Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q03012

Protein Details
Accession Q03012    Localization Confidence High Confidence Score 17.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
235-266VECGKEDSKGTKRKKKKNSSRSRARKNICGYCHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
243-260KGTKRKKKKNSSRSRARK
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR037869  Spp1/CFP1  
IPR019786  Zinc_finger_PHD-type_CS  
IPR011011  Znf_FYVE_PHD  
IPR001965  Znf_PHD  
IPR019787  Znf_PHD-finger  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0000781  C:chromosome, telomeric region  
GO:0005829  C:cytosol  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0048188  C:Set1C/COMPASS complex  
GO:0003682  F:chromatin binding  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0035064  F:methylated histone binding  
GO:0051568  P:histone H3-K4 methylation  
GO:0045893  P:positive regulation of DNA-templated transcription  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
GO:1903341  P:regulation of meiotic DNA double-strand break formation  
GO:0031509  P:subtelomeric heterochromatin formation  
KEGG sce:YPL138C  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00628  PHD  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS01359  ZF_PHD_1  
PS50016  ZF_PHD_2  
CDD cd16039  PHD_SPP1  
Amino Acid Sequences MSLPQWCPPHSTLKRNPTTGEDVYCICKRPDYGELMVGCDGCDDWFHFTCLHIPEQFKDLVFSFYCPYCQAGITGKNKDAIINGEGSLPKTLWKRKCRISDCYKPCLQDSKYCSEEHGREFVNDIWSRLKTDEDRAVVKKMVEQTGHIDKFKKFGQLDFIDNNIVVKTDDEKEIFDQIVVRDMTLKTLEDDLQEVQEISLPLFKKKLELLEVYLGWLDNVYTEMRKLDDDAASHVECGKEDSKGTKRKKKKNSSRSRARKNICGYCSTYERIPCSVEEFVRDFGSNEEATKIHEVCTKWKCNRHLDWVSTNQEQYLQQIDSLESMQERLQHLIQARKKQLNIQYYEEILRRGL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.73
2 0.7
3 0.7
4 0.65
5 0.65
6 0.58
7 0.51
8 0.43
9 0.37
10 0.4
11 0.39
12 0.36
13 0.29
14 0.29
15 0.26
16 0.29
17 0.33
18 0.33
19 0.33
20 0.36
21 0.35
22 0.35
23 0.35
24 0.29
25 0.23
26 0.18
27 0.15
28 0.09
29 0.1
30 0.09
31 0.13
32 0.14
33 0.16
34 0.16
35 0.17
36 0.21
37 0.23
38 0.26
39 0.24
40 0.25
41 0.26
42 0.29
43 0.3
44 0.25
45 0.24
46 0.21
47 0.21
48 0.19
49 0.19
50 0.19
51 0.18
52 0.19
53 0.17
54 0.18
55 0.15
56 0.15
57 0.15
58 0.18
59 0.25
60 0.31
61 0.34
62 0.34
63 0.36
64 0.36
65 0.34
66 0.3
67 0.25
68 0.2
69 0.18
70 0.17
71 0.16
72 0.17
73 0.17
74 0.16
75 0.13
76 0.16
77 0.21
78 0.3
79 0.36
80 0.45
81 0.51
82 0.59
83 0.7
84 0.71
85 0.74
86 0.75
87 0.77
88 0.75
89 0.75
90 0.69
91 0.61
92 0.57
93 0.56
94 0.49
95 0.45
96 0.44
97 0.43
98 0.42
99 0.4
100 0.4
101 0.37
102 0.39
103 0.34
104 0.33
105 0.26
106 0.24
107 0.26
108 0.26
109 0.27
110 0.24
111 0.22
112 0.21
113 0.21
114 0.23
115 0.21
116 0.22
117 0.17
118 0.21
119 0.25
120 0.24
121 0.28
122 0.28
123 0.3
124 0.28
125 0.27
126 0.25
127 0.24
128 0.24
129 0.2
130 0.2
131 0.22
132 0.29
133 0.31
134 0.29
135 0.29
136 0.26
137 0.29
138 0.3
139 0.31
140 0.23
141 0.22
142 0.28
143 0.27
144 0.3
145 0.28
146 0.27
147 0.21
148 0.2
149 0.19
150 0.12
151 0.1
152 0.06
153 0.06
154 0.07
155 0.08
156 0.1
157 0.1
158 0.11
159 0.11
160 0.13
161 0.12
162 0.1
163 0.1
164 0.08
165 0.12
166 0.11
167 0.1
168 0.11
169 0.11
170 0.12
171 0.11
172 0.11
173 0.08
174 0.09
175 0.1
176 0.08
177 0.1
178 0.09
179 0.08
180 0.08
181 0.08
182 0.06
183 0.07
184 0.07
185 0.06
186 0.09
187 0.1
188 0.1
189 0.12
190 0.12
191 0.12
192 0.14
193 0.16
194 0.16
195 0.17
196 0.18
197 0.2
198 0.2
199 0.18
200 0.17
201 0.14
202 0.11
203 0.09
204 0.06
205 0.03
206 0.05
207 0.05
208 0.05
209 0.06
210 0.07
211 0.08
212 0.08
213 0.09
214 0.11
215 0.12
216 0.12
217 0.14
218 0.17
219 0.17
220 0.16
221 0.16
222 0.14
223 0.12
224 0.15
225 0.14
226 0.11
227 0.12
228 0.19
229 0.27
230 0.36
231 0.46
232 0.53
233 0.62
234 0.72
235 0.82
236 0.86
237 0.89
238 0.91
239 0.93
240 0.93
241 0.94
242 0.95
243 0.95
244 0.94
245 0.88
246 0.85
247 0.82
248 0.8
249 0.71
250 0.65
251 0.58
252 0.52
253 0.51
254 0.44
255 0.39
256 0.34
257 0.34
258 0.31
259 0.28
260 0.24
261 0.25
262 0.26
263 0.23
264 0.23
265 0.23
266 0.23
267 0.23
268 0.23
269 0.19
270 0.17
271 0.2
272 0.16
273 0.15
274 0.15
275 0.13
276 0.16
277 0.19
278 0.18
279 0.17
280 0.21
281 0.22
282 0.29
283 0.38
284 0.45
285 0.49
286 0.57
287 0.62
288 0.67
289 0.72
290 0.74
291 0.73
292 0.7
293 0.69
294 0.68
295 0.67
296 0.61
297 0.55
298 0.45
299 0.4
300 0.34
301 0.29
302 0.26
303 0.2
304 0.18
305 0.18
306 0.18
307 0.16
308 0.17
309 0.15
310 0.11
311 0.12
312 0.13
313 0.16
314 0.18
315 0.2
316 0.2
317 0.23
318 0.28
319 0.37
320 0.43
321 0.48
322 0.55
323 0.59
324 0.6
325 0.64
326 0.67
327 0.67
328 0.65
329 0.61
330 0.57
331 0.53
332 0.55
333 0.49