FuNGI

P20050

Protein Details

Accession

P20050

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
586-605	SVPAKIRKISVSKKTLKSNW	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 20.5, cyto_nucl 14, cyto 4.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR016573 Hop1 IPR003511 HORMA_dom IPR036570 HORMA_dom_sf
Gene Ontology	GO:0000794 C:condensed nuclear chromosome GO:0000800 C:lateral element GO:0005634 C:nucleus GO:0000795 C:synaptonemal complex GO:0000400 F:four-way junction DNA binding GO:0046872 F:metal ion binding GO:0007129 P:homologous chromosome pairing at meiosis GO:0035825 P:homologous recombination GO:0051598 P:meiotic recombination checkpoint signaling GO:0007131 P:reciprocal meiotic recombination GO:0007130 P:synaptonemal complex assembly
KEGG	sce:YIL072W -
Pfam	View protein in Pfam PF02301 HORMA
PROSITE	View protein in PROSITE PS50815 HORMA

Amino Acid Sequences

MSNKQLVKPKTETKTEITTEQSQKLLQTMLTMSFGCLAFLRGLFPDDIFVDQRFVPEKVEKNYNKQNTSQNNSIKIKTLIRGKSAQADLLLDWLEKGVFKSIRLKCLKALSLGIFLEDPTDLLENYIFSFDYDEENNVNINVNLSGNKKGSKNADPENETISLLDSRRMVQQLMRRFIIITQSLEPLPQKKFLTMRLMFNDNVDEDYQPELFKDATFDKRATLKVPTNLDNDAIDVGTLNTKHHKVALSVLSAATSSMEKAGNTNFIRVDPFDLILQQQEENKLEESVPTKPQNFVTSQTTNVLGNLLNSSQASIQPTQFVSNNPVTGICSCECGLEVPKAATVLKTCKSCRKTLHGICYGNFLHSSIEKCFTCIFGPSLDTKWSKFQDLMMIRKVFRFLVRKKKGFPASITELIDSFINVEDQNNEVKERVAFALFVFFLDETLCLDNGGKPSQTIRYVTSSVLVDVKGIVIPNTRKQLNVNHEYKWHFTTSSPKAESFYQEVLPNSRKQVESWLQDITNLRKVYSEALSPSSTLQELDLNSSLPTQDPIISGQKRRRYDLDEYLEEDKSSVVNDTIKAKDFDESVPAKIRKISVSKKTLKSNW

