Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

P47130

Protein Details
Accession P47130    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
56-81GVDLKLKYSKRRSLKKQGRIKNATEEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
65-72KRRSLKKQ
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 12.5, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045114  Csn12-like  
IPR000717  PCI_dom  
IPR036388  WH-like_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0008180  C:COP9 signalosome  
GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003690  F:double-stranded DNA binding  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0000754  P:adaptation of signaling pathway by response to pheromone involved in conjugation with cellular fusion  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
GO:0016973  P:poly(A)+ mRNA export from nucleus  
GO:0000338  P:protein deneddylation  
KEGG sce:YJR084W  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01399  PCI  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50250  PCI  
Amino Acid Sequences MDVDIGCYFEEKRYDDKLLDFIRYDVKTPKKTKYILQRPTATDEESVRLQRFYQLGVDLKLKYSKRRSLKKQGRIKNATEELLRLANEQLKLFNRIVERETNWIIYPLWVMAKQLIRLANESSELNKDSIEECGRTIHRSFTICLNDRNPRLNENKKIGCYMFANLEFSIYHRLSNKDMIKNLVKVLESRVNARDIPPLNKSLAMEHKSQVVLYNYYLGQYYGCLENDHERGFFHLNEALLQCPMLYVESTGKFVLQGQMEKIMILLVPLALLTKRLYPHWDHPVIAGVITRSKRLSQVYPTLVRSVISGNLSLYEATAASHERFFLSQGLHVVITLLREVVFTRLVQRCWQWGNDRKSIMPLKILLATKQHDSSANEDEEEQLDALECRLASAIASGLLRAYLSHSNRCIVFSKKEPFPHSK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.34
2 0.34
3 0.36
4 0.4
5 0.39
6 0.39
7 0.35
8 0.31
9 0.35
10 0.34
11 0.35
12 0.35
13 0.42
14 0.48
15 0.53
16 0.6
17 0.61
18 0.64
19 0.69
20 0.71
21 0.73
22 0.73
23 0.75
24 0.74
25 0.7
26 0.73
27 0.67
28 0.58
29 0.5
30 0.43
31 0.38
32 0.34
33 0.35
34 0.3
35 0.28
36 0.26
37 0.28
38 0.27
39 0.25
40 0.22
41 0.22
42 0.24
43 0.26
44 0.29
45 0.25
46 0.27
47 0.32
48 0.33
49 0.38
50 0.44
51 0.5
52 0.57
53 0.67
54 0.74
55 0.79
56 0.86
57 0.87
58 0.89
59 0.89
60 0.9
61 0.86
62 0.8
63 0.78
64 0.72
65 0.65
66 0.56
67 0.47
68 0.38
69 0.33
70 0.29
71 0.21
72 0.19
73 0.2
74 0.2
75 0.19
76 0.21
77 0.21
78 0.26
79 0.25
80 0.26
81 0.25
82 0.25
83 0.28
84 0.29
85 0.28
86 0.29
87 0.31
88 0.28
89 0.26
90 0.25
91 0.22
92 0.18
93 0.17
94 0.12
95 0.12
96 0.11
97 0.11
98 0.14
99 0.16
100 0.16
101 0.19
102 0.21
103 0.2
104 0.22
105 0.22
106 0.19
107 0.18
108 0.18
109 0.16
110 0.16
111 0.16
112 0.15
113 0.13
114 0.13
115 0.12
116 0.16
117 0.16
118 0.14
119 0.13
120 0.18
