Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

P50105

Protein Details
Accession P50105    Localization Confidence High Confidence Score 16.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
101-124AGLALPKKDDKKKNKGTSKADSKDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
107-117KKDDKKKNKGT
241-247RRKAVKI
267-277KKEEERRVKKR
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto_nucl 15.5, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045144  TAF4  
IPR007900  TAF4_C  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0003682  F:chromatin binding  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0061629  F:RNA polymerase II-specific DNA-binding transcription factor binding  
GO:0045944  P:positive regulation of transcription by RNA polymerase II  
GO:0006366  P:transcription by RNA polymerase II  
GO:0006367  P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter  
KEGG sce:YMR005W  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF05236  TAF4  
CDD cd08045  TAF4  
Amino Acid Sequences MANSPKKPSDGTGVSASDTPKYQHTVPETKPAFNLSPGKASELSHSLPSPSQIKSTAHVSSTHNDAAGNTDDSVLPKNVSPTTNLRVESNGDTNNMFSSPAGLALPKKDDKKKNKGTSKADSKDGKASNSSGQNAQQQSDPNKMQDVLFSAGIDVREEEALLNSSINASKSQVQTNNVKIPNHLPFLHPEQVSNYMRKVGKEQNFNLTPTKNPEILDMMSSACENYMRDILTNAIVISRHRRKAVKINSGRRSEVSAALRAIALIQKKEEERRVKKRIALGLEKEDYENKIDSEETLHRASNVTAGLRAGSKKQYGWLTSSVNKPTSLGAKSSGKVASDITARGESGLKFREAREEPGIVMRDLLFALENRRNSVQTIISKGYAKIRD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.35
2 0.36
3 0.34
4 0.27
5 0.25
6 0.23
7 0.21
8 0.25
9 0.25
10 0.29
11 0.36
12 0.42
13 0.43
14 0.52
15 0.51
16 0.49
17 0.48
18 0.47
19 0.41
20 0.38
21 0.43
22 0.35
23 0.38
24 0.37
25 0.39
26 0.36
27 0.35
28 0.33
29 0.3
30 0.3
31 0.27
32 0.26
33 0.24
34 0.23
35 0.27
36 0.26
37 0.23
38 0.24
39 0.25
40 0.26
41 0.27
42 0.31
43 0.29
44 0.27
45 0.29
46 0.3
47 0.29
48 0.32
49 0.3
50 0.25
51 0.23
52 0.21
53 0.21
54 0.21
55 0.19
56 0.14
57 0.14
58 0.14
59 0.15
60 0.18
61 0.16
62 0.14
63 0.13
64 0.17
65 0.19
66 0.19
67 0.22
68 0.25
69 0.29
70 0.33
71 0.33
72 0.3
73 0.29
74 0.31
75 0.31
76 0.29
77 0.26
78 0.22
79 0.21
80 0.21
81 0.2
82 0.17
83 0.13
84 0.09
85 0.1
86 0.08
87 0.09
88 0.09
89 0.09
90 0.1
91 0.12
92 0.18
93 0.21
94 0.28
95 0.37
96 0.46
97 0.55
98 0.65
99 0.74
100 0.79
101 0.83
102 0.85
103 0.84
104 0.85
105 0.85
106 0.78
107 0.75
108 0.68
109 0.61
110 0.6
111 0.54
112 0.45
113 0.37
114 0.35
115 0.32
116 0.33
117 0.32
118 0.26
119 0.27
120 0.31
121 0.3
122 0.29
123 0.26
124 0.27
125 0.28
126 0.33
127 0.31
128 0.26
129 0.26
130 0.26
131 0.23
132 0.19
133 0.2
134 0.15
135 0.14
136 0.13
137 0.11
138 0.12
139 0.12
140 0.11
141 0.08
142 0.06
143 0.06
144 0.06
145 0.06
146 0.05
147 0.06
148 0.06
149 0.06
150 0.05
151 0.06
152 0.07
153 0.08
154 0.08
155 0.08
156 0.12
157 0.14
158 0.19
159 0.21
160 0.24
161 0.28
162 0.32
163 0.38
164 0.37
165 0.35
166 0.32
167 0.33
168 0.33
169 0.31
170 0.28
171 0.21
172 0.21
173 0.27
174 0.31
175 0.26
176 0.23
177 0.22
178 0.28
179 0.29
180 0.27
181 0.22
182 0.22
183 0.23
184 0.23
185 0.26
186 0.28
187 0.32
188 0.38
189 0.39
190 0.41
191 0.42
192 0.43
193 0.41
194 0.34
195 0.3
196 0.28
197 0.3
198 0.24
199 0.22
200 0.21
201 0.21
202 0.2
203 0.19
204 0.14
205 0.11
206 0.1
207 0.09
208 0.08
209 0.06
210 0.06
211 0.05
212 0.06
213 0.08
214 0.07
215 0.08
216 0.08
217 0.09
218 0.09
219 0.09
220 0.08
221 0.07
222 0.07
223 0.08
224 0.17
225 0.23
226 0.26
227 0.31
228 0.33
229 0.37
230 0.47
231 0.56
232 0.57
233 0.6
234 0.67
235 0.71
236 0.73
237 0.7
238 0.6
239 0.55
240 0.45
241 0.42
242 0.34
243 0.29
244 0.25
245 0.23
246 0.22
247 0.18
248 0.16
249 0.13
250 0.13
251 0.11
252 0.11
253 0.14
254 0.17
255 0.23
256 0.31
257 0.38
258 0.46
259 0.55
260 0.63
261 0.65
262 0.66
263 0.68
264 0.66
265 0.63
266 0.6
267 0.55
268 0.54
269 0.51
270 0.47
271 0.42
272 0.37
273 0.31
274 0.26
275 0.22
276 0.15
277 0.14
278 0.14
279 0.13
280 0.16
281 0.18
282 0.19
283 0.2
284 0.2
285 0.19
286 0.2
287 0.2
288 0.18
289 0.17
290 0.13
291 0.12
292 0.12
293 0.13
294 0.14
295 0.16
296 0.16
297 0.19
298 0.21
299 0.21
300 0.27
301 0.31
302 0.31
303 0.33
304 0.34
305 0.35
306 0.38
307 0.44
308 0.43
309 0.4
310 0.38
311 0.35
312 0.33
313 0.33
314 0.3
315 0.25
316 0.26
317 0.29
318 0.29
319 0.33
320 0.31
321 0.26
322 0.25
323 0.24
324 0.22
325 0.2
326 0.2
327 0.19
328 0.19
329 0.18
330 0.18
331 0.2
332 0.18
333 0.21
334 0.23
335 0.23
336 0.24
337 0.25
338 0.33
339 0.33
340 0.38
341 0.38
342 0.36
343 0.34
344 0.39
345 0.4
346 0.3
347 0.29
348 0.23
349 0.19
350 0.17
351 0.17
352 0.11
353 0.11
354 0.18
355 0.23
356 0.24
357 0.28
358 0.31
359 0.31
360 0.32
361 0.35
362 0.35
363 0.34
364 0.39
365 0.38
366 0.39
367 0.4
368 0.41