FuNGI

A0A0A1SQD1

Protein Details

Accession

A0A0A1SQD1

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
8-47	EGGPATATRSRRRQRPKSSENLVPQPKAKRQRIPLTEQTF	Hydrophilic
87-109	RKELNVRTRKSKHSDRAVQKGDG	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
18-24	RRRQRPK

Subcellular Location(s)

mito 13.5, cyto_mito 10.333, cyto_nucl 6.833, nucl 6.5, cyto 6

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007187 Nucleoporin_Nup133/Nup155_C IPR014908 Nucleoporin_Nup133/Nup155_N IPR037624 Nup133-like IPR015943 WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf
Gene Ontology	GO:0005643 C:nuclear pore GO:0017056 F:structural constituent of nuclear pore
Pfam	View protein in Pfam PF03177 Nucleoporin_C PF08801 Nucleoporin_N

Amino Acid Sequences

MFSPAVAEGGPATATRSRRRQRPKSSENLVPQPKAKRQRIPLTEQTFVNPDVHPEVVNAKPLRSPPTPTPDALMPDSNIENVNPVPRKELNVRTRKSKHSDRAVQKGDGSLVLTSTNAYTVSKLPAIPDRIRADWNSPQHADISSSFGYALSLTATHAMVWPYNSTSQSPETFTFTLPSASKPSDPLPVGSLVSPSASSVEPGLVVVMAGSGKVVFWESISSAATFAFIKKDRSGVEHVISGMSSGEKVVGITSAESAGFVLTFNSGRLAYMAVRDGHGKPAISTQFLRTNLTPSTSGIFGSIRHAFSNLSLRGEIAAVRADRSTRVGERNVVALTCKGKLQAWRIHRGGHNDHIGEADIRDQLVDALRESDPFAKDFPADSFEAVDFTFVPKGLESKYLELSRLSDAISSEDASEQHLLLLVSLTRRSTSRYAMIEVILNPKGCSIGMIRPITSYTTPISAADSPPTTRPRIYLPRPAIVAFAVFERATVIASLALAPESPDSQLQSDNNILPASFEDVIDFREDNLHETIGSGFEEMPSAAAEEARIFKQKAKNPAVLLFARGAGVIRVVTTEIDKFASEHPPQVSAKSKLEQTVFFGAKADNPLIFDGRRETAFSKEEIGAAALEISQEILSSTTTFMSTLPASLEDNLRARADALERLMLHVRSINAEIDRKTRWSLLFNAEKMHVAGLLWKRHEAFTAARAAGDKKSLIASIVDFIHQDQKTNPIAKIGEVDPVRHWFINDIFRMELFVSWAYEVIKTLYKDHLLDDVKVTLMIYEAMQINTTAHTGALEFRKTNLSFYGLSQDKLRLGILREGYEGLPEPWTGSYFVSNNLKRLVDLSDNWINKYHSLLTENTKAPNVPNPDIIRKIFDDLPLLTDAMLTSVLEYARWGMTSSEHKSIAQNFAKSYHGDRYDKPVLLARLGKWEEAAKIAEKHEALNALAVILLEYVANLEAQILEPGLSPTEMQNFKNLRDAKRAQLEDRFAKYGKEFAFPVYEFLLEKNGVEAVLEFDLETLGFKTQFLRSKPELARISWINDVEQENDIEHAAETLVNLAFTKEQQTWNKKIELSLGKLALLAEAEAQSEKGNMFKVKVDETRQEAQLEKVNRELITVRIQNQLYNQISSSTYDAVDEAAALNLAVEAHGDNIPRKQKALLQAFEGAMERLLKHEALDAMTLIDLLTLVSFKPEAREEIAHPFWLALKVAESSCHADEVREAKRLIWRRLYIRDDWSKINDTKLKDDEAVVARLAETELYAMFSDCVQYQDARDPFRPMAPKEAIGAFSEELDRRFRDIGADFQSKLVDGMKAEDKLLKSYIEKHRLGDWVRTALEAAQAEVAAIAEESRIE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.21
2	0.3
3	0.4
4	0.49
5	0.59
6	0.7
7	0.77
8	0.83
9	0.89
10	0.9
11	0.9
12	0.88
13	0.87
14	0.85
15	0.85
16	0.81
17	0.75
18	0.72
19	0.7
20	0.72
21	0.74
22	0.74
23	0.73
24	0.75
25	0.81
26	0.82
27	0.82
28	0.83
29	0.79
30	0.74
