Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q99257

Protein Details
Accession Q99257    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
411-431LESNKKTGKNNYQKNRRYNHGHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 15, mito 6, cyto 3, cysk 2, cyto_pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001611  Leu-rich_rpt  
IPR032675  LRR_dom_sf  
IPR040736  Mex67_RRM  
IPR032710  NTF2-like_dom_sf  
IPR018222  Nuclear_transport_factor_2_euk  
IPR030217  NXF_fam  
IPR005637  TAP_C_dom  
IPR009060  UBA-like_sf  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005643  C:nuclear pore  
GO:0042272  C:nuclear RNA export factor complex  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0015288  F:porin activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0030619  F:U1 snRNA binding  
GO:0030620  F:U2 snRNA binding  
GO:0030621  F:U4 snRNA binding  
GO:0030623  F:U5 snRNA binding  
GO:0017070  F:U6 snRNA binding  
GO:0006406  P:mRNA export from nucleus  
GO:0016973  P:poly(A)+ mRNA export from nucleus  
GO:0000055  P:ribosomal large subunit export from nucleus  
GO:0000056  P:ribosomal small subunit export from nucleus  
KEGG sce:YPL169C  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF18444  RRM_9  
PF03943  TAP_C  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51450  LRR  
PS50177  NTF2_DOMAIN  
PS51281  TAP_C  
CDD cd14342  UBA_TAP-C  
Amino Acid Sequences MSGFHNVGNINMMAQQQMQQNRIKISVRNWQNATMNDLINFISRNARVAVYDAHVEGPLVIGYVNSKAEAESLMKWNGVRFAGSNLKFELLDNNGASAGTSDTISFLRGVLLKRYDPQTKLLNLGALHSDPELIQKGVFSSISTQSKMFPAMMKLASTEKSLIVESVNLADNQLKDISAISTLAQTFPNLKNLCLANNQIFRFRSLEVWKNKFKDLRELLMTNNPITTDKLYRTEMLRLFPKLVVLDNVIVRDEQKLQTVYSLPMKIQQFFFENDALGQSSTDFATNFLNLWDNNREQLLNLYSPQSQFSVSVDSTIPPSTVTDSDQTPAFGYYMSSSRNISKVSSEKSIQQRLSIGQESINSIFKTLPKTKHHLQEQPNEYSMETISYPQINGFVITLHGFFEETGKPELESNKKTGKNNYQKNRRYNHGYNSTSNNKLSKKSFDRTWVIVPMNNSVIIASDLLTVRAYSTGAWKTASIAIAQPPQQQASVLPQVASMNPNITTPPQPQPSVVPGGMSIPGAPQGAMVMAPTLQLPPDVQSRLNPVQLELLNKLHLETKLNAEYTFMLAEQSNWNYEVAIKGFQSSMNGIPREAFVQF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.14
2 0.18
3 0.22
4 0.27
5 0.31
6 0.34
7 0.38
8 0.4
9 0.45
10 0.44
11 0.43
12 0.44
13 0.49
14 0.52
15 0.56
16 0.56
17 0.57
18 0.59
19 0.55
20 0.55
21 0.49
22 0.41
23 0.33
24 0.31
25 0.26
26 0.21
27 0.21
28 0.16
29 0.19
30 0.18
31 0.2
32 0.2
33 0.2
34 0.19
35 0.21
36 0.22
37 0.18
38 0.2
39 0.19
40 0.18
41 0.17
42 0.16
43 0.14
44 0.11
45 0.08
46 0.06
47 0.06
48 0.05
49 0.06
50 0.08
51 0.09
52 0.09
53 0.09
54 0.09
55 0.1
56 0.12
57 0.13
58 0.14
59 0.18
60 0.19
61 0.2
62 0.21
63 0.22
64 0.23
65 0.21
66 0.19
67 0.15
68 0.2
69 0.29
70 0.3
71 0.31
72 0.28
73 0.29
74 0.28
75 0.27
76 0.26
77 0.2
78 0.22
79 0.2
80 0.19
81 0.18
82 0.17
83 0.17
84 0.13
85 0.1
86 0.07
87 0.07
88 0.07
89 0.08
90 0.08
91 0.09
92 0.09
93 0.08
94 0.09
95 0.12
96 0.14
97 0.19
98 0.22
99 0.23
100 0.28
101 0.34
102 0.38
103 0.37
104 0.4
105 0.41
106 0.39
107 0.41
108 0.37
109 0.34
110 0.28
111 0.28
112 0.25
113 0.18
114 0.17
115 0.13
116 0.13
117 0.1
118 0.13
119 0.13
120 0.11
121 0.11
122 0.1
123 0.11
124 0.12
125 0.12
126 0.1
127 0.11
128 0.18
129 0.21
130 0.22
131 0.22
132 0.22
133 0.23
134 0.24
135 0.22
136 0.17
137 0.16
138 0.18
139 0.19
140 0.17
141 0.17
142 0.19
143 0.19
144 0.18
145 0.17
146 0.13
147 0.14
148 0.14
149 0.13
150 0.11
151 0.1
152 0.09
153 0.1
154 0.1
155 0.09
156 0.09
157 0.11
158 0.11
159 0.12
160 0.12
161 0.1
162 0.09
163 0.09
164 0.09
165 0.08
166 0.08
167 0.07
168 0.08
169 0.09
170 0.1
171 0.09
172 0.1
173 0.14
174 0.15
175 0.23
176 0.21
177 0.21
178 0.24
179 0.25
