Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0A1T8S2

Protein Details
Accession A0A0A1T8S2    Localization Confidence High Confidence Score 26.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
23-48RVPVEPEKNQWQKKKLKAAEPKNGIGHydrophilic
160-185AEAADQEPRRERKRKRKDQYEDLEGDAcidic
447-470FPPMLPRKLRVTRAKDPRKTNQAIHydrophilic
548-578SRDALPKDLKGKKGKGKKGKPTNRGARRGAEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
168-176RRERKRKRK
458-465TRAKDPRK
549-585RDALPKDLKGKKGKGKKGKPTNRGARRGAEWKKKKSA
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12394  RRM1_RBM34  
Amino Acid Sequences MTHCSGPRQSHLQRWQQLAAKERVPVEPEKNQWQKKKLKAAEPKNGIGIVSPTTTAKLFSKMAKGTSVFSVASKAIDPHLQSLFSGSSGPVQAPPKTRYAELRAAKLKEDDEDDEDDEEEGDDEVLSEASQELDYSDDDDDDNEDDVQEDEEQDLDAIAAEAADQEPRRERKRKRKDQYEDLEGDYLEQLQKDEHIEHETKRSKKETEAEDEDEEMDDGELPVHESLTKGGKSEEADKAARTVFIANVSTDAISSKSAKKTLMTHLSDALEKDEYPAQKVESIRFRSVAFSTAAMPKRAAYITKSLMDATTKSTNAYVVLSTEAAARRLVSKLNGTEVLGRHIRVDSVAHPSPTDHRRCIFVGNLGFVDDETIVKKNSEGEEERKKRNKVPSDIEEGLWRTFLKHGKVENVRVVRDPKTRVGKGFAYVQFYDANDVEAALLLNGKSFPPMLPRKLRVTRAKDPRKTNQAIERTRAKANAAADAKNKTGYNPKKTPEQLAAAGRASRLYGRSGAIHASRGTTHRSANSTLPDGIKPPSEIVFEGRRASSRDALPKDLKGKKGKGKKGKPTNRGARRGAEWKKKKSA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.7
2 0.71
3 0.67
4 0.66
5 0.64
6 0.61
7 0.53
8 0.5
9 0.47
10 0.44
11 0.42
12 0.43
13 0.42
14 0.44
15 0.47
16 0.53
17 0.61
18 0.67
19 0.72
20 0.75
21 0.78
22 0.79
23 0.84
24 0.82
25 0.82
26 0.84
27 0.86
28 0.87
29 0.84
30 0.77
31 0.69
32 0.61
33 0.5
34 0.4
35 0.32
36 0.24
37 0.18
38 0.16
39 0.13
40 0.15
41 0.15
42 0.16
43 0.16
44 0.18
45 0.21
46 0.24
47 0.31
48 0.32
49 0.33
50 0.36
51 0.35
52 0.33
53 0.32
54 0.31
55 0.24
56 0.21
57 0.22
58 0.18
59 0.17
60 0.16
61 0.15
62 0.14
63 0.17
64 0.18
65 0.19
66 0.21
67 0.2
68 0.19
69 0.2
70 0.19
71 0.15
72 0.15
73 0.11
74 0.12
75 0.12
76 0.13
77 0.16
78 0.19
79 0.23
80 0.29
81 0.31
82 0.34
83 0.36
84 0.38
85 0.39
86 0.43
87 0.48
88 0.46
89 0.52
90 0.53
91 0.52
92 0.52
93 0.48
94 0.42
95 0.35
96 0.34
97 0.29
98 0.25
99 0.26
100 0.25
101 0.23
102 0.23
103 0.2
104 0.16
105 0.13
106 0.1
107 0.07
108 0.06
109 0.05
110 0.05
111 0.05
112 0.05
113 0.05
114 0.04
115 0.04
116 0.05
117 0.05
118 0.05
119 0.05
120 0.06
121 0.06
122 0.08
123 0.08
124 0.08
125 0.08
126 0.08
127 0.09
128 0.09
129 0.1
130 0.08
131 0.08
132 0.08
133 0.08
134 0.09
135 0.08
136 0.07
137 0.06
138 0.07
139 0.07
140 0.06
141 0.06
142 0.04
143 0.04
144 0.04
145 0.03
146 0.03
147 0.03
148 0.03
149 0.04
150 0.07
151 0.07
152 0.09
153 0.16
154 0.24
155 0.32
156 0.42
157 0.52
158 0.61
159 0.72
160 0.81
161 0.85
162 0.9
163 0.91
164 0.92
165 0.89
166 0.86
167 0.77
168 0.68
169 0.58
170 0.46
171 0.37
172 0.27
173 0.2
174 0.12
175 0.09
176 0.08
177 0.07
178 0.08
179 0.09
180 0.1
181 0.1
182 0.14
183 0.17
184 0.18
185 0.27
186 0.34
187 0.36
188 0.41
189 0.43
190 0.41
191 0.44
192 0.5
193 0.46
194 0.47
195 0.49
196 0.47
197 0.44
198 0.42
199 0.37
200 0.29
201 0.24
202 0.15
203 0.09
204 0.06
205 0.05
206 0.04
207 0.04
208 0.05
209 0.05
210 0.05
211 0.05
212 0.05
213 0.07
214 0.11
215 0.11
216 0.11
217 0.11
218 0.13
219 0.15