31	0.66
32	0.59
33	0.52
34	0.45
35	0.39
36	0.28
37	0.25
38	0.24
39	0.24
40	0.21
41	0.19
42	0.22
43	0.22
44	0.3
45	0.28
46	0.25
47	0.29
48	0.32
49	0.38
50	0.36
51	0.41
52	0.41
53	0.49
54	0.51
55	0.48
56	0.49
57	0.45
58	0.47
59	0.44
60	0.38
61	0.3
62	0.29
63	0.29
64	0.26
65	0.23
66	0.18
67	0.18
68	0.16
69	0.24
70	0.25
71	0.25
72	0.3
73	0.31
74	0.37
75	0.43
76	0.51
77	0.53
78	0.6
79	0.64
80	0.69
81	0.74
82	0.77
83	0.78
84	0.79
85	0.78
86	0.79
87	0.84
88	0.82
89	0.86
90	0.82
91	0.76
92	0.67
93	0.59
94	0.49
95	0.4
96	0.32
97	0.21
98	0.16
99	0.13
100	0.12
101	0.1
102	0.09
103	0.09
104	0.08
105	0.08
106	0.1
107	0.12
108	0.16
109	0.17
110	0.17
111	0.19
112	0.26
113	0.32
114	0.33
115	0.39
116	0.4
117	0.4
118	0.44
119	0.43
120	0.43
121	0.44
122	0.49
123	0.47
124	0.44
125	0.42
126	0.4
127	0.38
128	0.35
129	0.27
130	0.27
131	0.2
132	0.19
133	0.18
134	0.16
135	0.16
136	0.12
137	0.12
138	0.06
139	0.06
140	0.06
141	0.08
142	0.08
143	0.08
144	0.1
145	0.11
146	0.12
147	0.13
148	0.14
149	0.15
150	0.19
151	0.2
152	0.2
153	0.22
154	0.25
155	0.26
156	0.28
157	0.27
158	0.3
159	0.29
160	0.28
161	0.26
162	0.23
163	0.25
164	0.22
165	0.23
166	0.22
167	0.24
168	0.24
169	0.25
170	0.27
171	0.3
172	0.3
173	0.29
174	0.26
175	0.26
176	0.25
177	0.23
178	0.21
179	0.14
180	0.14
181	0.13
182	0.1
183	0.1
184	0.09
185	0.09
186	0.09
187	0.09
188	0.08
189	0.08
190	0.08
191	0.06
192	0.05
193	0.04
194	0.04
195	0.04
196	0.04
197	0.04
198	0.03
199	0.03
200	0.04
201	0.05
202	0.05
203	0.05
204	0.07
205	0.08
206	0.1
207	0.11
208	0.11
209	0.1
210	0.1
211	0.1
212	0.09
213	0.1
214	0.14
215	0.16
216	0.2
217	0.21
218	0.25
219	0.25
220	0.29
221	0.35
222	0.33
223	0.33
224	0.3
225	0.3
226	0.26
227	0.24
228	0.2
229	0.14
230	0.1
231	0.07
232	0.06
233	0.06
234	0.05
235	0.06
236	0.06
237	0.06
238	0.06
239	0.06
240	0.07
241	0.07
242	0.07
243	0.07
244	0.07
245	0.06
246	0.05
247	0.05
248	0.05
249	0.06
250	0.06
251	0.07
252	0.08
253	0.08
254	0.08
255	0.09
256	0.1
257	0.09
258	0.11
259	0.14
260	0.13
261	0.14
262	0.17
263	0.18
264	0.21
265	0.22
266	0.2
267	0.18
268	0.24
269	0.25
270	0.25
271	0.26
272	0.26
273	0.31
274	0.32
275	0.35
276	0.29
277	0.3
278	0.28
279	0.3
280	0.26
281	0.2
282	0.21
283	0.17
284	0.17
285	0.14
286	0.14
287	0.11
288	0.15
289	0.18
290	0.17
291	0.17
292	0.18
293	0.17
294	0.19
295	0.26
296	0.23
297	0.21
298	0.2
299	0.2
300	0.2
301	0.2
302	0.17
303	0.1
304	0.12
305	0.1
306	0.11
