FuNGI

A0A0A1TTK6

Protein Details

Accession

A0A0A1TTK6

Localization Confidence

High

Confidence Score

18.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
10-41	NGNTPRAKTNPLRPLRKKPRPNPLVSRKGGKL	Hydrophilic
181-204	VAKDAVPKRPKKQKEEKTVFNRGP	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
15-43	RAKTNPLRPLRKKPRPNPLVSRKGGKLPM
183-198	KDAVPKRPKKQKEEKT
491-499	KPGKSLKRA
513-521	SRKKMKKAA
649-656	KKLRKKKD

Subcellular Location(s)

nucl 17, mito 9, cyto_nucl 9

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0003743 F:translation initiation factor activity GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter

Amino Acid Sequences

MNSNPPGPPNGNTPRAKTNPLRPLRKKPRPNPLVSRKGGKLPMKPVGSAASSSSQAGAKPSLDELRRQYGGWSEPPPQYEFKDIPIMTTKKALLDGIRYHLMKLAAPRADDPPIDPTDQDEFTRPVTLHRRDARQPPPGRTVKVEQPDRPMPDDQEKERIERIKAEKEAQRAVDQAKIAPVAKDAVPKRPKKQKEEKTVFNRGPRTSAAKKESDLRYEEALPWHLEDVDGKNVWVGTYVAALSEATVAFMIDNAVFRMIPLEKWYKFNSKPPFQAMTIDQAEELMGRKVDAGRWVMKDEEKRSGQAELEATRRMLSGHGQMIKTESDTFKAASRAEKMEHDELDISGDEFQDDDETPTFEKNEDEDTKESKDRIRREQLGANLFGDGDEQEVDKDLHEQLREELERQRFGKATKKALIKRDREDQYESDNSEDNPWSSSSDDDSSDDDDAEKDEDKKDQDKKDQDGDKNGNKSASSKGSTTPQGKQRHDVKPGKSLKRAGSPALSESSGNESSRKKMKKAASSTGSRAGTPMGQAARRPKVSGAGSGSDGETTAAEMSDGAVRKRKIKIVNSNRGTPTASRAGSPVPPSGSQSAPIEPKEILDRIPPEGIEIGELIKPFKARLGEGPGQMPKKDWIKLVTQLCEMGPNKKLRKKKDAA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.58
2	0.59
3	0.65
4	0.64
5	0.65
6	0.67
7	0.73
8	0.79
9	0.78
10	0.84
11	0.88
12	0.9
13	0.91
14	0.9
15	0.92
16	0.9
17	0.91
18	0.91
19	0.9
20	0.9
21	0.84
22	0.82
23	0.75
24	0.73
25	0.72
26	0.68
27	0.65
28	0.62
29	0.65
30	0.6
31	0.56
32	0.51
33	0.46
34	0.4
35	0.33
36	0.28
37	0.23
38	0.21
39	0.21
40	0.21
41	0.18
42	0.17
43	0.19
44	0.18
45	0.16
46	0.16
47	0.19
48	0.25
49	0.25
50	0.3
51	0.33
52	0.38
53	0.39
54	0.38
55	0.36
56	0.34
57	0.37
58	0.37
59	0.36
60	0.34
61	0.36
62	0.39
63	0.41
64	0.38
65	0.36
66	0.37
67	0.34
68	0.32
69	0.37
70	0.34
71	0.34
72	0.4
73	0.39
74	0.34
75	0.37
76	0.34
77	0.27
78	0.29
79	0.27
80	0.21
81	0.25
82	0.27
83	0.27
84	0.32
85	0.31
86	0.3
87	0.32
88	0.3
89	0.26
90	0.27
91	0.29
92	0.26
93	0.27
94	0.29
95	0.29
96	0.31
97	0.29
98	0.26
99	0.24
100	0.24
101	0.24
102	0.22
103	0.22
104	0.24
105	0.25
106	0.24
107	0.22
108	0.21
109	0.21
110	0.25
111	0.21
112	0.24
113	0.32
114	0.36
115	0.42
116	0.47
117	0.53
118	0.57
119	0.66
120	0.67
121	0.68