121 0.19
122 0.21
123 0.21
124 0.2
125 0.22
126 0.23
127 0.24
128 0.26
129 0.32
130 0.32
131 0.35
132 0.37
133 0.41
134 0.42
135 0.47
136 0.42
137 0.4
138 0.46
139 0.5
140 0.52
141 0.54
142 0.55
143 0.5
144 0.51
145 0.46
146 0.39
147 0.32
148 0.27
149 0.22
150 0.19
151 0.19
152 0.16
153 0.16
154 0.14
155 0.13
156 0.18
157 0.14
158 0.15
159 0.16
160 0.18
161 0.19
162 0.27
163 0.32
164 0.3
165 0.31
166 0.34
167 0.34
168 0.34
169 0.33
170 0.27
171 0.22
172 0.18
173 0.21
174 0.22
175 0.2
176 0.21
177 0.22
178 0.22
179 0.22
180 0.22
181 0.24
182 0.21
183 0.23
184 0.22
185 0.22
186 0.21
187 0.22
188 0.21
189 0.18
190 0.23
191 0.22
192 0.22
193 0.21
194 0.23
195 0.21
196 0.21
197 0.21
198 0.15
199 0.13
200 0.12
201 0.13
202 0.11
203 0.11
204 0.11
205 0.09
206 0.07
207 0.06
208 0.07
209 0.07
210 0.07
211 0.07
212 0.08
213 0.12
214 0.14
215 0.15
216 0.14
217 0.12
218 0.14
219 0.16
220 0.15
221 0.12
222 0.12
223 0.11
224 0.13
225 0.13
226 0.11
227 0.09
228 0.09
229 0.07
230 0.06
231 0.06
232 0.05
233 0.04
234 0.05
235 0.08
236 0.09
237 0.1
238 0.1
239 0.1
240 0.1
241 0.11
242 0.13
243 0.12
244 0.12
245 0.12
246 0.14
247 0.14
248 0.14
249 0.13
250 0.09
251 0.08
252 0.06
253 0.06
254 0.03
255 0.03
256 0.03
257 0.03
258 0.03
259 0.05
260 0.05
261 0.08
262 0.1
263 0.11
264 0.15
265 0.19
266 0.26
267 0.34
268 0.35
269 0.33
270 0.32
271 0.35
272 0.31
273 0.26
274 0.2
275 0.12
276 0.16
277 0.16
278 0.17
279 0.15
280 0.16
281 0.2
282 0.23
283 0.27
284 0.27
285 0.34
286 0.39
287 0.42
288 0.43
289 0.4
290 0.37
291 0.32
292 0.27
293 0.21
294 0.17
295 0.14
296 0.13
297 0.11
298 0.12
299 0.12
300 0.11
301 0.1
302 0.07
303 0.06
304 0.06
305 0.07
306 0.08
307 0.09
308 0.09
309 0.1
310 0.1
311 0.11
312 0.12
313 0.14
314 0.13
315 0.13
316 0.14
317 0.16
318 0.14
319 0.14
320 0.13
321 0.11
322 0.1
323 0.09
324 0.07
325 0.06
326 0.06
327 0.07
328 0.09
329 0.1
330 0.09
331 0.18
332 0.22
333 0.23
334 0.27
335 0.29
336 0.33
337 0.35
338 0.4
339 0.42
340 0.47
341 0.53
342 0.56
343 0.56
344 0.5
345 0.55
346 0.56
347 0.48
348 0.42
349 0.37
350 0.32
351 0.36
352 0.36
353 0.3
354 0.3
355 0.31
356 0.32
357 0.32
358 0.31
359 0.3
360 0.31
361 0.33
362 0.34
363 0.33
364 0.29
365 0.28
366 0.28
367 0.24
368 0.23
369 0.18
370 0.11
371 0.1
372 0.1
373 0.1
374 0.1
375 0.09
376 0.08
377 0.08
378 0.08
379 0.07
380 0.08
381 0.08
382 0.09
383 0.09
384 0.09
385 0.08
386 0.09
387 0.09
388 0.08
389 0.12
390 0.18
391 0.22
392 0.29
393 0.31
394 0.35
395 0.36
396 0.39
397 0.4
398 0.37
399 0.4
400 0.43
401 0.49
402 0.52
403 0.6