307	0.12
308	0.12
309	0.13
310	0.15
311	0.19
312	0.19
313	0.24
314	0.25
315	0.28
316	0.29
317	0.3
318	0.28
319	0.24
320	0.21
321	0.19
322	0.18
323	0.16
324	0.15
325	0.14
326	0.16
327	0.22
328	0.28
329	0.33
330	0.38
331	0.45
332	0.46
333	0.51
334	0.52
335	0.53
336	0.51
337	0.49
338	0.48
339	0.39
340	0.38
341	0.33
342	0.3
343	0.24
344	0.18
345	0.14
346	0.09
347	0.09
348	0.08
349	0.08
350	0.08
351	0.09
352	0.09
353	0.08
354	0.1
355	0.11
356	0.11
357	0.13
358	0.16
359	0.15
360	0.16
361	0.16
362	0.14
363	0.15
364	0.16
365	0.15
366	0.15
367	0.14
368	0.14
369	0.14
370	0.13
371	0.13
372	0.12
373	0.11
374	0.08
375	0.08
376	0.09
377	0.08
378	0.08
379	0.07
380	0.09
381	0.1
382	0.15
383	0.16
384	0.18
385	0.23
386	0.23
387	0.24
388	0.23
389	0.23
390	0.2
391	0.18
392	0.16
393	0.12
394	0.11
395	0.12
396	0.12
397	0.11
398	0.1
399	0.1
400	0.1
401	0.11
402	0.11
403	0.09
404	0.08
405	0.09
406	0.08
407	0.07
408	0.08
409	0.07
410	0.08
411	0.09
412	0.09
413	0.09
414	0.1
415	0.14
416	0.16
417	0.19
418	0.23
419	0.24
420	0.26
421	0.26
422	0.26
423	0.24
424	0.23
425	0.23
426	0.2
427	0.18
428	0.15
429	0.14
430	0.14
431	0.12
432	0.12
433	0.1
434	0.13
435	0.2
436	0.21
437	0.21
438	0.21
439	0.22
440	0.23
441	0.21
442	0.18
443	0.12
444	0.13
445	0.13
446	0.13
447	0.15
448	0.14
449	0.14
450	0.14
451	0.15
452	0.15
453	0.19
454	0.22
455	0.22
456	0.21
457	0.22
458	0.27
459	0.35
460	0.39
461	0.44
462	0.44
463	0.45
464	0.46
465	0.45
466	0.38
467	0.28
468	0.23
469	0.14
470	0.11
471	0.09
472	0.08
473	0.07
474	0.07
475	0.07
476	0.07
477	0.06
478	0.06
479	0.04
480	0.05
481	0.05
482	0.04
483	0.04
484	0.04
485	0.04
486	0.04
487	0.05
488	0.06
489	0.06
490	0.07
491	0.08
492	0.11
493	0.11
494	0.13
495	0.15
496	0.14
497	0.15
498	0.14
499	0.13
500	0.1
501	0.11
502	0.11
503	0.09
504	0.09
505	0.08
506	0.09
507	0.1
508	0.11
509	0.1
510	0.07
511	0.1
512	0.1
513	0.12
514	0.13
515	0.12
516	0.1
517	0.11
518	0.11
519	0.09
520	0.08
521	0.06
522	0.05
523	0.05
524	0.06
525	0.05
526	0.05
527	0.04
528	0.05
529	0.04
530	0.04
531	0.04
532	0.05
533	0.07
534	0.08
535	0.11
536	0.11
537	0.17
538	0.24
539	0.29
540	0.38
541	0.41
542	0.44
543	0.43
544	0.45
545	0.44
546	0.37
547	0.34
548	0.24
549	0.19
550	0.15
551	0.14
552	0.11
553	0.06
554	0.06
555	0.05
556	0.04
557	0.04
558	0.04
559	0.05
560	0.05
561	0.06
562	0.06
563	0.07
564	0.07
565	0.08
566	0.09
567	0.15
568	0.15
569	0.18
570	0.18
571	0.21
572	0.21
573	0.23