122	0.69
123	0.66
124	0.69
125	0.68
126	0.64
127	0.6
128	0.57
129	0.55
130	0.58
131	0.59
132	0.53
133	0.55
134	0.58
135	0.57
136	0.55
137	0.49
138	0.44
139	0.46
140	0.48
141	0.43
142	0.46
143	0.44
144	0.43
145	0.46
146	0.46
147	0.38
148	0.41
149	0.44
150	0.43
151	0.45
152	0.49
153	0.48
154	0.48
155	0.51
156	0.45
157	0.41
158	0.36
159	0.34
160	0.31
161	0.27
162	0.23
163	0.2
164	0.2
165	0.18
166	0.16
167	0.15
168	0.14
169	0.14
170	0.21
171	0.21
172	0.29
173	0.38
174	0.44
175	0.52
176	0.6
177	0.68
178	0.7
179	0.8
180	0.8
181	0.82
182	0.84
183	0.85
184	0.84
185	0.85
186	0.79
187	0.75
188	0.71
189	0.61
190	0.55
191	0.48
192	0.47
193	0.43
194	0.46
195	0.44
196	0.4
197	0.41
198	0.46
199	0.47
200	0.43
201	0.41
202	0.35
203	0.33
204	0.31
205	0.32
206	0.25
207	0.24
208	0.2
209	0.18
210	0.16
211	0.13
212	0.11
213	0.11
214	0.12
215	0.14
216	0.13
217	0.12
218	0.12
219	0.12
220	0.12
221	0.11
222	0.09
223	0.05
224	0.06
225	0.06
226	0.05
227	0.06
228	0.05
229	0.05
230	0.05
231	0.05
232	0.04
233	0.04
234	0.04
235	0.04
236	0.04
237	0.04
238	0.04
239	0.04
240	0.04
241	0.05
242	0.05
243	0.05
244	0.07
245	0.07
246	0.07
247	0.11
248	0.17
249	0.18
250	0.22
251	0.25
252	0.31
253	0.33
254	0.41
255	0.46
256	0.46
257	0.48
258	0.5
259	0.5
260	0.43
261	0.43
262	0.36
263	0.33
264	0.28
265	0.24
266	0.19
267	0.15
268	0.15
269	0.12
270	0.12
271	0.06
272	0.05
273	0.05
274	0.06
275	0.06
276	0.08
277	0.1
278	0.12
279	0.15
280	0.16
281	0.17
282	0.18
283	0.21
284	0.25
285	0.25
286	0.29
287	0.27
288	0.27
289	0.27
290	0.26
291	0.23
292	0.2
293	0.19
294	0.15
295	0.16
296	0.15
297	0.14
298	0.13
299	0.13
300	0.11
301	0.1
302	0.09
303	0.11
304	0.14
305	0.17
306	0.17
307	0.17
308	0.18
309	0.18
310	0.17
311	0.16
312	0.12
313	0.1
314	0.11
315	0.12
316	0.12
317	0.14
318	0.13
319	0.14
320	0.16
321	0.16
322	0.17
323	0.18
324	0.2
325	0.21
326	0.2
327	0.18
328	0.16
329	0.15
330	0.14
331	0.12
332	0.09
333	0.06
334	0.06
335	0.05
336	0.05
337	0.05
338	0.05
339	0.05
340	0.06
341	0.06
342	0.07
343	0.08
344	0.08
345	0.09
346	0.08
347	0.08
348	0.08
349	0.14
350	0.15
351	0.17
352	0.19
353	0.21
354	0.24
355	0.25
356	0.25
357	0.24
358	0.29
359	0.32
360	0.38
361	0.44
362	0.46
363	0.48
364	0.51
365	0.52
366	0.49
367	0.44
368	0.36
369	0.27
370	0.22
371	0.18
372	0.14
373	0.09
374	0.05
375	0.05
376	0.04
377	0.04
378	0.06
379	0.06
380	0.06
381	0.07
382	0.08
383	0.1
