Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q08208

Protein Details
Accession Q08208    Localization Confidence High Confidence Score 25.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
75-98EEVALPKVKKAKKSKRNDEDEDLEAcidic
349-378QEDENTKKPTKKARKLRVSRCKNMKKGTTIHydrophilic
420-447RAKKGEGSTHLKKKKQRSATGRVTKRSIBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
81-90KVKKAKKSKR
355-368KKPTKKARKLRVSR
420-459RAKKGEGSTHLKKKKQRSATGRVTKRSIAFKKAQAEKSKK
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR034777  Nop12_RRM1  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR047189  RRM2_Nop12p-like  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0030684  C:preribosome  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0019843  F:rRNA binding  
GO:0000463  P:maturation of LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
KEGG sce:YOL041C  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12669  RRM1_Nop12p_like  
cd12670  RRM2_Nop12p_like  
Amino Acid Sequences MSSAIDNLFGNIDEKKIESSVDKLFSSSCGPINKLEVKSKTRTVLPDSKKRERAAEADQEEKEASKPDVSDEQTEEVALPKVKKAKKSKRNDEDEDLEARYYAKLLNEEAEAEDDKPTVTKTDETSVPLTSAAKKVDFKEDELEKAERTVFIGNILSTVITSKKVYKEFKKLFGTNPIAETEESGNEKEEESSKKSDNNEFAIESIRFRSISFDEALPRKVAFVQQKFHKSRDTINAYIVYKNKSAVRKICSNLNAVVFQDHHLRVDSVAHPAPHDKKRSIFVGNLDFEEIEESLWKHFEPCGDIEYVRIIRDSKTNMGKGFAYVQFKDLQSVNKALLLNEKPMKSQKQEDENTKKPTKKARKLRVSRCKNMKKGTTIGTGLDRNGLTDSQRTRAGRAKKILGKADRATLGQEITIEGLRAKKGEGSTHLKKKKQRSATGRVTKRSIAFKKAQAEKSKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.13
2 0.14
3 0.14
4 0.15
5 0.16
6 0.2
7 0.25
8 0.28
9 0.27
10 0.26
11 0.26
12 0.26
13 0.27
14 0.26
15 0.24
16 0.24
17 0.26
18 0.27
19 0.34
20 0.39
21 0.4
22 0.46
23 0.49
24 0.51
25 0.56
26 0.59
27 0.56
28 0.54
29 0.55
30 0.55
31 0.58
32 0.6
33 0.64
34 0.68
35 0.74
36 0.76
37 0.73
38 0.71
39 0.66
40 0.62
41 0.6
42 0.61
43 0.55
44 0.54
45 0.51
46 0.47
47 0.42
48 0.37
49 0.3
50 0.23
51 0.2
52 0.16
53 0.16
54 0.18
55 0.25
56 0.27
57 0.29
58 0.28
59 0.29
60 0.27
61 0.27
62 0.23
63 0.18
64 0.18
65 0.18
66 0.16
67 0.18
68 0.27
69 0.32
70 0.41
71 0.5
72 0.58
73 0.66
74 0.76
75 0.83
76 0.85
77 0.9
78 0.88
79 0.84
80 0.77
81 0.71
82 0.62
83 0.52
84 0.42
85 0.32
86 0.25
87 0.18
88 0.14
89 0.12
90 0.1
91 0.11
92 0.12
93 0.13
94 0.13
95 0.14
96 0.14
97 0.15
98 0.14
99 0.13
100 0.13
101 0.11
102 0.1
103 0.1
104 0.1
105 0.09
106 0.1
107 0.12
108 0.13
109 0.18
110 0.2
111 0.22
112 0.24
113 0.22
114 0.21
115 0.2
116 0.19
117 0.17
118 0.18
119 0.17
120 0.18
121 0.21
122 0.22
123 0.31
124 0.31
125 0.3
126 0.34
127 0.34
128 0.33
129 0.34
130 0.33
131 0.24
132 0.24
133 0.22
134 0.16
135 0.15
136 0.14
137 0.1
138 0.1
139 0.11
140 0.09
141 0.09
142 0.09
143 0.08
144 0.06
145 0.07
146 0.07
147 0.07
148 0.09
149 0.12
150 0.17
151 0.24
152 0.32
153 0.38
154 0.48
155 0.51
156 0.58
157 0.62
158 0.59
159 0.55
160 0.57
161 0.55
162 0.45
163 0.42
164 0.34
165 0.29
166 0.26
167 0.24
168 0.16
169 0.13
170 0.13
171 0.12
172 0.12
173 0.11
174 0.12
175 0.11
176 0.14
177 0.15
178 0.18
179 0.21
180 0.21
181 0.25
182 0.28
183 0.32
184 0.31
185 0.31
186 0.29
187 0.25
188 0.24
189 0.23
190 0.2
191 0.16
192 0.14
193 0.12
194 0.11
195 0.11
196 0.13
197 0.11
198 0.13
199 0.14
200 0.13
201 0.17
202 0.18
203 0.19
204 0.17
205 0.16
206 0.14
207 0.14
208 0.18
209 0.21
210 0.23
211 0.28
212 0.33
213 0.43
214 0.45
215 0.46
216 0.45
217 0.39
218 0.4
219 0.44
220 0.44
221 0.36
222 0.35
223 0.37
224 0.34
225 0.36
226 0.33
227 0.26
228 0.2
229 0.21
230 0.24
231 0.24
232 0.28
233 0.3
234 0.32
235 0.36
236 0.37
237 0.41
238 0.39
239 0.37
240 0.35
241 0.31
242 0.27
243 0.2
244 0.2
245 0.15
246 0.14
247 0.16
248 0.14
249 0.13
250 0.13
251 0.13
252 0.12
253 0.15
254 0.15
255 0.14
256 0.15
257 0.15
258 0.15
259 0.2
260 0.26
261 0.29
262 0.33
263 0.31
264 0.32
265 0.35
266 0.39
267 0.36
268 0.32
269 0.31
270 0.33
271 0.32
272 0.29
273 0.26
274 0.22
275 0.19
276 0.18
277 0.13
278 0.07
279 0.07
280 0.07
281 0.07
282 0.07
283 0.07
284 0.07
285 0.08
286 0.09
287 0.11
288 0.12
289 0.13
290 0.14
291 0.14
292 0.14
293 0.17
294 0.17
295 0.15
296 0.14
297 0.13
298 0.13
299 0.17
300 0.2
301 0.23
302 0.28
303 0.31
304 0.31
305 0.32
306 0.31
307 0.28
308 0.29
309 0.27
310 0.26
311 0.23
312 0.24
313 0.25
314 0.25
315 0.26
316 0.23
317 0.22
318 0.21
319 0.22
320 0.21
321 0.21
322 0.22
323 0.19
324 0.25
325 0.24
326 0.27
327 0.31
328 0.31
329 0.3
330 0.37
331 0.42
332 0.39
333 0.45
334 0.46
335 0.51
336 0.57
337 0.64
338 0.67
339 0.7
340 0.74
341 0.73
342 0.7
343 0.66
344 0.71
345 0.72
346 0.73
347 0.76
348 0.79
349 0.82
350 0.88
351 0.93
352 0.93
353 0.92
354 0.92
355 0.92
356 0.91
357 0.89
358 0.87
359 0.83
360 0.78
361 0.74
362 0.69
363 0.64
364 0.55
365 0.48
366 0.44
367 0.39
368 0.33
369 0.31
370 0.25
371 0.2
372 0.21
373 0.19
374 0.16
375 0.21
376 0.23
377 0.23
378 0.29
379 0.3
380 0.32
381 0.4
382 0.47
383 0.49
384 0.54
385 0.59
386 0.6
387 0.66
388 0.71
389 0.69
390 0.68
391 0.62
392 0.6
393 0.53
394 0.47
395 0.42
396 0.34
397 0.29
398 0.22
399 0.19
400 0.14
401 0.13
402 0.13
403 0.11
404 0.11
405 0.13
406 0.14
407 0.14
408 0.15
409 0.17
410 0.19
411 0.24
412 0.3
413 0.36
414 0.45
415 0.56
416 0.64
417 0.67
418 0.72
419 0.78
420 0.81
421 0.82
422 0.83
423 0.82
424 0.84
425 0.88
426 0.9
427 0.89
428 0.85
429 0.8
430 0.75
431 0.71
432 0.71
433 0.66
434 0.64
435 0.62
436 0.63
437 0.68
438 0.71
439 0.74