574	0.27
575	0.25
576	0.27
577	0.26
578	0.27
579	0.27
580	0.28
581	0.25
582	0.23
583	0.26
584	0.23
585	0.21
586	0.2
587	0.17
588	0.16
589	0.18
590	0.15
591	0.08
592	0.09
593	0.09
594	0.1
595	0.1
596	0.1
597	0.1
598	0.11
599	0.11
600	0.12
601	0.13
602	0.15
603	0.16
604	0.16
605	0.16
606	0.15
607	0.15
608	0.13
609	0.12
610	0.09
611	0.07
612	0.07
613	0.04
614	0.04
615	0.03
616	0.03
617	0.03
618	0.03
619	0.03
620	0.03
621	0.04
622	0.04
623	0.05
624	0.05
625	0.05
626	0.05
627	0.05
628	0.07
629	0.06
630	0.06
631	0.06
632	0.07
633	0.07
634	0.08
635	0.09
636	0.09
637	0.1
638	0.11
639	0.11
640	0.1
641	0.1
642	0.1
643	0.1
644	0.1
645	0.09
646	0.1
647	0.1
648	0.12
649	0.13
650	0.12
651	0.11
652	0.11
653	0.1
654	0.1
655	0.11
656	0.11
657	0.1
658	0.13
659	0.13
660	0.15
661	0.15
662	0.16
663	0.16
664	0.17
665	0.17
666	0.17
667	0.19
668	0.24
669	0.28
670	0.27
671	0.27
672	0.25
673	0.24
674	0.22
675	0.18
676	0.11
677	0.06
678	0.11
679	0.14
680	0.16
681	0.17
682	0.18
683	0.18
684	0.19
685	0.19
686	0.16
687	0.13
688	0.13
689	0.17
690	0.15
691	0.15
692	0.16
693	0.16
694	0.15
695	0.15
696	0.12
697	0.08
698	0.09
699	0.08
700	0.08
701	0.07
702	0.07
703	0.08
704	0.08
705	0.08
706	0.07
707	0.08
708	0.15
709	0.14
710	0.15
711	0.13
712	0.18
713	0.22
714	0.24
715	0.24
716	0.19
717	0.19
718	0.19
719	0.21
720	0.16
721	0.18
722	0.16
723	0.17
724	0.16
725	0.18
726	0.19
727	0.17
728	0.16
729	0.13
730	0.15
731	0.2
732	0.19
733	0.18
734	0.17
735	0.16
736	0.17
737	0.16
738	0.13
739	0.08
740	0.07
741	0.06
742	0.06
743	0.07
744	0.06
745	0.06
746	0.07
747	0.07
748	0.1
749	0.1
750	0.12
751	0.13
752	0.14
753	0.15
754	0.15
755	0.21
756	0.19
757	0.19
758	0.18
759	0.16
760	0.15
761	0.15
762	0.14
763	0.07
764	0.06
765	0.05
766	0.04
767	0.06
768	0.07
769	0.07
770	0.07
771	0.07
772	0.07
773	0.07
774	0.08
775	0.06
776	0.05
777	0.05
778	0.05
779	0.08
780	0.11
781	0.12
782	0.12
783	0.13
784	0.18
785	0.18
786	0.19
787	0.17
788	0.17
789	0.16
790	0.17
791	0.24
792	0.19
793	0.2
794	0.2
795	0.2
796	0.17
797	0.17
798	0.17
799	0.11
800	0.12
801	0.16
802	0.17
803	0.16
804	0.16
805	0.17
806	0.16
807	0.15
808	0.14
809	0.1
810	0.09
811	0.08
812	0.08
813	0.07
814	0.08
815	0.09
816	0.08
817	0.1
818	0.1
819	0.14
820	0.22
821	0.22
822	0.23
823	0.25
824	0.24
825	0.22
826	0.23
827	0.22
828	0.16
829	0.16
830	0.2
831	0.25
832	0.25
833	0.26
834	0.28
835	0.25
836	0.23
837	0.24
838	0.2
839	0.14
840	0.16
841	0.18
842	0.2
843	0.26
844	0.27
845	0.26
846	0.25
847	0.24
848	0.23
849	0.26
850	0.28
851	0.23
852	0.27
853	0.29
854	0.33
855	0.36
856	0.35
857	0.32
858	0.27
859	0.29
860	0.24
861	0.22
862	0.2
863	0.17
864	0.18
865	0.16
866	0.15
867	0.11
868	0.1
869	0.09
870	0.07
871	0.07
872	0.04
873	0.04
874	0.05
875	0.05
876	0.05
877	0.05
878	0.06
879	0.06
880	0.07
881	0.07
882	0.06
883	0.1
884	0.16
885	0.2
886	0.22
887	0.23
888	0.24
889	0.26
890	0.29
891	0.34
892	0.32
893	0.3
894	0.27
895	0.28
896	0.29
897	0.28
898	0.28
899	0.26
900	0.28
901	0.29
902	0.3
903	0.36
904	0.4
905	0.39
906	0.37
907	0.35
908	0.3
909	0.31
910	0.32
911	0.24
912	0.27
913	0.28
914	0.27
915	0.23
916	0.23
917	0.2
918	0.19
919	0.2
920	0.14
921	0.16
922	0.17
923	0.19
924	0.18
925	0.18
926	0.17
927	0.17
928	0.14
929	0.13
930	0.12
931	0.08
932	0.08
933	0.07
934	0.06
935	0.04
936	0.04
937	0.03
938	0.03
939	0.03
940	0.03
941	0.03
942	0.03
943	0.03
944	0.03
945	0.04
946	0.04
947	0.04
948	0.04
949	0.05
950	0.05
951	0.06
952	0.06
953	0.06
954	0.07
955	0.14
956	0.17
957	0.17
958	0.25
959	0.26
960	0.27
961	0.35
962	0.39
963	0.35
964	0.42
965	0.45
966	0.44
967	0.51
968	0.53
969	0.48
970	0.49
971	0.52
972	0.49
973	0.49
974	0.45
975	0.37
976	0.36
977	0.33
978	0.33
979	0.28
980	0.25
981	0.22
982	0.2
983	0.24
984	0.23
985	0.24
986	0.19
987	0.18
988	0.15
989	0.15
990	0.17
991	0.12
992	0.12
993	0.1
994	0.1
995	0.09
996	0.08
997	0.08
998	0.07
999	0.07
1000	0.07
1001	0.06
1002	0.06
1003	0.06
1004	0.06
1005	0.06
1006	0.05
1007	0.06
1008	0.06
1009	0.07
1010	0.09
1011	0.15
1012	0.21
1013	0.23
1014	0.3
1015	0.32
1016	0.41
1017	0.43
1018	0.5
1019	0.47
1020	0.42
1021	0.46
1022	0.4
1023	0.41
1024	0.35
1025	0.34
1026	0.25
1027	0.25
1028	0.25
1029	0.21
1030	0.2
1031	0.17
1032	0.14
1033	0.14
1034	0.14
1035	0.1
1036	0.09
1037	0.07
1038	0.06
1039	0.06
1040	0.05
1041	0.07
1042	0.07
1043	0.06
1044	0.06
1045	0.07
1046	0.07
1047	0.08
1048	0.12
1049	0.13
1050	0.2
1051	0.29
1052	0.37
1053	0.43
1054	0.47
1055	0.5
1056	0.47
1057	0.45
1058	0.47
1059	0.44
1060	0.41
1061	0.4
1062	0.36
1063	0.32
1064	0.31
1065	0.3
1066	0.22
1067	0.16
1068	0.11
1069	0.07
1070	0.06
1071	0.07
1072	0.07
1073	0.07
1074	0.07
1075	0.08
1076	0.08
1077	0.08
1078	0.12
1079	0.13
1080	0.14
1081	0.18
1082	0.2
1083	0.25
1084	0.3
1085	0.34
1086	0.36
1087	0.4
1088	0.44
1089	0.42
1090	0.41
1091	0.37
1092	0.34
1093	0.36
1094	0.34
1095	0.29
1096	0.28
1097	0.29