180 0.26
181 0.24
182 0.26
183 0.25
184 0.3
185 0.31
186 0.32
187 0.32
188 0.31
189 0.3
190 0.28
191 0.27
192 0.26
193 0.34
194 0.38
195 0.44
196 0.48
197 0.49
198 0.53
199 0.52
200 0.48
201 0.49
202 0.44
203 0.42
204 0.4
205 0.38
206 0.36
207 0.37
208 0.37
209 0.27
210 0.23
211 0.19
212 0.16
213 0.16
214 0.17
215 0.14
216 0.15
217 0.18
218 0.2
219 0.21
220 0.22
221 0.27
222 0.26
223 0.27
224 0.28
225 0.26
226 0.26
227 0.24
228 0.23
229 0.18
230 0.16
231 0.14
232 0.11
233 0.12
234 0.11
235 0.11
236 0.1
237 0.1
238 0.1
239 0.1
240 0.11
241 0.1
242 0.12
243 0.13
244 0.12
245 0.14
246 0.15
247 0.15
248 0.17
249 0.17
250 0.14
251 0.19
252 0.2
253 0.2
254 0.19
255 0.19
256 0.17
257 0.18
258 0.2
259 0.15
260 0.14
261 0.12
262 0.12
263 0.11
264 0.08
265 0.07
266 0.05
267 0.05
268 0.05
269 0.06
270 0.05
271 0.06
272 0.06
273 0.07
274 0.07
275 0.06
276 0.08
277 0.07
278 0.1
279 0.12
280 0.12
281 0.13
282 0.13
283 0.13
284 0.11
285 0.14
286 0.12
287 0.1
288 0.1
289 0.12
290 0.12
291 0.13
292 0.13
293 0.12
294 0.1
295 0.1
296 0.1
297 0.11
298 0.1
299 0.11
300 0.11
301 0.1
302 0.11
303 0.11
304 0.1
305 0.07
306 0.08
307 0.08
308 0.08
309 0.1
310 0.1
311 0.1
312 0.11
313 0.11
314 0.11
315 0.1
316 0.1
317 0.08
318 0.07
319 0.06
320 0.07
321 0.08
322 0.09
323 0.1
324 0.11
325 0.12
326 0.14
327 0.15
328 0.14
329 0.16
330 0.2
331 0.22
332 0.24
333 0.24
334 0.29
335 0.35
336 0.41
337 0.38
338 0.34
339 0.33
340 0.31
341 0.34
342 0.28
343 0.22
344 0.16
345 0.16
346 0.17
347 0.17
348 0.18
349 0.14
350 0.13
351 0.14
352 0.15
353 0.21
354 0.25
355 0.31
356 0.34
357 0.41
358 0.47
359 0.54
360 0.59
361 0.61
362 0.62
363 0.64
364 0.65
365 0.61
366 0.56
367 0.48
368 0.41
369 0.33
370 0.26
371 0.17
372 0.12
373 0.1
374 0.1
375 0.1
376 0.1
377 0.09
378 0.1
379 0.09
380 0.09
381 0.07
382 0.06
383 0.06
384 0.07
385 0.07
386 0.06
387 0.06
388 0.06
389 0.06
390 0.09
391 0.09
392 0.11
393 0.12
394 0.12
395 0.13
396 0.15
397 0.21
398 0.26
399 0.27
400 0.3
401 0.37
402 0.42
403 0.45
404 0.52
405 0.57
406 0.6
407 0.68
408 0.73
409 0.76
410 0.79
411 0.84
412 0.81
413 0.78
414 0.77
415 0.73
416 0.72
417 0.71
418 0.67
419 0.62
420 0.64
421 0.62
422 0.57
423 0.53
424 0.49
425 0.42
426 0.43
427 0.43
428 0.45
429 0.47
430 0.49
431 0.51
432 0.52
433 0.55
434 0.53
435 0.53
436 0.5
437 0.44
438 0.4
439 0.36
440 0.31
441 0.27
442 0.24
443 0.2
444 0.13
445 0.12
446 0.11
447 0.09
448 0.07
449 0.08
450 0.08
451 0.09
452 0.09
453 0.08
454 0.08
455 0.09
456 0.08
457 0.06
458 0.12
459 0.14
460 0.15
461 0.16
462 0.15
463 0.17
464 0.2
465 0.2
466 0.15
467 0.15
468 0.17
469 0.21
470 0.24
471 0.26
472 0.25
473 0.26
474 0.25
475 0.23
476 0.21
477 0.23
478 0.26
479 0.23
480 0.21
481 0.21
482 0.21
483 0.22
484 0.23
485 0.17
486 0.13
487 0.13
488 0.13
489 0.14
490 0.16
491 0.19
492 0.22
493 0.29
494 0.32
495 0.33
496 0.34
497 0.36
498 0.38
499 0.39
500 0.34
501 0.26
502 0.22
503 0.22
504 0.22
505 0.18
506 0.14
507 0.08
508 0.1
509 0.1
510 0.09
511 0.08
512 0.07
513 0.07
514 0.07
515 0.07
516 0.05
517 0.05
518 0.05
519 0.06
520 0.06
521 0.06
522 0.07
523 0.08
524 0.1
525 0.16
526 0.18
527 0.19
528 0.21
529 0.29
530 0.33
531 0.36
532 0.34
533 0.29
534 0.33
535 0.34
536 0.35
537 0.3
538 0.28
539 0.26
540 0.26
541 0.26
542 0.24
543 0.24
544 0.24
545 0.23
546 0.28
547 0.32
548 0.33
549 0.32
550 0.29
551 0.28
552 0.26
553 0.24
554 0.17
555 0.13
556 0.12
557 0.14
558 0.18
559 0.19
560 0.19
561 0.19
562 0.19
563 0.18
564 0.19
565 0.21
566 0.17
567 0.18
568 0.17
569 0.17
570 0.18
571 0.19
572 0.2
573 0.19
574 0.23
575 0.27
576 0.28
577 0.27
578 0.27
579 0.28