384	0.11
385	0.11
386	0.12
387	0.17
388	0.17
389	0.18
390	0.23
391	0.24
392	0.28
393	0.28
394	0.29
395	0.26
396	0.28
397	0.35
398	0.34
399	0.38
400	0.4
401	0.48
402	0.51
403	0.59
404	0.66
405	0.64
406	0.63
407	0.65
408	0.63
409	0.58
410	0.57
411	0.49
412	0.46
413	0.43
414	0.39
415	0.31
416	0.28
417	0.25
418	0.23
419	0.22
420	0.16
421	0.13
422	0.13
423	0.13
424	0.12
425	0.12
426	0.12
427	0.13
428	0.14
429	0.14
430	0.15
431	0.15
432	0.15
433	0.14
434	0.12
435	0.1
436	0.1
437	0.1
438	0.1
439	0.1
440	0.11
441	0.14
442	0.17
443	0.24
444	0.31
445	0.37
446	0.44
447	0.5
448	0.53
449	0.59
450	0.64
451	0.61
452	0.62
453	0.63
454	0.61
455	0.58
456	0.55
457	0.47
458	0.4
459	0.38
460	0.34
461	0.31
462	0.27
463	0.24
464	0.25
465	0.29
466	0.36
467	0.38
468	0.4
469	0.43
470	0.5
471	0.51
472	0.57
473	0.61
474	0.62
475	0.68
476	0.69
477	0.64
478	0.65
479	0.72
480	0.71
481	0.68
482	0.66
483	0.61
484	0.62
485	0.61
486	0.54
487	0.48
488	0.43
489	0.39
490	0.35
491	0.31
492	0.22
493	0.21
494	0.23
495	0.22
496	0.21
497	0.23
498	0.22
499	0.27
500	0.36
501	0.4
502	0.37
503	0.43
504	0.51
505	0.56
506	0.62
507	0.66
508	0.64
509	0.65
510	0.66
511	0.66
512	0.59
513	0.48
514	0.41
515	0.33
516	0.26
517	0.21
518	0.21
519	0.17
520	0.18
521	0.22
522	0.3
523	0.36
524	0.37
525	0.37
526	0.34
527	0.38
528	0.38
529	0.39
530	0.35
531	0.3
532	0.3
533	0.29
534	0.28
535	0.21
536	0.19
537	0.14
538	0.1
539	0.08
540	0.07
541	0.06
542	0.05
543	0.05
544	0.06
545	0.1
546	0.12
547	0.13
548	0.2
549	0.22
550	0.28
551	0.34
552	0.4
553	0.44
554	0.53
555	0.62
556	0.66
557	0.75
558	0.74
559	0.77
560	0.72
561	0.66
562	0.59
563	0.49
564	0.44
565	0.4
566	0.36
567	0.29
568	0.28
569	0.3
570	0.31
571	0.33
572	0.3
573	0.26
574	0.27
575	0.3
576	0.31
577	0.29
578	0.28
579	0.27
580	0.29
581	0.3
582	0.3
583	0.29
584	0.25
585	0.26
586	0.28
587	0.27
588	0.22
589	0.24
590	0.25
591	0.27
592	0.28
593	0.26
594	0.23
595	0.23
596	0.22
597	0.17
598	0.15
599	0.13
600	0.13
601	0.13
602	0.12
603	0.13
604	0.14
605	0.13
606	0.17
607	0.18
608	0.19
609	0.25
610	0.33
611	0.37
612	0.39
613	0.45
614	0.48
615	0.49
616	0.47
617	0.43
618	0.42
619	0.42
620	0.43
621	0.41
622	0.38
623	0.4
624	0.48
625	0.52
626	0.49
627	0.45
628	0.43
629	0.39
630	0.43
631	0.39
632	0.36
633	0.37
634	0.42
635	0.5
636	0.57
637	0.65
638	0.67

A0A0A1TTK6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer