Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0A1SXW1

Protein Details
Accession A0A0A1SXW1    Localization Confidence High Confidence Score 20.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
62-100EDNARTLKASKRKRTDAKPRKPREGRREKKRRDEDVAMABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
69-93KASKRKRTDAKPRKPREGRREKKRR
109-131SKPARRRAAAGAGAGERAPKEKA
147-172RRKRAIDRALDSALKKPGGAGKRRRK
419-424KNKKKG
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR035441  TFIIS/LEDGF_dom_sf  
IPR017923  TFIIS_N  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF08711  Med26  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51319  TFIIS_N  
Amino Acid Sequences MSDNESPIGSPAKDPINEDQDMDAVAGSDHESDVLSEIDEDELDDYDPALVNIEDRPIDIDEDNARTLKASKRKRTDAKPRKPREGRREKKRRDEDVAMADGSDGDAPSKPARRRAAAGAGAGERAPKEKASSPEPENEENLTPEQRRKRAIDRALDSALKKPGGAGKRRRKDEIDLEDEIDELLVDLKVQMEKACQADNEARTAGNAAVHKLKLLPQVNGILNRNNVQHAVLDPDTNFLLHVKFFLEPLNDGSLPAYNIQRDIFTALTKLNIEKEALLSSGIGKVVLFYTRSKKPEPNIKRMAERLLGEWSRPILKRTDDYKKRHIETRDFDYQAAKLAQRQKMGSQYSVPDRSSQSAADIERERLLAPARVNNQARMVNMPASYSIAPRSTFDGARGSEHRPLGANGMEAFRKMTQKNKKKGGA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.35
3 0.37
4 0.37
5 0.37
6 0.33
7 0.28
8 0.26
9 0.23
10 0.15
11 0.09
12 0.08
13 0.07
14 0.07
15 0.07
16 0.06
17 0.07
18 0.07
19 0.07
20 0.08
21 0.08
22 0.08
23 0.07
24 0.08
25 0.08
26 0.08
27 0.08
28 0.07
29 0.07
30 0.08
31 0.07
32 0.07
33 0.07
34 0.08
35 0.07
36 0.08
37 0.07
38 0.08
39 0.08
40 0.11
41 0.1
42 0.1
43 0.13
44 0.12
45 0.15
46 0.14
47 0.16
48 0.17
49 0.2
50 0.21
51 0.19
52 0.18
53 0.17
54 0.21
55 0.26
56 0.32
57 0.4
58 0.49
59 0.58
60 0.68
61 0.77
62 0.84
63 0.88
64 0.89
65 0.9
66 0.91
67 0.9
68 0.91
69 0.92
70 0.92
71 0.91
72 0.92
73 0.91
74 0.91
75 0.94
76 0.92
77 0.93
78 0.93
79 0.89
80 0.86
81 0.82
82 0.77
83 0.71
84 0.64
85 0.52
86 0.42
87 0.34
88 0.25
89 0.19
90 0.13
91 0.07
92 0.05
93 0.06
94 0.08
95 0.13
96 0.2
97 0.23
98 0.31
99 0.36
100 0.39
101 0.42
102 0.45
103 0.49
104 0.44
105 0.42
106 0.36
107 0.31
108 0.28
109 0.24
110 0.2
111 0.13
112 0.12
113 0.12
114 0.1
115 0.13
116 0.18
117 0.22
118 0.26
119 0.32
120 0.33
121 0.39
122 0.42
123 0.41
124 0.38
125 0.36
126 0.32
127 0.27
128 0.26
129 0.24
130 0.21
131 0.27
132 0.32
133 0.34
134 0.38
135 0.41
136 0.47
137 0.52
138 0.58
139 0.59
140 0.55
141 0.55
142 0.53
143 0.51
144 0.44
145 0.39
146 0.34
147 0.26
148 0.22
149 0.18
150 0.22
151 0.26
152 0.33
153 0.4
154 0.48
155 0.57
156 0.61
157 0.64
158 0.62
159 0.61
160 0.62
161 0.59
162 0.54
163 0.46
164 0.43
165 0.39
166 0.35
167 0.28
168 0.19
169 0.11
170 0.05
171 0.04
172 0.03
173 0.03
174 0.03
175 0.04
176 0.04
177 0.05
178 0.05
179 0.05
180 0.08
181 0.09
182 0.1
183 0.09
184 0.12
185 0.16
186 0.16
187 0.17
188 0.15
189 0.14
190 0.13
191 0.14
192 0.12
193 0.1
194 0.09
195 0.09
196 0.11
197 0.11
198 0.12
199 0.11
200 0.14
201 0.18
202 0.2
203 0.19
204 0.18
205 0.23
206 0.24
207 0.27
208 0.26
209 0.21
210 0.2
211 0.21
212 0.2
213 0.17
214 0.16
215 0.13
216 0.12
217 0.1
218 0.13
219 0.11
220 0.11
221 0.1
222 0.11
223 0.11
224 0.1
225 0.1
226 0.07
227 0.07
228 0.06
229 0.06
230 0.06
231 0.07
232 0.07
233 0.09
234 0.09
235 0.09
236 0.11
237 0.14
238 0.13
239 0.13
240 0.13
241 0.12
242 0.11
243 0.12
244 0.12
245 0.09
246 0.1
247 0.1
248 0.1
249 0.1
250 0.11
251 0.1
252 0.09
253 0.1
254 0.09
255 0.1
256 0.11
257 0.11
258 0.11
259 0.11
260 0.11
261 0.1
262 0.11
263 0.1
264 0.1
265 0.09
266 0.08
267 0.07
268 0.08
269 0.08
270 0.07
271 0.06
272 0.06
273 0.07
274 0.08
275 0.09
276 0.11
277 0.17
278 0.23
279 0.28
280 0.31
281 0.36
282 0.42
283 0.52
284 0.57
285 0.61
286 0.64
287 0.64
288 0.65
289 0.63
290 0.6
291 0.53
292 0.45
293 0.37
294 0.35
295 0.32
296 0.27
297 0.26
298 0.23
299 0.25
300 0.25
301 0.25
302 0.22
303 0.25
304 0.31
305 0.37
306 0.47
307 0.5
308 0.56
309 0.64
310 0.69
311 0.69
312 0.7
313 0.7
314 0.68
315 0.65
316 0.66
317 0.65
318 0.57
319 0.54
320 0.49
321 0.41
322 0.37
323 0.33
324 0.26
325 0.23
326 0.3
327 0.34
328 0.36
329 0.37
330 0.37
331 0.42
332 0.45
333 0.41
334 0.36
335 0.37
336 0.41
337 0.45
338 0.41
339 0.37
340 0.36
341 0.37
342 0.36
343 0.31
344 0.25
345 0.25
346 0.25
347 0.27
348 0.27
349 0.25
350 0.25
351 0.25
352 0.23
353 0.21
354 0.22
355 0.2
356 0.21
357 0.26
358 0.29
359 0.37
360 0.39
361 0.4
362 0.43
363 0.41
364 0.4
365 0.36
366 0.35
367 0.29
368 0.27
369 0.26
370 0.21
371 0.22
372 0.21
373 0.19
374 0.19
375 0.19
376 0.2
377 0.2
378 0.24
379 0.25
380 0.25
381 0.26
382 0.29
383 0.27
384 0.32
385 0.34
386 0.34
387 0.36
388 0.36
389 0.36
390 0.32
391 0.32
392 0.3
393 0.28
394 0.26
395 0.21
396 0.24
397 0.23
398 0.21
399 0.23
400 0.22
401 0.28
402 0.3
403 0.38
404 0.45
405 0.55
406 0.65