Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

P38803

Protein Details
Accession P38803    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-35MTKSRKQKQKKQDFLRKKLKVGKPKEKARNATDTSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
4-29SRKQKQKKQDFLRKKLKVGKPKEKAR
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011989  ARM-like  
IPR016024  ARM-type_fold  
IPR024679  Ipi1_N  
Gene Ontology GO:0005829  C:cytosol  
GO:0005654  C:nucleoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0097344  C:Rix1 complex  
GO:0003682  F:chromatin binding  
GO:0000463  P:maturation of LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0006267  P:pre-replicative complex assembly involved in nuclear cell cycle DNA replication  
GO:0030174  P:regulation of DNA-templated DNA replication initiation  
GO:0000027  P:ribosomal large subunit assembly  
GO:0006364  P:rRNA processing  
KEGG sce:YHR085W  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF12333  Ipi1_N  
Amino Acid Sequences MTKSRKQKQKKQDFLRKKLKVGKPKEKARNATDTSFVSKTISIRNQHLDQNPHDLTKRLTLLKHHNINVRKETLTTFQKSIPSIIKSRLMTPLLTQSIPLICDESQQVRQGLIDLVDEIGSHDAEILKLHCNIFVLYINMAMTHIVTQIQADSTKFLSHLLKYCGDEVVRKSWVKLLNGVFGVLGWGQVGKNDSASIVQTKKRNAKYVTIHLNALYTLVEYGCQDERARSDGDTAETTEDSGTLRNPYLIPDYPQPFEHLKLFTRELKVQDATSSGVNATLLSLATQDIDTRKAVFIEQFLPIVRKKIEVIIKEGGECGKSANKLKTLLAKIFD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.95
2 0.95
3 0.91
4 0.89
5 0.88
6 0.86
7 0.85
8 0.85
9 0.85
10 0.85
11 0.88
12 0.9
13 0.89
14 0.88
15 0.84
16 0.83
17 0.77
18 0.69
19 0.63
20 0.55
21 0.51
22 0.44
23 0.37
24 0.29
25 0.26
26 0.25
27 0.3
28 0.34
29 0.33
30 0.37
31 0.44
32 0.45
33 0.5
34 0.54
35 0.52
36 0.48
37 0.52
38 0.48
39 0.45
40 0.43
41 0.37
42 0.33
43 0.33
44 0.35
45 0.3
46 0.31
47 0.35
48 0.44
49 0.52
50 0.57
51 0.56
52 0.58
53 0.61
54 0.66
55 0.65
56 0.58
57 0.49
58 0.43
59 0.41
60 0.41
61 0.42
62 0.39
63 0.35
64 0.34
65 0.36
66 0.36
67 0.37
68 0.34
69 0.31
70 0.3
71 0.32
72 0.35
73 0.32
74 0.34
75 0.36
76 0.32
77 0.28
78 0.27
79 0.3
80 0.26
81 0.25
82 0.23
83 0.19
84 0.18
85 0.18
86 0.17
87 0.12
88 0.09
89 0.11
90 0.13
91 0.15
92 0.17
93 0.19
94 0.19
95 0.17
96 0.17
97 0.17
98 0.15
99 0.12
100 0.1
101 0.07
102 0.07
103 0.06
104 0.06
105 0.06
106 0.06
107 0.05
108 0.05
109 0.05
110 0.05
111 0.05
112 0.06
113 0.07
114 0.08
115 0.1
116 0.1
117 0.1
118 0.11
119 0.1
120 0.11
121 0.11
122 0.1
123 0.08
124 0.09
125 0.08
126 0.07
127 0.07
128 0.06
129 0.05
130 0.04
131 0.04
132 0.04
133 0.04
134 0.04
135 0.05
136 0.05
137 0.06
138 0.06
139 0.07
140 0.07
141 0.07
142 0.07
143 0.09
144 0.1
145 0.11
146 0.14
147 0.16
148 0.17
149 0.18
150 0.18
151 0.18
152 0.16
153 0.17
154 0.15
155 0.16
156 0.18
157 0.17
158 0.17
159 0.2
160 0.24
161 0.22
162 0.26
163 0.24
164 0.23
165 0.23
166 0.23
167 0.18
168 0.13
169 0.13
170 0.08
171 0.06
172 0.03
173 0.04
174 0.04
175 0.05
176 0.06
177 0.05
178 0.06
179 0.06
180 0.06
181 0.06
182 0.08
183 0.11
184 0.13
185 0.17
186 0.21
187 0.27
188 0.36
189 0.39
190 0.46
191 0.45
192 0.49
193 0.51
194 0.55
195 0.58
196 0.51
197 0.48
198 0.4
199 0.38
200 0.3
201 0.24
202 0.16
203 0.07
204 0.06
205 0.05
206 0.05
207 0.05
208 0.07
209 0.08
210 0.09
211 0.1
212 0.11
213 0.12
214 0.15
215 0.16
216 0.13
217 0.15
218 0.15
219 0.17
220 0.17
221 0.16
222 0.15
223 0.14
224 0.14
225 0.11
226 0.1
227 0.08
228 0.08
229 0.09
230 0.09
231 0.09
232 0.1
233 0.1
234 0.12
235 0.17
236 0.18
237 0.2
238 0.25
239 0.28
240 0.29
241 0.29
242 0.31
243 0.28
244 0.3
245 0.3
246 0.26
247 0.25
248 0.28
249 0.31
250 0.33
251 0.36
252 0.37
253 0.36
254 0.38
255 0.38
256 0.33
257 0.3
258 0.26
259 0.23
260 0.19
261 0.17
262 0.12
263 0.11
264 0.1
265 0.09
266 0.08
267 0.07
268 0.06
269 0.05
270 0.06
271 0.05
272 0.06
273 0.07
274 0.09
275 0.1
276 0.12
277 0.13
278 0.14
279 0.15
280 0.15
281 0.17
282 0.16
283 0.17
284 0.18
285 0.18
286 0.18
287 0.19
288 0.22
289 0.22
290 0.25
291 0.23
292 0.22
293 0.22
294 0.29
295 0.34
296 0.34
297 0.38
298 0.39
299 0.39
300 0.38
301 0.38
302 0.32
303 0.25
304 0.23
305 0.2
306 0.19
307 0.24
308 0.3
309 0.35
310 0.38
311 0.4
312 0.44
313 0.51
314 0.52