220 0.19
221 0.21
222 0.2
223 0.21
224 0.21
225 0.22
226 0.2
227 0.18
228 0.14
229 0.12
230 0.08
231 0.1
232 0.1
233 0.09
234 0.09
235 0.09
236 0.09
237 0.08
238 0.07
239 0.06
240 0.07
241 0.09
242 0.13
243 0.15
244 0.16
245 0.17
246 0.19
247 0.22
248 0.28
249 0.35
250 0.33
251 0.31
252 0.32
253 0.32
254 0.31
255 0.28
256 0.22
257 0.13
258 0.11
259 0.11
260 0.12
261 0.11
262 0.12
263 0.13
264 0.12
265 0.15
266 0.16
267 0.19
268 0.23
269 0.27
270 0.26
271 0.27
272 0.27
273 0.25
274 0.25
275 0.23
276 0.15
277 0.12
278 0.13
279 0.18
280 0.19
281 0.18
282 0.17
283 0.15
284 0.16
285 0.16
286 0.15
287 0.11
288 0.14
289 0.16
290 0.17
291 0.18
292 0.16
293 0.16
294 0.16
295 0.14
296 0.14
297 0.15
298 0.13
299 0.13
300 0.13
301 0.13
302 0.13
303 0.13
304 0.09
305 0.06
306 0.07
307 0.06
308 0.06
309 0.08
310 0.08
311 0.09
312 0.09
313 0.08
314 0.09
315 0.1
316 0.11
317 0.1
318 0.13
319 0.13
320 0.15
321 0.15
322 0.15
323 0.17
324 0.16
325 0.19
326 0.17
327 0.17
328 0.15
329 0.15
330 0.14
331 0.11
332 0.12
333 0.1
334 0.16
335 0.17
336 0.17
337 0.17
338 0.17
339 0.23
340 0.29
341 0.32
342 0.28
343 0.28
344 0.31
345 0.31
346 0.33
347 0.28
348 0.26
349 0.23
350 0.21
351 0.2
352 0.17
353 0.16
354 0.13
355 0.12
356 0.07
357 0.06
358 0.07
359 0.08
360 0.08
361 0.08
362 0.09
363 0.11
364 0.12
365 0.17
366 0.2
367 0.25
368 0.36
369 0.43
370 0.52
371 0.57
372 0.59
373 0.6
374 0.66
375 0.68
376 0.65
377 0.68
378 0.63
379 0.64
380 0.62
381 0.56
382 0.49
383 0.42
384 0.34
385 0.26
386 0.21
387 0.14
388 0.17
389 0.2
390 0.21
391 0.23
392 0.26
393 0.33
394 0.39
395 0.42
396 0.45
397 0.44
398 0.42
399 0.42
400 0.43
401 0.41
402 0.41
403 0.41
404 0.41
405 0.47
406 0.48
407 0.46
408 0.48
409 0.43
410 0.4
411 0.44
412 0.39
413 0.35
414 0.33
415 0.32
416 0.28
417 0.26
418 0.27
419 0.19
420 0.17
421 0.12
422 0.11
423 0.1
424 0.08
425 0.08
426 0.05
427 0.06
428 0.05
429 0.05
430 0.06
431 0.06
432 0.06
433 0.07
434 0.08
435 0.16
436 0.23
437 0.3
438 0.38
439 0.43
440 0.51
441 0.58
442 0.67
443 0.68
444 0.7
445 0.72
446 0.75
447 0.82
448 0.81
449 0.82
450 0.82
451 0.83
452 0.78
453 0.75
454 0.74
455 0.73
456 0.7
457 0.68
458 0.66
459 0.6
460 0.58
461 0.53
462 0.45
463 0.39
464 0.35
465 0.37
466 0.32
467 0.32
468 0.33
469 0.35
470 0.34
471 0.34
472 0.33
473 0.27
474 0.35
475 0.4
476 0.46
477 0.5
478 0.52
479 0.58
480 0.61
481 0.64
482 0.59
483 0.55
484 0.52
485 0.48
486 0.49
487 0.41
488 0.39
489 0.33
490 0.27
491 0.23
492 0.2
493 0.17
494 0.16
495 0.16
496 0.17
497 0.19
498 0.2
499 0.24
500 0.23
501 0.24
502 0.22
503 0.22
504 0.23
505 0.23
506 0.28
507 0.26
508 0.29
509 0.31
510 0.34
511 0.35
512 0.37
513 0.4
514 0.38
515 0.38
516 0.36
517 0.33
518 0.31
519 0.3
520 0.28
521 0.24
522 0.23
523 0.22
524 0.21
525 0.21
526 0.24
527 0.28
528 0.28
529 0.3
530 0.3
531 0.3
532 0.32
533 0.36
534 0.37
535 0.38
536 0.45
537 0.46
538 0.52
539 0.54
540 0.56
541 0.61
542 0.62
543 0.63
544 0.63
545 0.68
546 0.71
547 0.77
548 0.81
549 0.82
550 0.86
551 0.89
552 0.91
553 0.92
554 0.91
555 0.92
556 0.92
557 0.91
558 0.9
559 0.85
560 0.8
561 0.76
562 0.78
563 0.77
564 0.77
565 0.77