1098	0.27
1099	0.28
1100	0.26
1101	0.23
1102	0.27
1103	0.3
1104	0.29
1105	0.33
1106	0.33
1107	0.33
1108	0.34
1109	0.4
1110	0.33
1111	0.31
1112	0.29
1113	0.24
1114	0.24
1115	0.24
1116	0.24
1117	0.16
1118	0.14
1119	0.13
1120	0.13
1121	0.11
1122	0.1
1123	0.09
1124	0.07
1125	0.05
1126	0.05
1127	0.05
1128	0.05
1129	0.04
1130	0.04
1131	0.04
1132	0.04
1133	0.04
1134	0.06
1135	0.08
1136	0.09
1137	0.11
1138	0.18
1139	0.25
1140	0.26
1141	0.27
1142	0.28
1143	0.31
1144	0.4
1145	0.47
1146	0.42
1147	0.39
1148	0.42
1149	0.4
1150	0.39
1151	0.35
1152	0.25
1153	0.17
1154	0.16
1155	0.13
1156	0.11
1157	0.13
1158	0.12
1159	0.11
1160	0.14
1161	0.14
1162	0.14
1163	0.15
1164	0.13
1165	0.12
1166	0.11
1167	0.11
1168	0.08
1169	0.06
1170	0.05
1171	0.04
1172	0.04
1173	0.04
1174	0.04
1175	0.05
1176	0.06
1177	0.07
1178	0.11
1179	0.13
1180	0.16
1181	0.2
1182	0.23
1183	0.24
1184	0.32
1185	0.34
1186	0.31
1187	0.29
1188	0.26
1189	0.24
1190	0.23
1191	0.2
1192	0.12
1193	0.12
1194	0.14
1195	0.14
1196	0.15
1197	0.16
1198	0.19
1199	0.19
1200	0.21
1201	0.2
1202	0.18
1203	0.23
1204	0.28
1205	0.29
1206	0.3
1207	0.3
1208	0.3
1209	0.39
1210	0.47
1211	0.5
1212	0.52
1213	0.55
1214	0.56
1215	0.65
1216	0.68
1217	0.64
1218	0.64
1219	0.66
1220	0.61
1221	0.58
1222	0.57
1223	0.55
1224	0.52
1225	0.55
1226	0.51
1227	0.46
1228	0.5
1229	0.49
1230	0.47
1231	0.41
1232	0.4
1233	0.38
1234	0.37
1235	0.35
1236	0.27
1237	0.24
1238	0.2
1239	0.19
1240	0.18
1241	0.11
1242	0.08
1243	0.07
1244	0.06
1245	0.08
1246	0.08
1247	0.08
1248	0.08
1249	0.08
1250	0.1
1251	0.1
1252	0.11
1253	0.12
1254	0.13
1255	0.14
1256	0.23
1257	0.28
1258	0.32
1259	0.34
1260	0.37
1261	0.38
1262	0.44
1263	0.48
1264	0.42
1265	0.46
1266	0.44
1267	0.43
1268	0.41
1269	0.41
1270	0.36
1271	0.3
1272	0.31
1273	0.22
1274	0.19
1275	0.22
1276	0.2
1277	0.2
1278	0.23
1279	0.23
1280	0.23
1281	0.24
1282	0.23
1283	0.25
1284	0.26
1285	0.31
1286	0.35
1287	0.38
1288	0.35
1289	0.35
1290	0.35
1291	0.3
1292	0.28
1293	0.23
1294	0.17
1295	0.13
1296	0.17
1297	0.22
1298	0.22
1299	0.23
1300	0.27
1301	0.27
1302	0.28
1303	0.29
1304	0.27
1305	0.25
1306	0.33
1307	0.42
1308	0.47
1309	0.48
1310	0.47
1311	0.5
1312	0.54
1313	0.55
1314	0.53
1315	0.48
1316	0.45
1317	0.43
1318	0.41
1319	0.37
1320	0.3
1321	0.32
1322	0.25
1323	0.2
1324	0.15
1325	0.14
1326	0.14
1327	0.13
1328	0.12
1329	0.06
1330	0.06
1331	0.05

A0A0A1SQD1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer