Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

P89105

Protein Details
Accession P89105    Localization Confidence High Confidence Score 15.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
978-1019DKDNEYDEEKPRQKRKRSTKTKNSGESKRRKAAKKTLSDSDEBasic
1021-1043DDDVVKKPSHNKGKKSQLSNEFIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
987-1012KPRQKRKRSTKTKNSGESKRRKAAKK
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 15, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR031101  Ctr9  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR019734  TPR_repeat  
Gene Ontology GO:0016593  C:Cdc73/Paf1 complex  
GO:0000791  C:euchromatin  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:1990269  F:RNA polymerase II C-terminal domain phosphoserine binding  
GO:0000993  F:RNA polymerase II complex binding  
GO:0061629  F:RNA polymerase II-specific DNA-binding transcription factor binding  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
GO:0045142  F:triplex DNA binding  
GO:0006353  P:DNA-templated transcription termination  
GO:0016571  P:histone methylation  
GO:0031124  P:mRNA 3'-end processing  
GO:1901525  P:negative regulation of mitophagy  
GO:2001209  P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase I  
GO:0051569  P:regulation of histone H3-K4 methylation  
GO:0060260  P:regulation of transcription initiation by RNA polymerase II  
GO:0000083  P:regulation of transcription involved in G1/S transition of mitotic cell cycle  
GO:0090262  P:regulation of transcription-coupled nucleotide-excision repair  
GO:0031126  P:sno(s)RNA 3'-end processing  
GO:0001015  P:snoRNA transcription by RNA polymerase II  
GO:0006360  P:transcription by RNA polymerase I  
GO:0006362  P:transcription elongation by RNA polymerase I  
GO:0006368  P:transcription elongation by RNA polymerase II  
KEGG sce:YOL145C  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF13176  TPR_7  
PF13181  TPR_8  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50005  TPR  
PS50293  TPR_REGION  
Amino Acid Sequences MTNAMKVEGYPSMEWPTSLDIPLKASEELVGIDLETDLPDDPTDLKTLLVEENSEKEHWLTIALAYCNHGKTNEGIKLIEMALDVFQNSERASLHTFLTWAHLNLAKGQSLSVETKEHELTQAELNLKDAIGFDPTWIGNMLATVELYYQRGHYDKALETSDLFVKSIHAEDHRSGRQSKPNCLFLLLRAKLLYQKKNYMASLKIFQELLVINPVLQPDPRIGIGLCFWQLKDSKMAIKSWQRALQLNPKNTSASILVLLGEFRESFTNSTNDKTFKEAFTKALSDLNNIFSENQHNPVLLTLLQTYYYFKGDYQTVLDIYHHRILKMSPMIAKIVLSESSFWCGRAHYALGDYRKSFIMFQESLKKNEDNLLAKLGLGQTQIKNNLLEESIITFENLYKTNESLQELNYILGMLYAGKAFDAKTAKNTSAKEQSNLNEKALKYLERYLKLTLATKNQLVISRAYLVISQLYELQNQYKTSLDYLSKALEEMEFIKKEIPLEVLNNLACYHFINGDFIKADDLFKQAKAKVSDKDESVNITLEYNIARTNEKNDCEKSESIYSQVTSLHPAYIAARIRNLYLKFAQSKIEDSDMSTEMNKLLDLNKSDLEIRSFYGWYLKNSKERKNNEKSTTHNKETLVKYNSHDAYALISLANLYVTIARDGKKSRNPKEQEKSKHSYLKAIQLYQKVLQVDPFNIFAAQGLAIIFAESKRLGPALEILRKVRDSLDNEDVQLNLAHCYLEMREYGKAIENYELVLKKFDNEKTRPHILNLLGRAWYARAIKERSVNFYQKALENAKTALDLFVKESSKSKFIHSVKFNIALLHFQIAETLRRSNPKFRTVQQIKDSLEGLKEGLELFRELNDLKEFNMIPKEELEQRIQLGETTMKSALERSLNEQEEFEKEQSAKIDEARKILEENELKEQGWMKQEEEARRLKLEKQAEEYRKLQDEAQKLIQEREAMAISEHNVKDDSDLSDKDNEYDEEKPRQKRKRSTKTKNSGESKRRKAAKKTLSDSDEDDDDVVKKPSHNKGKKSQLSNEFIEDSDEEEAQMSGSEQNKNDDNDENNDNDDNDGLF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.23
3 0.26
4 0.24
5 0.25
6 0.25
7 0.21
8 0.23
9 0.26
10 0.26
11 0.21
12 0.19
13 0.18
14 0.15
15 0.15
16 0.13
17 0.11
18 0.08
19 0.08
20 0.08
21 0.08
22 0.07
23 0.07
24 0.07
25 0.07
26 0.08
27 0.09
28 0.1
29 0.11
30 0.13
31 0.13
32 0.12
33 0.12
34 0.14
35 0.16
36 0.15
37 0.16
38 0.16
39 0.19
40 0.22
41 0.22
42 0.21
43 0.19
44 0.2
45 0.17
46 0.16
47 0.14
48 0.13
49 0.18
50 0.18
51 0.18
52 0.19
53 0.23
54 0.23
55 0.24
56 0.21
57 0.18
58 0.22
59 0.3
60 0.32
61 0.31
62 0.3
63 0.29
64 0.31
65 0.29
66 0.25
67 0.16
68 0.12
69 0.1
70 0.11
71 0.1
72 0.08
73 0.09
74 0.1
75 0.1
76 0.11
77 0.11
78 0.13
79 0.17
80 0.18
81 0.19
82 0.18
83 0.18
84 0.17
85 0.2
86 0.19
87 0.17
88 0.18
89 0.2
90 0.2
91 0.25
92 0.27
93 0.24
94 0.22
95 0.21
96 0.19
97 0.2
98 0.21
99 0.18
100 0.19
101 0.18
102 0.22
103 0.24
104 0.23
105 0.22
106 0.2
107 0.2
108 0.22
109 0.25
110 0.24
111 0.22
112 0.23
113 0.21
114 0.2
115 0.18
116 0.15
117 0.11
118 0.12
119 0.11
120 0.1
121 0.13
122 0.13
123 0.13
124 0.13
125 0.12
126 0.09
127 0.09
128 0.1
129 0.07
130 0.07
131 0.07
132 0.07
133 0.08
134 0.09
135 0.1
136 0.1
137 0.12
138 0.14
139 0.15
140 0.17
141 0.2
142 0.22
143 0.25
144 0.27
145 0.25
146 0.24
147 0.25
148 0.26
149 0.22
150 0.2
151 0.16
152 0.15
153 0.16
154 0.17
155 0.17
156 0.16
157 0.19
158 0.22
159 0.3
160 0.33
161 0.36
162 0.37
163 0.41
164 0.47
165 0.49
166 0.56
167 0.55
168 0.56
169 0.53
170 0.53
171 0.48
172 0.44
173 0.5
174 0.41
175 0.35
176 0.3
177 0.3
178 0.34
179 0.42
180 0.44
181 0.39
182 0.46
183 0.49
184 0.54
185 0.55
186 0.52
187 0.48
188 0.44
189 0.44
190 0.38
191 0.35
192 0.3
193 0.27
194 0.25
195 0.22
196 0.18
197 0.16
198 0.14
199 0.12
200 0.13
201 0.14
202 0.12
203 0.12
204 0.12
205 0.1
206 0.12
207 0.12
208 0.12
209 0.12
210 0.12
211 0.13
212 0.14
213 0.15
214 0.14
215 0.13
216 0.16
217 0.18
218 0.18
219 0.22
220 0.22
221 0.26
222 0.27
223 0.29
224 0.33
225 0.41
226 0.45
227 0.46
228 0.49
229 0.46
230 0.47
231 0.51
232 0.53
233 0.53
234 0.54
235 0.5
236 0.47
237 0.45
238 0.42
239 0.39
240 0.29
241 0.22
242 0.16
243 0.13
244 0.12
245 0.1
246 0.1
247 0.08
248 0.07
249 0.06
250 0.06
251 0.08
252 0.09
253 0.1
254 0.13
255 0.17
256 0.18
257 0.21
258 0.24
259 0.25
260 0.25
261 0.29
262 0.28
263 0.26
264 0.3
265 0.29
266 0.28
267 0.28
268 0.29
269 0.25
270 0.27
271 0.25
272 0.23
273 0.22
274 0.23
275 0.2
276 0.19
277 0.18
278 0.15
279 0.2
280 0.18
281 0.2
282 0.18
283 0.18
284 0.17
285 0.17
286 0.17
287 0.12
288 0.12
289 0.09
290 0.09
291 0.09
292 0.1
293 0.12
294 0.12
295 0.13
296 0.12
297 0.11
298 0.13
299 0.14
300 0.14
301 0.14
302 0.14
303 0.14
304 0.14
305 0.15
306 0.15
307 0.18
308 0.22
309 0.21
310 0.2
311 0.2
312 0.2
313 0.25
314 0.26
315 0.24
316 0.21
317 0.21
318 0.22
319 0.21
320 0.21
321 0.15
322 0.14
323 0.12
324 0.1
325 0.1
326 0.1
327 0.13
328 0.14
329 0.14
330 0.13
331 0.12
332 0.13
333 0.13
334 0.13
335 0.1
336 0.13
337 0.17
338 0.19
339 0.22
340 0.21
341 0.21
342 0.21
343 0.21
344 0.19
345 0.16
346 0.2
347 0.18
348 0.2
349 0.29
350 0.31
351 0.33
352 0.36
353 0.35
354 0.28
355 0.32
356 0.34
357 0.27
358 0.26
359 0.26
360 0.22
361 0.22
362 0.22
363 0.18
364 0.14
365 0.12
366 0.14
367 0.13
368 0.17
369 0.19
370 0.19
371 0.19
372 0.18
373 0.18
374 0.15
375 0.13
376 0.1
377 0.09
378 0.09
379 0.09
380 0.08
381 0.07
382 0.08
383 0.1
384 0.11
385 0.11
386 0.11
387 0.11
388 0.14
389 0.16
390 0.17
391 0.16
392 0.16
393 0.17
394 0.16
395 0.16
396 0.13
397 0.11
398 0.09
399 0.07
400 0.06
401 0.04
402 0.04
403 0.04
404 0.03
405 0.03
406 0.04
407 0.04
408 0.08
409 0.11
410 0.11
411 0.16
412 0.19
413 0.21
414 0.26
415 0.27
416 0.29
417 0.35
418 0.36
419 0.33
420 0.34
421 0.35
422 0.39
423 0.4
424 0.35
425 0.31
426 0.29
427 0.31
428 0.29
429 0.27
430 0.2
431 0.26
432 0.3
433 0.28
434 0.3
435 0.27
436 0.28
437 0.28
438 0.29
439 0.25
440 0.25
441 0.25
442 0.23
443 0.23
444 0.23
445 0.24
446 0.21
447 0.19
448 0.15
449 0.14
450 0.14
451 0.13
452 0.11
453 0.09
454 0.09
455 0.08
456 0.07
457 0.08
458 0.09
459 0.1
460 0.1
461 0.12
462 0.13
463 0.14
464 0.14
465 0.12
466 0.12
467 0.12
468 0.15
469 0.13
470 0.13
471 0.13
472 0.13
473 0.12
474 0.12
475 0.11
476 0.08
477 0.08
478 0.09
479 0.12
480 0.11
481 0.11
482 0.12
483 0.13
484 0.13
485 0.13
486 0.12
487 0.09
488 0.1
489 0.1
490 0.11
491 0.11
492 0.11
493 0.11
494 0.09
495 0.08
496 0.07
497 0.08
498 0.07
499 0.07
500 0.09
501 0.08
502 0.09
503 0.09
504 0.09
505 0.09
506 0.08
507 0.09
508 0.07
509 0.1
510 0.1
511 0.11
512 0.14
513 0.15
514 0.19
515 0.22
516 0.25
517 0.26
518 0.3
519 0.32
520 0.29
521 0.3
522 0.25
523 0.23
524 0.21
525 0.17
526 0.12
527 0.1
528 0.1
529 0.08
530 0.08
531 0.06
532 0.07
533 0.07
534 0.08
535 0.08
536 0.13
537 0.17
538 0.19
539 0.23
540 0.23
541 0.25
542 0.28
543 0.28
544 0.26
545 0.25
546 0.23
547 0.21
548 0.2
549 0.17
550 0.14
551 0.15
552 0.12
553 0.12
554 0.12
555 0.1
556 0.09
557 0.09
558 0.09
559 0.13
560 0.14
561 0.12
562 0.13
563 0.13
564 0.14
565 0.19
566 0.19
567 0.17
568 0.17
569 0.2
570 0.21
571 0.21
572 0.23
573 0.19
574 0.21
575 0.19
576 0.2
577 0.16
578 0.15
579 0.16
580 0.14
581 0.14
582 0.12
583 0.11
584 0.09
585 0.09
586 0.09
587 0.06
588 0.07
589 0.1
590 0.11
591 0.12
592 0.12
593 0.13
594 0.14
595 0.14
596 0.14
597 0.12
598 0.12
599 0.11
600 0.11
601 0.1
602 0.15
603 0.16
604 0.18
605 0.23
606 0.25
607 0.33
608 0.39
609 0.47
610 0.5
611 0.56
612 0.64
613 0.68
614 0.73
615 0.71
616 0.7
617 0.69
618 0.7
619 0.71
620 0.64
621 0.58
622 0.5
623 0.51
624 0.49
625 0.52
626 0.44
627 0.37
628 0.36
629 0.39
630 0.38
631 0.31
632 0.28
633 0.19
634 0.18
635 0.16
636 0.15
637 0.07
638 0.06
639 0.06
640 0.05
641 0.05
642 0.03
643 0.03
644 0.04
645 0.05
646 0.06
647 0.08
648 0.09
649 0.13
650 0.16
651 0.22
652 0.3
653 0.39
654 0.46
655 0.54
656 0.6
657 0.67
658 0.75
659 0.78
660 0.79
661 0.78
662 0.77
663 0.73
664 0.74
665 0.64
666 0.61
667 0.55
668 0.54
669 0.49
670 0.46
671 0.44
672 0.4
673 0.42
674 0.36
675 0.36
676 0.27
677 0.24
678 0.23
679 0.2
680 0.18
681 0.17
682 0.16
683 0.14
684 0.13
685 0.12
686 0.09
687 0.09
688 0.07
689 0.06
690 0.05
691 0.04
692 0.04
693 0.05
694 0.05
695 0.04
696 0.06
697 0.05
698 0.06
699 0.06
700 0.07
701 0.07
702 0.07
703 0.12
704 0.18
705 0.22
706 0.24
707 0.25
708 0.28
709 0.28
710 0.28
711 0.25
712 0.24
713 0.24
714 0.28
715 0.32
716 0.3
717 0.31
718 0.31
719 0.28
720 0.23
721 0.2
722 0.14
723 0.09
724 0.09
725 0.08
726 0.07
727 0.08
728 0.07
729 0.08
730 0.09
731 0.09
732 0.1
733 0.11
734 0.12
735 0.16
736 0.17
737 0.16
738 0.17
739 0.15
740 0.15
741 0.19
742 0.2
743 0.15
744 0.16
745 0.15
746 0.16
747 0.22
748 0.27
749 0.31
750 0.33
751 0.4
752 0.45
753 0.53
754 0.51
755 0.47
756 0.47
757 0.42
758 0.44
759 0.4
760 0.34
761 0.27
762 0.26
763 0.24
764 0.19
765 0.2
766 0.16
767 0.16
768 0.21
769 0.24
770 0.28
771 0.35
772 0.36
773 0.39
774 0.44
775 0.46
776 0.41
777 0.4
778 0.39
779 0.34
780 0.37
781 0.34
782 0.3
783 0.26
784 0.25
785 0.23
786 0.21
787 0.19
788 0.16
789 0.13
790 0.11
791 0.12
792 0.16
793 0.17
794 0.17
795 0.21
796 0.22
797 0.26
798 0.26
799 0.27
800 0.32
801 0.36
802 0.44
803 0.44
804 0.47
805 0.46
806 0.49
807 0.46
808 0.38
809 0.34
810 0.26
811 0.23
812 0.19
813 0.15
814 0.11
815 0.13
816 0.13
817 0.15
818 0.16
819 0.18
820 0.19
821 0.27
822 0.31
823 0.38
824 0.43
825 0.48
826 0.51
827 0.52
828 0.6
829 0.59
830 0.64
831 0.61
832 0.62
833 0.56
834 0.52
835 0.5
836 0.39
837 0.34
838 0.26
839 0.2
840 0.13
841 0.11
842 0.09
843 0.09
844 0.09
845 0.09
846 0.08
847 0.09
848 0.1
849 0.1
850 0.12
851 0.15
852 0.14
853 0.14
854 0.18
855 0.17
856 0.19
857 0.24
858 0.22
859 0.2
860 0.21
861 0.24
862 0.25
863 0.28
864 0.28
865 0.25
866 0.25
867 0.25
868 0.24
869 0.2
870 0.17
871 0.17
872 0.15
873 0.16
874 0.16
875 0.15
876 0.15
877 0.16
878 0.18
879 0.19
880 0.2
881 0.23
882 0.31
883 0.33
884 0.34
885 0.33
886 0.31
887 0.31
888 0.34
889 0.28
890 0.24
891 0.21
892 0.23
893 0.24
894 0.25
895 0.22
896 0.23
897 0.3
898 0.29
899 0.32
900 0.31
901 0.3
902 0.29
903 0.28
904 0.32
905 0.28
906 0.29
907 0.33
908 0.33
909 0.32
910 0.33
911 0.34
912 0.29
913 0.32
914 0.31
915 0.24
916 0.29
917 0.35
918 0.38
919 0.42
920 0.44
921 0.41
922 0.43
923 0.45
924 0.43
925 0.45
926 0.47
927 0.46
928 0.48
929 0.56
930 0.57
931 0.61
932 0.6
933 0.58
934 0.54
935 0.5
936 0.47
937 0.44
938 0.43
939 0.43
940 0.46
941 0.45
942 0.42
943 0.43
944 0.41
945 0.35
946 0.3
947 0.27
948 0.22
949 0.17
950 0.16
951 0.16
952 0.15
953 0.22
954 0.22
955 0.2
956 0.2
957 0.2
958 0.21
959 0.22
960 0.23
961 0.2
962 0.22
963 0.23
964 0.28
965 0.28
966 0.28
967 0.28
968 0.26
969 0.24
970 0.29
971 0.32
972 0.37
973 0.44
974 0.53
975 0.6
976 0.69
977 0.76
978 0.81
979 0.86
980 0.88
981 0.91
982 0.93
983 0.94
984 0.95
985 0.95
986 0.94
987 0.93
988 0.92
989 0.91
990 0.91
991 0.89
992 0.88
993 0.87
994 0.86
995 0.86
996 0.86
997 0.85
998 0.85
999 0.82
1000 0.82
1001 0.76
1002 0.7
1003 0.64
1004 0.57
1005 0.48
1006 0.38
1007 0.32
1008 0.23
1009 0.21
1010 0.2
1011 0.19
1012 0.17
1013 0.2
1014 0.27
1015 0.37
1016 0.47
1017 0.55
1018 0.61
1019 0.69
1020 0.78
1021 0.84
1022 0.84
1023 0.83
1024 0.82
1025 0.8
1026 0.74
1027 0.68
1028 0.59
1029 0.5
1030 0.45
1031 0.35
1032 0.27
1033 0.23
1034 0.19
1035 0.14
1036 0.13
1037 0.13
1038 0.1
1039 0.1
1040 0.09
1041 0.12
1042 0.16
1043 0.21
1044 0.22
1045 0.27
1046 0.32
1047 0.34
1048 0.36
1049 0.37
1050 0.37
1051 0.37
1052 0.4
1053 0.37
1054 0.35
1055 0.34
1056 0.31
1057 0.26