFDPSVANAQTLSGTSGGNIESRLAQLEHHGHSEQRTFFGNMTLDEWECAGDWFADRFADIMKKMRQARRNKRQMIQEFENEAAQREAAVRIRSDKIDRKLQTMKENGRRVVGERALR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.55
2 0.57
3 0.61
4 0.63
5 0.62
6 0.62
7 0.63
8 0.62
9 0.58
10 0.56
11 0.52
12 0.47
13 0.45
14 0.48
15 0.44
16 0.43
17 0.44
18 0.4
19 0.36
20 0.31
21 0.25
22 0.21
23 0.2
24 0.17
25 0.13
26 0.1
27 0.08
28 0.08
29 0.08
30 0.1
31 0.15
32 0.16
33 0.19
34 0.22
35 0.3
36 0.31
37 0.33
38 0.37
39 0.38
40 0.42
41 0.44
42 0.46
43 0.41
44 0.41
45 0.37
46 0.36
47 0.36
48 0.34
49 0.36
50 0.41
51 0.45
52 0.45
53 0.51
54 0.48
55 0.53
56 0.52
57 0.49
58 0.43
59 0.38
60 0.38
61 0.33
62 0.33
63 0.24
64 0.21
65 0.18
66 0.15
67 0.14
68 0.14
69 0.15
70 0.14
71 0.15
72 0.2
73 0.21
74 0.23
75 0.24
76 0.26
77 0.3
78 0.31
79 0.31
80 0.32
81 0.33
82 0.34
83 0.34
84 0.32
85 0.34
86 0.34
87 0.34
88 0.3
89 0.29
90 0.31
91 0.29
92 0.3
93 0.23
94 0.19
95 0.17
96 0.17
97 0.15
98 0.11
99 0.1
100 0.07
101 0.06
102 0.07
103 0.07
104 0.06
105 0.07
106 0.07
107 0.07
108 0.06
109 0.07
110 0.08
111 0.1
112 0.1
113 0.11
114 0.14
115 0.15
116 0.15
117 0.15
118 0.16
119 0.17
120 0.17
121 0.18
122 0.17
123 0.16
124 0.17
125 0.2
126 0.21
127 0.22
128 0.24
129 0.25
130 0.3
131 0.35
132 0.39
133 0.44
134 0.5
135 0.54
136 0.59
137 0.65
138 0.68
139 0.73
140 0.77
141 0.76
142 0.71
143 0.66
144 0.68
145 0.69
146 0.62
147 0.52
148 0.45
149 0.4
150 0.39
151 0.39
152 0.3
153 0.23
154 0.19
155 0.19
156 0.17
157 0.17
158 0.12
159 0.11
160 0.1
161 0.08
162 0.08
163 0.06
164 0.07
165 0.05
166 0.06
167 0.06
168 0.07
169 0.07
170 0.11
171 0.15
172 0.15
173 0.22
174 0.25
175 0.29
176 0.36
177 0.37
178 0.34
179 0.35
180 0.36
181 0.29
182 0.26
183 0.24
184 0.15
185 0.19
186 0.2
187 0.16
188 0.16
189 0.17
190 0.18
191 0.18
192 0.24
193 0.25
194 0.32
195 0.42
196 0.47
197 0.49
198 0.57
199 0.65
200 0.69
201 0.7
202 0.68
203 0.66
204 0.66
205 0.7
206 0.66
207 0.56
208 0.49
209 0.45
210 0.39
211 0.33
212 0.28
213 0.21
214 0.19
215 0.22
216 0.25
217 0.32
218 0.37
219 0.39
220 0.47
221 0.52
222 0.54
223 0.57
224 0.54
225 0.47
226 0.48
227 0.5
228 0.44
229 0.47
230 0.47
231 0.43
232 0.47
233 0.45
234 0.41
235 0.41
236 0.42
237 0.44
238 0.46
239 0.52
240 0.48
241 0.5
242 0.5
243 0.47
244 0.46
245 0.37
246 0.29
247 0.22
248 0.21
249 0.18
250 0.16
251 0.13
252 0.12
253 0.11
254 0.09
255 0.07
256 0.06
257 0.05
258 0.05
259 0.05
260 0.03
261 0.03
262 0.04
263 0.04
264 0.05
265 0.05
266 0.05
267 0.07
268 0.07
269 0.08
270 0.11
271 0.12
272 0.11
273 0.15
274 0.16
275 0.16
276 0.23
277 0.33
278 0.41
279 0.5
280 0.6
281 0.67
282 0.73
283 0.79
284 0.82
285 0.8
286 0.8
287 0.72
288 0.65
289 0.62
290 0.63
291 0.56
292 0.51
293 0.47
294 0.37
295 0.37
296 0.35
297 0.32
298 0.32
299 0.4
300 0.46
301 0.51
302 0.6
303 0.68
304 0.78
305 0.83
306 0.82
307 0.8
308 0.75
309 0.75
310 0.74
311 0.75
312 0.69
313 0.64
314 0.56
315 0.5
316 0.45
317 0.36
318 0.26
319 0.16
320 0.11
321 0.09
322 0.09
323 0.08
324 0.11
325 0.12
326 0.13
327 0.13
328 0.13
329 0.14
330 0.13
331 0.14
332 0.12
333 0.11
334 0.11
335 0.11
336 0.14
337 0.12
338 0.12
339 0.1
340 0.1
341 0.1
342 0.09
343 0.09
344 0.07
345 0.07
346 0.07
347 0.08
348 0.08
349 0.09
350 0.09
351 0.08
352 0.08
353 0.09
354 0.11
355 0.1
356 0.09
357 0.14
358 0.19
359 0.2
360 0.22
361 0.23
362 0.22
363 0.25
364 0.31
365 0.27
366 0.24
367 0.25
368 0.23
369 0.23
370 0.26
371 0.24
372 0.19
373 0.2
374 0.2
375 0.17
376 0.16
377 0.16
378 0.12
379 0.11
380 0.1
381 0.09
382 0.07
383 0.08
384 0.09
385 0.1
386 0.09
387 0.09
388 0.09
389 0.11
390 0.15
391 0.15
392 0.22
393 0.26
394 0.34
395 0.43
396 0.51
397 0.57
398 0.64
399 0.74
400 0.78
401 0.84
402 0.85
403 0.83
404 0.85
405 0.86
406 0.84
407 0.79
408 0.75
409 0.68
410 0.6
411 0.57
412 0.47
413 0.39
414 0.31
415 0.24
416 0.17
417 0.15
418 0.18
419 0.19
420 0.21
421 0.22
422 0.26
423 0.3
424 0.34
425 0.42
426 0.47
427 0.49
428 0.57
429 0.57
430 0.6
431 0.64
432 0.66
433 0.67
434 0.67
435 0.71
436 0.71
437 0.76
438 0.71
439 0.67
440 0.63
441 0.57
442 0.56