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.64
2	0.6
3	0.57
4	0.53
5	0.55
6	0.53
7	0.52
8	0.48
9	0.41
10	0.38
11	0.36
12	0.31
13	0.22
14	0.19
15	0.18
16	0.17
17	0.18
18	0.17
19	0.15
20	0.17
21	0.17
22	0.15
23	0.13
24	0.13
25	0.13
26	0.13
27	0.14
28	0.11
29	0.13
30	0.13
31	0.13
32	0.14
33	0.13
34	0.16
35	0.16
36	0.16
37	0.17
38	0.16
39	0.19
40	0.21
41	0.2
42	0.22
43	0.27
44	0.33
45	0.36
46	0.47
47	0.48
48	0.54
49	0.63
50	0.68
51	0.65
52	0.64
53	0.68
54	0.67
55	0.71
56	0.71
57	0.67
58	0.67
59	0.68
60	0.63
61	0.58
62	0.53
63	0.49
64	0.46
65	0.49
66	0.43
67	0.44
68	0.47
69	0.45
70	0.48
71	0.45
72	0.41
73	0.32
74	0.3
75	0.24
76	0.22
77	0.21
78	0.12
79	0.11
80	0.1
81	0.09
82	0.08
83	0.09
84	0.14
85	0.14
86	0.17
87	0.27
88	0.31
89	0.41
90	0.45
91	0.46
92	0.43
93	0.49
94	0.49
95	0.42
96	0.42
97	0.34
98	0.33
99	0.31
100	0.27
101	0.2
102	0.18
103	0.16
104	0.12
105	0.1
106	0.07
107	0.08
108	0.07
109	0.07
110	0.08
111	0.07
112	0.08
113	0.09
114	0.07
115	0.07
116	0.09
117	0.09
118	0.11
119	0.12
120	0.13
121	0.13
122	0.13
123	0.14
124	0.12
125	0.13
126	0.1
127	0.1
128	0.09
129	0.09
130	0.11
131	0.13
132	0.17
133	0.18
134	0.22
135	0.23
136	0.27
137	0.32
138	0.36
139	0.4
140	0.44
141	0.49
142	0.49
143	0.5
144	0.48
145	0.43
146	0.36
147	0.3
148	0.24
149	0.19
150	0.15
151	0.16
152	0.13
153	0.14
154	0.17
155	0.18
156	0.17
157	0.19
158	0.25
159	0.32
160	0.36
161	0.35
162	0.32
163	0.31
164	0.31
165	0.33
166	0.28
167	0.22
168	0.19
169	0.2
170	0.2
171	0.21
172	0.22
173	0.21
174	0.2
175	0.23
176	0.22
177	0.24
178	0.27
179	0.3
180	0.38
181	0.36
182	0.4
183	0.38
184	0.41
185	0.37
186	0.35
187	0.32
188	0.22
189	0.21
190	0.16
191	0.12
192	0.1
193	0.12
194	0.11
195	0.1
196	0.09
197	0.09
198	0.09
199	0.08
200	0.1
201	0.12
202	0.17
203	0.19
204	0.19
205	0.21
206	0.24
207	0.25
208	0.24
209	0.26
210	0.26
211	0.3
212	0.33
213	0.34
214	0.33
215	0.33
216	0.32
217	0.26
218	0.22
219	0.16
220	0.12
221	0.08
222	0.06
223	0.05
224	0.06
225	0.07
226	0.07
227	0.1
228	0.12
229	0.12
230	0.14
231	0.15
232	0.14
233	0.19
234	0.21
235	0.18
236	0.18
237	0.17
238	0.15
239	0.14
240	0.13
241	0.09
242	0.06
243	0.05
244	0.06
245	0.06
246	0.06
247	0.07
248	0.08
249	0.15
250	0.15
251	0.17
252	0.15
253	0.15
254	0.16
255	0.16
256	0.17
257	0.11
258	0.11
259	0.1
260	0.1
261	0.09
262	0.09
263	0.1
264	0.08
265	0.09
266	0.1
267	0.11
268	0.12
269	0.12
270	0.12
271	0.11
272	0.12
273	0.13
274	0.14
275	0.18
276	0.2
277	0.2
278	0.21
279	0.22
280	0.23
281	0.23
282	0.23
283	0.24
284	0.22
285	0.22
286	0.22
287	0.21
288	0.19
289	0.17
290	0.15
291	0.09
292	0.08
293	0.07
294	0.06
295	0.06
296	0.06
297	0.06
298	0.06
299	0.07
300	0.09
301	0.1
302	0.1
303	0.11
304	0.12
305	0.13
306	0.13
307	0.13
308	0.15
309	0.15
310	0.15
311	0.14
312	0.14
313	0.13
314	0.12
315	0.14
316	0.09
317	0.1
318	0.1
319	0.1
320	0.1
321	0.1
322	0.12
323	0.1
324	0.11
325	0.09
326	0.09
327	0.1
328	0.1
329	0.09
330	0.09
331	0.13
332	0.16
333	0.21
334	0.23
335	0.31
336	0.34
337	0.39
338	0.42
339	0.46
340	0.52
341	0.54
342	0.6
343	0.59
344	0.58
345	0.52
346	0.53
347	0.45
348	0.36
349	0.3
350	0.21
351	0.14
352	0.14
353	0.16
354	0.12
355	0.17
356	0.15
357	0.17
358	0.17
359	0.17
360	0.16
361	0.15
362	0.14
363	0.11
364	0.12
365	0.13
366	0.14
367	0.17
368	0.18
369	0.18
370	0.24
371	0.24
372	0.24
373	0.23
374	0.22
375	0.26
376	0.3
377	0.34
378	0.33
379	0.34
380	0.33
381	0.34
382	0.34
383	0.26
384	0.27
385	0.31
386	0.33
387	0.42
388	0.51
389	0.55
390	0.57
391	0.65
392	0.67
393	0.62
394	0.56
395	0.53
396	0.5
397	0.51
398	0.48
399	0.39
400	0.32
401	0.28
402	0.25
403	0.18
404	0.11
405	0.07
406	0.07
407	0.06
408	0.07
409	0.07
410	0.08
411	0.11
412	0.11
413	0.12
414	0.11
415	0.12
416	0.12
417	0.13
418	0.13
419	0.11
420	0.1
421	0.1
422	0.12
423	0.11
424	0.11
425	0.1
426	0.08
427	0.08
428	0.08
429	0.08
430	0.07
431	0.08
432	0.08
433	0.07
434	0.08
435	0.1
436	0.13
437	0.15
438	0.13
439	0.13
440	0.15
441	0.2
442	0.22
443	0.22
444	0.22
445	0.25
446	0.27
447	0.26
448	0.27
449	0.22
450	0.2
451	0.2
452	0.17
453	0.12
454	0.1
455	0.11
456	0.09
457	0.09
458	0.08
459	0.13
460	0.16
461	0.22
462	0.29
463	0.29
464	0.29
465	0.32
466	0.4
467	0.44
468	0.5
469	0.47
470	0.43
471	0.49
472	0.51
473	0.51
474	0.45
475	0.38
476	0.29
477	0.28
478	0.35
479	0.36
480	0.42
481	0.41
482	0.38
483	0.39
484	0.4
485	0.43
486	0.38
487	0.34
488	0.27
489	0.28
490	0.29
491	0.33
492	0.35
493	0.34
494	0.33
495	0.35
496	0.33
497	0.31
498	0.39
499	0.4
500	0.41
501	0.4
502	0.4
503	0.35
504	0.38
505	0.42
506	0.37
507	0.37
508	0.32
509	0.3
510	0.27
511	0.28
512	0.29
513	0.27
514	0.25
515	0.2
516	0.24
517	0.24
518	0.24
519	0.24
520	0.21
521	0.19
522	0.16
523	0.14
524	0.14
525	0.14
526	0.18
527	0.17
528	0.16
529	0.16
530	0.16
531	0.16
532	0.13
533	0.14
534	0.11
535	0.12
536	0.12
537	0.16
538	0.25
539	0.3
540	0.38
541	0.45
542	0.53
543	0.56
544	0.6
545	0.62
546	0.6
547	0.62
548	0.64
549	0.64
550	0.59
551	0.58
552	0.57
553	0.51
554	0.44
555	0.36
556	0.26
557	0.18
558	0.16
559	0.13
560	0.11
561	0.13
562	0.16
563	0.21
564	0.24
565	0.27
566	0.28
567	0.27
568	0.28
569	0.27
570	0.26
571	0.29
572	0.28
573	0.28
574	0.36
575	0.37
576	0.36
577	0.38
578	0.4
579	0.39
580	0.46
581	0.52
582	0.53
583	0.62
584	0.7
585	0.74

P20050

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer